MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-285

Total Repeats: 164

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020384	ACAAA	2	10	88	97	80 %	0 %	0 %	20 %	452195885
2	NC_020384	ATTTG	2	10	140	149	20 %	60 %	20 %	0 %	452195885
3	NC_020384	GAACA	2	10	1058	1067	60 %	0 %	20 %	20 %	452195886
4	NC_020384	TTATT	2	10	2065	2074	20 %	80 %	0 %	0 %	452195887
5	NC_020384	ATATC	2	10	5679	5688	40 %	40 %	0 %	20 %	452195890
6	NC_020384	TTTGT	2	10	7359	7368	0 %	80 %	20 %	0 %	452195891
7	NC_020384	CTATT	2	10	8422	8431	20 %	60 %	0 %	20 %	452195893
8	NC_020384	ATTTT	2	10	8552	8561	20 %	80 %	0 %	0 %	452195893
9	NC_020384	TTTAC	2	10	9270	9279	20 %	60 %	0 %	20 %	452195894
10	NC_020384	CTACA	2	10	10175	10184	40 %	20 %	0 %	40 %	452195895
11	NC_020384	AAAGT	2	10	10878	10887	60 %	20 %	20 %	0 %	452195895
12	NC_020384	TGTTT	2	10	13823	13832	0 %	80 %	20 %	0 %	452195899
13	NC_020384	AAAAC	2	10	14792	14801	80 %	0 %	0 %	20 %	452195900
14	NC_020384	TAATA	2	10	17431	17440	60 %	40 %	0 %	0 %	452195902
15	NC_020384	TCAAT	2	10	21971	21980	40 %	40 %	0 %	20 %	452195907
16	NC_020384	AACAA	2	10	23280	23289	80 %	0 %	0 %	20 %	452195908
17	NC_020384	CCATT	2	10	24555	24564	20 %	40 %	0 %	40 %	452195909
18	NC_020384	TCTTA	2	10	32702	32711	20 %	60 %	0 %	20 %	452195918
19	NC_020384	AATAC	2	10	32878	32887	60 %	20 %	0 %	20 %	452195918
20	NC_020384	AGTAA	2	10	36429	36438	60 %	20 %	20 %	0 %	452195923
21	NC_020384	ACAGA	2	10	44724	44733	60 %	0 %	20 %	20 %	452195933
22	NC_020384	TTGCT	2	10	46198	46207	0 %	60 %	20 %	20 %	452195934
23	NC_020384	TTGTT	2	10	46708	46717	0 %	80 %	20 %	0 %	452195935
24	NC_020384	AAATT	2	10	48335	48344	60 %	40 %	0 %	0 %	452195938
25	NC_020384	GAAAA	2	10	48452	48461	80 %	0 %	20 %	0 %	452195938
26	NC_020384	ATGAA	2	10	48484	48493	60 %	20 %	20 %	0 %	452195938
27	NC_020384	TTCAA	2	10	50129	50138	40 %	40 %	0 %	20 %	452195942
28	NC_020384	TCTTT	2	10	52259	52268	0 %	80 %	0 %	20 %	452195943
29	NC_020384	ATTAT	2	10	54575	54584	40 %	60 %	0 %	0 %	452195945
30	NC_020384	AGAAA	2	10	55859	55868	80 %	0 %	20 %	0 %	452195946
31	NC_020384	ATTGA	2	10	56784	56793	40 %	40 %	20 %	0 %	452195946
32	NC_020384	TTTTA	2	10	57374	57383	20 %	80 %	0 %	0 %	452195948
33	NC_020384	AAAAT	2	10	59782	59791	80 %	20 %	0 %	0 %	452195950
34	NC_020384	TATAA	2	10	60445	60454	60 %	40 %	0 %	0 %	452195951
35	NC_020384	AATAC	2	10	62470	62479	60 %	20 %	0 %	20 %	452195955
36	NC_020384	AAGAA	2	10	62521	62530	80 %	0 %	20 %	0 %	452195955
