MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-63

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020392	GATT	2	8	662	669	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020392	TGCT	2	8	1510	1517	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020392	TTTG	2	8	1544	1551	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020392	CATA	2	8	1977	1984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020392	CCAG	2	8	2269	2276	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020392	TCGA	2	8	2752	2759	25 %	25 %	25 %	25 %	452202049
7	NC_020392	TCAT	2	8	2867	2874	25 %	50 %	0 %	25 %	452202049
8	NC_020392	GATA	2	8	2878	2885	50 %	25 %	25 %	0 %	452202049
9	NC_020392	TATT	2	8	3375	3382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020392	CTTT	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	452202050
11	NC_020392	GGAG	2	8	4110	4117	25 %	0 %	75 %	0 %	452202050
12	NC_020392	ACCT	2	8	4627	4634	25 %	25 %	0 %	50 %	452202050
13	NC_020392	TGAC	2	8	4979	4986	25 %	25 %	25 %	25 %	452202050
14	NC_020392	CTAG	2	8	5160	5167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020392	AGAA	2	8	5174	5181	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020392	TTAT	2	8	5359	5366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020392	TTCC	2	8	5470	5477	0 %	50 %	0 %	50 %	452202051
18	NC_020392	GTAC	2	8	5705	5712	25 %	25 %	25 %	25 %	452202051
19	NC_020392	GACA	2	8	5899	5906	50 %	0 %	25 %	25 %	452202051
20	NC_020392	CTTC	2	8	8025	8032	0 %	50 %	0 %	50 %	452202051
21	NC_020392	TTAA	2	8	8640	8647	50 %	50 %	0 %	0 %	452202051
22	NC_020392	TTCT	2	8	8809	8816	0 %	75 %	0 %	25 %	452202051
23	NC_020392	CATT	2	8	8865	8872	25 %	50 %	0 %	25 %	452202051
24	NC_020392	TACT	2	8	9053	9060	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020392	CAGC	2	8	9447	9454	25 %	0 %	25 %	50 %	452202052
26	NC_020392	TCTT	2	8	10180	10187	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020392	TTAA	2	8	10438	10445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020392	TCCT	2	8	10543	10550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020392	GGTT	2	8	10670	10677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020392	TTTA	2	8	10954	10961	25 %	75 %	0 %	0 %	452202053
31	NC_020392	ATAG	2	8	11009	11016	50 %	25 %	25 %	0 %	452202053
32	NC_020392	TTTA	2	8	11485	11492	25 %	75 %	0 %	0 %	452202053
33	NC_020392	TTCT	2	8	11892	11899	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020392	TATC	2	8	12782	12789	25 %	50 %	0 %	25 %	452202054
35	NC_020392	AAAG	2	8	13352	13359	75 %	0 %	25 %	0 %	452202054
36	NC_020392	AATA	2	8	13520	13527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020392	GTAT	2	8	13573	13580	25 %	50 %	25 %	0 %	452202055
38	NC_020392	ATAA	2	8	13671	13678	75 %	25 %	0 %	0 %	452202055
39	NC_020392	GAAA	2	8	14030	14037	75 %	0 %	25 %	0 %	452202055
40	NC_020392	ATTC	2	8	15031	15038	25 %	50 %	0 %	25 %	452202056
41	NC_020392	TGAT	2	8	15606	15613	25 %	50 %	25 %	0 %	452202056
42	NC_020392	TCAT	2	8	15673	15680	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020392	AATG	2	8	16346	16353	50 %	25 %	25 %	0 %	452202059
