MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 45896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020410	CGA	2	6	546	551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854063
2	NC_020410	GAA	2	6	671	676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854063
3	NC_020410	GAA	2	6	713	718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854063
4	NC_020410	GCA	2	6	848	853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854063
5	NC_020410	GTG	2	6	986	991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854063
6	NC_020410	TCT	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854063
7	NC_020410	TCA	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854063
8	NC_020410	ATA	2	6	1041	1046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854063
9	NC_020410	GAT	2	6	1097	1102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854063
10	NC_020410	GAA	2	6	1169	1174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854063
11	NC_020410	CCG	2	6	1205	1210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854063
12	NC_020410	CCG	2	6	1280	1285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854063
13	NC_020410	TCT	2	6	1499	1504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854063
14	NC_020410	CAG	2	6	1550	1555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854063
15	NC_020410	TTC	2	6	1654	1659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854063
16	NC_020410	GAA	2	6	1676	1681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854063
17	NC_020410	GGC	2	6	1685	1690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854063
18	NC_020410	CTG	2	6	1736	1741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854063
19	NC_020410	TGA	2	6	1744	1749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854063
20	NC_020410	AGC	2	6	1752	1757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854063
21	NC_020410	CAG	3	9	1760	1768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854063
22	NC_020410	ATA	2	6	1795	1800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854063
23	NC_020410	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854064
24	NC_020410	AGA	3	9	2159	2167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854064
25	NC_020410	TGC	2	6	2209	2214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854064
26	NC_020410	TTC	2	6	2223	2228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854064
27	NC_020410	ATT	2	6	2501	2506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854064
28	NC_020410	TGA	2	6	2627	2632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854064
29	NC_020410	TTC	2	6	2700	2705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854064
30	NC_020410	TCG	2	6	2773	2778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854064
31	NC_020410	CTT	2	6	2815	2820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854064
32	NC_020410	CAA	2	6	2840	2845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854064
33	NC_020410	CGG	2	6	2869	2874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854064
34	NC_020410	TCA	2	6	2889	2894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854064
35	NC_020410	ATG	2	6	3073	3078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854064
36	NC_020410	ATA	2	6	3249	3254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854065
37	NC_020410	CGG	2	6	3331	3336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854065
38	NC_020410	CAA	2	6	3376	3381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854065
39	NC_020410	CGC	2	6	3395	3400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854065
40	NC_020410	GTC	2	6	3458	3463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854065
41	NC_020410	ATC	2	6	3566	3571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854066
42	NC_020410	TGA	2	6	3705	3710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854066
43	NC_020410	AGC	2	6	3783	3788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854066
44	NC_020410	AGG	2	6	3875	3880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854066
45	NC_020410	AGC	2	6	4045	4050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854066
46	NC_020410	GAA	2	6	4139	4144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854066
47	NC_020410	ATT	2	6	4267	4272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854066
48	NC_020410	GAT	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854066
49	NC_020410	ACG	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854066
50	NC_020410	GAA	2	6	4397	4402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854066
51	NC_020410	GAT	2	6	4430	4435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854066
52	NC_020410	GAT	2	6	4451	4456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854066
53	NC_020410	CAC	2	6	4510	4515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452854066
54	NC_020410	GAC	2	6	4633	4638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854067
55	NC_020410	TCG	2	6	4661	4666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854067
56	NC_020410	TTG	2	6	4700	4705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854067
57	NC_020410	AGT	2	6	4734	4739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854067
58	NC_020410	GAA	2	6	4821	4826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854067
59	NC_020410	CAG	2	6	4923	4928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854068
60	NC_020410	ATG	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854068
61	NC_020410	CAC	2	6	5031	5036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452854068
62	NC_020410	TCG	2	6	5050	5055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854068
63	NC_020410	ACA	2	6	5056	5061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854068
64	NC_020410	GCC	2	6	5182	5187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854068
65	NC_020410	TCA	2	6	5200	5205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854068
66	NC_020410	CGG	2	6	5222	5227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854068
67	NC_020410	CGG	2	6	5258	5263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854068
68	NC_020410	AAC	2	6	5456	5461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854068
69	NC_020410	AAG	2	6	5626	5631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854068
70	NC_020410	AAT	2	6	5739	5744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854068
71	NC_020410	GGC	2	6	5760	5765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854068
72	NC_020410	AAG	2	6	5819	5824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854068
73	NC_020410	GAT	2	6	5865	5870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854068
74	NC_020410	ATT	2	6	5892	5897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854068
75	NC_020410	TCT	2	6	5988	5993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854068
76	NC_020410	CTT	2	6	6009	6014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854068
77	NC_020410	CGC	2	6	6105	6110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854068
78	NC_020410	TTC	2	6	6158	6163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854068
79	NC_020410	AGT	2	6	6401	6406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854068
80	NC_020410	CAT	2	6	6407	6412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854068
81	NC_020410	TTA	2	6	6453	6458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854068
82	NC_020410	TTC	2	6	6462	6467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854068
83	NC_020410	ATC	2	6	6486	6491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854068
84	NC_020410	GCC	2	6	6518	6523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854068
85	NC_020410	GCA	2	6	6536	6541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854068
86	NC_020410	AGC	2	6	6574	6579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854068
87	NC_020410	TGA	2	6	6581	6586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854068
88	NC_020410	TCG	2	6	7257	7262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854069
89	NC_020410	ACC	2	6	7281	7286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452854069
90	NC_020410	TTG	2	6	7356	7361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854069
