MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-107

Total Repeats: 352

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020393	CTTT	2	8	148	155	0 %	75 %	0 %	25 %	452202696
2	NC_020393	CAGT	2	8	897	904	25 %	25 %	25 %	25 %	452202697
3	NC_020393	TGGT	2	8	1723	1730	0 %	50 %	50 %	0 %	452202697
4	NC_020393	ATAA	2	8	2892	2899	75 %	25 %	0 %	0 %	452202698
5	NC_020393	GATG	2	8	3629	3636	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020393	ATTA	2	8	3727	3734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020393	TTCT	2	8	4085	4092	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020393	AGTA	2	8	4231	4238	50 %	25 %	25 %	0 %	452202699
9	NC_020393	GTAT	2	8	4793	4800	25 %	50 %	25 %	0 %	452202699
10	NC_020393	AGAT	2	8	4865	4872	50 %	25 %	25 %	0 %	452202699
11	NC_020393	GAAT	2	8	4937	4944	50 %	25 %	25 %	0 %	452202699
12	NC_020393	TTTA	2	8	5166	5173	25 %	75 %	0 %	0 %	452202699
13	NC_020393	ATTG	2	8	5253	5260	25 %	50 %	25 %	0 %	452202699
14	NC_020393	TAAT	2	8	5863	5870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020393	TTCC	2	8	5944	5951	0 %	50 %	0 %	50 %	452202700
16	NC_020393	TCCT	2	8	7316	7323	0 %	50 %	0 %	50 %	452202700
17	NC_020393	CCAT	2	8	7349	7356	25 %	25 %	0 %	50 %	452202700
18	NC_020393	GATG	2	8	7427	7434	25 %	25 %	50 %	0 %	452202700
19	NC_020393	TTTC	2	8	7458	7465	0 %	75 %	0 %	25 %	452202700
20	NC_020393	TATT	2	8	8755	8762	25 %	75 %	0 %	0 %	452202700
21	NC_020393	TCGT	2	8	8929	8936	0 %	50 %	25 %	25 %	452202700
22	NC_020393	CTAG	2	8	9363	9370	25 %	25 %	25 %	25 %	452202700
23	NC_020393	TCCT	2	8	10197	10204	0 %	50 %	0 %	50 %	452202701
24	NC_020393	AGGA	2	8	10389	10396	50 %	0 %	50 %	0 %	452202701
25	NC_020393	GTTT	2	8	10467	10474	0 %	75 %	25 %	0 %	452202701
26	NC_020393	CCTT	2	8	11240	11247	0 %	50 %	0 %	50 %	452202703
27	NC_020393	ATTC	2	8	11500	11507	25 %	50 %	0 %	25 %	452202703
28	NC_020393	GATA	2	8	11562	11569	50 %	25 %	25 %	0 %	452202703
29	NC_020393	GTAA	2	8	12120	12127	50 %	25 %	25 %	0 %	452202703
30	NC_020393	GGAT	2	8	12379	12386	25 %	25 %	50 %	0 %	452202703
31	NC_020393	ATTA	2	8	12586	12593	50 %	50 %	0 %	0 %	452202703
32	NC_020393	TGTT	2	8	12662	12669	0 %	75 %	25 %	0 %	452202703
33	NC_020393	AGAA	2	8	12783	12790	75 %	0 %	25 %	0 %	452202703
34	NC_020393	TTAC	2	8	12959	12966	25 %	50 %	0 %	25 %	452202703
35	NC_020393	ACAT	2	8	13051	13058	50 %	25 %	0 %	25 %	452202704
36	NC_020393	ATCT	2	8	13284	13291	25 %	50 %	0 %	25 %	452202704
37	NC_020393	TGTA	2	8	13296	13303	25 %	50 %	25 %	0 %	452202704
38	NC_020393	AGCT	2	8	13866	13873	25 %	25 %	25 %	25 %	452202704
39	NC_020393	TTTA	2	8	14134	14141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020393	GAAA	2	8	14347	14354	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020393	TACA	2	8	14426	14433	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020393	ATTC	2	8	15028	15035	25 %	50 %	0 %	25 %	452202706
43	NC_020393	TCCT	2	8	15159	15166	0 %	50 %	0 %	50 %	452202706
44	NC_020393	TGTT	2	8	15411	15418	0 %	75 %	25 %	0 %	452202707
45	NC_020393	TGCT	2	8	15623	15630	0 %	50 %	25 %	25 %	452202707
46	NC_020393	TTTC	2	8	15984	15991	0 %	75 %	0 %	25 %	452202708
47	NC_020393	CTTC	2	8	16464	16471	0 %	50 %	0 %	50 %	452202708