44	NC_020392	ATTT	2	8	16400	16407	25 %	75 %	0 %	0 %	452202059
45	NC_020392	TTTA	2	8	16566	16573	25 %	75 %	0 %	0 %	452202059
46	NC_020392	CATC	2	8	17287	17294	25 %	25 %	0 %	50 %	452202060
47	NC_020392	TTAC	2	8	17436	17443	25 %	50 %	0 %	25 %	452202060
48	NC_020392	CGGA	2	8	17448	17455	25 %	0 %	50 %	25 %	452202060
49	NC_020392	AAAG	2	8	17473	17480	75 %	0 %	25 %	0 %	452202060
50	NC_020392	CTGT	2	8	18745	18752	0 %	50 %	25 %	25 %	452202061
51	NC_020392	TTGT	2	8	19328	19335	0 %	75 %	25 %	0 %	452202061
52	NC_020392	ATAA	2	8	19413	19420	75 %	25 %	0 %	0 %	452202061
53	NC_020392	AAAC	2	8	19469	19476	75 %	0 %	0 %	25 %	452202061
54	NC_020392	CCAT	2	8	19486	19493	25 %	25 %	0 %	50 %	452202061
55	NC_020392	CTTT	2	8	19519	19526	0 %	75 %	0 %	25 %	452202061
56	NC_020392	TATT	2	8	19785	19792	25 %	75 %	0 %	0 %	452202062
57	NC_020392	CATT	2	8	20952	20959	25 %	50 %	0 %	25 %	452202062
58	NC_020392	TCCT	2	8	21082	21089	0 %	50 %	0 %	50 %	452202062
59	NC_020392	TGTT	2	8	21646	21653	0 %	75 %	25 %	0 %	452202062
60	NC_020392	CCAT	2	8	21842	21849	25 %	25 %	0 %	50 %	452202062
61	NC_020392	ATCC	2	8	21861	21868	25 %	25 %	0 %	50 %	452202062
62	NC_020392	TGCC	2	8	21876	21883	0 %	25 %	25 %	50 %	452202062
63	NC_020392	ATAA	2	8	22199	22206	75 %	25 %	0 %	0 %	452202062
64	NC_020392	AGCA	2	8	22226	22233	50 %	0 %	25 %	25 %	452202062
65	NC_020392	ATTT	2	8	22398	22405	25 %	75 %	0 %	0 %	452202062
66	NC_020392	TTTG	2	8	22520	22527	0 %	75 %	25 %	0 %	452202062
67	NC_020392	CTTA	2	8	22558	22565	25 %	50 %	0 %	25 %	452202062
68	NC_020392	ATTC	2	8	22597	22604	25 %	50 %	0 %	25 %	452202062
69	NC_020392	ATAA	2	8	22717	22724	75 %	25 %	0 %	0 %	452202062
70	NC_020392	TATC	2	8	23058	23065	25 %	50 %	0 %	25 %	452202062
71	NC_020392	ATTC	2	8	23543	23550	25 %	50 %	0 %	25 %	452202063
72	NC_020392	TATC	2	8	23636	23643	25 %	50 %	0 %	25 %	452202063
73	NC_020392	TCGC	2	8	24059	24066	0 %	25 %	25 %	50 %	452202064
74	NC_020392	CGCT	2	8	25358	25365	0 %	25 %	25 %	50 %	452202064
75	NC_020392	TACT	2	8	25416	25423	25 %	50 %	0 %	25 %	452202064
76	NC_020392	TAAA	2	8	26190	26197	75 %	25 %	0 %	0 %	452202064
77	NC_020392	TAAA	2	8	26641	26648	75 %	25 %	0 %	0 %	452202065
78	NC_020392	AACA	2	8	26807	26814	75 %	0 %	0 %	25 %	452202065
79	NC_020392	TAAC	2	8	27121	27128	50 %	25 %	0 %	25 %	452202066
80	NC_020392	TCCA	2	8	27185	27192	25 %	25 %	0 %	50 %	452202066
81	NC_020392	CTTT	2	8	27376	27383	0 %	75 %	0 %	25 %	452202067
82	NC_020392	ATAC	2	8	27463	27470	50 %	25 %	0 %	25 %	452202067
83	NC_020392	CTTT	2	8	28167	28174	0 %	75 %	0 %	25 %	452202067
84	NC_020392	ATCC	2	8	28790	28797	25 %	25 %	0 %	50 %	452202069
85	NC_020392	TTTC	2	8	29114	29121	0 %	75 %	0 %	25 %	452202069
86	NC_020392	TAAT	2	8	29397	29404	50 %	50 %	0 %	0 %	452202070
87	NC_020392	CATT	2	8	30048	30055	25 %	50 %	0 %	25 %	452202070
88	NC_020392	ACAA	2	8	30284	30291	75 %	0 %	0 %	25 %	452202070
89	NC_020392	TCCA	2	8	30585	30592	25 %	25 %	0 %	50 %	452202070
90	NC_020392	TTCA	2	8	31241	31248	25 %	50 %	0 %	25 %	452202070
91	NC_020392	TAAA	2	8	31349	31356	75 %	25 %	0 %	0 %	452202070
