MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020385	ATAGA	2	10	3034	3043	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020385	TTAAA	2	10	6519	6528	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020385	AATTT	2	10	7199	7208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020385	ATAAA	2	10	9389	9398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020385	AGAGT	2	10	11224	11233	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020385	CATAA	2	10	11500	11509	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020385	ATTTT	2	10	12179	12188	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020385	ATAAA	2	10	15259	15268	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020385	ATTTG	2	10	16052	16061	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020385	CTTAA	2	10	16363	16372	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020385	TATGA	2	10	16511	16520	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020385	CAATT	2	10	16815	16824	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_020385	AGGTA	2	10	17082	17091	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020385	AAAAG	2	10	17810	17819	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020385	TAAAA	2	10	18429	18438	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020385	TCATT	2	10	18785	18794	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020385	ATTCA	2	10	20481	20490	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020385	AATTT	2	10	23762	23771	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020385	TGTTT	2	10	26724	26733	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020385	AATAA	2	10	28207	28216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020385	ATTTT	2	10	37678	37687	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020385	AAAAT	2	10	37694	37703	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020385	TCTGT	2	10	48258	48267	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020385	AATAC	2	10	55544	55553	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020385	TTAAA	2	10	58904	58913	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020385	GAAAA	2	10	59010	59019	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020385	TCTTT	2	10	59062	59071	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020385	TGAAA	2	10	59420	59429	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020385	TCAAT	2	10	59504	59513	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020385	TTTAT	2	10	60247	60256	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020385	AAAAG	2	10	61476	61485	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020385	TTCAA	2	10	65810	65819	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020385	AATGT	2	10	89883	89892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020385	TAAAA	2	10	94864	94873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020385	AAATT	2	10	98640	98649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020385	AAATA	2	10	98787	98796	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020385	TATTT	2	10	107403	107412	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020385	GCATT	2	10	108360	108369	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_020385	ATTGG	2	10	108548	108557	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020385	ACAAA	2	10	108907	108916	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_020385	ATATA	2	10	109793	109802	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020385	GTACA	2	10	115131	115140	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_020385	CAGGA	2	10	118017	118026	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020385	AGTAT	2	10	121742	121751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020385	ATAAG	2	10	122470	122479	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020385	ATTAA	2	10	122850	122859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020385	TAATT	2	10	123072	123081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020385	ATTAT	2	10	129704	129713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020385	ATATT	2	10	129751	129760	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020385	GTTTT	2	10	138524	138533	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020385	CCCTT	2	10	146217	146226	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_020385	AATAA	2	10	146589	146598	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020385	AAGAT	2	10	146756	146765	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020385	ATCTT	2	10	146777	146786	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_020385	TTATA	2	10	146883	146892	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020385	TTAAA	2	10	147657	147666	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020385	ATAGA	2	10	149861	149870	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020385	TAGAT	2	10	153907	153916	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020385	ATATT	2	10	158187	158196	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020385	CTAAT	2	10	164122	164131	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_020385	TATAA	2	10	169418	169427	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020385	TCAAT	2	10	169730	169739	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_020385	AATTT	2	10	171528	171537	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020385	TATTT	2	10	174368	174377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020385	TATTT	2	10	178321	178330	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020385	AGTAT	2	10	178937	178946	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020385	TCAAT	2	10	179328	179337	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_020385	AACTT	2	10	181694	181703	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_020385	GCTCC	2	10	184924	184933	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_020385	GTTTA	2	10	184981	184990	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020385	TGATA	2	10	190755	190764	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020385	ACTTA	2	10	192024	192033	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_020385	TGTAC	2	10	194355	194364	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_020385	AAAAC	2	10	195444	195453	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_020385	GTAAA	2	10	197674	197683	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020385	TCTTT	2	10	198339	198348	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_020385	TCTTT	2	10	198774	198783	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_020385	ATTCT	2	10	201626	201635	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_020385	AGCTT	2	10	202016	202025	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_020385	TTAAG	2	10	205033	205042	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020385	ACTAA	2	10	212535	212544	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_020385	TAAAT	2	10	214026	214035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020385	ATTTT	2	10	215612	215621	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020385	TTAAT	2	10	215706	215715	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020385	TAAAA	2	10	223837	223846	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020385	TACCT	2	10	230126	230135	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_020385	TGCAA	2	10	231787	231796	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_020385	AATTA	2	10	231857	231866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020385	TTGTA	2	10	256238	256247	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020385	AAAAT	2	10	256452	256461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020385	TTTTA	2	10	261019	261028	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020385	TATAG	2	10	263656	263665	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020385	AAGAA	2	10	263991	264000	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020385	AATTG	2	10	267250	267259	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020385	TCAAA	2	10	268853	268862	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_020385	ATTCC	2	10	273026	273035	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_020385	AAAAG	2	10	273878	273887	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020385	TATTT	2	10	274888	274897	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020385	ATAAA	2	10	276323	276332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020385	TGGAT	2	10	278793	278802	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020385	CTTTA	2	10	281444	281453	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_020385	GGAGT	2	10	284024	284033	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020385	AAAAT	2	10	289411	289420	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020385	AAAAG	2	10	291657	291666	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020385	AAAAG	2	10	291777	291786	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020385	TTTTG	2	10	297361	297370	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020385	AAAAT	2	10	298644	298653	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020385	CATTG	2	10	304249	304258	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_020385	ATGAA	2	10	310260	310269	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020385	TTCAA	2	10	312501	312510	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_020385	CTTCT	2	10	312547	312556	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_020385	TAATG	2	10	314607	314616	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020385	ATATG	2	10	314999	315008	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020385	TCCTA	2	10	316724	316733	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_020385	AGTTT	2	10	316982	316991	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020385	TAGGA	2	10	319447	319456	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020385	TAATG	2	10	319729	319738	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.