MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-285

Total Repeats: 401

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020384	AT	3	6	1498	1503	50 %	50 %	0 %	0 %	452195886
2	NC_020384	TA	3	6	1661	1666	50 %	50 %	0 %	0 %	452195886
3	NC_020384	CA	4	8	2484	2491	50 %	0 %	0 %	50 %	452195888
4	NC_020384	GT	4	8	7346	7353	0 %	50 %	50 %	0 %	452195891
5	NC_020384	AT	3	6	10711	10716	50 %	50 %	0 %	0 %	452195895
6	NC_020384	GT	3	6	13074	13079	0 %	50 %	50 %	0 %	452195899
7	NC_020384	GT	3	6	13521	13526	0 %	50 %	50 %	0 %	452195899
8	NC_020384	AT	3	6	14598	14603	50 %	50 %	0 %	0 %	452195900
9	NC_020384	AG	3	6	14772	14777	50 %	0 %	50 %	0 %	452195900
10	NC_020384	AT	3	6	14878	14883	50 %	50 %	0 %	0 %	452195900
11	NC_020384	AT	3	6	17302	17307	50 %	50 %	0 %	0 %	452195902
12	NC_020384	AT	3	6	18702	18707	50 %	50 %	0 %	0 %	452195904
13	NC_020384	AT	4	8	18848	18855	50 %	50 %	0 %	0 %	452195904
14	NC_020384	AT	3	6	19112	19117	50 %	50 %	0 %	0 %	452195904
15	NC_020384	TA	3	6	19339	19344	50 %	50 %	0 %	0 %	452195904
16	NC_020384	GT	3	6	19410	19415	0 %	50 %	50 %	0 %	452195904
17	NC_020384	GA	3	6	19428	19433	50 %	0 %	50 %	0 %	452195904
18	NC_020384	TA	3	6	19456	19461	50 %	50 %	0 %	0 %	452195904
19	NC_020384	CA	3	6	19530	19535	50 %	0 %	0 %	50 %	452195904
20	NC_020384	AC	3	6	21603	21608	50 %	0 %	0 %	50 %	452195906
21	NC_020384	AT	3	6	21807	21812	50 %	50 %	0 %	0 %	452195907
22	NC_020384	CT	3	6	22962	22967	0 %	50 %	0 %	50 %	452195908
23	NC_020384	AT	3	6	23040	23045	50 %	50 %	0 %	0 %	452195908
24	NC_020384	TC	3	6	23069	23074	0 %	50 %	0 %	50 %	452195908
25	NC_020384	TA	3	6	23158	23163	50 %	50 %	0 %	0 %	452195908
26	NC_020384	TA	3	6	23384	23389	50 %	50 %	0 %	0 %	452195908
27	NC_020384	AT	4	8	23647	23654	50 %	50 %	0 %	0 %	452195908
28	NC_020384	AT	3	6	23795	23800	50 %	50 %	0 %	0 %	452195908
29	NC_020384	AT	3	6	24498	24503	50 %	50 %	0 %	0 %	452195909
30	NC_020384	TA	3	6	25018	25023	50 %	50 %	0 %	0 %	452195909
31	NC_020384	CA	3	6	27803	27808	50 %	0 %	0 %	50 %	452195911
32	NC_020384	TC	3	6	27821	27826	0 %	50 %	0 %	50 %	452195911
33	NC_020384	TA	3	6	30761	30766	50 %	50 %	0 %	0 %	452195915
34	NC_020384	AT	3	6	31363	31368	50 %	50 %	0 %	0 %	452195915
35	NC_020384	AG	3	6	31466	31471	50 %	0 %	50 %	0 %	452195915
36	NC_020384	TA	4	8	32077	32084	50 %	50 %	0 %	0 %	452195917
37	NC_020384	TA	3	6	33058	33063	50 %	50 %	0 %	0 %	452195918
38	NC_020384	TA	3	6	33407	33412	50 %	50 %	0 %	0 %	452195919
39	NC_020384	TA	3	6	33956	33961	50 %	50 %	0 %	0 %	452195920
40	NC_020384	TA	3	6	35000	35005	50 %	50 %	0 %	0 %	452195922
41	NC_020384	AT	3	6	35163	35168	50 %	50 %	0 %	0 %	452195922
42	NC_020384	AT	3	6	36753	36758	50 %	50 %	0 %	0 %	452195923
43	NC_020384	TA	3	6	38198	38203	50 %	50 %	0 %	0 %	452195926
44	NC_020384	AT	3	6	38520	38525	50 %	50 %	0 %	0 %	452195926
45	NC_020384	CT	3	6	39305	39310	0 %	50 %	0 %	50 %	452195926
46	NC_020384	TC	3	6	41292	41297	0 %	50 %	0 %	50 %	452195929
47	NC_020384	TC	3	6	42492	42497	0 %	50 %	0 %	50 %	452195930