48	NC_020393	TTCC	2	8	16661	16668	0 %	50 %	0 %	50 %	452202708
49	NC_020393	ATAG	2	8	16815	16822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020393	ATTT	2	8	17304	17311	25 %	75 %	0 %	0 %	452202709
51	NC_020393	TTAT	2	8	17317	17324	25 %	75 %	0 %	0 %	452202709
52	NC_020393	GATG	2	8	17431	17438	25 %	25 %	50 %	0 %	452202709
53	NC_020393	CTTT	2	8	17851	17858	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020393	GAAA	2	8	17922	17929	75 %	0 %	25 %	0 %	452202711
55	NC_020393	GAAA	2	8	18195	18202	75 %	0 %	25 %	0 %	452202712
56	NC_020393	TGAT	2	8	18374	18381	25 %	50 %	25 %	0 %	452202712
57	NC_020393	TTTA	2	8	19610	19617	25 %	75 %	0 %	0 %	452202715
58	NC_020393	TAAT	2	8	19638	19645	50 %	50 %	0 %	0 %	452202715
59	NC_020393	TAGG	2	8	19973	19980	25 %	25 %	50 %	0 %	452202715
60	NC_020393	ATGT	2	8	20251	20258	25 %	50 %	25 %	0 %	452202715
61	NC_020393	ATTA	2	8	21124	21131	50 %	50 %	0 %	0 %	452202716
62	NC_020393	TTTC	2	8	21195	21202	0 %	75 %	0 %	25 %	452202716
63	NC_020393	ATTT	2	8	21234	21241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020393	ATTA	2	8	21435	21442	50 %	50 %	0 %	0 %	452202717
65	NC_020393	AAGA	2	8	21815	21822	75 %	0 %	25 %	0 %	452202717
66	NC_020393	ATAG	2	8	22147	22154	50 %	25 %	25 %	0 %	452202717
67	NC_020393	TTTA	2	8	22371	22378	25 %	75 %	0 %	0 %	452202717
68	NC_020393	GAAA	2	8	22478	22485	75 %	0 %	25 %	0 %	452202718
69	NC_020393	GAAG	2	8	24183	24190	50 %	0 %	50 %	0 %	452202719
70	NC_020393	TAGG	2	8	24448	24455	25 %	25 %	50 %	0 %	452202719
71	NC_020393	AATT	2	8	24705	24712	50 %	50 %	0 %	0 %	452202720
72	NC_020393	TAAA	2	8	24813	24820	75 %	25 %	0 %	0 %	452202720
73	NC_020393	TAGA	2	8	25251	25258	50 %	25 %	25 %	0 %	452202720
74	NC_020393	TGTT	2	8	25296	25303	0 %	75 %	25 %	0 %	452202720
75	NC_020393	TTGC	2	8	25550	25557	0 %	50 %	25 %	25 %	452202720
76	NC_020393	TTGC	2	8	25592	25599	0 %	50 %	25 %	25 %	452202720
77	NC_020393	AATT	2	8	26003	26010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020393	TTGT	2	8	26066	26073	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020393	AATA	2	8	26113	26120	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020393	TAAA	2	8	26553	26560	75 %	25 %	0 %	0 %	452202721
81	NC_020393	TTAA	2	8	26660	26667	50 %	50 %	0 %	0 %	452202721
82	NC_020393	TTTA	2	8	27046	27053	25 %	75 %	0 %	0 %	452202721
83	NC_020393	TACA	2	8	27134	27141	50 %	25 %	0 %	25 %	452202721
84	NC_020393	TTTA	2	8	27202	27209	25 %	75 %	0 %	0 %	452202721
85	NC_020393	GTTC	2	8	27219	27226	0 %	50 %	25 %	25 %	452202721
86	NC_020393	GTAT	2	8	27792	27799	25 %	50 %	25 %	0 %	452202722
87	NC_020393	TTAA	2	8	28039	28046	50 %	50 %	0 %	0 %	452202722
88	NC_020393	ATGA	2	8	28114	28121	50 %	25 %	25 %	0 %	452202722
89	NC_020393	GATG	2	8	28293	28300	25 %	25 %	50 %	0 %	452202722
90	NC_020393	TAAA	2	8	28424	28431	75 %	25 %	0 %	0 %	452202722
91	NC_020393	TTGC	2	8	28636	28643	0 %	50 %	25 %	25 %	452202722
92	NC_020393	CTTT	2	8	29002	29009	0 %	75 %	0 %	25 %	452202722
93	NC_020393	TTAT	2	8	29148	29155	25 %	75 %	0 %	0 %	452202722
94	NC_020393	TTTC	2	8	29839	29846	0 %	75 %	0 %	25 %	452202722
95	NC_020393	ACCC	2	8	30055	30062	25 %	0 %	0 %	75 %	452202722
96	NC_020393	TAAA	2	8	30302	30309	75 %	25 %	0 %	0 %	452202722
