MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Dehalococcoides mccartyi DCMB5

Total Repeats: 433

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020386	CTTG	2	8	118	125	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020386	GGGA	2	8	248	255	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020386	TGGC	2	8	6001	6008	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020386	CTTT	2	8	12334	12341	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020386	AGAT	2	8	12344	12351	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020386	AGGG	2	8	12428	12435	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020386	TAAA	2	8	12461	12468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020386	AATC	2	8	15573	15580	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020386	GCTT	2	8	20304	20311	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020386	TAAA	2	8	24054	24061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020386	GAAA	2	8	29850	29857	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020386	AAAT	2	8	29858	29865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020386	CTTT	2	8	35068	35075	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020386	GCGA	2	8	48140	48147	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020386	TTCT	2	8	48334	48341	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020386	TGGA	2	8	50248	50255	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020386	GGTC	2	8	50549	50556	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020386	TTCA	2	8	51080	51087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020386	TTAA	2	8	51121	51128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020386	CTTT	2	8	51191	51198	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020386	ATTA	2	8	62240	62247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020386	AATG	2	8	62866	62873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020386	GGAT	2	8	68090	68097	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020386	AGGA	2	8	82964	82971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020386	GCCA	2	8	83409	83416	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020386	GCAG	2	8	83466	83473	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020386	TTAT	2	8	83646	83653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020386	ATTA	2	8	87321	87328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020386	ATAA	2	8	87544	87551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020386	GATA	2	8	89039	89046	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020386	TTTA	2	8	89368	89375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020386	AGTT	2	8	89516	89523	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020386	TCTG	2	8	89549	89556	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020386	ACTT	2	8	89588	89595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020386	ATTT	2	8	89719	89726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020386	AAAG	2	8	90999	91006	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020386	AAAG	2	8	91034	91041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020386	TTTG	2	8	93953	93960	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020386	GTAT	2	8	95204	95211	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020386	TTTG	2	8	97254	97261	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020386	TTCT	2	8	97542	97549	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020386	AGAT	2	8	106520	106527	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020386	ACTA	2	8	106694	106701	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020386	CTGC	2	8	106970	106977	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020386	AAAG	2	8	109079	109086	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020386	TAAT	2	8	109136	109143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020386	AATA	2	8	109661	109668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020386	TAAT	2	8	109995	110002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020386	TGAA	2	8	111198	111205	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020386	CAAT	2	8	112941	112948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020386	ATTA	2	8	113439	113446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020386	CAGG	2	8	115896	115903	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020386	TTTG	2	8	116369	116376	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020386	TTAT	2	8	117450	117457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020386	CCTT	2	8	121515	121522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020386	CCTT	2	8	123299	123306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020386	CTTG	2	8	123367	123374	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_020386	GGTT	2	8	124963	124970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020386	AACC	2	8	124973	124980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020386	ACCA	2	8	125298	125305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020386	GCTG	2	8	129903	129910	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020386	AATC	2	8	129953	129960	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020386	ATAA	2	8	130156	130163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020386	GCTG	2	8	130401	130408	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020386	AATA	2	8	130479	130486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020386	TTAC	2	8	130537	130544	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020386	TGAA	2	8	130803	130810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020386	TTGG	2	8	131303	131310	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020386	GATA	2	8	138660	138667	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020386	ATAA	2	8	138790	138797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020386	TAAA	2	8	139034	139041	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020386	CCCT	2	8	140539	140546	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_020386	GGCT	2	8	141642	141649	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020386	TGCG	2	8	148272	148279	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020386	GCAG	2	8	149569	149576	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020386	AATA	2	8	153509	153516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020386	ATAA	2	8	154144	154151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020386	ATTT	2	8	157974	157981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020386	CTGT	2	8	168635	168642	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020386	GGAA	2	8	168644	168651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020386	GCCA	2	8	173732	173739	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020386	CTTT	2	8	179109	179116	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_020386	GTAA	2	8	183310	183317	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020386	GGCA	2	8	183500	183507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020386	TATG	2	8	184790	184797	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020386	GGAT	2	8	186513	186520	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020386	GTCA	2	8	189962	189969	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020386	CTTT	2	8	198265	198272	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_020386	CCTG	2	8	198303	198310	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020386	CCCT	2	8	200493	200500	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_020386	TATC	2	8	203860	203867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_020386	AATT	2	8	204973	204980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020386	TAAA	2	8	205343	205350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020386	ATTT	2	8	205977	205984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020386	CTGG	2	8	230766	230773	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_020386	ATAA	2	8	230915	230922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020386	TTTC	2	8	232285	232292	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_020386	TATT	2	8	233009	233016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020386	AGGA	2	8	233354	233361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020386	TTTG	2	8	235616	235623	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020386	TTTC	2	8	237033	237040	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020386	TTTC	2	8	239790	239797	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_020386	CAAG	2	8	240746	240753	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020386	GCCG	2	8	242062	242069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020386	TTAT	2	8	251205	251212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020386	CTTA	2	8	266686	266693	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020386	AGAT	2	8	268666	268673	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020386	GATT	2	8	268936	268943	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020386	AGGA	2	8	269249	269256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020386	TGCT	2	8	269360	269367	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_020386	AGTG	2	8	269726	269733	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020386	CCAA	2	8	269870	269877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020386	TTCT	2	8	270075	270082	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_020386	AATA	2	8	270102	270109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020386	GAGC	2	8	271038	271045	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_020386	CTTG	2	8	271146	271153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_020386	TACG	2	8	280105	280112	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_020386	TTTC	2	8	280355	280362	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020386	TAAC	2	8	284576	284583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_020386	GAGG	2	8	284654	284661	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020386	TTTC	2	8	285174	285181	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_020386	CCGG	2	8	292537	292544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020386	AACG	2	8	295723	295730	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_020386	AATT	2	8	295977	295984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020386	GCTT	2	8	296097	296104	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020386	ACAA	2	8	309295	309302	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_020386	CTTT	2	8	315576	315583	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_020386	CATT	2	8	320205	320212	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_020386	AACC	2	8	335808	335815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020386	AATG	2	8	336009	336016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020386	CAAG	2	8	350242	350249	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020386	GGAG	2	8	362952	362959	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020386	ATCT	2	8	365464	365471	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_020386	TGGC	2	8	368727	368734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_020386	AGAT	2	8	377682	377689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020386	GCCA	2	8	380196	380203	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020386	TAGA	2	8	383600	383607	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020386	ATTT	2	8	383670	383677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020386	TGGT	2	8	384402	384409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020386	AGGC	2	8	386191	386198	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_020386	GGAC	2	8	386205	386212	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_020386	TAGT	2	8	399761	399768	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020386	CATT	2	8	405186	405193	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_020386	TTTG	2	8	407335	407342	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020386	TGGG	2	8	407408	407415	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020386	CGGG	2	8	411447	411454	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_020386	CAAA	2	8	411485	411492	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_020386	TAAA	2	8	418267	418274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020386	TCTG	2	8	428080	428087	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_020386	ATTT	2	8	432523	432530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020386	AGCT	2	8	432589	432596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_020386	TGGT	2	8	436612	436619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.