48	NC_020384	AG	3	6	42682	42687	50 %	0 %	50 %	0 %	452195930
49	NC_020384	AT	3	6	43016	43021	50 %	50 %	0 %	0 %	452195931
50	NC_020384	AT	3	6	43781	43786	50 %	50 %	0 %	0 %	452195933
51	NC_020384	AC	3	6	43851	43856	50 %	0 %	0 %	50 %	452195933
52	NC_020384	AT	3	6	44030	44035	50 %	50 %	0 %	0 %	452195933
53	NC_020384	GT	3	6	44736	44741	0 %	50 %	50 %	0 %	452195933
54	NC_020384	CT	3	6	44965	44970	0 %	50 %	0 %	50 %	452195933
55	NC_020384	AG	3	6	45827	45832	50 %	0 %	50 %	0 %	452195934
56	NC_020384	CT	3	6	46849	46854	0 %	50 %	0 %	50 %	452195935
57	NC_020384	AT	3	6	47621	47626	50 %	50 %	0 %	0 %	452195936
58	NC_020384	AT	3	6	48022	48027	50 %	50 %	0 %	0 %	452195937
59	NC_020384	GA	3	6	48385	48390	50 %	0 %	50 %	0 %	452195938
60	NC_020384	CA	3	6	48622	48627	50 %	0 %	0 %	50 %	452195939
61	NC_020384	AC	3	6	48692	48697	50 %	0 %	0 %	50 %	452195939
62	NC_020384	TC	3	6	50301	50306	0 %	50 %	0 %	50 %	452195942
63	NC_020384	AT	3	6	50405	50410	50 %	50 %	0 %	0 %	452195942
64	NC_020384	TA	3	6	50769	50774	50 %	50 %	0 %	0 %	452195942
65	NC_020384	AT	3	6	51087	51092	50 %	50 %	0 %	0 %	452195942
66	NC_020384	AT	3	6	52789	52794	50 %	50 %	0 %	0 %	452195944
67	NC_020384	AT	3	6	55076	55081	50 %	50 %	0 %	0 %	452195946
68	NC_020384	AT	3	6	55778	55783	50 %	50 %	0 %	0 %	452195946
69	NC_020384	AT	3	6	56141	56146	50 %	50 %	0 %	0 %	452195946
70	NC_020384	AT	3	6	56882	56887	50 %	50 %	0 %	0 %	452195946
71	NC_020384	TA	3	6	57074	57079	50 %	50 %	0 %	0 %	452195947
72	NC_020384	TA	3	6	57605	57610	50 %	50 %	0 %	0 %	452195948
73	NC_020384	TA	3	6	57687	57692	50 %	50 %	0 %	0 %	452195948
74	NC_020384	TG	3	6	57734	57739	0 %	50 %	50 %	0 %	452195948
75	NC_020384	TA	3	6	57971	57976	50 %	50 %	0 %	0 %	452195948
76	NC_020384	TA	3	6	58141	58146	50 %	50 %	0 %	0 %	452195948
77	NC_020384	TA	3	6	58151	58156	50 %	50 %	0 %	0 %	452195948
78	NC_020384	AT	3	6	58468	58473	50 %	50 %	0 %	0 %	452195949
79	NC_020384	AT	4	8	58668	58675	50 %	50 %	0 %	0 %	452195949
80	NC_020384	TA	3	6	58842	58847	50 %	50 %	0 %	0 %	452195949
81	NC_020384	AT	3	6	59281	59286	50 %	50 %	0 %	0 %	452195950
82	NC_020384	AT	3	6	59385	59390	50 %	50 %	0 %	0 %	452195950
83	NC_020384	CT	3	6	59504	59509	0 %	50 %	0 %	50 %	452195950
84	NC_020384	CT	3	6	60352	60357	0 %	50 %	0 %	50 %	452195951
85	NC_020384	TA	3	6	60885	60890	50 %	50 %	0 %	0 %	452195952
86	NC_020384	CT	3	6	61615	61620	0 %	50 %	0 %	50 %	452195954
87	NC_020384	AT	3	6	62761	62766	50 %	50 %	0 %	0 %	452195956
88	NC_020384	CA	3	6	63202	63207	50 %	0 %	0 %	50 %	452195956
89	NC_020384	AT	3	6	63229	63234	50 %	50 %	0 %	0 %	452195956
90	NC_020384	TA	3	6	63288	63293	50 %	50 %	0 %	0 %	452195956
91	NC_020384	TA	4	8	64186	64193	50 %	50 %	0 %	0 %	452195957
92	NC_020384	GA	3	6	64561	64566	50 %	0 %	50 %	0 %	452195957
93	NC_020384	AT	4	8	64577	64584	50 %	50 %	0 %	0 %	452195957
94	NC_020384	AC	3	6	64641	64646	50 %	0 %	0 %	50 %	452195957
95	NC_020384	TA	3	6	64849	64854	50 %	50 %	0 %	0 %	452195957
