MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-285

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020384	TTAAAA	2	12	1712	1723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195887
2	NC_020384	TGCTTG	2	12	14058	14069	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	452195899
3	NC_020384	TATGAA	2	12	19575	19586	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452195904
4	NC_020384	AATACG	2	12	19711	19722	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452195904
5	NC_020384	CGTATT	2	12	22780	22791	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452195908
6	NC_020384	CTGTAA	2	12	27653	27664	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452195911
7	NC_020384	GTGTTA	2	12	29875	29886	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	452195913
8	NC_020384	TTTTAA	2	12	34943	34954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452195921
9	NC_020384	AAAATC	2	12	41736	41747	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452195930
10	NC_020384	TCTCTT	2	12	46752	46763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452195935
11	NC_020384	TGCAGC	2	12	48798	48809	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452195940
12	NC_020384	AGCTGG	2	12	49528	49539	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	452195941
13	NC_020384	TTAATT	2	12	57026	57037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452195947
14	NC_020384	TAGAAC	2	12	60773	60784	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452195952
15	NC_020384	GATAAA	2	12	63530	63541	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452195956
16	NC_020384	TAAATA	2	12	63615	63626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195956
17	NC_020384	CGTATT	2	12	67936	67947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452195961
18	NC_020384	ATTAAA	2	12	68232	68243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452195961
19	NC_020384	ATACAC	2	12	69513	69524	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	452195962
20	NC_020384	TTCAAT	2	12	71559	71570	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452195964
21	NC_020384	TTTTTC	2	12	79990	80001	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452195974
22	NC_020384	TTTGGT	2	12	87343	87354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452195983
23	NC_020384	TATATC	2	12	89960	89971	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452195985
24	NC_020384	TGTGTT	2	12	92283	92294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452195987
25	NC_020384	TTTCTC	2	12	94463	94474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452195987
26	NC_020384	ACCCAT	2	12	95261	95272	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	452195987
27	NC_020384	CTCTGG	2	12	96902	96913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452195988
28	NC_020384	CTTTTT	2	12	100962	100973	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452195990
29	NC_020384	TTTGAA	2	12	102897	102908	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452195995
30	NC_020384	TCATTT	2	12	111260	111271	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452196004
31	NC_020384	ACACGT	2	12	119575	119586	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	452196016
32	NC_020384	TTTAAA	2	12	119734	119745	50 %	50 %	0 %	0 %	452196016
33	NC_020384	CCTTTA	2	12	121922	121933	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	452196019
34	NC_020384	CTGGAT	2	12	122454	122465	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452196019
35	NC_020384	TTTGAA	2	12	124599	124610	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452196020
36	NC_020384	CCAAAG	2	12	124840	124851	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	452196020
37	NC_020384	TGCTCC	2	12	124980	124991	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	452196020
38	NC_020384	TGCTGT	2	12	125019	125030	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	452196020
39	NC_020384	TTTTGT	2	12	129591	129602	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	452196025
40	NC_020384	ACGATA	2	12	130141	130152	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452196025
41	NC_020384	CTAATG	2	12	133803	133814	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452196028
42	NC_020384	ATTTGG	2	12	137342	137353	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	452196031
43	NC_020384	TTTTAA	2	12	140007	140018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196033
44	NC_020384	TGATTT	2	12	143466	143477	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	452196036
45	NC_020384	CGTCTT	2	12	146951	146962	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	452196038
46	NC_020384	TATAGA	2	12	147676	147687	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452196038
47	NC_020384	AAAGGA	2	12	148766	148777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196039
48	NC_020384	GAAAGT	2	12	151915	151926	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452196042
49	NC_020384	TTTAAA	2	12	154259	154270	50 %	50 %	0 %	0 %	452196045
50	NC_020384	ATCAAT	2	12	155311	155322	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452196047
51	NC_020384	AATATA	2	12	156387	156398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452196048
52	NC_020384	CTTTTT	2	12	158578	158589	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452196051
53	NC_020384	ATAAAA	2	12	161692	161703	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	452196057
54	NC_020384	ATCATT	2	12	164702	164713	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452196059
55	NC_020384	AAACAA	2	12	170492	170503	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	452196062
56	NC_020384	AAAAGA	2	12	171824	171835	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452196062
57	NC_020384	TTTGAA	2	12	175669	175680	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452196067
58	NC_020384	AAATGA	2	12	175734	175745	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452196067
59	NC_020384	AGAGAA	2	12	178404	178415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196069
60	NC_020384	TACTCA	2	12	178824	178835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452196069
61	NC_020384	GAAAGA	2	12	180859	180870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196070
62	NC_020384	AAAATT	2	12	181456	181467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452196070
63	NC_020384	GAAATA	2	12	181542	181553	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452196070
64	NC_020384	GAAAAA	2	12	182687	182698	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452196070
65	NC_020384	GAAAAT	2	12	182942	182953	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452196071
66	NC_020384	ATGGGA	2	12	185153	185164	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	452196072
67	NC_020384	AGAACA	2	12	198523	198534	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	452196089
68	NC_020384	AATTGA	2	12	199480	199491	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452196090
69	NC_020384	AATGAA	2	12	199499	199510	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452196090
70	NC_020384	AAAGGA	2	12	201095	201106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196093
71	NC_020384	CATTAG	2	12	201931	201942	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452196094
72	NC_020384	ACGTAA	2	12	207786	207797	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452196100
73	NC_020384	TTACTT	2	12	213444	213455	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452196110
74	NC_020384	TATTTT	2	12	227043	227054	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452196121
75	NC_020384	CAAGCA	2	12	228031	228042	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	452196123
76	NC_020384	GCTGCA	2	12	230762	230773	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452196124
77	NC_020384	AGATGA	2	12	233137	233148	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452196126
78	NC_020384	TAAATT	2	12	233515	233526	50 %	50 %	0 %	0 %	452196126
79	NC_020384	AATGTT	2	12	239544	239555	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452196135
80	NC_020384	ATTTTT	2	12	240412	240423	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452196136
81	NC_020384	AATTTA	2	12	241756	241767	50 %	50 %	0 %	0 %	452196137
82	NC_020384	CCTACA	2	12	243723	243734	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	452196140
83	NC_020384	ATGTGC	2	12	244511	244522	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452196140
84	NC_020384	CAAGCA	2	12	247552	247563	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	452196144
85	NC_020384	AAACAA	2	12	250927	250938	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	452196151
86	NC_020384	ATGAAC	2	12	256340	256351	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452196157
87	NC_020384	AATGTA	2	12	256814	256825	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452196157
88	NC_020384	CAAGCA	2	12	259508	259519	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	452196158
89	NC_020384	GAAAGT	2	12	268508	268519	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452196167
90	NC_020384	AACCGT	2	12	270019	270030	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	452196168
91	NC_020384	GAAGTA	2	12	271255	271266	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452196169
92	NC_020384	TTAAGA	2	12	273740	273751	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452196169
93	NC_020384	ATGTAG	2	12	274178	274189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196169
94	NC_020384	GGTATT	2	12	275421	275432	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	452196170
95	NC_020384	CTTAAA	2	12	283302	283313	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452196177
96	NC_020384	CACAAT	2	12	284623	284634	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	452196178

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.