MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328

Total Repeats: 331

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020385	TGTTA	2	10	1806	1815	20 %	60 %	20 %	0 %	452202393
2	NC_020385	GATTT	2	10	2717	2726	20 %	60 %	20 %	0 %	452202393
3	NC_020385	GTTTG	2	10	2934	2943	0 %	60 %	40 %	0 %	452202393
4	NC_020385	ATAGA	2	10	3034	3043	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020385	TGCTT	2	10	3461	3470	0 %	60 %	20 %	20 %	452202394
6	NC_020385	TACCA	2	10	4027	4036	40 %	20 %	0 %	40 %	452202396
7	NC_020385	TATCT	2	10	4549	4558	20 %	60 %	0 %	20 %	452202396
8	NC_020385	TTAAA	2	10	6519	6528	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020385	AATTT	2	10	7199	7208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020385	ATCCC	2	10	9231	9240	20 %	20 %	0 %	60 %	452202401
11	NC_020385	ATAAA	2	10	9389	9398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020385	CCATG	2	10	10897	10906	20 %	20 %	20 %	40 %	452202402
13	NC_020385	AGAGT	2	10	11224	11233	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020385	CATAA	2	10	11500	11509	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020385	ATTTT	2	10	12179	12188	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020385	GAAAT	2	10	12978	12987	60 %	20 %	20 %	0 %	452202403
17	NC_020385	ATATT	2	10	14282	14291	40 %	60 %	0 %	0 %	452202406
18	NC_020385	ATAAA	2	10	15259	15268	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020385	ATTTG	2	10	16052	16061	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020385	CTTAA	2	10	16363	16372	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020385	TATGA	2	10	16511	16520	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020385	CAATT	2	10	16815	16824	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_020385	TGCAT	2	10	16905	16914	20 %	40 %	20 %	20 %	452202411
24	NC_020385	TTAAA	2	10	17054	17063	60 %	40 %	0 %	0 %	452202411
25	NC_020385	AGGTA	2	10	17082	17091	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020385	AAAAG	2	10	17810	17819	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020385	TAAAA	2	10	18429	18438	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020385	TGTAA	2	10	18586	18595	40 %	40 %	20 %	0 %	452202414
29	NC_020385	TCATT	2	10	18785	18794	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020385	CGAAA	2	10	20000	20009	60 %	0 %	20 %	20 %	452202415
31	NC_020385	ATTCA	2	10	20481	20490	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020385	GATTC	2	10	20760	20769	20 %	40 %	20 %	20 %	452202417
33	NC_020385	TTTAT	2	10	21530	21539	20 %	80 %	0 %	0 %	452202417
34	NC_020385	GTTTA	2	10	21610	21619	20 %	60 %	20 %	0 %	452202417
35	NC_020385	TATTT	2	10	22255	22264	20 %	80 %	0 %	0 %	452202417
36	NC_020385	AATTT	2	10	23762	23771	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020385	TTATT	2	10	26051	26060	20 %	80 %	0 %	0 %	452202419
38	NC_020385	TAAAA	2	10	26205	26214	80 %	20 %	0 %	0 %	452202419
39	NC_020385	ATTTA	2	10	26249	26258	40 %	60 %	0 %	0 %	452202419
40	NC_020385	TATAA	2	10	26338	26347	60 %	40 %	0 %	0 %	452202419
41	NC_020385	TGTTT	2	10	26724	26733	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020385	AATAA	2	10	28207	28216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020385	GAACA	2	10	29229	29238	60 %	0 %	20 %	20 %	452202422
44	NC_020385	TGGAT	2	10	29734	29743	20 %	40 %	40 %	0 %	452202422
45	NC_020385	GAAAA	2	10	34168	34177	80 %	0 %	20 %	0 %	452202429
46	NC_020385	ATGAA	2	10	37039	37048	60 %	20 %	20 %	0 %	452202432
47	NC_020385	ATTTT	2	10	37678	37687	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020385	AAAAT	2	10	37694	37703	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020385	CTTTG	2	10	39435	39444	0 %	60 %	20 %	20 %	452202434
50	NC_020385	TTTCT	2	10	40125	40134	0 %	80 %	0 %	20 %	452202434
51	NC_020385	GAAAA	2	10	41811	41820	80 %	0 %	20 %	0 %	452202435
52	NC_020385	AGATA	2	10	46588	46597	60 %	20 %	20 %	0 %	452202437
53	NC_020385	TCTGT	2	10	48258	48267	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_020385	CAAAT	2	10	52951	52960	60 %	20 %	0 %	20 %	452202443
55	NC_020385	ACATG	2	10	53076	53085	40 %	20 %	20 %	20 %	452202443
56	NC_020385	AATAC	2	10	55544	55553	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_020385	AGAAA	2	10	57758	57767	80 %	0 %	20 %	0 %	452202450
