MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-285

Total Repeats: 263

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020384	ATTT	2	8	3750	3757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020384	TAAT	2	8	3985	3992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020384	ATAA	2	8	4623	4630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020384	TTTG	2	8	4730	4737	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020384	TAAT	2	8	4820	4827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020384	TAAT	2	8	5251	5258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020384	GAAA	2	8	5302	5309	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020384	CATG	2	8	5976	5983	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020384	TAAA	2	8	6110	6117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020384	TTAG	2	8	6251	6258	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020384	AGAT	2	8	6438	6445	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020384	AAAT	2	8	6483	6490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020384	GTTT	2	8	6637	6644	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020384	ACTT	2	8	6847	6854	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020384	ATCA	2	8	6933	6940	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020384	ACAT	2	8	7082	7089	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020384	TAGT	2	8	7709	7716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020384	ATTC	2	8	8236	8243	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020384	TCAT	2	8	8369	8376	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020384	ATCT	2	8	9070	9077	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020384	CCTA	2	8	9358	9365	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020384	AATA	2	8	9662	9669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020384	CTTA	2	8	11489	11496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020384	AATA	2	8	11504	11511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020384	ACTA	2	8	11730	11737	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020384	TCTT	2	8	12145	12152	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020384	ATAA	2	8	12684	12691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020384	TATG	2	8	12762	12769	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020384	GATA	2	8	14163	14170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020384	CTTC	2	8	14210	14217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020384	AGGA	2	8	14284	14291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020384	TCCT	2	8	14381	14388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020384	TAGG	2	8	14406	14413	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020384	GATG	2	8	15470	15477	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020384	AATT	2	8	16059	16066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020384	GATT	2	8	16102	16109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020384	ACTA	2	8	16722	16729	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020384	TTTA	2	8	16767	16774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020384	TAAA	2	8	17720	17727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020384	TTAT	2	8	17924	17931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020384	GTTA	2	8	18264	18271	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020384	CTTC	2	8	18350	18357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020384	AGAA	2	8	20110	20117	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020384	TAAT	2	8	20468	20475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020384	CATC	2	8	20566	20573	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020384	AGAA	2	8	20641	20648	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020384	CAAT	2	8	20976	20983	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020384	TTCT	2	8	22380	22387	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020384	TTTA	2	8	25300	25307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020384	AACA	2	8	26041	26048	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020384	AAGA	2	8	26745	26752	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020384	TGAT	2	8	28602	28609	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020384	CATC	2	8	28643	28650	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020384	GTTT	2	8	29295	29302	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020384	ATTA	2	8	29311	29318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020384	ATGA	2	8	29715	29722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020384	TTAA	2	8	30588	30595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020384	TATT	2	8	30608	30615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020384	AAAT	2	8	31951	31958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020384	ATTT	2	8	33168	33175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020384	AGGA	2	8	33299	33306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020384	TTTA	2	8	33552	33559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020384	ATAG	2	8	36858	36865	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020384	TTTC	2	8	39532	39539	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020384	TGAA	2	8	39634	39641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020384	AGAA	2	8	40037	40044	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020384	TTAG	2	8	40207	40214	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020384	AATT	2	8	42857	42864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020384	AATT	2	8	45168	45175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020384	AATT	2	8	47045	47052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020384	TATG	2	8	47286	47293	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020384	AATG	2	8	47401	47408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020384	TAAG	2	8	48271	48278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020384	TAAC	2	8	49131	49138	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020384	CTTT	2	8	49178	49185	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020384	TTAG	2	8	49305	49312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020384	ACTT	2	8	49343	49350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020384	TTCT	2	8	50082	50089	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020384	AGCT	2	8	50094	50101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020384	CAAT	2	8	51844	51851	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_020384	TGAA	2	8	56984	56991	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020384	TATG	2	8	60087	60094	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020384	TTTG	2	8	61770	61777	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020384	TAAC	2	8	62187	