MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Natronomonas moolapensis 8.8.11 complete genome

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020388	TCCGAC	2	12	14067	14078	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020388	TTATAT	2	12	24577	24588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020388	TGAGAG	2	12	26451	26462	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020388	CGTGAC	2	12	63949	63960	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020388	TTTCAC	2	12	91486	91497	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020388	TACACC	2	12	104173	104184	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020388	CATATT	2	12	143278	143289	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_020388	CGGTGC	2	12	159231	159242	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020388	AGCGCG	2	12	186153	186164	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020388	CGACCG	2	12	197718	197729	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020388	GGTCGT	3	18	220033	220050	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020388	GTCGCG	2	12	243963	243974	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020388	GTGGGC	2	12	257684	257695	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_020388	ATGAGA	2	12	258668	258679	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020388	ACGCCA	2	12	283609	283620	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020388	CGGCGA	2	12	283902	283913	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020388	AACGGA	2	12	298520	298531	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020388	CGGCCG	2	12	312065	312076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020388	TCTCCG	2	12	328593	328604	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020388	ACCGAC	2	12	364916	364927	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020388	CGCCCC	2	12	387284	387295	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
22	NC_020388	GGATAA	2	12	388815	388826	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020388	CGGACG	2	12	397864	397875	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020388	ATCGAA	2	12	451393	451404	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020388	TTGTGT	2	12	452474	452485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020388	CTCGCG	2	12	514455	514466	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020388	GCCAAC	2	12	518124	518135	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020388	GTCCGC	2	12	529768	529779	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020388	GCCAAC	2	12	592219	592230	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_020388	TCAATC	2	12	596824	596835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020388	TGAGTG	2	12	603967	603978	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020388	GATCGA	2	12	604781	604792	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020388	GTAGCG	2	12	610737	610748	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020388	CACCGA	2	12	611079	611090	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020388	CTTCGA	2	12	611248	611259	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020388	ATCAGT	2	12	688858	688869	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020388	TGTCGG	5	30	690524	690553	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020388	AAAATC	2	12	700612	700623	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020388	ACCGAC	2	12	726780	726791	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020388	CGAACG	2	12	753237	753248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020388	GTCGAG	2	12	814327	814338	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020388	TCCCAC	2	12	814727	814738	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_020388	GTCGCG	2	12	817437	817448	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020388	GACGCG	2	12	847078	847089	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020388	TCGCCG	2	12	937240	937251	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020388	CGTCGC	2	12	943598	943609	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020388	CGTACC	2	12	1008666	1008677	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020388	CGCGAG	2	12	1014660	1014671	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020388	AATATA	2	12	1058905	1058916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020388	CGGCGA	2	12	1067339	1067350	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020388	GGTCGC	2	12	1069747	1069758	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020388	CCCCGG	3	18	1070733	1070750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_020388	CAGGCG	2	12	1086744	1086755	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020388	CCGACG	2	12	1087477	1087488	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020388	GGCGAC	2	12	1114794	1114805	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020388	TCGGCG	2	12	1160246	1160257	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020388	CGGGGG	2	12	1168699	1168710	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020388	GCGATC	2	12	1230380	1230391	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020388	CGGCGA	2	12	1263893	1263904	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020388	GCCGTC	2	12	1267434	1267445	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020388	GCGCCG	2	12	1296609	1296620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020388	ACGCCG	2	12	1330591	1330602	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020388	CTCCGA	2	12	1374835	1374846	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020388	CTCCGA	2	12	1374851	1374862	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020388	CATCCG	2	12	1384283	1384294	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020388	CGATAC	2	12	1408336	1408347	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020388	GTACGA	2	12	1408934	1408945	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_020388	GTGGTC	2	12	1420811	1420822	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020388	GTGGTC	2	12	1420835	1420846	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_020388	GTGGTC	2	12	1420859	1420870	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_020388	GTGGTC	2	12	1420883	1420894	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_020388	GTGGTC	2	12	1420907	1420918	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020388	GTGGTC	2	12	1420931	1420942	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_020388	AGTGAA	2	12	1443546	1443557	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020388	CGTCTC	2	12	1449553	1449564	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020388	GCTGTC	2	12	1449745	1449756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020388	CGCCCA	2	12	1459180	1459191	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_020388	TCTGGA	2	12	1477262	1477273	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_020388	AGGGGA	2	12	1478930	