37	NC_020384	AAATG	2	10	62727	62736	60 %	20 %	20 %	0 %	452195956
38	NC_020384	AAGAA	2	10	62791	62800	80 %	0 %	20 %	0 %	452195956
39	NC_020384	TTTCC	2	10	65197	65206	0 %	60 %	0 %	40 %	452195958
40	NC_020384	CTTTA	2	10	76112	76121	20 %	60 %	0 %	20 %	452195969
41	NC_020384	TATGG	2	10	76892	76901	20 %	40 %	40 %	0 %	452195970
42	NC_020384	TCTTT	2	10	77151	77160	0 %	80 %	0 %	20 %	452195970
43	NC_020384	CATTT	2	10	78987	78996	20 %	60 %	0 %	20 %	452195972
44	NC_020384	ACAAA	2	10	81075	81084	80 %	0 %	0 %	20 %	452195977
45	NC_020384	ATTAC	2	10	82128	82137	40 %	40 %	0 %	20 %	452195979
46	NC_020384	AATGA	2	10	83447	83456	60 %	20 %	20 %	0 %	452195981
47	NC_020384	CCTTT	2	10	84574	84583	0 %	60 %	0 %	40 %	452195981
48	NC_020384	TTTTC	2	10	84706	84715	0 %	80 %	0 %	20 %	452195981
49	NC_020384	TCGGA	2	10	85608	85617	20 %	20 %	40 %	20 %	452195982
50	NC_020384	TGTCC	2	10	86003	86012	0 %	40 %	20 %	40 %	452195983
51	NC_020384	TTCGC	2	10	87250	87259	0 %	40 %	20 %	40 %	452195983
52	NC_020384	TTTCA	2	10	89273	89282	20 %	60 %	0 %	20 %	452195985
53	NC_020384	TTCAC	2	10	92331	92340	20 %	40 %	0 %	40 %	452195987
54	NC_020384	AACCA	2	10	95234	95243	60 %	0 %	0 %	40 %	452195987
55	NC_020384	TAGAT	2	10	96029	96038	40 %	40 %	20 %	0 %	452195987
56	NC_020384	ATTTA	2	10	97490	97499	40 %	60 %	0 %	0 %	452195989
57	NC_020384	TCGTT	2	10	98189	98198	0 %	60 %	20 %	20 %	452195989
58	NC_020384	CCAGT	2	10	98555	98564	20 %	20 %	20 %	40 %	452195989
59	NC_020384	CTTTT	2	10	100944	100953	0 %	80 %	0 %	20 %	452195990
60	NC_020384	TAAAT	2	10	101340	101349	60 %	40 %	0 %	0 %	452195991
61	NC_020384	TACCA	2	10	102887	102896	40 %	20 %	0 %	40 %	452195995
62	NC_020384	CCATT	2	10	103570	103579	20 %	40 %	0 %	40 %	452195997
63	NC_020384	AATCA	2	10	105127	105136	60 %	20 %	0 %	20 %	452195999
64	NC_020384	AATCA	2	10	105139	105148	60 %	20 %	0 %	20 %	452195999
65	NC_020384	CTCAT	2	10	105611	105620	20 %	40 %	0 %	40 %	452195999
66	NC_020384	AGCGA	2	10	107260	107269	40 %	0 %	40 %	20 %	452196001
67	NC_020384	ACCTT	2	10	107540	107549	20 %	40 %	0 %	40 %	452196001
68	NC_020384	TTTTA	2	10	113099	113108	20 %	80 %	0 %	0 %	452196007
69	NC_020384	TAATG	2	10	113958	113967	40 %	40 %	20 %	0 %	452196008
70	NC_020384	CATTT	2	10	114558	114567	20 %	60 %	0 %	20 %	452196009
71	NC_020384	CTTTC	2	10	117586	117595	0 %	60 %	0 %	40 %	452196014
72	NC_020384	TTTTC	2	10	119001	119010	0 %	80 %	0 %	20 %	452196015
73	NC_020384	ATTGG	2	10	119278	119287	20 %	40 %	40 %	0 %	452196016