58	NC_020385	TTAAA	2	10	58904	58913	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020385	GAAAA	2	10	59010	59019	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020385	TCTTT	2	10	59062	59071	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_020385	TGAAA	2	10	59420	59429	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020385	TCAAT	2	10	59504	59513	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_020385	ATTTT	2	10	59857	59866	20 %	80 %	0 %	0 %	452202452
64	NC_020385	TTTAT	2	10	60247	60256	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020385	AAAAG	2	10	61476	61485	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020385	CTAAA	2	10	61547	61556	60 %	20 %	0 %	20 %	452202454
67	NC_020385	ACAAA	2	10	63548	63557	80 %	0 %	0 %	20 %	452202455
68	NC_020385	ATGGT	2	10	63606	63615	20 %	40 %	40 %	0 %	452202455
69	NC_020385	TTCAA	2	10	65810	65819	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_020385	AATCA	2	10	66159	66168	60 %	20 %	0 %	20 %	452202458
71	NC_020385	ACGAA	2	10	66454	66463	60 %	0 %	20 %	20 %	452202458
72	NC_020385	ATTTT	2	10	69956	69965	20 %	80 %	0 %	0 %	452202461
73	NC_020385	TTTAT	2	10	70323	70332	20 %	80 %	0 %	0 %	452202461
74	NC_020385	ACTGA	2	10	70333	70342	40 %	20 %	20 %	20 %	452202461
75	NC_020385	TAAGT	2	10	70431	70440	40 %	40 %	20 %	0 %	452202461
76	NC_020385	AAGTG	2	10	71728	71737	40 %	20 %	40 %	0 %	452202462
77	NC_020385	TGCAT	2	10	73220	73229	20 %	40 %	20 %	20 %	452202464
78	NC_020385	ATTTA	2	10	74612	74621	40 %	60 %	0 %	0 %	452202465
79	NC_020385	ATTTT	2	10	74915	74924	20 %	80 %	0 %	0 %	452202465
80	NC_020385	ATTTT	2	10	76670	76679	20 %	80 %	0 %	0 %	452202467
81	NC_020385	ATTTA	2	10	77937	77946	40 %	60 %	0 %	0 %	452202468
82	NC_020385	TAATG	2	10	79370	79379	40 %	40 %	20 %	0 %	452202471
83	NC_020385	ATTTT	2	10	79694	79703	20 %	80 %	0 %	0 %	452202472
84	NC_020385	GTGTT	2	10	79891	79900	0 %	60 %	40 %	0 %	452202472
85	NC_020385	TTTTA	2	10	80940	80949	20 %	80 %	0 %	0 %	452202473
86	NC_020385	GAAGT	2	10	84252	84261	40 %	20 %	40 %	0 %	452202477
87	NC_020385	AATGT	2	10	89883	89892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020385	TGTTA	2	10	91254	91263	20 %	60 %	20 %	0 %	452202483
89	NC_020385	TATAT	2	10	91512	91521	40 %	60 %	0 %	0 %	452202483
90	NC_020385	GAAAA	2	10	91948	91957	80 %	0 %	20 %	0 %	452202483
91	NC_020385	TTTAA	2	10	93211	93220	40 %	60 %	0 %	0 %	452202484
92	NC_020385	ATCGA	2	10	93952	93961	40 %	20 %	20 %	20 %	452202485
93	NC_020385	TAAAA	2	10	94864	94873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020385	AAATT	2	10	98640	98649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020385	AAATA	2	10	98787	98796	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020385	ATGGA	2	10	100220	100229	40 %	20 %	40 %	0 %	452202489
97	NC_020385	TAGAA	2	10	100356	100365	60 %	20 %	20 %	0 %	452202489
98	NC_020385	CTTCG	2	10	100520	100529	0 %	40 %	20 %	40 %	452202489
99	NC_020385	AAAAT	2	10	104265	104274	80 %	20 %	0 %	0 %	452202492
100	NC_020385	TGACA	2	10	104502	104511	40 %	20 %	20 %	20 %	452202492
101	NC_020385	ATCAA	2	10	105475	105484	60 %	20 %	0 %	20 %	452202493
102	NC_020385	CTAAT	2	10	106448	106457	40 %	40 %	0 %	20 %	452202494
103	NC_020385	TATTT	2	10	107403	107412	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020385	GCATT	2	10	108360	108369	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020385	ATTGG	2	10	108548	108557	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020385	ACAAA	2	10	108907	108916	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_020385	ATATA	2	10	109793	109802	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020385	CCATT	2	10	111377	111386	20 %	40 %	0 %	40 %	452202498
109	NC_020385	CTATC	2	10	111828	111837	20 %	40 %	0 %	40 %	452202498
110	NC_020385	GAAAC	2	10	112553	112562	60 %	0 %	20 %	20 %	452202499
111	NC_020385	GTACA	2	10	115131	115140	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_020385	TAATA	2	10	115273	115282	60 %	40 %	0 %	0 %	452202501
113	NC_020385	AACCA	2	10	116116	116125	60 %	0 %	0 %	40 %	452202502
114	NC_020385	CAGGA	2	10	118017	118026	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_020385	GAAAA	2	10	118052	118061	80 %	0 %	20 %	0 %	452202504
116	NC_020385	AAGTA	2	10	119007	119016	60 %	20 %	20 %	0 %	452202504
117	NC_020385	AATTT	2	10	119974	119983	40 %	60 %	0 %	0 %	452202506
118	NC_020385	TTAAA	2	10	120514	120523	60 %	40 %	0 %	0 %	452202506
119	NC_020385	CAATG	2	10	120716	120725	40 %	20 %	20 %	20 %	452202506
120	NC_020385	AATGA	2	10	121035	121044	60 %	20 %	20 %	0 %	452202506
121	NC_020385	GAAAT	2	10	121559	121568	60 %	20 %	20 %	0 %	452202507
122	NC_020385	AGTAT	2	10	121742	121751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020385	CAACT	2	10	122075	122084	40 %	20 %	0 %	40 %	452202508
