MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-85

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020383	ATTCG	2	10	605	614	20 %	40 %	20 %	20 %	452202279
2	NC_020383	ATCAA	2	10	1014	1023	60 %	20 %	0 %	20 %	452202279
3	NC_020383	ATTTT	2	10	2390	2399	20 %	80 %	0 %	0 %	452202280
4	NC_020383	TTTGG	2	10	3643	3652	0 %	60 %	40 %	0 %	452202282
5	NC_020383	AATCT	2	10	5463	5472	40 %	40 %	0 %	20 %	452202285
6	NC_020383	TTTCT	2	10	6357	6366	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020383	AGATA	2	10	6531	6540	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020383	ATTTT	2	10	7523	7532	20 %	80 %	0 %	0 %	452202287
9	NC_020383	ATTTC	2	10	7757	7766	20 %	60 %	0 %	20 %	452202288
10	NC_020383	TATAA	2	10	8665	8674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020383	CTTGA	2	10	8900	8909	20 %	40 %	20 %	20 %	452202290
12	NC_020383	AGATT	2	10	10864	10873	40 %	40 %	20 %	0 %	452202294
13	NC_020383	ATAAA	2	10	10939	10948	80 %	20 %	0 %	0 %	452202294
14	NC_020383	ATGAA	2	10	11075	11084	60 %	20 %	20 %	0 %	452202294
15	NC_020383	TTAAA	2	10	11496	11505	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020383	CTTTT	2	10	11629	11638	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020383	GTAAT	2	10	13012	13021	40 %	40 %	20 %	0 %	452202296
18	NC_020383	TAAAA	2	10	15637	15646	80 %	20 %	0 %	0 %	452202302
19	NC_020383	ACCAT	2	10	16211	16220	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_020383	GAACA	2	10	17075	17084	60 %	0 %	20 %	20 %	452202303
21	NC_020383	TTATT	2	10	18082	18091	20 %	80 %	0 %	0 %	452202304
22	NC_020383	ATTGA	2	10	19254	19263	40 %	40 %	20 %	0 %	452202305
23	NC_020383	GAAAA	2	10	19674	19683	80 %	0 %	20 %	0 %	452202305
24	NC_020383	ACAAT	2	10	20479	20488	60 %	20 %	0 %	20 %	452202305
25	NC_020383	ATATA	2	10	21050	21059	60 %	40 %	0 %	0 %	452202305
26	NC_020383	CTTTT	2	10	22281	22290	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020383	TTTCA	2	10	22632	22641	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020383	CGATT	2	10	24631	24640	20 %	40 %	20 %	20 %	452202310
29	NC_020383	TATAC	2	10	24749	24758	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020383	CATTA	2	10	26232	26241	40 %	40 %	0 %	20 %	452202313
31	NC_020383	TTTAA	2	10	28752	28761	40 %	60 %	0 %	0 %	452202316
32	NC_020383	ATAGT	2	10	29023	29032	40 %	40 %	20 %	0 %	452202317
33	NC_020383	TTTTG	2	10	29158	29167	0 %	80 %	20 %	0 %	452202318
34	NC_020383	ATAAA	2	10	29229	29238	80 %	20 %	0 %	0 %	452202318
35	NC_020383	ATATA	2	10	29529	29538	60 %	40 %	0 %	0 %	452202318
36	NC_020383	TCAGA	2	10	29936	29945	40 %	20 %	20 %	20 %	452202319
37	NC_020383	TTGAA	2	10	32805	32814	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020383	GGATT	2	10	33189	33198	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020383	TAAAA	2	10	33309	33318	80 %	20 %	0 %	0 %	452202324
40	NC_020383	TTTAT	2	10	34479	34488	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020383	ATTTA	2	10	34967	34976	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020383	ATTTG	2	10	36741	36750	20 %	60 %	20 %	0 %	452202326
