MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 11296

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020410	CTGG	2	8	613	620	0 %	25 %	50 %	25 %	452854063
2	NC_020410	TTTA	2	8	895	902	25 %	75 %	0 %	0 %	452854063
3	NC_020410	AACA	2	8	1125	1132	75 %	0 %	0 %	25 %	452854063
4	NC_020410	CAAA	2	8	1177	1184	75 %	0 %	0 %	25 %	452854063
5	NC_020410	TTCG	2	8	1239	1246	0 %	50 %	25 %	25 %	452854063
6	NC_020410	GATT	2	8	1260	1267	25 %	50 %	25 %	0 %	452854063
7	NC_020410	GAAA	2	8	1314	1321	75 %	0 %	25 %	0 %	452854063
8	NC_020410	GAAA	2	8	1771	1778	75 %	0 %	25 %	0 %	452854063
9	NC_020410	TCAT	2	8	2145	2152	25 %	50 %	0 %	25 %	452854064
10	NC_020410	CGAT	2	8	2185	2192	25 %	25 %	25 %	25 %	452854064
11	NC_020410	GCTG	2	8	2930	2937	0 %	25 %	50 %	25 %	452854064
12	NC_020410	TTCA	2	8	2966	2973	25 %	50 %	0 %	25 %	452854064
13	NC_020410	GAGC	2	8	3355	3362	25 %	0 %	50 %	25 %	452854065
14	NC_020410	GAAG	2	8	3695	3702	50 %	0 %	50 %	0 %	452854066
15	NC_020410	TCAG	2	8	3795	3802	25 %	25 %	25 %	25 %	452854066
16	NC_020410	GACA	2	8	4717	4724	50 %	0 %	25 %	25 %	452854067
17	NC_020410	GAAA	2	8	4725	4732	75 %	0 %	25 %	0 %	452854067
18	NC_020410	CCGT	2	8	4741	4748	0 %	25 %	25 %	50 %	452854067
19	NC_020410	CGGT	2	8	5158	5165	0 %	25 %	50 %	25 %	452854068
20	NC_020410	GCGG	2	8	6210	6217	0 %	0 %	75 %	25 %	452854068
21	NC_020410	TCAG	2	8	7089	7096	25 %	25 %	25 %	25 %	452854069
22	NC_020410	TCCT	2	8	7109	7116	0 %	50 %	0 %	50 %	452854069
23	NC_020410	AATG	2	8	7204	7211	50 %	25 %	25 %	0 %	452854069
24	NC_020410	ATCA	2	8	7765	7772	50 %	25 %	0 %	25 %	452854069
25	NC_020410	AGAA	2	8	7816	7823	75 %	0 %	25 %	0 %	452854069
26	NC_020410	ACAA	2	8	8010	8017	75 %	0 %	0 %	25 %	452854069
27	NC_020410	ACTG	2	8	8293	8300	25 %	25 %	25 %	25 %	452854069
28	NC_020410	ATCA	2	8	8379	8386	50 %	25 %	0 %	25 %	452854069
29	NC_020410	CTGA	2	8	9008	9015	25 %	25 %	25 %	25 %	452854069
30	NC_020410	ACGC	2	8	9211	9218	25 %	0 %	25 %	50 %	452854069
31	NC_020410	CGTC	2	8	9412	9419	0 %	25 %	25 %	50 %	452854069
32	NC_020410	TAAA	2	8	9766	9773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020410	AGTC	2	8	9792	9799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020410	CCTG	2	8	9935	9942	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020410	GTGA	2	8	10217	10224	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020410	AGCC	2	8	11271	11278	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020410	AAGC	2	8	11622	11629	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020410	CACG	2	8	12318	12325	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020410	GCGA	2	8	13106	13113	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020410	TAGG	2	8	13681	13688	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020410	CGGG	2	8	13777	13784	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020410	ATCG	2	8	14442	14449	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020410	AGGC	2	8	15376	15383	25 %	0 %	50 %	25 %	452854070
44	NC_020410	GGAC	2	8	17001	17008	25 %	0 %	50 %	25 %	452854071
45	NC_020410	ATGA	2	8	17341	17348	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020410	AATG	2	8	17824	17831	50 %	25 %	25 %	0 %	452854072
47	NC_020410	TGAA	2	8	17889	17896	50 %	25 %	25 %	0 %	452854072
48	NC_020410	CAAG	2	8	18367	18374	50 %	0 %	25 %	25 %	452854072