1478941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020388	ACTCGG	2	12	1501973	1501984	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020388	GGCGGG	2	12	1502801	1502812	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_020388	TCCGAC	2	12	1512837	1512848	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020388	GTTTAT	2	12	1525838	1525849	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020388	ATTCCG	2	12	1527792	1527803	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020388	TGTTAT	2	12	1540019	1540030	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020388	GTGAAA	2	12	1565226	1565237	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020388	GAGGGG	2	12	1565308	1565319	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020388	GTATAA	2	12	1570114	1570125	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020388	GATAGC	2	12	1570382	1570393	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_020388	AAGCCG	2	12	1615025	1615036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020388	TCTCAC	2	12	1645679	1645690	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020388	GACGGG	2	12	1661137	1661148	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020388	GCGTTC	2	12	1679511	1679522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020388	CGTTCG	2	12	1698528	1698539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020388	GCCCCG	2	12	1715845	1715856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_020388	ACGCCG	2	12	1724144	1724155	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020388	ACCCCC	2	12	1841352	1841363	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
98	NC_020388	CGGCGA	2	12	1845450	1845461	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020388	CGTCGG	2	12	1857278	1857289	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020388	GTTCCT	2	12	1868232	1868243	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020388	CAACCA	2	12	1876438	1876449	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020388	GTAGCG	2	12	1925086	1925097	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_020388	CACCGA	2	12	1925844	1925855	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020388	CGGGGT	2	12	1950613	1950624	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_020388	CACCGA	2	12	1991598	1991609	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020388	CGCCGG	2	12	2010459	2010470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020388	CGAACC	2	12	2051450	2051461	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020388	TCCGCC	2	12	2087886	2087897	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_020388	GTCGGT	2	12	2098643	2098654	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_020388	GTACGA	2	12	2108716	2108727	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_020388	ACGTGT	2	12	2109066	2109077	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_020388	CGAACG	2	12	2128295	2128306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020388	CGCAGG	2	12	2131483	2131494	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020388	ACCGAG	2	12	2131854	2131865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020388	AGTGAA	3	18	2163526	2163543	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020388	GGCTGT	2	12	2184916	2184927	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_020388	TCGATC	2	12	2193175	2193186	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020388	GTCGGC	2	12	2203966	2203977	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_020388	GTCCGG	2	12	2260608	2260619	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020388	TCGCCC	2	12	2263630	2263641	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_020388	TGTCGG	2	12	2276087	2276098	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_020388	GCCTCG	2	12	2279448	2279459	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020388	ACCGGA	2	12	2283846	2283857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020388	GCTCCA	2	12	2306704	2306715	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020388	GGTGAC	2	12	2326337	2326348	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_020388	GGTGAC	2	12	2326361	2326372	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_020388	GGCTCA	2	12	2329888	2329899	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020388	TATATT	2	12	2372067	2372078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020388	GGTGTG	2	12	2373944	2373955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020388	TCGACG	2	12	2376008	2376019	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_020388	ATCCGA	2	12	2413302	2413313	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020388	TGCGTA	2	12	2430685	2430696	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_020388	TAGACG	2	12	2430907	2430918	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_020388	TCCGGG	3	18	2446209	2446226	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_020388	TCCTCG	2	12	2446635	2446646	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020388	ATCCGA	2	12	2474214	2474225	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020388	GCTACC	2	12	2474350	2474361	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020388	GCTGTC	2	12	2500378	2500389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020388	TTCGGT	2	12	2524785	2524796	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_020388	GCCGAG	2	12	2549831	2549842	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_020388	GCGAGC	2	12	2569575	2569586	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_020388	TGCCGG	2	12	2576531	2576542	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_020388	TCGCCG	2	12	2578907	2578918	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020388	CGGCGC	2	12	2618734	2618745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_020388	TCACCG	2	12	2619300	2619311	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020388	GGCTCC	2	12	2664778	2664789	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020388	GCCACA	2	12	2674962	2674973	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
148	NC_020388	TTCGCG	2	12	2687539	2687550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_020388	CGACGC	2	12	2689389	2689400	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020388	GAGGGC	2	12	2693335	2693346	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_020388	CGCCCG	2	12	2736312	2736323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_020388	ACCGAC	2	12	2744230	2744241	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
153	NC_020388	GCCGAA	2	12	2780813	2780824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_020388	CGTCCG	2	12	2787112	2787123	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
155	NC_020388	TCGAAA	2	12	2833147	2833158	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_020388	GAGGGT	2	12	2862225	2862236	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_020388	ACGTTC	2	12	2882715	2882726	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.