43	NC_020383	TTCCT	2	10	36812	36821	0 %	60 %	0 %	40 %	452202326
44	NC_020383	ACATA	2	10	36928	36937	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020383	ATACA	2	10	37757	37766	60 %	20 %	0 %	20 %	452202328
46	NC_020383	CACTA	2	10	37940	37949	40 %	20 %	0 %	40 %	452202328
47	NC_020383	TATAA	2	10	39915	39924	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020383	TCCAT	2	10	40338	40347	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_020383	TTCTT	2	10	41527	41536	0 %	80 %	0 %	20 %	452202333
50	NC_020383	CATTT	2	10	41591	41600	20 %	60 %	0 %	20 %	452202333
51	NC_020383	GTATT	2	10	41848	41857	20 %	60 %	20 %	0 %	452202334
52	NC_020383	CTTTT	2	10	44084	44093	0 %	80 %	0 %	20 %	452202339
53	NC_020383	TTTCT	2	10	44237	44246	0 %	80 %	0 %	20 %	452202339
54	NC_020383	ATTTA	2	10	50400	50409	40 %	60 %	0 %	0 %	452202345
55	NC_020383	TCGTT	2	10	51099	51108	0 %	60 %	20 %	20 %	452202345
56	NC_020383	CCAGT	2	10	51465	51474	20 %	20 %	20 %	40 %	452202345
57	NC_020383	TTTCC	2	10	53013	53022	0 %	60 %	0 %	40 %	452202346
58	NC_020383	CAATT	2	10	53300	53309	40 %	40 %	0 %	20 %	452202346
59	NC_020383	GTTTT	2	10	56070	56079	0 %	80 %	20 %	0 %	452202351
60	NC_020383	TTCCA	2	10	56731	56740	20 %	40 %	0 %	40 %	452202353
61	NC_020383	GTAAA	2	10	57033	57042	60 %	20 %	20 %	0 %	452202354
62	NC_020383	ATAAA	2	10	57151	57160	80 %	20 %	0 %	0 %	452202354
63	NC_020383	ATCTT	2	10	60402	60411	20 %	60 %	0 %	20 %	452202356
64	NC_020383	GAACA	2	10	61508	61517	60 %	0 %	20 %	20 %	452202359
65	NC_020383	TTGAT	2	10	61593	61602	20 %	60 %	20 %	0 %	452202359
66	NC_020383	TTCAA	2	10	63423	63432	40 %	40 %	0 %	20 %	452202361
67	NC_020383	TCCCT	2	10	66292	66301	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_020383	CAAAA	2	10	68651	68660	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_020383	AAATC	2	10	69104	69113	60 %	20 %	0 %	20 %	452202368
70	NC_020383	AATTG	2	10	70038	70047	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020383	TCTTA	2	10	70478	70487	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_020383	GGCGG	2	10	70621	70630	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
73	NC_020383	TTCAT	2	10	71347	71356	20 %	60 %	0 %	20 %	452202371
74	NC_020383	AATTA	2	10	72858	72867	60 %	40 %	0 %	0 %	452202373
75	NC_020383	CACAT	2	10	73188	73197	40 %	20 %	0 %	40 %	452202374
76	NC_020383	AAAAG	2	10	73682	73691	80 %	0 %	20 %	0 %	452202374
77	NC_020383	CTTTT	2	10	79194	79203	0 %	80 %	0 %	20 %	452202379
78	NC_020383	TCCAT	2	10	79540	79549	20 %	40 %	0 %	40 %	452202380
79	NC_020383	GATCC	2	10	80443	80452	20 %	20 %	20 %	40 %	452202382
80	NC_020383	TAAAA	2	10	82466	82475	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020383	TTCAA	2	10	82757	82766	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_020383	TTTTC	2	10	83222	83231	0 %	80 %	0 %	20 %	452202385
83	NC_020383	TTCCT	2	10	83327	83336	0 %	60 %	0 %	40 %	452202386
84	NC_020383	CCTTC	2	10	84320	84329	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
85	NC_020383	AATTT	2	10	84603	84612	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.