92	NC_020392	AACG	2	8	31488	31495	50 %	0 %	25 %	25 %	452202070
93	NC_020392	TTTC	2	8	31612	31619	0 %	75 %	0 %	25 %	452202070
94	NC_020392	TAAA	2	8	32003	32010	75 %	25 %	0 %	0 %	452202070
95	NC_020392	AATA	2	8	32255	32262	75 %	25 %	0 %	0 %	452202070
96	NC_020392	CAAA	2	8	32346	32353	75 %	0 %	0 %	25 %	452202070
97	NC_020392	CAAT	2	8	32578	32585	50 %	25 %	0 %	25 %	452202071
98	NC_020392	TGCC	2	8	32784	32791	0 %	25 %	25 %	50 %	452202072
99	NC_020392	TTTC	2	8	32866	32873	0 %	75 %	0 %	25 %	452202072
100	NC_020392	ACAA	2	8	32919	32926	75 %	0 %	0 %	25 %	452202072
101	NC_020392	CAAA	2	8	33153	33160	75 %	0 %	0 %	25 %	452202073
102	NC_020392	TTTC	2	8	34062	34069	0 %	75 %	0 %	25 %	452202076
103	NC_020392	TAAA	2	8	34346	34353	75 %	25 %	0 %	0 %	452202077
104	NC_020392	CCTT	2	8	34661	34668	0 %	50 %	0 %	50 %	452202078
105	NC_020392	TAAA	2	8	35111	35118	75 %	25 %	0 %	0 %	452202080
106	NC_020392	TAAC	2	8	35322	35329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020392	TTAC	2	8	35482	35489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_020392	TCCT	2	8	35965	35972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020392	ATAA	2	8	36285	36292	75 %	25 %	0 %	0 %	452202082
110	NC_020392	ATTT	2	8	36315	36322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020392	ATTA	2	8	36324	36331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020392	TAGA	2	8	36523	36530	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020392	GTAA	2	8	37149	37156	50 %	25 %	25 %	0 %	452202083
114	NC_020392	TTCC	2	8	37424	37431	0 %	50 %	0 %	50 %	452202083
115	NC_020392	AGAA	2	8	38983	38990	75 %	0 %	25 %	0 %	452202085
116	NC_020392	CCTT	2	8	39050	39057	0 %	50 %	0 %	50 %	452202085
117	NC_020392	AAGC	2	8	39121	39128	50 %	0 %	25 %	25 %	452202085
118	NC_020392	GAAT	2	8	39320	39327	50 %	25 %	25 %	0 %	452202085
119	NC_020392	TAAA	2	8	39479	39486	75 %	25 %	0 %	0 %	452202085
120	NC_020392	AATT	2	8	39894	39901	50 %	50 %	0 %	0 %	452202085
121	NC_020392	TAAA	2	8	40082	40089	75 %	25 %	0 %	0 %	452202086
122	NC_020392	CTTT	2	8	41117	41124	0 %	75 %	0 %	25 %	452202086
123	NC_020392	AATT	2	8	41151	41158	50 %	50 %	0 %	0 %	452202086
124	NC_020392	TAAA	2	8	41260	41267	75 %	25 %	0 %	0 %	452202086
125	NC_020392	CTTC	2	8	41973	41980	0 %	50 %	0 %	50 %	452202087
126	NC_020392	TTTC	2	8	42012	42019	0 %	75 %	0 %	25 %	452202087
127	NC_020392	ATCC	2	8	44089	44096	25 %	25 %	0 %	50 %	452202090
128	NC_020392	AGGA	2	8	44132	44139	50 %	0 %	50 %	0 %	452202090
129	NC_020392	GTTT	2	8	44417	44424	0 %	75 %	25 %	0 %	452202090
130	NC_020392	TTTA	2	8	44654	44661	25 %	75 %	0 %	0 %	452202090
131	NC_020392	TCTT	2	8	45231	45238	0 %	75 %	0 %	25 %	452202090
132	NC_020392	GTAC	2	8	45486	45493	25 %	25 %	25 %	25 %	452202090
133	NC_020392	TAAA	2	8	46751	46758	75 %	25 %	0 %	0 %	452202091
134	NC_020392	ACAA	2	8	47587	47594	75 %	0 %	0 %	25 %	452202092
135	NC_020392	ATCA	2	8	48245	48252	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_020392	TTCA	2	8	48432	48439	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_020392	CTTT	2	8	48734	48741	0 %	75 %	0 %	25 %	452202093
138	NC_020392	TTAT	2	8	48912	48919	25 %	75 %	0 %	0 %	452202094
