MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-85

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020383	TAAACA	2	12	292	303	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452202279
2	NC_020383	AATTTA	2	12	1663	1674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020383	AAGAAA	2	12	5286	5297	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452202285
4	NC_020383	TTGATT	2	12	8117	8128	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	452202288
5	NC_020383	CAGTAT	2	12	10089	10100	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202293
6	NC_020383	AAATAA	2	12	11519	11530	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020383	CTAAAA	2	12	13310	13321	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_020383	AATTCA	2	12	14061	14072	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452202298
9	NC_020383	TAACTA	2	12	15809	15820	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_020383	TCTTTT	2	12	15840	15851	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020383	TTAAAA	2	12	17729	17740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202304
12	NC_020383	AAGTTA	2	12	18913	18924	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452202305
13	NC_020383	TATCTG	2	12	19147	19158	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452202305
14	NC_020383	TTAGAA	2	12	21393	21404	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452202305
15	NC_020383	ATAGAT	2	12	22199	22210	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020383	ACTTAT	2	12	22650	22661	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020383	ATCCCA	2	12	25445	25456	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	452202312
18	NC_020383	CCATAT	2	12	29298	29309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202318
19	NC_020383	CCTAAT	2	12	33562	33573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202324
20	NC_020383	GATATT	2	12	33943	33954	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452202324
21	NC_020383	TTATAT	2	12	34988	34999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202325
22	NC_020383	TATTTA	2	12	40698	40709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202333
23	NC_020383	TTTATC	2	12	40783	40794	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452202333
24	NC_020383	TCAAAT	2	12	40961	40972	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452202333
25	NC_020383	ACTTGT	2	12	41213	41224	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452202333
26	NC_020383	TTTCTT	2	12	45416	45427	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_020383	CTTCCT	2	12	47042	47053	0 %	50 %	0 %	50 %	452202342
28	NC_020383	ATGAAC	2	12	48716	48727	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452202343
29	NC_020383	TTCCAT	2	12	57477	57488	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	452202355
30	NC_020383	AATCCA	2	12	58800	58811	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	452202356
31	NC_020383	GGTTGT	2	12	61814	61825	0 %	50 %	50 %	0 %	452202360
32	NC_020383	AATTTT	2	12	65918	65929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020383	ATTTTT	2	12	67413	67424	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452202367
34	NC_020383	TGTATA	2	12	69547	69558	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452202368
35	NC_020383	GAAAAT	2	12	74889	74900	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452202376
36	NC_020383	CAAGAG	2	12	75946	75957	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	452202377
37	NC_020383	TTTATT	2	12	76169	76180	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020383	AAATTT	2	12	76417	76428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020383	TATTAA	2	12	79921	79932	50 %	50 %	0 %	0 %	452202381
40	NC_020383	ATTTTC	2	12	84069	84080	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452202387
41	NC_020383	AATTTA	2	12	84652	84663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.