97	NC_020393	ATCA	2	8	30446	30453	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_020393	AAGA	2	8	31183	31190	75 %	0 %	25 %	0 %	452202723
99	NC_020393	TGAG	2	8	31857	31864	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020393	GTTT	2	8	32405	32412	0 %	75 %	25 %	0 %	452202724
101	NC_020393	TTGT	2	8	32515	32522	0 %	75 %	25 %	0 %	452202724
102	NC_020393	GATT	2	8	32785	32792	25 %	50 %	25 %	0 %	452202724
103	NC_020393	TTTC	2	8	32894	32901	0 %	75 %	0 %	25 %	452202724
104	NC_020393	GATT	2	8	32987	32994	25 %	50 %	25 %	0 %	452202724
105	NC_020393	GTTC	2	8	33045	33052	0 %	50 %	25 %	25 %	452202724
106	NC_020393	ATAA	2	8	33091	33098	75 %	25 %	0 %	0 %	452202724
107	NC_020393	AATA	2	8	33764	33771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020393	GTAT	2	8	33817	33824	25 %	50 %	25 %	0 %	452202726
109	NC_020393	ATAA	2	8	33915	33922	75 %	25 %	0 %	0 %	452202726
110	NC_020393	GAAA	2	8	34274	34281	75 %	0 %	25 %	0 %	452202726
111	NC_020393	ATTC	2	8	35275	35282	25 %	50 %	0 %	25 %	452202727
112	NC_020393	TGAT	2	8	35850	35857	25 %	50 %	25 %	0 %	452202727
113	NC_020393	ATAA	2	8	36115	36122	75 %	25 %	0 %	0 %	452202728
114	NC_020393	TAAT	2	8	36293	36300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020393	ACAA	2	8	36444	36451	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_020393	TAAA	2	8	36552	36559	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020393	ATTT	2	8	37000	37007	25 %	75 %	0 %	0 %	452202729
118	NC_020393	AAAG	2	8	37096	37103	75 %	0 %	25 %	0 %	452202730
119	NC_020393	TAAA	2	8	37514	37521	75 %	25 %	0 %	0 %	452202730
120	NC_020393	ATTT	2	8	37616	37623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020393	TAAA	2	8	38131	38138	75 %	25 %	0 %	0 %	452202731
122	NC_020393	CTAT	2	8	38155	38162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_020393	TTGT	2	8	38262	38269	0 %	75 %	25 %	0 %	452202732
124	NC_020393	CAAA	2	8	38300	38307	75 %	0 %	0 %	25 %	452202732
125	NC_020393	ATAA	2	8	39484	39491	75 %	25 %	0 %	0 %	452202733
126	NC_020393	TATT	2	8	39533	39540	25 %	75 %	0 %	0 %	452202733
127	NC_020393	AATT	2	8	40018	40025	50 %	50 %	0 %	0 %	452202734
128	NC_020393	CAAC	2	8	40517	40524	50 %	0 %	0 %	50 %	452202734
129	NC_020393	CAAA	2	8	40901	40908	75 %	0 %	0 %	25 %	452202735
130	NC_020393	ACAA	2	8	40939	40946	75 %	0 %	0 %	25 %	452202735
131	NC_020393	AACA	2	8	40947	40954	75 %	0 %	0 %	25 %	452202735
132	NC_020393	TTGT	2	8	41451	41458	0 %	75 %	25 %	0 %	452202735
133	NC_020393	TTTA	2	8	41818	41825	25 %	75 %	0 %	0 %	452202736
134	NC_020393	TAGA	2	8	42053	42060	50 %	25 %	25 %	0 %	452202737
135	NC_020393	TTCT	2	8	42129	42136	0 %	75 %	0 %	25 %	452202737
136	NC_020393	TTTA	2	8	42475	42482	25 %	75 %	0 %	0 %	452202738
137	NC_020393	GTCT	2	8	42732	42739	0 %	50 %	25 %	25 %	452202738
138	NC_020393	AATG	2	8	42967	42974	50 %	25 %	25 %	0 %	452202738
139	NC_020393	ATTT	2	8	43015	43022	25 %	75 %	0 %	0 %	452202738
140	NC_020393	TAAA	2	8	44113	44120	75 %	25 %	0 %	0 %	452202739
141	NC_020393	TAAC	2	8	44395	44402	50 %	25 %	0 %	25 %	452202739
142	NC_020393	CAAA	2	8	44596	44603	75 %	0 %	0 %	25 %	452202739
143	NC_020393	TTTA	2	8	44648	44655	25 %	75 %	0 %	0 %	452202739
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.