MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328

Total Repeats: 214

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020385	TGTTA	2	10	1806	1815	20 %	60 %	20 %	0 %	452202393
2	NC_020385	GATTT	2	10	2717	2726	20 %	60 %	20 %	0 %	452202393
3	NC_020385	GTTTG	2	10	2934	2943	0 %	60 %	40 %	0 %	452202393
4	NC_020385	TGCTT	2	10	3461	3470	0 %	60 %	20 %	20 %	452202394
5	NC_020385	TACCA	2	10	4027	4036	40 %	20 %	0 %	40 %	452202396
6	NC_020385	TATCT	2	10	4549	4558	20 %	60 %	0 %	20 %	452202396
7	NC_020385	ATCCC	2	10	9231	9240	20 %	20 %	0 %	60 %	452202401
8	NC_020385	CCATG	2	10	10897	10906	20 %	20 %	20 %	40 %	452202402
9	NC_020385	GAAAT	2	10	12978	12987	60 %	20 %	20 %	0 %	452202403
10	NC_020385	ATATT	2	10	14282	14291	40 %	60 %	0 %	0 %	452202406
11	NC_020385	TGCAT	2	10	16905	16914	20 %	40 %	20 %	20 %	452202411
12	NC_020385	TTAAA	2	10	17054	17063	60 %	40 %	0 %	0 %	452202411
13	NC_020385	TGTAA	2	10	18586	18595	40 %	40 %	20 %	0 %	452202414
14	NC_020385	CGAAA	2	10	20000	20009	60 %	0 %	20 %	20 %	452202415
15	NC_020385	GATTC	2	10	20760	20769	20 %	40 %	20 %	20 %	452202417
16	NC_020385	TTTAT	2	10	21530	21539	20 %	80 %	0 %	0 %	452202417
17	NC_020385	GTTTA	2	10	21610	21619	20 %	60 %	20 %	0 %	452202417
18	NC_020385	TATTT	2	10	22255	22264	20 %	80 %	0 %	0 %	452202417
19	NC_020385	TTATT	2	10	26051	26060	20 %	80 %	0 %	0 %	452202419
20	NC_020385	TAAAA	2	10	26205	26214	80 %	20 %	0 %	0 %	452202419
21	NC_020385	ATTTA	2	10	26249	26258	40 %	60 %	0 %	0 %	452202419
22	NC_020385	TATAA	2	10	26338	26347	60 %	40 %	0 %	0 %	452202419
23	NC_020385	GAACA	2	10	29229	29238	60 %	0 %	20 %	20 %	452202422
24	NC_020385	TGGAT	2	10	29734	29743	20 %	40 %	40 %	0 %	452202422
25	NC_020385	GAAAA	2	10	34168	34177	80 %	0 %	20 %	0 %	452202429
26	NC_020385	ATGAA	2	10	37039	37048	60 %	20 %	20 %	0 %	452202432
27	NC_020385	CTTTG	2	10	39435	39444	0 %	60 %	20 %	20 %	452202434
28	NC_020385	TTTCT	2	10	40125	40134	0 %	80 %	0 %	20 %	452202434
29	NC_020385	GAAAA	2	10	41811	41820	80 %	0 %	20 %	0 %	452202435
30	NC_020385	AGATA	2	10	46588	46597	60 %	20 %	20 %	0 %	452202437
31	NC_020385	CAAAT	2	10	52951	52960	60 %	20 %	0 %	20 %	452202443
32	NC_020385	ACATG	2	10	53076	53085	40 %	20 %	20 %	20 %	452202443
33	NC_020385	AGAAA	2	10	57758	57767	80 %	0 %	20 %	0 %	452202450
34	NC_020385	ATTTT	2	10	59857	59866	20 %	80 %	0 %	0 %	452202452
35	NC_020385	CTAAA	2	10	61547	61556	60 %	20 %	0 %	20 %	452202454
36	NC_020385	ACAAA	2	10	63548	63557	80 %	0 %	0 %	20 %	452202455
37	NC_020385	ATGGT	2	10	63606	63615	20 %	40 %	40 %	0 %	452202455
38	NC_020385	AATCA	2	10	66159	66168	60 %	20 %	0 %	20 %	452202458
39	NC_020385	ACGAA	2	10	66454	66463	60 %	0 %	20 %	20 %	452202458
40	NC_020385	ATTTT	2	10	69956	69965	20 %	80 %	0 %	0 %	452202461
41	NC_020385	TTTAT	2	10	70323	70332	20 %	80 %	0 %	0 %	452202461
42	NC_020385	ACTGA	2	10	70333	70342	40 %	20 %	20 %	20 %	452202461
43	NC_020385	TAAGT	2	10	70431	70440	40 %	40 %	20 %	0 %	452202461
44	NC_020385	AAGTG	2	10	71728	71737	40 %	20 %	40 %	0 %	452202462
45	NC_020385	TGCAT	2	10	73220	73229	20 %	40 %	20 %	20 %	452202464