96	NC_020384	TA	3	6	65023	65028	50 %	50 %	0 %	0 %	452195957
97	NC_020384	AT	3	6	65180	65185	50 %	50 %	0 %	0 %	452195958
98	NC_020384	AT	3	6	65212	65217	50 %	50 %	0 %	0 %	452195958
99	NC_020384	TC	3	6	65365	65370	0 %	50 %	0 %	50 %	452195958
100	NC_020384	AT	3	6	65472	65477	50 %	50 %	0 %	0 %	452195958
101	NC_020384	TG	3	6	66476	66481	0 %	50 %	50 %	0 %	452195959
102	NC_020384	AT	3	6	67857	67862	50 %	50 %	0 %	0 %	452195961
103	NC_020384	TA	3	6	67989	67994	50 %	50 %	0 %	0 %	452195961
104	NC_020384	TA	3	6	68221	68226	50 %	50 %	0 %	0 %	452195961
105	NC_020384	TA	3	6	68254	68259	50 %	50 %	0 %	0 %	452195961
106	NC_020384	AT	3	6	68539	68544	50 %	50 %	0 %	0 %	452195961
107	NC_020384	CT	3	6	69416	69421	0 %	50 %	0 %	50 %	452195962
108	NC_020384	TA	4	8	70089	70096	50 %	50 %	0 %	0 %	452195963
109	NC_020384	TA	3	6	70106	70111	50 %	50 %	0 %	0 %	452195963
110	NC_020384	AT	3	6	71338	71343	50 %	50 %	0 %	0 %	452195964
111	NC_020384	CT	3	6	71614	71619	0 %	50 %	0 %	50 %	452195964
112	NC_020384	TA	3	6	71957	71962	50 %	50 %	0 %	0 %	452195964
113	NC_020384	TA	3	6	73769	73774	50 %	50 %	0 %	0 %	452195967
114	NC_020384	TA	3	6	73851	73856	50 %	50 %	0 %	0 %	452195967
115	NC_020384	AT	4	8	73915	73922	50 %	50 %	0 %	0 %	452195967
116	NC_020384	TC	3	6	74635	74640	0 %	50 %	0 %	50 %	452195968
117	NC_020384	CA	3	6	75226	75231	50 %	0 %	0 %	50 %	452195968
118	NC_020384	AT	3	6	77076	77081	50 %	50 %	0 %	0 %	452195970
119	NC_020384	AT	3	6	77205	77210	50 %	50 %	0 %	0 %	452195970
120	NC_020384	TC	3	6	77325	77330	0 %	50 %	0 %	50 %	452195970
121	NC_020384	TA	3	6	77467	77472	50 %	50 %	0 %	0 %	452195970
122	NC_020384	AT	3	6	78254	78259	50 %	50 %	0 %	0 %	452195971
123	NC_020384	TA	4	8	78648	78655	50 %	50 %	0 %	0 %	452195971
124	NC_020384	TA	3	6	79064	79069	50 %	50 %	0 %	0 %	452195972
125	NC_020384	AT	4	8	79434	79441	50 %	50 %	0 %	0 %	452195973
126	NC_020384	AG	3	6	80521	80526	50 %	0 %	50 %	0 %	452195975
127	NC_020384	TA	3	6	81317	81322	50 %	50 %	0 %	0 %	452195977
128	NC_020384	AT	3	6	81890	81895	50 %	50 %	0 %	0 %	452195978
129	NC_020384	CA	3	6	82994	82999	50 %	0 %	0 %	50 %	452195979
130	NC_020384	TC	3	6	83117	83122	0 %	50 %	0 %	50 %	452195980
131	NC_020384	TC	3	6	83518	83523	0 %	50 %	0 %	50 %	452195981
132	NC_020384	CA	3	6	83740	83745	50 %	0 %	0 %	50 %	452195981
133	NC_020384	TA	3	6	84889	84894	50 %	50 %	0 %	0 %	452195981
134	NC_020384	TC	3	6	86213	86218	0 %	50 %	0 %	50 %	452195983
135	NC_020384	TG	3	6	86461	86466	0 %	50 %	50 %	0 %	452195983
136	NC_020384	AC	3	6	86596	86601	50 %	0 %	0 %	50 %	452195983
137	NC_020384	CA	3	6	87141	87146	50 %	0 %	0 %	50 %	452195983
138	NC_020384	TA	3	6	89338	89343	50 %	50 %	0 %	0 %	452195985
139	NC_020384	TG	3	6	89930	89935	0 %	50 %	50 %	0 %	452195985
140	NC_020384	CT	3	6	90187	90192	0 %	50 %	0 %	50 %	452195985
141	NC_020384	AC	3	6	91351	91356	50 %	0 %	0 %	50 %	452195986
142	NC_020384	AT	3	6	91816	91821	50 %	50 %	0 %	0 %	452195986
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.