124	NC_020385	ATAAG	2	10	122470	122479	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020385	ATTAA	2	10	122850	122859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020385	TAATT	2	10	123072	123081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020385	AAATG	2	10	123228	123237	60 %	20 %	20 %	0 %	452202510
128	NC_020385	ACCTC	2	10	123515	123524	20 %	20 %	0 %	60 %	452202510
129	NC_020385	ATGAA	2	10	126222	126231	60 %	20 %	20 %	0 %	452202512
130	NC_020385	CTTTT	2	10	126635	126644	0 %	80 %	0 %	20 %	452202513
131	NC_020385	TAGCT	2	10	127884	127893	20 %	40 %	20 %	20 %	452202514
132	NC_020385	TCAAA	2	10	128941	128950	60 %	20 %	0 %	20 %	452202515
133	NC_020385	ATTAT	2	10	129704	129713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020385	ATATT	2	10	129751	129760	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020385	TTCAT	2	10	132093	132102	20 %	60 %	0 %	20 %	452202517
136	NC_020385	AAACC	2	10	132653	132662	60 %	0 %	0 %	40 %	452202518
137	NC_020385	TTATA	2	10	132963	132972	40 %	60 %	0 %	0 %	452202518
138	NC_020385	ATATT	2	10	138275	138284	40 %	60 %	0 %	0 %	452202522
139	NC_020385	GTTTT	2	10	138524	138533	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020385	GGAAA	2	10	139935	139944	60 %	0 %	40 %	0 %	452202524
141	NC_020385	ATTCA	2	10	143679	143688	40 %	40 %	0 %	20 %	452202526
142	NC_020385	ATTTT	2	10	144973	144982	20 %	80 %	0 %	0 %	452202527
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152	NC_020385	ATAGA	2	10	149861	149870	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_020385	ATTCT	2	10	201626	201635	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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257	NC_020385	TTGTA	2	10	256238	256247	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
258	NC_020385	AAAAT	2	10	256452	256461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_020385	TAATT	2	10	256960	256969	40 %	60 %	0 %	0 %	452202623
260	NC_020385	TAAAT	2	10	257281	257290	60 %	40 %	0 %	0 %	452202623
261	NC_020385	TGGAA	2	10	258407	258416	40 %	20 %	40 %	0 %	452202624
262	NC_020385	GCATT	2	10	259459	259468	20 %	40 %	20 %	20 %	452202625
263	NC_020385	TTTTA	2	10	261019	261028	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_020385	TATAG	2	10	263656	263665	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
265	NC_020385	AAGAA	2	10	263991	264000	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
266	NC_020385	ATTCG	2	10	264812	264821	20 %	40 %	20 %	20 %	452202630
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268	NC_020385	ATATT	2	10	265891	265900	40 %	60 %	0 %	0 %	452202631
269	NC_020385	AATTG	2	10	267250	267259	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
270	NC_020385	ATAGT	2	10	267435	267444	40 %	40 %	20 %	0 %	452202632
271	NC_020385	TCAAA	2	10	268853	268862	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
272	NC_020385	GCTAC	2	10	270602	270611	20 %	20 %	20 %	40 %	452202635
273	NC_020385	CATAC	2	10	271456	271465	40 %	20 %	0 %	40 %	452202636
274	NC_020385	ATTCC	2	10	273026	273035	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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276	NC_020385	TATTT	2	10	274888	274897	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_020385	ATAAA	2	10	276323	276332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_020385	AAAAG	2	10	291657	291666	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
291	NC_020385	AAAAG	2	10	291777	291786	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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320	NC_020385	TTATG	2	10	315247	315256	20 %	60 %	20 %	0 %	452202677
321	NC_020385	TCCTA	2	10	316724	316733	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
322	NC_020385	AGTTT	2	10	316982	316991	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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325	NC_020385	TAATG	2	10	319729	319738	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
326	NC_020385	TAAAT	2	10	319991	320000	60 %	40 %	0 %	0 %	452202684
327	NC_020385	CTTTA	2	10	321604	321613	20 %	60 %	0 %	20 %	452202685
328	NC_020385	TATGG	2	10	322383	322392	20 %	40 %	40 %	0 %	452202686
329	NC_020385	TCTTT	2	10	322642	322651	0 %	80 %	0 %	20 %	452202686
330	NC_020385	ATTTT	2	10	323825	323834	20 %	80 %	0 %	0 %	452202687
331	NC_020385	TTGCT	2	10	324513	324522	0 %	60 %	20 %	20 %	452202687

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.