46	NC_020385	ATTTA	2	10	74612	74621	40 %	60 %	0 %	0 %	452202465
47	NC_020385	ATTTT	2	10	74915	74924	20 %	80 %	0 %	0 %	452202465
48	NC_020385	ATTTT	2	10	76670	76679	20 %	80 %	0 %	0 %	452202467
49	NC_020385	ATTTA	2	10	77937	77946	40 %	60 %	0 %	0 %	452202468
50	NC_020385	TAATG	2	10	79370	79379	40 %	40 %	20 %	0 %	452202471
51	NC_020385	ATTTT	2	10	79694	79703	20 %	80 %	0 %	0 %	452202472
52	NC_020385	GTGTT	2	10	79891	79900	0 %	60 %	40 %	0 %	452202472
53	NC_020385	TTTTA	2	10	80940	80949	20 %	80 %	0 %	0 %	452202473
54	NC_020385	GAAGT	2	10	84252	84261	40 %	20 %	40 %	0 %	452202477
55	NC_020385	TGTTA	2	10	91254	91263	20 %	60 %	20 %	0 %	452202483
56	NC_020385	TATAT	2	10	91512	91521	40 %	60 %	0 %	0 %	452202483
57	NC_020385	GAAAA	2	10	91948	91957	80 %	0 %	20 %	0 %	452202483
58	NC_020385	TTTAA	2	10	93211	93220	40 %	60 %	0 %	0 %	452202484
59	NC_020385	ATCGA	2	10	93952	93961	40 %	20 %	20 %	20 %	452202485
60	NC_020385	ATGGA	2	10	100220	100229	40 %	20 %	40 %	0 %	452202489
61	NC_020385	TAGAA	2	10	100356	100365	60 %	20 %	20 %	0 %	452202489
62	NC_020385	CTTCG	2	10	100520	100529	0 %	40 %	20 %	40 %	452202489
63	NC_020385	AAAAT	2	10	104265	104274	80 %	20 %	0 %	0 %	452202492
64	NC_020385	TGACA	2	10	104502	104511	40 %	20 %	20 %	20 %	452202492
65	NC_020385	ATCAA	2	10	105475	105484	60 %	20 %	0 %	20 %	452202493
66	NC_020385	CTAAT	2	10	106448	106457	40 %	40 %	0 %	20 %	452202494
67	NC_020385	CCATT	2	10	111377	111386	20 %	40 %	0 %	40 %	452202498
68	NC_020385	CTATC	2	10	111828	111837	20 %	40 %	0 %	40 %	452202498
69	NC_020385	GAAAC	2	10	112553	112562	60 %	0 %	20 %	20 %	452202499
70	NC_020385	TAATA	2	10	115273	115282	60 %	40 %	0 %	0 %	452202501
71	NC_020385	AACCA	2	10	116116	116125	60 %	0 %	0 %	40 %	452202502
72	NC_020385	GAAAA	2	10	118052	118061	80 %	0 %	20 %	0 %	452202504
73	NC_020385	AAGTA	2	10	119007	119016	60 %	20 %	20 %	0 %	452202504
74	NC_020385	AATTT	2	10	119974	119983	40 %	60 %	0 %	0 %	452202506
75	NC_020385	TTAAA	2	10	120514	120523	60 %	40 %	0 %	0 %	452202506
76	NC_020385	CAATG	2	10	120716	120725	40 %	20 %	20 %	20 %	452202506
77	NC_020385	AATGA	2	10	121035	121044	60 %	20 %	20 %	0 %	452202506
78	NC_020385	GAAAT	2	10	121559	121568	60 %	20 %	20 %	0 %	452202507
79	NC_020385	CAACT	2	10	122075	122084	40 %	20 %	0 %	40 %	452202508
80	NC_020385	AAATG	2	10	123228	123237	60 %	20 %	20 %	0 %	452202510
81	NC_020385	ACCTC	2	10	123515	123524	20 %	20 %	0 %	60 %	452202510
82	NC_020385	ATGAA	2	10	126222	126231	60 %	20 %	20 %	0 %	452202512
83	NC_020385	CTTTT	2	10	126635	126644	0 %	80 %	0 %	20 %	452202513
84	NC_020385	TAGCT	2	10	127884	127893	20 %	40 %	20 %	20 %	452202514
85	NC_020385	TCAAA	2	10	128941	128950	60 %	20 %	0 %	20 %	452202515
86	NC_020385	TTCAT	2	10	132093	132102	20 %	60 %	0 %	20 %	452202517
87	NC_020385	AAACC	2	10	132653	132662	60 %	0 %	0 %	40 %	452202518
88	NC_020385	TTATA	2	10	132963	132972	40 %	60 %	0 %	0 %	452202518
89	NC_020385	ATATT	2	10	138275	138284	40 %	60 %	0 %	0 %	452202522
90	NC_020385	GGAAA	2	10	139935	139944	60 %	0 %	40 %	0 %	452202524
