MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020410	TTTGAA	2	12	17297	17308	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020410	TCATAT	2	12	65478	65489	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_020410	AGTCAA	2	12	102196	102207	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020410	GAAAAG	2	12	148687	148698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020410	AAACAA	2	12	148728	148739	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_020410	AGGTAT	2	12	166877	166888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020410	GAGAAT	2	12	271907	271918	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020410	GATAAA	2	12	323633	323644	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020410	ATTGAT	2	12	325039	325050	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020410	ACGATT	2	12	336484	336495	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020410	ATATCA	2	12	339895	339906	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020410	TGATAA	2	12	405886	405897	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020410	TTTTTC	2	12	438200	438211	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_020410	AATAAA	2	12	463322	463333	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020410	CGGCTC	2	12	476329	476340	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020410	AATCTA	2	12	510770	510781	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020410	ATCAAT	2	12	510784	510795	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020410	ATCCTC	2	12	516291	516302	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020410	ATGTGA	2	12	548773	548784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020410	GACCCA	2	12	556703	556714	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020410	TTTCAA	2	12	571499	571510	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020410	AAAAGG	2	12	614756	614767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020410	TCAATC	2	12	632376	632387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020410	CTTTCT	2	12	644624	644635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020410	TTTCTC	2	12	664572	664583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020410	CGCGGC	2	12	684516	684527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020410	AAATGA	2	12	685705	685716	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020410	AAAACT	2	12	698490	698501	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020410	AAAAAT	2	12	702124	702135	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020410	GGCGGG	2	12	720509	720520	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020410	ACAAAA	2	12	722688	722699	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020410	TTTTTC	2	12	769313	769324	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020410	TAAAAC	2	12	776590	776601	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020410	GGATTT	2	12	777065	777076	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020410	TAAAAA	2	12	778884	778895	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020410	TCATTT	2	12	808162	808173	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020410	CTTTTT	2	12	816635	816646	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020410	TAAAAT	2	12	838887	838898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020410	ATATGG	2	12	841346	841357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020410	TTGAAT	2	12	841579	841590	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020410	GTGCTG	2	12	845542	845553	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020410	CATCTT	2	12	847393	847404	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020410	CCTTTC	2	12	884684	884695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020410	ATGAAA	2	12	885421	885432	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020410	ATGCTC	2	12	986741	986752	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020410	ATAATG	2	12	997345	997356	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020410	TCTTTT	2	12	1003468	1003479	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020410	GAAAAA	2	12	1006497	1006508	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020410	GAAAAG	2	12	1012311	1012322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020410	TTACTA	2	12	1017474	1017485	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_020410	CGCAAA	2	12	1017549	1017560	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020410	GGCTGC	2	12	1118534	1118545	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020410	TTTTTA	2	12	1130746	1130757	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020410	AGATAA	2	12	1131061	1131072	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020410	ATTTTG	2	12	1131405	1131416	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020410	TTTTGT	2	12	1159356	1159367	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020410	GTTAAC	2	12	1174981	1174992	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020410	TCTTTT	2	12	1308691	1308702	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_020410	CTGTTT	2	12	1319192	1319203	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_020410	TAATTG	2	12	1330954	1330965	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020410	ATCATT	2	12	1344365	1344376	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_020410	ATCATT	2	12	1347604	1347615	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_020410	TGCTTT	2	12	1384606	1384617	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020410	TCAAAC	2	12	1462367	1462378	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020410	GCCTGT	2	12	1579563	1579574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020410	TCCGGT	2	12	1584581	1584592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020410	TTTGTT	2	12	1658838	1658849	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020410	AATTCT	2	12	1694990	1695001	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020410	AATTTT	2	12	1695653	1695664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020410	AAAATA	2	12	1782740	1782751	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020410	TCATTT	2	12	1789023	1789034	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_020410	GTGGCT	2	12	1790645	1790656	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020410	AGGAGC	2	12	1790671	1790682	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_020410	TGGAGA	2	12	1791284	1791295	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020410	ATAAAA	2	12	1808986	1808997	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020410	TGTTCT	2	12	1812132	1812143	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_020410	TGCAAA	2	12	1813288	1813299	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020410	AAAACA	2	12	1813756	1813767	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_020410	GGGAAA	2	12	1814413	1814424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020410	TAAAAA	2	12	1831722	1831733	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020410	TAAAAT	2	12	1846738	1846749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020410	CTCTAT	2	12	1863421	1863432	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020410	GTCATT	2	12	1866196	1866207	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_020410	ATAAAA	2	12	1971892	1971903	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020410	AAGAGA	2	12	1971969	1971980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020410	CTTTTT	2	12	2011047	2011058	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_020410	CCTTCC	2	12	2042830	2042841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_020410	AAATAA	2	12	2114793	2114804	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020410	ATCAAA	2	12	2186643	2186654	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_020410	ATAAAA	2	12	2338759	2338770	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020410	ATATTT	2	12	2356763	2356774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020410	AACGGA	2	12	2377664	2377675	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020410	CAATCT	2	12	2400895	2400906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020410	ACCGTT	2	12	2406569	2406580	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020410	TGAAAA	2	12	2409401	2409412	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020410	TTCTAA	2	12	2459286	2459297	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_020410	TGACTT	2	12	2485406	2485417	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_020410	GAAGCA	2	12	2507250	2507261	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_020410	TAAAAA	2	12	2511405	2511416	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020410	AATAAA	2	12	2531536	2531547	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020410	TTCTCC	2	12	2546597	2546608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020410	GAATCA	2	12	2655708	2655719	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_020410	CCCTCT	2	12	2674995	2675006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_020410	ATTGGA	2	12	2687105	2687116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020410	CTCTTT	2	12	2721799	2721810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020410	CTTATA	2	12	2734896	2734907	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_020410	TTTAAG	2	12	2748599	2748610	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020410	GGAAAA	2	12	2764295	2764306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020410	AAAAGC	2	12	2772802	2772813	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_020410	CCAAAA	2	12	2775689	2775700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_020410	CTTATC	2	12	2812045	2812056	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020410	CTAAAA	2	12	2852059	2852070	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_020410	TTAAGA	2	12	2914908	2914919	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020410	TGCATC	2	12	2945407	2945418	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020410	ATTATC	2	12	3012907	3012918	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_020410	CCGCGG	2	12	3020413	3020424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020410	ATTTTA	2	12	3023310	3023321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020410	TAAATG	2	12	3097479	3097490	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020410	TAATGA	2	12	3135415	3135426	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020410	GAAAAA	2	12	3153715	3153726	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020410	AATAAC	2	12	3234840	3234851	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_020410	GAGAAA	2	12	3284563	3284574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020410	TTTCTT	2	12	3288174	3288185	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_020410	TTTCAT	2	12	3323646	3323657	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_020410	ATTTTT	2	12	3334576	3334587	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020410	TCTTAT	2	12	3361476	3361487	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_020410	CAATCA	2	12	3398020	3398031	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020410	GATGAA	2	12	3431407	3431418	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020410	TTTAAT	2	12	3447220	3447231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020410	GCATAA	2	12	3457732	3457743	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_020410	ATTCCC	2	12	3460060	3460071	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_020410	AAAATA	2	12	3489506	3489517	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020410	CAAAAA	2	12	3561802	3561813	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_020410	ATCTCC	2	12	3581909	3581920	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020410	CAAAAA	2	12	3582039	3582050	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_020410	AATATA	2	12	3647239	3647250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.