62194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020384	ATTT	2	8	63770	63777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020384	TTTA	2	8	63801	63808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020384	TTCT	2	8	67534	67541	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020384	AAAT	2	8	69297	69304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020384	TAAT	2	8	69674	69681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020384	AATT	2	8	69811	69818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020384	CAAA	2	8	70380	70387	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_020384	ATTA	2	8	70431	70438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020384	AAAT	2	8	72052	72059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020384	TAAA	2	8	72146	72153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020384	AATT	2	8	75566	75573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020384	TGTT	2	8	75733	75740	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020384	TAAA	2	8	77751	77758	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020384	TTTA	2	8	77924	77931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020384	TTAA	2	8	78888	78895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020384	TCGT	2	8	78943	78950	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020384	AATA	2	8	81456	81463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020384	CCTT	2	8	85025	85032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020384	TCTA	2	8	87922	87929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020384	AAAC	2	8	90547	90554	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_020384	CATG	2	8	91027	91034	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_020384	CCTT	2	8	96165	96172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020384	TTCT	2	8	97175	97182	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_020384	GTAA	2	8	99349	99356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020384	CTAA	2	8	99458	99465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_020384	TACA	2	8	99552	99559	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_020384	ATTT	2	8	103305	103312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020384	ATCA	2	8	103707	103714	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_020384	TTGT	2	8	103737	103744	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020384	GTTT	2	8	108795	108802	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020384	CTGT	2	8	110680	110687	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_020384	TTAT	2	8	112394	112401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020384	TTTA	2	8	112521	112528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020384	AACA	2	8	112562	112569	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020384	ATTT	2	8	114856	114863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020384	TAAT	2	8	120377	120384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020384	TAAA	2	8	120820	120827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020384	TAAA	2	8	123552	123559	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020384	ATTT	3	12	123564	123575	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020384	ATTA	3	12	125140	125151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020384	ATAA	2	8	128930	128937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020384	ACAA	2	8	129086	129093	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_020384	AAAC	2	8	129203	129210	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_020384	TCAA	2	8	130765	130772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_020384	AATG	2	8	131112	131119	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020384	ACTA	2	8	131446	131453	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_020384	TATT	2	8	131681	131688	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020384	ATTT	2	8	131833	131840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020384	TCTA	2	8	131985	131992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_020384	TTTA	2	8	132806	132813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020384	ATAA	2	8	132953	132960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020384	TCCG	2	8	135165	135172	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020384	AAAT	2	8	135362	135369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020384	ATAA	2	8	138586	138593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020384	TATC	2	8	138799	138806	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_020384	GAAG	2	8	138966	138973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020384	GTAC	2	8	143072	143079	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_020384	GGAA	2	8	143970	143977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020384	ACTA	2	8	146293	146300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_020384	CGCA	2	8	146355	146362	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_020384	TAAA	2	8	148503	148510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020384	AATC	2	8	149368	149375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_020384	TTTG	2	8	152141	152148	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020384	TATT	2	8	152196	152203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020384	TCTT	2	8	159107	159114	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_020384	CATA	2	8	161656	161663	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_020384	ACAA	2	8	165158	165165	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_020384	GAAA	2	8	165747	165754	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020384	ATGA	2	8	166213	166220	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020384	TTTA	2	8	168349	168356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020384	AAAC	2	8	171940	171947	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_020384	TAAA	2	8	172225	172232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_020384	TAAT	2	8	173426	173433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_020384	TTTG	2	8	174485	174492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_020384	TATT	2	8	174787	174794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_020384	TAAA	2	8	177320	177327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_020384	TAAA	2	8	177390	177397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_020384	TGAT	2	8	179603	179610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_020384	TTTA	2	8	215264	215271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_020384	TAAA	2	8	215959	215966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_020384	TTAA	2	8	215971	215978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_020384	AATA	2	8	216097	216104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.