MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-233

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020394	TACAAA	2	12	5095	5106	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452196184
2	NC_020394	ACTGCA	2	12	5174	5185	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	452196184
3	NC_020394	ATAAGA	2	12	5529	5540	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452196184
4	NC_020394	CAAGAA	2	12	6913	6924	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	452196186
5	NC_020394	TTAAAA	2	12	10075	10086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452196189
6	NC_020394	AAAAGA	2	12	14349	14360	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452196194
7	NC_020394	ATTTCA	2	12	15618	15629	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452196196
8	NC_020394	TCTTTG	2	12	16532	16543	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	452196197
9	NC_020394	ATTTTT	2	12	23001	23012	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452196201
10	NC_020394	TGCTTG	2	12	26137	26148	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	452196204
11	NC_020394	GGTAAA	2	12	29685	29696	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452196208
12	NC_020394	TTTTTC	2	12	29903	29914	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452196208
13	NC_020394	TCAATT	2	12	33997	34008	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452196212
14	NC_020394	ATATTA	2	12	37481	37492	50 %	50 %	0 %	0 %	452196213
15	NC_020394	TTCTTT	2	12	41299	41310	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452196213
16	NC_020394	TTTTCT	2	12	43114	43125	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452196215
17	NC_020394	TTTTTC	2	12	46188	46199	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452196215
18	NC_020394	TACGGT	2	12	47041	47052	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452196216
19	NC_020394	CTTATA	2	12	48553	48564	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452196217
20	NC_020394	TTTTCT	2	12	49768	49779	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452196217
21	NC_020394	TCCATA	2	12	52655	52666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452196219
22	NC_020394	CTTCTA	2	12	55752	55763	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	452196219
23	NC_020394	GTACCA	2	12	55781	55792	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	452196219
24	NC_020394	TTAACT	2	12	60138	60149	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452196220
25	NC_020394	TATTTT	2	12	67556	67567	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452196228
26	NC_020394	CTACAA	2	12	69778	69789	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	452196228
27	NC_020394	CATCTT	2	12	70943	70954	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	452196229
28	NC_020394	AATCTA	2	12	75485	75496	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452196229
29	NC_020394	CTTTAT	2	12	76190	76201	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452196229
30	NC_020394	TTTCTT	2	12	77062	77073	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452196230
31	NC_020394	AAATCT	2	12	78255	78266	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452196230
32	NC_020394	TTTACA	2	12	80592	80603	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452196230
33	NC_020394	TGAATT	2	12	82290	82301	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452196230
34	NC_020394	TTCATT	2	12	83288	83299	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452196230
35	NC_020394	CAATAT	2	12	93835	93846	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452196237
36	NC_020394	TTTCAG	2	12	98103	98114	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452196242
37	NC_020394	ATTTTG	2	12	100131	100142	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	452196244
38	NC_020394	TAAAAA	2	12	102060	102071	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	452196246
39	NC_020394	TATGTT	2	12	103045	103056	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	452196247
40	NC_020394	ATATTT	2	12	105496	105507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196249
41	NC_020394	TACTCG	2	12	110013	110024	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	452196255
42	NC_020394	CATTTA	2	12	115647	115658	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452196261
43	NC_020394	TTTAGT	2	12	117691	117702	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	452196263
44	NC_020394	TATTTT	2	12	119283	119294	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452196264
45	NC_020394	TATTTT	2	12	121007	121018	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452196266
46	NC_020394	TTTCAC	2	12	124453	124464	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	452196270
47	NC_020394	GTATTA	2	12	126987	126998	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452196272
48	NC_020394	TTCATT	2	12	127820	127831	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452196272
49	NC_020394	TATTTA	2	12	127874	127885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196273
50	NC_020394	CCTAAA	2	12	129803	129814	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	452196273
51	NC_020394	TAATTT	2	12	130783	130794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196273
52	NC_020394	GATTTA	2	12	131720	131731	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452196274
53	NC_020394	AGAAAA	2	12	137081	137092	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452196281
54	NC_020394	GAAACA	2	12	140785	140796	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	452196283
55	NC_020394	ATTTGT	2	12	150061	150072	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	452196288
56	NC_020394	ACATAG	2	12	151209	151220	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452196288
57	NC_020394	TTTGGT	2	12	153378	153389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452196290
58	NC_020394	CATTTT	2	12	156012	156023	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452196293
59	NC_020394	TTTTGA	2	12	160809	160820	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	452196297
60	NC_020394	TTTGTT	2	12	163772	163783	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	452196300
61	NC_020394	AAATCA	2	12	168210	168221	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452196302
62	NC_020394	AATTAA	2	12	171965	171976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452196304
63	NC_020394	CCAAAT	2	12	172146	172157	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	452196304
64	NC_020394	TTCCAC	2	12	172634	172645	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	452196305
65	NC_020394	TCATTT	2	12	173068	173079	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452196306
66	NC_020394	AAATGA	2	12	176945	176956	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452196309
67	NC_020394	GATGAG	2	12	177552	177563	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	452196309
68	NC_020394	ATGAAG	2	12	177634	177645	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452196309
69	NC_020394	TTGGCG	2	12	177949	177960	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	452196310
70	NC_020394	TTTTAA	2	12	180904	180915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196311
71	NC_020394	GATTTC	2	12	185615	185626	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452196314
72	NC_020394	TAATCA	2	12	186395	186406	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452196316
73	NC_020394	ACAGCA	2	12	186809	186820	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	452196317
74	NC_020394	AGGAGC	2	12	186847	186858	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	452196317
75	NC_020394	TTTGGT	2	12	186986	186997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452196317
76	NC_020394	ACGTGT	2	12	191854	191865	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452196320
77	NC_020394	ATTGTA	2	12	197324	197335	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452196328
78	NC_020394	TTTTTA	2	12	203133	203144	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452196335
79	NC_020394	CAGTGT	2	12	210343	210354	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452196344
80	NC_020394	TAAATA	2	12	212959	212970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452196345
81	NC_020394	AATGTT	2	12	216087	216098	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452196349
82	NC_020394	TATATG	2	12	216163	216174	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452196349
83	NC_020394	TCTCTG	2	12	216475	216486	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	452196349
84	NC_020394	GCTAAT	2	12	216767	216778	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452196350
85	NC_020394	TTAATA	2	12	217476	217487	50 %	50 %	0 %	0 %	452196351
86	NC_020394	CAATAT	2	12	219123	219134	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452196353
87	NC_020394	TCAAAT	2	12	222065	222076	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452196358
88	NC_020394	GCGTTT	2	12	222961	222972	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	452196360
89	NC_020394	AGCCAG	2	12	228081	228092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452196364
90	NC_020394	AAGAGA	2	12	230427	230438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196365
91	NC_020394	ATCAAT	2	12	232262	232273	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452196365

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.