MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-63

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020392	GT	3	6	169	174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020392	TA	3	6	916	921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020392	AC	3	6	2961	2966	50 %	0 %	0 %	50 %	452202049
4	NC_020392	AT	3	6	3511	3516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020392	AT	3	6	4171	4176	50 %	50 %	0 %	0 %	452202050
6	NC_020392	AT	3	6	4488	4493	50 %	50 %	0 %	0 %	452202050
7	NC_020392	GA	3	6	4957	4962	50 %	0 %	50 %	0 %	452202050
8	NC_020392	AT	3	6	5421	5426	50 %	50 %	0 %	0 %	452202051
9	NC_020392	TC	3	6	6309	6314	0 %	50 %	0 %	50 %	452202051
10	NC_020392	TA	3	6	7097	7102	50 %	50 %	0 %	0 %	452202051
11	NC_020392	TC	3	6	8373	8378	0 %	50 %	0 %	50 %	452202051
12	NC_020392	CT	3	6	8546	8551	0 %	50 %	0 %	50 %	452202051
13	NC_020392	TA	4	8	9162	9169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020392	AT	3	6	10033	10038	50 %	50 %	0 %	0 %	452202052
15	NC_020392	GT	3	6	10103	10108	0 %	50 %	50 %	0 %	452202052
16	NC_020392	AT	4	8	10429	10436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020392	TA	3	6	10968	10973	50 %	50 %	0 %	0 %	452202053
18	NC_020392	AT	3	6	11534	11539	50 %	50 %	0 %	0 %	452202053
19	NC_020392	AT	3	6	11634	11639	50 %	50 %	0 %	0 %	452202053
20	NC_020392	AT	3	6	12215	12220	50 %	50 %	0 %	0 %	452202054
21	NC_020392	TA	3	6	12347	12352	50 %	50 %	0 %	0 %	452202054
22	NC_020392	TA	3	6	12579	12584	50 %	50 %	0 %	0 %	452202054
23	NC_020392	TA	3	6	12612	12617	50 %	50 %	0 %	0 %	452202054
24	NC_020392	CG	3	6	12772	12777	0 %	0 %	50 %	50 %	452202054
25	NC_020392	AT	3	6	12897	12902	50 %	50 %	0 %	0 %	452202054
26	NC_020392	GT	4	8	13400	13407	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020392	AT	3	6	14688	14693	50 %	50 %	0 %	0 %	452202055
28	NC_020392	TA	3	6	14851	14856	50 %	50 %	0 %	0 %	452202055
29	NC_020392	AT	3	6	15706	15711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020392	TA	3	6	15726	15731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020392	CT	3	6	15953	15958	0 %	50 %	0 %	50 %	452202058
32	NC_020392	CT	3	6	15985	15990	0 %	50 %	0 %	50 %	452202058
33	NC_020392	TC	3	6	16241	16246	0 %	50 %	0 %	50 %	452202059
34	NC_020392	AC	3	6	17018	17023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020392	AC	3	6	18040	18045	50 %	0 %	0 %	50 %	452202060
36	NC_020392	AT	3	6	18465	18470	50 %	50 %	0 %	0 %	452202061
37	NC_020392	TA	3	6	19049	19054	50 %	50 %	0 %	0 %	452202061
38	NC_020392	AC	3	6	19288	19293	50 %	0 %	0 %	50 %	452202061
39	NC_020392	CT	3	6	21088	21093	0 %	50 %	0 %	50 %	452202062
40	NC_020392	AC	4	8	22655	22662	50 %	0 %	0 %	50 %	452202062
41	NC_020392	AT	3	6	22726	22731	50 %	50 %	0 %	0 %	452202062
42	NC_020392	AT	3	6	23584	23589	50 %	50 %	0 %	0 %	452202063
43	NC_020392	AT	3	6	25048	25053	50 %	50 %	0 %	0 %	452202064
44	NC_020392	AT	3	6	25459	25464	50 %	50 %	0 %	0 %	452202064
45	NC_020392	TA	3	6	26926	26931	50 %	50 %	0 %	0 %	452202065
46	NC_020392	CT	3	6	27241	27246	0 %	50 %	0 %	50 %	452202067
47	NC_020392	AT	3	6	27270	27275	50 %	50 %	0 %	0 %	452202067
48	NC_020392	AT	3	6	29185	29190	50 %	50 %	0 %	0 %	452202069
49	NC_020392	TA	3	6	30627	30632	50 %	50 %	0 %	0 %	452202070
50	NC_020392	AT	3	6	30658	30663	50 %	50 %	0 %	0 %	452202070
51	NC_020392	CT	3	6	30776	30781	0 %	50 %	0 %	50 %	452202070
52	NC_020392	TC	3	6	30875	30880	0 %	50 %	0 %	50 %	452202070
53	NC_020392	TC	3	6	31336	31341	0 %	50 %	0 %	50 %	452202070
54	NC_020392	TA	3	6	31948	31953	50 %	50 %	0 %	0 %	452202070
55	NC_020392	TA	3	6	32215	32220	50 %	50 %	0 %	0 %	452202070
56	NC_020392	CT	3	6	32489	32494	0 %	50 %	0 %	50 %	452202071
57	NC_020392	AC	3	6	32912	32917	50 %	0 %	0 %	50 %	452202072
58	NC_020392	AT	3	6	33827	33832	50 %	50 %	0 %	0 %	452202076
59	NC_020392	AT	3	6	33892	33897	50 %	50 %	0 %	0 %	452202076
60	NC_020392	CT	3	6	34502	34507	0 %	50 %	0 %	50 %	452202077
61	NC_020392	TA	3	6	35363	35368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020392	AT	3	6	35380	35385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020392	CT	3	6	35814	35819	0 %	50 %	0 %	50 %	452202081