91	NC_020410	TCC	2	6	7597	7602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854069
92	NC_020410	CAT	2	6	7803	7808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854069
93	NC_020410	CCG	2	6	7969	7974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854069
94	NC_020410	CTG	2	6	8048	8053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854069
95	NC_020410	TTG	2	6	8388	8393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854069
96	NC_020410	GAA	2	6	8429	8434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854069
97	NC_020410	ATC	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854069
98	NC_020410	GAA	2	6	8456	8461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854069
99	NC_020410	ATG	2	6	8487	8492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854069
100	NC_020410	TCA	2	6	8568	8573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854069
101	NC_020410	TTC	2	6	8723	8728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854069
102	NC_020410	TAA	2	6	8731	8736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854069
103	NC_020410	ATT	2	6	8804	8809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854069
104	NC_020410	ATT	2	6	8849	8854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854069
105	NC_020410	TGA	2	6	8869	8874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854069
106	NC_020410	CTT	2	6	8887	8892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854069
107	NC_020410	ATC	3	9	9029	9037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854069
108	NC_020410	GAA	2	6	9043	9048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854069
109	NC_020410	GAA	2	6	9071	9076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854069
110	NC_020410	GAT	2	6	9134	9139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854069
111	NC_020410	GAA	2	6	9164	9169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854069
112	NC_020410	CAA	2	6	9312	9317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854069
113	NC_020410	ATT	2	6	9338	9343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854069
114	NC_020410	GCG	2	6	9351	9356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854069
115	NC_020410	GAA	2	6	9476	9481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854069
116	NC_020410	GAA	2	6	9488	9493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854069
117	NC_020410	GAA	2	6	9497	9502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854069
118	NC_020410	CGG	2	6	14740	14745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854070
119	NC_020410	ATC	2	6	14746	14751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854070
120	NC_020410	ATC	2	6	14757	14762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854070
121	NC_020410	CAG	2	6	14778	14783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854070
122	NC_020410	ACC	2	6	14789	14794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452854070
123	NC_020410	ATC	2	6	14815	14820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854070
124	NC_020410	AAT	2	6	14847	14852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854070
125	NC_020410	ATG	2	6	15015	15020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854070
126	NC_020410	TTC	2	6	15181	15186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854070
127	NC_020410	TTC	2	6	15198	15203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854070
128	NC_020410	ACA	2	6	15410	15415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854070
129	NC_020410	TTC	2	6	15525	15530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854070
130	NC_020410	AAG	2	6	15766	15771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854071
131	NC_020410	GAT	2	6	15783	15788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854071
132	NC_020410	TCA	2	6	15880	15885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854071
133	NC_020410	GGC	2	6	15942	15947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854071
134	NC_020410	CAG	2	6	15981	15986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854071
135	NC_020410	TTA	2	6	16027	16032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854071
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137	NC_020410	ATC	2	6	16057	16062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854071
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143	NC_020410	CGG	2	6	16766	16771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854071
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146	NC_020410	AGA	2	6	17027	17032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854071
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150	NC_020410	AAG	2	6	17610	17615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854072
151	NC_020410	TGA	2	6	17647	17652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854072
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154	NC_020410	AGA	2	6	17935	17940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854072
155	NC_020410	CTT	2	6	17969	17974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854072
156	NC_020410	ACA	2	6	18014	18019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854072
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159	NC_020410	TGA	2	6	18247	18252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854072
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162	NC_020410	CGG	2	6	18634	18639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854072
163	NC_020410	AAT	2	6	18888	18893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854073
164	NC_020410	GGC	2	6	18946	18951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854073
165	NC_020410	TCA	2	6	18953	18958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854073
166	NC_020410	CGG	2	6	19056	19061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854073
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247	NC_020410	TTG	2	6	26807	26812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854080
248	NC_020410	TGT	2	6	26838	26843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854080
249	NC_020410	GAA	2	6	26980	26985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854081
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376	NC_020410	AGC	2	6	41125	41130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854093
377	NC_020410	AGC	2	6	41314	41319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854093
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379	NC_020410	GCA	2	6	41501	41506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854094
380	NC_020410	GAC	2	6	41837	41842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854094
381	NC_020410	CTG	2	6	41859	41864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854094
382	NC_020410	TTA	2	6	41905	41910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854094
383	NC_020410	AGC	2	6	41914	41919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854094
384	NC_020410	AGA	2	6	41993	41998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854094
385	NC_020410	ATA	2	6	42058	42063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854094
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388	NC_020410	ACA	2	6	42344	42349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854094
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391	NC_020410	TTG	2	6	42558	42563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854095
392	NC_020410	ATG	2	6	42624	42629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854095
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400	NC_020410	ATG	2	6	43089	43094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854095
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496	NC_020410	AGA	2	6	50318	50323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854103
497	NC_020410	AGC	2	6	50389	50394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854103
498	NC_020410	TCT	2	6	50415	50420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854103
499	NC_020410	ATT	2	6	50879	50884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854104
500	NC_020410	TCA	2	6	50976	50981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854104

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