91	NC_020385	ATTCA	2	10	143679	143688	40 %	40 %	0 %	20 %	452202526
92	NC_020385	ATTTT	2	10	144973	144982	20 %	80 %	0 %	0 %	452202527
93	NC_020385	CTGTA	2	10	145217	145226	20 %	40 %	20 %	20 %	452202527
94	NC_020385	TAAGA	2	10	145781	145790	60 %	20 %	20 %	0 %	452202527
95	NC_020385	CTTTT	2	10	147289	147298	0 %	80 %	0 %	20 %	452202530
96	NC_020385	AAAAG	2	10	152568	152577	80 %	0 %	20 %	0 %	452202539
97	NC_020385	CTTCT	2	10	155520	155529	0 %	60 %	0 %	40 %	452202543
98	NC_020385	GAATT	2	10	155748	155757	40 %	40 %	20 %	0 %	452202543
99	NC_020385	TTTGC	2	10	156401	156410	0 %	60 %	20 %	20 %	452202543
100	NC_020385	TACTG	2	10	157405	157414	20 %	40 %	20 %	20 %	452202543
101	NC_020385	GCTTT	2	10	157833	157842	0 %	60 %	20 %	20 %	452202543
102	NC_020385	TAATA	2	10	160211	160220	60 %	40 %	0 %	0 %	452202545
103	NC_020385	ATTGA	2	10	162272	162281	40 %	40 %	20 %	0 %	452202548
104	NC_020385	ATTGA	2	10	162308	162317	40 %	40 %	20 %	0 %	452202548
105	NC_020385	TCACT	2	10	162860	162869	20 %	40 %	0 %	40 %	452202548
106	NC_020385	GTTCT	2	10	165608	165617	0 %	60 %	20 %	20 %	452202550
107	NC_020385	ATTTT	2	10	166817	166826	20 %	80 %	0 %	0 %	452202551
108	NC_020385	AGAAA	2	10	174167	174176	80 %	0 %	20 %	0 %	452202556
109	NC_020385	TAACA	2	10	177489	177498	60 %	20 %	0 %	20 %	452202559
110	NC_020385	CTTTT	2	10	178131	178140	0 %	80 %	0 %	20 %	452202559
111	NC_020385	CATTT	2	10	178657	178666	20 %	60 %	0 %	20 %	452202560
112	NC_020385	TAACT	2	10	182105	182114	40 %	40 %	0 %	20 %	452202564
113	NC_020385	TAGCT	2	10	182359	182368	20 %	40 %	20 %	20 %	452202564
114	NC_020385	ATTCA	2	10	190075	190084	40 %	40 %	0 %	20 %	452202573
115	NC_020385	CAAAA	2	10	191191	191200	80 %	0 %	0 %	20 %	452202574
116	NC_020385	GAACA	2	10	192842	192851	60 %	0 %	20 %	20 %	452202575
117	NC_020385	TTATT	2	10	193849	193858	20 %	80 %	0 %	0 %	452202576
118	NC_020385	AAAGA	2	10	195120	195129	80 %	0 %	20 %	0 %	452202577
119	NC_020385	TGTAC	2	10	203368	203377	20 %	40 %	20 %	20 %	452202584
120	NC_020385	TGAAT	2	10	204385	204394	40 %	40 %	20 %	0 %	452202584
121	NC_020385	TTTTC	2	10	205687	205696	0 %	80 %	0 %	20 %	452202587
122	NC_020385	GAATG	2	10	206501	206510	40 %	20 %	40 %	0 %	452202587
123	NC_020385	TGTTT	2	10	208388	208397	0 %	80 %	20 %	0 %	452202588
124	NC_020385	CTGTT	2	10	209682	209691	0 %	60 %	20 %	20 %	452202590
125	NC_020385	CAAAT	2	10	209983	209992	60 %	20 %	0 %	20 %	452202590
126	NC_020385	CCTTA	2	10	210044	210053	20 %	40 %	0 %	40 %	452202590
127	NC_020385	CATTT	2	10	210954	210963	20 %	60 %	0 %	20 %	452202592
128	NC_020385	TCATC	2	10	212251	212260	20 %	40 %	0 %	40 %	452202593
129	NC_020385	CTTTT	2	10	213673	213682	0 %	80 %	0 %	20 %	452202594
130	NC_020385	ATTAA	2	10	214566	214575	60 %	40 %	0 %	0 %	452202595
131	NC_020385	TTACT	2	10	217072	217081	20 %	60 %	0 %	20 %	452202597
132	NC_020385	TTGTT	2	10	217973	217982	0 %	80 %	20 %	0 %	452202597
133	NC_020385	ATAAA	2	10	218422	218431	80 %	20 %	0 %	0 %	452202597
134	NC_020385	GAATT	2	10	221510	221519	40 %	40 %	20 %	0 %	452202600
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.