49	NC_020410	TACA	2	8	18514	18521	50 %	25 %	0 %	25 %	452854072
50	NC_020410	AAGA	2	8	18700	18707	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020410	ATCT	2	8	18777	18784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020410	AATG	2	8	19101	19108	50 %	25 %	25 %	0 %	452854073
53	NC_020410	TAAA	2	8	19238	19245	75 %	25 %	0 %	0 %	452854073
54	NC_020410	CGGG	2	8	19931	19938	0 %	0 %	75 %	25 %	452854074
55	NC_020410	TATT	2	8	20192	20199	25 %	75 %	0 %	0 %	452854074
56	NC_020410	TGAT	2	8	20709	20716	25 %	50 %	25 %	0 %	452854075
57	NC_020410	GCTT	2	8	21482	21489	0 %	50 %	25 %	25 %	452854075
58	NC_020410	CGTC	2	8	22892	22899	0 %	25 %	25 %	50 %	452854076
59	NC_020410	CTTT	2	8	23105	23112	0 %	75 %	0 %	25 %	452854076
60	NC_020410	GCAT	2	8	23930	23937	25 %	25 %	25 %	25 %	452854077
61	NC_020410	AAAT	2	8	24038	24045	75 %	25 %	0 %	0 %	452854077
62	NC_020410	GTCT	2	8	24273	24280	0 %	50 %	25 %	25 %	452854078
63	NC_020410	GTGA	2	8	24504	24511	25 %	25 %	50 %	0 %	452854078
64	NC_020410	GAAA	2	8	25010	25017	75 %	0 %	25 %	0 %	452854079
65	NC_020410	TTAA	2	8	25059	25066	50 %	50 %	0 %	0 %	452854079
66	NC_020410	CGGC	2	8	26046	26053	0 %	0 %	50 %	50 %	452854079
67	NC_020410	TGAA	2	8	26241	26248	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020410	ATAA	2	8	26698	26705	75 %	25 %	0 %	0 %	452854080
69	NC_020410	ATGA	2	8	26939	26946	50 %	25 %	25 %	0 %	452854081
70	NC_020410	AAAG	2	8	27388	27395	75 %	0 %	25 %	0 %	452854081
71	NC_020410	ATTT	2	8	27496	27503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020410	TAAG	2	8	27602	27609	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020410	GGAA	2	8	27664	27671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020410	ATCA	2	8	27774	27781	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020410	AATG	2	8	28123	28130	50 %	25 %	25 %	0 %	452854082
76	NC_020410	TGAA	2	8	28706	28713	50 %	25 %	25 %	0 %	452854082
77	NC_020410	GAAG	2	8	29181	29188	50 %	0 %	50 %	0 %	452854082
78	NC_020410	ATAA	2	8	29948	29955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020410	CAAC	2	8	30382	30389	50 %	0 %	0 %	50 %	452854084
80	NC_020410	GAAG	2	8	30534	30541	50 %	0 %	50 %	0 %	452854084
81	NC_020410	ACAG	2	8	30658	30665	50 %	0 %	25 %	25 %	452854085
82	NC_020410	TAAA	2	8	31329	31336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020410	AGTC	2	8	31355	31362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020410	CCTG	2	8	31498	31505	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020410	GTGA	2	8	31780	31787	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020410	AGCC	2	8	32834	32841	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020410	AAGC	2	8	33185	33192	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020410	CACG	2	8	33881	33888	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020410	GCGA	2	8	34669	34676	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_020410	TAGG	2	8	35244	35251	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020410	CGGG	2	8	35340	35347	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_020410	ATCG	2	8	36007	36014	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_020410	ATGA	2	8	36369	36376	50 %	25 %	25 %	0 %	452854087
94	NC_020410	TCGT	2	8	36517	36524	0 %	50 %	25 %	25 %	452854087