74	NC_020384	TCATT	2	10	121311	121320	20 %	60 %	0 %	20 %	452196019
75	NC_020384	CTTTT	2	10	121813	121822	0 %	80 %	0 %	20 %	452196019
76	NC_020384	TTTTC	2	10	121956	121965	0 %	80 %	0 %	20 %	452196019
77	NC_020384	CTTTT	2	10	126237	126246	0 %	80 %	0 %	20 %	452196023
78	NC_020384	TTGGT	2	10	126257	126266	0 %	60 %	40 %	0 %	452196023
79	NC_020384	CATCA	2	10	127583	127592	40 %	20 %	0 %	40 %	452196023
80	NC_020384	CTTCT	2	10	128151	128160	0 %	60 %	0 %	40 %	452196024
81	NC_020384	TTTCT	2	10	128493	128502	0 %	80 %	0 %	20 %	452196024
82	NC_020384	AACAA	2	10	132244	132253	80 %	0 %	0 %	20 %	452196026
83	NC_020384	TTAAT	2	10	141764	141773	40 %	60 %	0 %	0 %	452196035
84	NC_020384	AAGTG	2	10	142050	142059	40 %	20 %	40 %	0 %	452196035
85	NC_020384	TTACT	2	10	150800	150809	20 %	60 %	0 %	20 %	452196041
86	NC_020384	GAAAT	2	10	154434	154443	60 %	20 %	20 %	0 %	452196045
87	NC_020384	TTCTA	2	10	158021	158030	20 %	60 %	0 %	20 %	452196050
88	NC_020384	TTCAA	2	10	162692	162701	40 %	40 %	0 %	20 %	452196057
89	NC_020384	ATTAT	2	10	162718	162727	40 %	60 %	0 %	0 %	452196057
90	NC_020384	TGTAT	2	10	163591	163600	20 %	60 %	20 %	0 %	452196058
91	NC_020384	TGGCT	2	10	167773	167782	0 %	40 %	40 %	20 %	452196060
92	NC_020384	CATAA	2	10	168894	168903	60 %	20 %	0 %	20 %	452196061
93	NC_020384	GAAAA	2	10	169041	169050	80 %	0 %	20 %	0 %	452196061
94	NC_020384	TTAAT	2	10	172281	172290	40 %	60 %	0 %	0 %	452196063
95	NC_020384	ATATT	2	10	172806	172815	40 %	60 %	0 %	0 %	452196063
96	NC_020384	AAATT	2	10	175819	175828	60 %	40 %	0 %	0 %	452196067
97	NC_020384	AATTA	2	10	175902	175911	60 %	40 %	0 %	0 %	452196067
98	NC_020384	AAGAG	2	10	176324	176333	60 %	0 %	40 %	0 %	452196068
99	NC_020384	GATAT	2	10	179003	179012	40 %	40 %	20 %	0 %	452196069
100	NC_020384	GGAGA	2	10	185598	185607	40 %	0 %	60 %	0 %	452196072
101	NC_020384	AGGAA	2	10	191454	191463	60 %	0 %	40 %	0 %	452196083
102	NC_020384	TTTTG	2	10	191863	191872	0 %	80 %	20 %	0 %	452196085
103	NC_020384	TTACA	2	10	192007	192016	40 %	40 %	0 %	20 %	452196085
104	NC_020384	ATGGA	2	10	196501	196510	40 %	20 %	40 %	0 %	452196088
105	NC_020384	AATGC	2	10	197464	197473	40 %	20 %	20 %	20 %	452196088
106	NC_020384	GAAAT	2	10	199614	199623	60 %	20 %	20 %	0 %	452196090
107	NC_020384	GTATG	2	10	200912	200921	20 %	40 %	40 %	0 %	452196092
108	NC_020384	TTCTT	2	10	200930	200939	0 %	80 %	0 %	20 %	452196092
109	NC_020384	CCATA	2	10	201215	201224	40 %	20 %	0 %	40 %	452196093
