MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-285

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020384	CATAT	2	10	2926	2935	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020384	ATACA	2	10	3560	3569	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_020384	ATATT	2	10	4029	4038	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020384	TAAAT	2	10	5340	5349	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020384	AGTAA	2	10	6267	6276	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020384	TATTG	2	10	6506	6515	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020384	AATAT	2	10	6828	6837	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020384	TACAT	2	10	7119	7128	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020384	AACAC	2	10	7191	7200	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_020384	TAATA	2	10	7836	7845	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020384	ATTAC	2	10	8271	8280	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_020384	AATTA	2	10	9902	9911	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020384	AATTT	2	10	9926	9935	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020384	TATGT	2	10	9986	9995	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020384	TATTC	2	10	12483	12492	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020384	ATTTC	2	10	12844	12853	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020384	GCTTT	2	10	14444	14453	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020384	ATGAT	2	10	14912	14921	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020384	ATTGA	2	10	16139	16148	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020384	AAAAT	2	10	16581	16590	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020384	AATCA	2	10	17748	17757	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_020384	CAAAA	2	10	18332	18341	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_020384	TGTAA	2	10	21202	21211	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020384	AGCTT	2	10	23957	23966	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020384	CTTTA	2	10	26850	26859	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020384	ATAAA	2	10	28853	28862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020384	AATTA	2	10	32042	32051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020384	AATTT	2	10	33228	33237	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020384	CTATA	2	10	39498	39507	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020384	TAGAT	2	10	39694	39703	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020384	ACTTA	2	10	39742	39751	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020384	TATAA	2	10	40220	40229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020384	GCAAT	2	10	40481	40490	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_020384	CATAT	2	10	49324	49333	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020384	AATTT	2	10	51700	51709	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020384	ATTTT	2	10	51999	52008	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020384	TATAG	2	10	53775	53784	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020384	AAAAT	2	10	61797	61806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020384	ATTTT	2	10	69106	69115	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020384	ATAAA	2	10	69943	69952	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020384	AAAAT	2	10	70401	70410	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020384	CATTT	2	10	81385	81394	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_020384	CTTGA	2	10	85415	85424	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020384	CCTTC	2	10	87856	87865	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
45	NC_020384	TAAAA	2	10	110622	110631	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020384	CACAA	2	10	112279	112288	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_020384	TATTT	2	10	121122	121131	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020384	TAAAT	2	10	128920	128929	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020384	TAGGT	2	10	133107	133116	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020384	AATCA	2	10	136770	136779	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_020384	TCACC	2	10	138484	138493	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_020384	TTTGA	2	10	148308	148317	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020384	GAGAA	2	10	160780	160789	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020384	TTTTA	2	10	163531	163540	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020384	AATCT	2	10	165278	165287	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_020384	TATAT	2	10	174644	174653	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020384	AGTAG	2	10	177451	177460	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020384	AAAAT	2	10	179394	179403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020384	ATATA	2	10	182870	182879	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020384	AAATT	2	10	187646	187655	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020384	GATAA	2	10	187716	187725	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020384	GATAA	2	10	188524	188533	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020384	TACTG	2	10	188975	188984	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_020384	TTGTG	2	10	189467	189476	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020384	AGGAG	2	10	193275	193284	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020384	TATCA	2	10	201581	201590	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_020384	AAAAG	2	10	203017	203026	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020384	ATGTT	2	10	204102	204111	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020384	TATGA	2	10	207162	207171	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020384	TCATT	2	10	210094	210103	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_020384	CTTTT	2	10	214111	214120	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_020384	ATCAA	2	10	214144	214153	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_020384	TAATC	2	10	215002	215011	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_020384	TAATA	2	10	216246	216255	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020384	GCTTT	2	10	219611	219620	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_020384	TAAAC	2	10	220998	221007	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_020384	AATAA	2	10	221208	221217	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020384	TTTAA	2	10	224428	224437	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020384	ATATA	2	10	224816	224825	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020384	ATGAA	2	10	229567	229576	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020384	AAACG	2	10	234136	234145	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_020384	TGAAA	2	10	239992	240001	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020384	GAAAA	2	10	243389	243398	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020384	TAAAA	2	10	246173	246182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020384	GAAAG	2	10	250416	250425	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020384	GTAAA	2	10	251454	251463	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020384	AAAAT	2	10	251733	251742	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020384	CATTC	2	10	252022	252031	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_020384	AAAAT	2	10	252346	252355	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020384	TTTGG	2	10	254075	254084	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020384	TAACA	2	10	254295	254304	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_020384	TGTAA	2	10	254803	254812	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020384	AAAGC	2	10	255251	255260	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_020384	TTTTG	2	10	260805	260814	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020384	AAATA	2	10	260935	260944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020384	TTAAT	2	10	264833	264842	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020384	AAAAT	2	10	265159	265168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020384	TAAAA	2	10	265182	265191	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020384	ATTAA	2	10	267783	267792	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020384	AAACT	2	10	284551	284560	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.