139	NC_020392	ATCA	2	8	49185	49192	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_020392	AAAT	2	8	49797	49804	75 %	25 %	0 %	0 %	452202096
141	NC_020392	ATAA	2	8	49956	49963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020392	TTTC	2	8	50103	50110	0 %	75 %	0 %	25 %	452202097
143	NC_020392	AAAT	2	8	50282	50289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020392	CCTC	2	8	50486	50493	0 %	25 %	0 %	75 %	452202098
145	NC_020392	GAAT	2	8	50563	50570	50 %	25 %	25 %	0 %	452202098
146	NC_020392	CTGG	2	8	51010	51017	0 %	25 %	50 %	25 %	452202099
147	NC_020392	AAAG	2	8	51147	51154	75 %	0 %	25 %	0 %	452202099
148	NC_020392	TAAC	2	8	51245	51252	50 %	25 %	0 %	25 %	452202099
149	NC_020392	ACTG	2	8	51569	51576	25 %	25 %	25 %	25 %	452202099
150	NC_020392	AATT	2	8	52158	52165	50 %	50 %	0 %	0 %	452202099
151	NC_020392	TTAG	2	8	52264	52271	25 %	50 %	25 %	0 %	452202099
152	NC_020392	AATC	2	8	52800	52807	50 %	25 %	0 %	25 %	452202100
153	NC_020392	GCCA	2	8	53006	53013	25 %	0 %	25 %	50 %	452202100
154	NC_020392	TAAA	2	8	53337	53344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020392	TTCT	2	8	53370	53377	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_020392	TAAT	2	8	53396	53403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_020392	CCAC	2	8	53680	53687	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
158	NC_020392	GAAA	2	8	54216	54223	75 %	0 %	25 %	0 %	452202101
159	NC_020392	TCTG	2	8	54535	54542	0 %	50 %	25 %	25 %	452202101
160	NC_020392	TAAA	2	8	55134	55141	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_020392	ATCA	2	8	55286	55293	50 %	25 %	0 %	25 %	452202102
162	NC_020392	GAAT	2	8	55861	55868	50 %	25 %	25 %	0 %	452202102
163	NC_020392	CTTT	2	8	56861	56868	0 %	75 %	0 %	25 %	452202103
164	NC_020392	TTTA	2	8	57220	57227	25 %	75 %	0 %	0 %	452202103
165	NC_020392	ATAC	2	8	57319	57326	50 %	25 %	0 %	25 %	452202103
166	NC_020392	GTTT	2	8	58046	58053	0 %	75 %	25 %	0 %	452202104
167	NC_020392	TAGT	2	8	58259	58266	25 %	50 %	25 %	0 %	452202104
168	NC_020392	AGTT	2	8	58467	58474	25 %	50 %	25 %	0 %	452202104
169	NC_020392	AAAT	2	8	59049	59056	75 %	25 %	0 %	0 %	452202104
170	NC_020392	ATGG	2	8	59185	59192	25 %	25 %	50 %	0 %	452202105
171	NC_020392	GATG	2	8	59858	59865	25 %	25 %	50 %	0 %	452202106
172	NC_020392	GAAT	2	8	59921	59928	50 %	25 %	25 %	0 %	452202106
173	NC_020392	GCCG	2	8	59934	59941	0 %	0 %	50 %	50 %	452202106
174	NC_020392	AAAT	2	8	60334	60341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_020392	ATCT	2	8	60648	60655	25 %	50 %	0 %	25 %	452202107
176	NC_020392	ACAA	2	8	61096	61103	75 %	0 %	0 %	25 %	452202107
177	NC_020392	TTCT	2	8	61692	61699	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
178	NC_020392	AGGT	2	8	62239	62246	25 %	25 %	50 %	0 %	452202108
179	NC_020392	TATC	2	8	62582	62589	25 %	50 %	0 %	25 %	452202108
180	NC_020392	AAAG	2	8	63152	63159	75 %	0 %	25 %	0 %	452202108
181	NC_020392	ATTG	2	8	63673	63680	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_020392	TTTA	2	8	63688	63695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.