MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020385	AAATTT	2	12	4813	4824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020385	ATATTT	2	12	23119	23130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020385	AAAACT	2	12	23442	23453	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020385	TTAAAA	2	12	24211	24222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020385	TTAAAT	2	12	54826	54837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020385	ATATAA	2	12	58166	58177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020385	ATCCTA	2	12	65223	65234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020385	TGTATT	2	12	66901	66912	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020385	ACATAT	2	12	83247	83258	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_020385	TATATG	2	12	86984	86995	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020385	CATTTA	2	12	95008	95019	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020385	TATATT	2	12	98867	98878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020385	TAATTA	2	12	109749	109760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020385	ATTTAT	2	12	131070	131081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020385	TAACAA	2	12	131145	131156	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_020385	AATATT	2	12	140876	140887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020385	TTTTTG	2	12	147524	147535	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020385	AAATAA	2	12	147706	147717	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020385	TTTCTA	2	12	150592	150603	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020385	TAAAAA	2	12	151769	151780	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020385	AATATA	2	12	158376	158387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020385	TATTAA	2	12	168994	169005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020385	ATTTTT	2	12	172706	172717	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020385	TACTTA	2	12	190551	190562	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020385	AATAGA	2	12	194267	194278	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020385	TTAATA	2	12	199511	199522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020385	ATAGTT	2	12	204554	204565	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020385	TAAAAA	2	12	218934	218945	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020385	ATACAA	2	12	223581	223592	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020385	TTTGTG	2	12	227371	227382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020385	AATTTA	2	12	258665	258676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020385	ATGTTA	2	12	263774	263785	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020385	AAATTT	2	12	272655	272666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020385	AAATAC	2	12	274679	274690	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_020385	TAAAAT	2	12	281614	281625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020385	TATTAA	2	12	285480	285491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020385	TGATGG	2	12	287419	287430	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020385	TTTCTT	2	12	289322	289333	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020385	TTTAAT	2	12	291821	291832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020385	CTTTCA	2	12	325717	325728	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020385	ATCAAT	3	18	326492	326509	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.