110	NC_020384	TTCCG	2	10	201334	201343	0 %	40 %	20 %	40 %	452196093
111	NC_020384	ATTTT	2	10	201982	201991	20 %	80 %	0 %	0 %	452196094
112	NC_020384	GGAAA	2	10	202142	202151	60 %	0 %	40 %	0 %	452196095
113	NC_020384	AATGA	2	10	206181	206190	60 %	20 %	20 %	0 %	452196099
114	NC_020384	AAAGA	2	10	206682	206691	80 %	0 %	20 %	0 %	452196099
115	NC_020384	AGAAA	2	10	208572	208581	80 %	0 %	20 %	0 %	452196101
116	NC_020384	TGTAA	2	10	209895	209904	40 %	40 %	20 %	0 %	452196104
117	NC_020384	CGAAA	2	10	211309	211318	60 %	0 %	20 %	20 %	452196105
118	NC_020384	AATTT	2	10	212059	212068	40 %	60 %	0 %	0 %	452196108
119	NC_020384	CATTA	2	10	213733	213742	40 %	40 %	0 %	20 %	452196110
120	NC_020384	TGAAA	2	10	216783	216792	60 %	20 %	20 %	0 %	452196113
121	NC_020384	TAACA	2	10	219820	219829	60 %	20 %	0 %	20 %	452196117
122	NC_020384	AAAAC	2	10	219965	219974	80 %	0 %	0 %	20 %	452196117
123	NC_020384	TGTTT	2	10	223573	223582	0 %	80 %	20 %	0 %	452196119
124	NC_020384	TTGTT	2	10	225226	225235	0 %	80 %	20 %	0 %	452196120
125	NC_020384	GATGG	2	10	225353	225362	20 %	20 %	60 %	0 %	452196120
126	NC_020384	TTAAA	2	10	226391	226400	60 %	40 %	0 %	0 %	452196121
127	NC_020384	AGACG	2	10	226740	226749	40 %	0 %	40 %	20 %	452196121
128	NC_020384	AAACA	2	10	229965	229974	80 %	0 %	0 %	20 %	452196124
129	NC_020384	AAGAT	2	10	231683	231692	60 %	20 %	20 %	0 %	452196125
130	NC_020384	AACCT	2	10	233532	233541	40 %	20 %	0 %	40 %	452196126
131	NC_020384	TGGGA	2	10	237635	237644	20 %	20 %	60 %	0 %	452196132
132	NC_020384	TGGAA	2	10	238085	238094	40 %	20 %	40 %	0 %	452196132
133	NC_020384	TTAGT	2	10	239363	239372	20 %	60 %	20 %	0 %	452196135
134	NC_020384	TTCAA	2	10	241208	241217	40 %	40 %	0 %	20 %	452196137
135	NC_020384	TTCTA	2	10	242059	242068	20 %	60 %	0 %	20 %	452196138
136	NC_020384	ATATT	2	10	242699	242708	40 %	60 %	0 %	0 %	452196139
137	NC_020384	ATATA	2	10	242829	242838	60 %	40 %	0 %	0 %	452196139
138	NC_020384	ATATT	2	10	242880	242889	40 %	60 %	0 %	0 %	452196139
139	NC_020384	TAAAT	2	10	243405	243414	60 %	40 %	0 %	0 %	452196140
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143	NC_020384	TGGAT	2	10	252879	252888	20 %	40 %	40 %	0 %	452196153
144	NC_020384	ATAAA	2	10	253307	253316	80 %	20 %	0 %	0 %	452196153
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164	NC_020384	TTCGC	2	10	281929	281938	0 %	40 %	20 %	40 %	452196176

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.