MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-63

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020392	ATTTT	2	10	2492	2501	20 %	80 %	0 %	0 %	452202049
2	NC_020392	CTGTA	2	10	2736	2745	20 %	40 %	20 %	20 %	452202049
3	NC_020392	TAAGA	2	10	3300	3309	60 %	20 %	20 %	0 %	452202049
4	NC_020392	TTGAA	2	10	5125	5134	40 %	40 %	20 %	0 %	452202050
5	NC_020392	CGTAA	2	10	6731	6740	40 %	20 %	20 %	20 %	452202051
6	NC_020392	ATTAT	2	10	7497	7506	40 %	60 %	0 %	0 %	452202051
7	NC_020392	GAGCC	2	10	8041	8050	20 %	0 %	40 %	40 %	452202051
8	NC_020392	ATTGA	2	10	8489	8498	40 %	40 %	20 %	0 %	452202051
9	NC_020392	TCTCT	2	10	8506	8515	0 %	60 %	0 %	40 %	452202051
10	NC_020392	GAACA	2	10	14248	14257	60 %	0 %	20 %	20 %	452202055
11	NC_020392	TTATT	2	10	15255	15264	20 %	80 %	0 %	0 %	452202056
12	NC_020392	AAATT	2	10	16089	16098	60 %	40 %	0 %	0 %	452202058
13	NC_020392	GCTTC	2	10	19827	19836	0 %	40 %	20 %	40 %	452202062
14	NC_020392	TTGTT	2	10	21733	21742	0 %	80 %	20 %	0 %	452202062
15	NC_020392	AAATA	2	10	23188	23197	80 %	20 %	0 %	0 %	452202062
16	NC_020392	TTTCA	2	10	24481	24490	20 %	60 %	0 %	20 %	452202064
17	NC_020392	ATTTA	2	10	24952	24961	40 %	60 %	0 %	0 %	452202064
18	NC_020392	AAATA	2	10	25216	25225	80 %	20 %	0 %	0 %	452202064
19	NC_020392	GAAAC	2	10	25515	25524	60 %	0 %	20 %	20 %	452202064
20	NC_020392	TTTTC	2	10	25967	25976	0 %	80 %	0 %	20 %	452202064
21	NC_020392	ATTTT	2	10	27228	27237	20 %	80 %	0 %	0 %	452202066
22	NC_020392	AAAAT	2	10	28341	28350	80 %	20 %	0 %	0 %	452202068
23	NC_020392	TAACA	2	10	31076	31085	60 %	20 %	0 %	20 %	452202070
24	NC_020392	TTCCA	2	10	31784	31793	20 %	40 %	0 %	40 %	452202070
25	NC_020392	AAGTT	2	10	32812	32821	40 %	40 %	20 %	0 %	452202072
26	NC_020392	TTTAA	2	10	33531	33540	40 %	60 %	0 %	0 %	452202075
27	NC_020392	AAGGG	2	10	34958	34967	40 %	0 %	60 %	0 %	452202079
28	NC_020392	AAGTA	2	10	36067	36076	60 %	20 %	20 %	0 %	452202082
29	NC_020392	ATTCG	2	10	37062	37071	20 %	40 %	20 %	20 %	452202083
30	NC_020392	ATCAA	2	10	37471	37480	60 %	20 %	0 %	20 %	452202083
31	NC_020392	ATTTA	2	10	38513	38522	40 %	60 %	0 %	0 %	452202084
32	NC_020392	ATTCC	2	10	40482	40491	20 %	40 %	0 %	40 %	452202086
33	NC_020392	TTCAT	2	10	40513	40522	20 %	60 %	0 %	20 %	452202086
34	NC_020392	ACCTT	2	10	42550	42559	20 %	40 %	0 %	40 %	452202088
35	NC_020392	ATCTA	2	10	44627	44636	40 %	40 %	0 %	20 %	452202090
36	NC_020392	TTTTC	2	10	45082	45091	0 %	80 %	0 %	20 %	452202090
37	NC_020392	GTTTC	2	10	46610	46619	0 %	60 %	20 %	20 %	452202091
38	NC_020392	CTTCT	2	10	46833	46842	0 %	60 %	0 %	40 %	452202091
39	NC_020392	GATTG	2	10	49282	49291	20 %	40 %	40 %	0 %	452202095
40	NC_020392	AAAGA	2	10	49512	49521	80 %	0 %	20 %	0 %	452202095
41	NC_020392	TACTC	2	10	49706	49715	20 %	40 %	0 %	40 %	452202096
42	NC_020392	CTTAC	2	10	50572	50581	20 %	40 %	0 %	40 %	452202098
43	NC_020392	CATTA	2	10	51087	51096	40 %	40 %	0 %	20 %	452202099
44	NC_020392	CATAA	2	10	51924	51933	60 %	20 %	0 %	20 %	452202099
45	NC_020392	ATTTT	2	10	53128	53137	20 %	80 %	0 %	0 %	452202100
46	NC_020392	AAGCA	2	10	53884	53893	60 %	0 %	20 %	20 %	452202101
47	NC_020392	TATCT	2	10	54069	54078	20 %	60 %	0 %	20 %	452202101
48	NC_020392	AAGTT	2	10	57992	58001	40 %	40 %	20 %	0 %	452202104
49	NC_020392	AAGAT	2	10	58010	58019	60 %	20 %	20 %	0 %	452202104
50	NC_020392	CAATA	2	10	58134	58143	60 %	20 %	0 %	20 %	452202104
51	NC_020392	AAAAC	2	10	59166	59175	80 %	0 %	0 %	20 %	452202105
52	NC_020392	GAAAT	2	10	60557	60566	60 %	20 %	20 %	0 %	452202107

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.