95	NC_020410	AATA	2	8	36691	36698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020410	TGAG	2	8	37197	37204	25 %	25 %	50 %	0 %	452854088
97	NC_020410	GCAG	2	8	38013	38020	25 %	0 %	50 %	25 %	452854089
98	NC_020410	CCGG	2	8	38442	38449	0 %	0 %	50 %	50 %	452854089
99	NC_020410	TTTC	2	8	38775	38782	0 %	75 %	0 %	25 %	452854090
100	NC_020410	CATG	2	8	38943	38950	25 %	25 %	25 %	25 %	452854090
101	NC_020410	GGCC	2	8	39139	39146	0 %	0 %	50 %	50 %	452854090
102	NC_020410	GCGG	2	8	39471	39478	0 %	0 %	75 %	25 %	452854090
103	NC_020410	GCTG	2	8	39567	39574	0 %	25 %	50 %	25 %	452854090
104	NC_020410	ATAA	2	8	39775	39782	75 %	25 %	0 %	0 %	452854090
105	NC_020410	TTTA	2	8	39977	39984	25 %	75 %	0 %	0 %	452854091
106	NC_020410	TAAA	2	8	40129	40136	75 %	25 %	0 %	0 %	452854091
107	NC_020410	GATG	2	8	40148	40155	25 %	25 %	50 %	0 %	452854091
108	NC_020410	TTCT	2	8	40315	40322	0 %	75 %	0 %	25 %	452854091
109	NC_020410	AATG	2	8	40630	40637	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020410	AAAT	2	8	41024	41031	75 %	25 %	0 %	0 %	452854093
111	NC_020410	GAAA	2	8	41337	41344	75 %	0 %	25 %	0 %	452854093
112	NC_020410	GGAA	2	8	41485	41492	50 %	0 %	50 %	0 %	452854094
113	NC_020410	TTTG	2	8	41567	41574	0 %	75 %	25 %	0 %	452854094
114	NC_020410	TTCA	2	8	42171	42178	25 %	50 %	0 %	25 %	452854094
115	NC_020410	CAAT	2	8	42312	42319	50 %	25 %	0 %	25 %	452854094
116	NC_020410	AAAC	2	8	42694	42701	75 %	0 %	0 %	25 %	452854095
117	NC_020410	ACGG	2	8	42825	42832	25 %	0 %	50 %	25 %	452854095
118	NC_020410	AGAA	2	8	43502	43509	75 %	0 %	25 %	0 %	452854096
119	NC_020410	TCAT	2	8	44021	44028	25 %	50 %	0 %	25 %	452854097
120	NC_020410	TTTA	2	8	44311	44318	25 %	75 %	0 %	0 %	452854097
121	NC_020410	GAAA	2	8	44676	44683	75 %	0 %	25 %	0 %	452854098
122	NC_020410	ACAG	2	8	45175	45182	50 %	0 %	25 %	25 %	452854099
123	NC_020410	AAAC	2	8	45543	45550	75 %	0 %	0 %	25 %	452854099
124	NC_020410	TACG	2	8	45921	45928	25 %	25 %	25 %	25 %	452854100
125	NC_020410	ATTG	2	8	46069	46076	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020410	AGTA	2	8	46094	46101	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020410	TTTA	2	8	46276	46283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020410	ATAG	2	8	46338	46345	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020410	GTAT	2	8	47144	47151	25 %	50 %	25 %	0 %	452854101
130	NC_020410	ATTA	2	8	47508	47515	50 %	50 %	0 %	0 %	452854101
131	NC_020410	TGCT	2	8	47767	47774	0 %	50 %	25 %	25 %	452854101
132	NC_020410	TAAA	2	8	48419	48426	75 %	25 %	0 %	0 %	452854101
133	NC_020410	AGAA	2	8	48821	48828	75 %	0 %	25 %	0 %	452854102
134	NC_020410	TCAT	2	8	48878	48885	25 %	50 %	0 %	25 %	452854102
135	NC_020410	CTTC	2	8	49337	49344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020410	GAAC	2	8	49871	49878	50 %	0 %	25 %	25 %	452854103
137	NC_020410	GAAA	2	8	49993	50000	75 %	0 %	25 %	0 %	452854103
138	NC_020410	GAAA	2	8	50186	50193	75 %	0 %	25 %	0 %	452854103
139	NC_020410	GAAA	2	8	50219	50226	75 %	0 %	25 %	0 %	452854103
140	NC_020410	GAAA	2	8	50695	50702	75 %	0 %	25 %	0 %	452854103
141	NC_020410	AATT	2	8	50724	50731	50 %	50 %	0 %	0 %	452854103
142	NC_020410	TCAT	2	8	51712	51719	25 %	50 %	0 %	25 %	452854105
143	NC_020410	TCCT	2	8	51914	51921	0 %	50 %	0 %	50 %	452854105
144	NC_020410	AAGC	2	8	52105	52112	50 %	0 %	25 %	25 %	452854105
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