MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020385	CATCCC	2	12	5910	5921	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	452202397
2	NC_020385	GAAGGC	2	12	6946	6957	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	452202398
3	NC_020385	GTTAAA	2	12	8072	8083	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452202400
4	NC_020385	CAAGAC	2	12	8756	8767	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	452202400
5	NC_020385	ACAGGT	2	12	12469	12480	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452202403
6	NC_020385	AATGAA	2	12	12863	12874	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452202403
7	NC_020385	CATTAG	2	12	14233	14244	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202406
8	NC_020385	TAAACA	2	12	14817	14828	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452202407
9	NC_020385	TAAAAA	2	12	15778	15789	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	452202409
10	NC_020385	ATTCAC	2	12	22069	22080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202417
11	NC_020385	ATTTTA	2	12	28965	28976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202422
12	NC_020385	AGATTC	2	12	29473	29484	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202422
13	NC_020385	TAAAAA	2	12	36956	36967	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	452202432
14	NC_020385	TATTTT	2	12	40309	40320	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452202434
15	NC_020385	AAATAT	2	12	41746	41757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202435
16	NC_020385	GTGAAT	2	12	43893	43904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202436
17	NC_020385	GCAAGT	2	12	47027	47038	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452202437
18	NC_020385	ATTCTG	2	12	51221	51232	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452202442
19	NC_020385	GATGTA	2	12	54389	54400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202445
20	NC_020385	ATAAAA	2	12	57639	57650	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	452202450
21	NC_020385	AATTGC	2	12	62344	62355	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202455
22	NC_020385	TACATT	2	12	63910	63921	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452202456
23	NC_020385	GGACAT	2	12	66441	66452	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452202458
24	NC_020385	TACGAT	2	12	66672	66683	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202458
25	NC_020385	ACAGTT	2	12	69591	69602	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202461
26	NC_020385	GGAACA	2	12	71054	71065	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	452202462
27	NC_020385	TAAAAA	2	12	73532	73543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	452202464
28	NC_020385	TGAAAT	2	12	75139	75150	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452202465
29	NC_020385	AGATGG	2	12	75431	75442	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	452202466
30	NC_020385	ATTTTT	2	12	75837	75848	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452202466
31	NC_020385	TTCTTT	2	12	80141	80152	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452202472
32	NC_020385	TTTATT	3	18	81229	81246	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452202473
33	NC_020385	AGGATA	2	12	81460	81471	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452202473
34	NC_020385	AGTGAA	2	12	83410	83421	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452202476
35	NC_020385	AATATC	2	12	85212	85223	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452202478
36	NC_020385	TAAAAA	2	12	88322	88333	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	452202479
37	NC_020385	ACAGGA	2	12	89254	89265	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	452202480
38	NC_020385	ATGAAT	2	12	89686	89697	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452202481
39	NC_020385	TAACAC	2	12	90806	90817	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	452202483
40	NC_020385	AAAGAA	2	12	92056	92067	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452202483
41	NC_020385	TAATTA	2	12	95750	95761	50 %	50 %	0 %	0 %	452202486
42	NC_020385	TAAAAG	2	12	100970	100981	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452202489
43	NC_020385	AATTTA	2	12	101270	101281	50 %	50 %	0 %	0 %	452202489
44	NC_020385	TTGGTG	2	12	112659	112670	0 %	50 %	50 %	0 %	452202499
45	NC_020385	TGGTAT	2	12	117639	117650	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	452202503
46	NC_020385	GGCGAG	2	12	118259	118270	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	452202504
47	NC_020385	AAATGA	2	12	118719	118730	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452202504
48	NC_020385	AAAGAA	2	12	121589	121600	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452202507
49	NC_020385	ATAAAG	2	12	123590	123601	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452202510
50	NC_020385	ACCATC	2	12	125247	125258	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	452202511
51	NC_020385	AATCCT	2	12	126498	126509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202513
52	NC_020385	GAAAAA	2	12	130728	130739	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452202516
53	NC_020385	CATATA	2	12	132747	132758	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452202518
54	NC_020385	CTTTAT	2	12	133296	133307	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452202518
55	NC_020385	CCATTT	2	12	140669	140680	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	452202524
56	NC_020385	ATTTAT	2	12	145896	145907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202528
57	NC_020385	ATAAAG	2	12	148540	148551	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452202531
58	NC_020385	TTCTTT	2	12	163578	163589	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452202548
59	NC_020385	TCCTGT	2	12	165848	165859	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	452202550
60	NC_020385	TTTTAA	2	12	167448	167459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202551
61	NC_020385	GGTGAT	2	12	173499	173510	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	452202556
62	NC_020385	TTTTAA	2	12	175380	175391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202557
63	NC_020385	GGTCTT	2	12	183513	183524	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	452202566
64	NC_020385	TTTAAC	2	12	184198	184209	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452202566
65	NC_020385	CAATCA	2	12	188694	188705	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	452202572
66	NC_020385	TTAAAA	2	12	193496	193507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202576
67	NC_020385	CCGGTA	2	12	195833	195844	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452202578
68	NC_020385	ACATTG	2	12	220759	220770	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202599
69	NC_020385	ATCTAA	2	12	225045	225056	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452202603
70	NC_020385	TGCAGC	2	12	230345	230356	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452202609
71	NC_020385	TTTTAA	2	12	232785	232796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202611
72	NC_020385	GATTCA	2	12	234760	234771	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202613
73	NC_020385	CTTTAT	2	12	239778	239789	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452202619
74	NC_020385	TTTAAT	2	12	248124	248135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202621
75	NC_020385	ATTAAA	2	12	249665	249676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202621
76	NC_020385	TAATCA	2	12	251115	251126	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452202621
77	NC_020385	CTAAAC	2	12	251797	251808	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	452202621
78	NC_020385	AACATT	2	12	252170	252181	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452202621
79	NC_020385	ATGCTA	2	12	253974	253985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202622
80	NC_020385	AGGTTC	2	12	255685	255696	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452202622
81	NC_020385	TAAACA	2	12	264499	264510	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452202630
82	NC_020385	TGTCAT	2	12	271655	271666	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452202637
83	NC_020385	GCTGTA	2	12	272305	272316	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452202639
84	NC_020385	GCAAGA	2	12	275781	275792	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	452202642
85	NC_020385	AATATT	2	12	278304	278315	50 %	50 %	0 %	0 %	452202644
86	NC_020385	ACAATT	2	12	286279	286290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452202650
87	NC_020385	GCGAAA	2	12	288446	288457	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	452202653
88	NC_020385	ACGTAT	2	12	294436	294447	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202658
89	NC_020385	TTTAAT	2	12	299516	299527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202661
90	NC_020385	AATACG	2	12	299812	299823	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452202661
91	NC_020385	TCTGGT	2	12	300394	300405	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	452202662
92	NC_020385	GCAATT	2	12	301931	301942	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202663
93	NC_020385	AATTTG	2	12	302762	302773	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452202664
94	NC_020385	AATTGA	2	12	302873	302884	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452202665
95	NC_020385	ATTTGA	2	12	317631	317642	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452202680
96	NC_020385	AATAAA	2	12	317647	317658	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	452202680
97	NC_020385	TCTTTT	2	12	324298	324309	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452202687

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.