64	NC_020392	AT	3	6	36863	36868	50 %	50 %	0 %	0 %	452202083
65	NC_020392	CA	3	6	37899	37904	50 %	0 %	0 %	50 %	452202083
66	NC_020392	TA	3	6	37986	37991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020392	AT	3	6	40235	40240	50 %	50 %	0 %	0 %	452202086
68	NC_020392	TC	3	6	40357	40362	0 %	50 %	0 %	50 %	452202086
69	NC_020392	TG	3	6	41235	41240	0 %	50 %	50 %	0 %	452202086
70	NC_020392	AT	3	6	41445	41450	50 %	50 %	0 %	0 %	452202087
71	NC_020392	CT	3	6	41856	41861	0 %	50 %	0 %	50 %	452202087
72	NC_020392	CT	3	6	41927	41932	0 %	50 %	0 %	50 %	452202087
73	NC_020392	AT	3	6	42161	42166	50 %	50 %	0 %	0 %	452202087
74	NC_020392	CT	3	6	42817	42822	0 %	50 %	0 %	50 %	452202088
75	NC_020392	AT	3	6	44248	44253	50 %	50 %	0 %	0 %	452202090
76	NC_020392	AT	3	6	45252	45257	50 %	50 %	0 %	0 %	452202090
77	NC_020392	TA	3	6	45289	45294	50 %	50 %	0 %	0 %	452202090
78	NC_020392	AT	3	6	45631	45636	50 %	50 %	0 %	0 %	452202090
79	NC_020392	TA	3	6	45743	45748	50 %	50 %	0 %	0 %	452202090
80	NC_020392	AT	3	6	47410	47415	50 %	50 %	0 %	0 %	452202092
81	NC_020392	AT	4	8	47573	47580	50 %	50 %	0 %	0 %	452202092
82	NC_020392	AT	3	6	47613	47618	50 %	50 %	0 %	0 %	452202092
83	NC_020392	AT	3	6	47695	47700	50 %	50 %	0 %	0 %	452202092
84	NC_020392	AC	3	6	47777	47782	50 %	0 %	0 %	50 %	452202092
85	NC_020392	TA	3	6	47942	47947	50 %	50 %	0 %	0 %	452202092
86	NC_020392	CA	3	6	48141	48146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020392	TA	3	6	50218	50223	50 %	50 %	0 %	0 %	452202097
88	NC_020392	TA	3	6	50263	50268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020392	TA	3	6	50889	50894	50 %	50 %	0 %	0 %	452202098
90	NC_020392	CA	3	6	50897	50902	50 %	0 %	0 %	50 %	452202098
91	NC_020392	TA	4	8	51213	51220	50 %	50 %	0 %	0 %	452202099
92	NC_020392	CG	3	6	51481	51486	0 %	0 %	50 %	50 %	452202099
93	NC_020392	AT	3	6	51911	51916	50 %	50 %	0 %	0 %	452202099
94	NC_020392	AT	3	6	51981	51986	50 %	50 %	0 %	0 %	452202099
95	NC_020392	AT	3	6	52318	52323	50 %	50 %	0 %	0 %	452202099
96	NC_020392	AT	3	6	52627	52632	50 %	50 %	0 %	0 %	452202100
97	NC_020392	GC	3	6	53279	53284	0 %	0 %	50 %	50 %	452202100
98	NC_020392	TA	3	6	53425	53430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020392	AT	3	6	53484	53489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020392	AT	3	6	53574	53579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020392	TA	4	8	53587	53594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020392	TG	3	6	54098	54103	0 %	50 %	50 %	0 %	452202101
103	NC_020392	TA	3	6	56043	56048	50 %	50 %	0 %	0 %	452202103
104	NC_020392	AT	3	6	56206	56211	50 %	50 %	0 %	0 %	452202103
105	NC_020392	CA	3	6	58421	58426	50 %	0 %	0 %	50 %	452202104
106	NC_020392	CG	3	6	58528	58533	0 %	0 %	50 %	50 %	452202104
107	NC_020392	AT	3	6	59548	59553	50 %	50 %	0 %	0 %	452202105
108	NC_020392	AT	3	6	59640	59645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020392	TA	3	6	59787	59792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020392	AT	3	6	59799	59804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020392	TA	3	6	59815	59820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020392	AT	4	8	59836	59843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020392	AT	3	6	60193	60198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020392	AG	3	6	60544	60549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020392	TA	3	6	60551	60556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020392	TA	4	8	61545	61552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020392	AT	3	6	62015	62020	50 %	50 %	0 %	0 %	452202108
118	NC_020392	TA	3	6	62147	62152	50 %	50 %	0 %	0 %	452202108
119	NC_020392	TA	3	6	62379	62384	50 %	50 %	0 %	0 %	452202108
120	NC_020392	TA	3	6	62412	62417	50 %	50 %	0 %	0 %	452202108
121	NC_020392	AT	3	6	62697	62702	50 %	50 %	0 %	0 %	452202108
122	NC_020392	GT	4	8	63200	63207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020392	AT	3	6	63542	63547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020392	CA	3	6	63557	63562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.