MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-63

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020392	ATTCA	2	10	1198	1207	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020392	ATTTT	2	10	2492	2501	20 %	80 %	0 %	0 %	452202049
3	NC_020392	CTGTA	2	10	2736	2745	20 %	40 %	20 %	20 %	452202049
4	NC_020392	TAAGA	2	10	3300	3309	60 %	20 %	20 %	0 %	452202049
5	NC_020392	TTGAA	2	10	5125	5134	40 %	40 %	20 %	0 %	452202050
6	NC_020392	CGTAA	2	10	6731	6740	40 %	20 %	20 %	20 %	452202051
7	NC_020392	ATTAT	2	10	7497	7506	40 %	60 %	0 %	0 %	452202051
8	NC_020392	GAGCC	2	10	8041	8050	20 %	0 %	40 %	40 %	452202051
9	NC_020392	ATTGA	2	10	8489	8498	40 %	40 %	20 %	0 %	452202051
10	NC_020392	TCTCT	2	10	8506	8515	0 %	60 %	0 %	40 %	452202051
11	NC_020392	TGATT	2	10	10337	10346	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020392	ATTTT	2	10	13464	13473	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020392	GAACA	2	10	14248	14257	60 %	0 %	20 %	20 %	452202055
14	NC_020392	TTATT	2	10	15255	15264	20 %	80 %	0 %	0 %	452202056
15	NC_020392	AAATT	2	10	16089	16098	60 %	40 %	0 %	0 %	452202058
16	NC_020392	GCTTC	2	10	19827	19836	0 %	40 %	20 %	40 %	452202062
17	NC_020392	TTGTT	2	10	21733	21742	0 %	80 %	20 %	0 %	452202062
18	NC_020392	AAATA	2	10	23188	23197	80 %	20 %	0 %	0 %	452202062
19	NC_020392	TTTCA	2	10	24481	24490	20 %	60 %	0 %	20 %	452202064
20	NC_020392	ATTTA	2	10	24952	24961	40 %	60 %	0 %	0 %	452202064
21	NC_020392	AAATA	2	10	25216	25225	80 %	20 %	0 %	0 %	452202064
22	NC_020392	GAAAC	2	10	25515	25524	60 %	0 %	20 %	20 %	452202064
23	NC_020392	TTTTC	2	10	25967	25976	0 %	80 %	0 %	20 %	452202064
24	NC_020392	ATTTT	2	10	27228	27237	20 %	80 %	0 %	0 %	452202066
25	NC_020392	AAAAT	2	10	28341	28350	80 %	20 %	0 %	0 %	452202068
26	NC_020392	TAACA	2	10	31076	31085	60 %	20 %	0 %	20 %	452202070
27	NC_020392	TTCCA	2	10	31784	31793	20 %	40 %	0 %	40 %	452202070
28	NC_020392	AAGTT	2	10	32812	32821	40 %	40 %	20 %	0 %	452202072
29	NC_020392	TACCT	2	10	33502	33511	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_020392	TTTAA	2	10	33531	33540	40 %	60 %	0 %	0 %	452202075
31	NC_020392	ATCAC	2	10	34295	34304	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_020392	AAGGG	2	10	34958	34967	40 %	0 %	60 %	0 %	452202079
33	NC_020392	TAGAA	2	10	35276	35285	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020392	CTTTT	2	10	35308	35317	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020392	ATTTA	2	10	35463	35472	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020392	CTTAA	2	10	35515	35524	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_020392	AAGTA	2	10	36067	36076	60 %	20 %	20 %	0 %	452202082
38	NC_020392	ACTAA	2	10	36335	36344	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_020392	ATTCG	2	10	37062	37071	20 %	40 %	20 %	20 %	452202083
40	NC_020392	ATCAA	2	10	37471	37480	60 %	20 %	0 %	20 %	452202083
41	NC_020392	ATTTA	2	10	38513	38522	40 %	60 %	0 %	0 %	452202084
42	NC_020392	ATTCC	2	10	40482	40491	20 %	40 %	0 %	40 %	452202086
43	NC_020392	TTCAT	2	10	40513	40522	20 %	60 %	0 %	20 %	452202086
44	NC_020392	ACCTT	2	10	42550	42559	20 %	40 %	0 %	40 %	452202088
45	NC_020392	ATCTA	2	10	44627	44636	40 %	40 %	0 %	20 %	452202090
46	NC_020392	TTTTC	2	10	45082	45091	0 %	80 %	0 %	20 %	452202090
47	NC_020392	GTTTC	2	10	46610	46619	0 %	60 %	20 %	20 %	452202091
48	NC_020392	CTTCT	2	10	46833	46842	0 %	60 %	0 %	40 %	452202091
49	NC_020392	GATTG	2	10	49282	49291	20 %	40 %	40 %	0 %	452202095
50	NC_020392	AAAGA	2	10	49512	49521	80 %	0 %	20 %	0 %	452202095
51	NC_020392	GGGTA	2	10	49684	49693	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020392	TACTC	2	10	49706	49715	20 %	40 %	0 %	40 %	452202096
53	NC_020392	CTTAC	2	10	50572	50581	20 %	40 %	0 %	40 %	452202098
54	NC_020392	CATTA	2	10	51087	51096	40 %	40 %	0 %	20 %	452202099
55	NC_020392	CATAA	2	10	51924	51933	60 %	20 %	0 %	20 %	452202099
56	NC_020392	ATTTT	2	10	53128	53137	20 %	80 %	0 %	0 %	452202100
57	NC_020392	AAGCA	2	10	53884	53893	60 %	0 %	20 %	20 %	452202101
58	NC_020392	TATCT	2	10	54069	54078	20 %	60 %	0 %	20 %	452202101
59	NC_020392	AAGTT	2	10	57992	58001	40 %	40 %	20 %	0 %	452202104
60	NC_020392	AAGAT	2	10	58010	58019	60 %	20 %	20 %	0 %	452202104
61	NC_020392	CAATA	2	10	58134	58143	60 %	20 %	0 %	20 %	452202104
62	NC_020392	AAAAC	2	10	59166	59175	80 %	0 %	0 %	20 %	452202105
63	NC_020392	CTATT	2	10	60150	60159	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_020392	AAGAA	2	10	60449	60458	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020392	GAAAT	2	10	60557	60566	60 %	20 %	20 %	0 %	452202107
66	NC_020392	ATTTT	2	10	63264	63273	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.