MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-85

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020383	TAGA	2	8	66	73	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020383	GTAA	2	8	692	699	50 %	25 %	25 %	0 %	452202279
3	NC_020383	ATTT	2	8	1594	1601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020383	ATTT	2	8	2498	2505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020383	GATT	2	8	2855	2862	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020383	GAAG	2	8	3224	3231	50 %	0 %	50 %	0 %	452202281
7	NC_020383	GAAG	2	8	3284	3291	50 %	0 %	50 %	0 %	452202281
8	NC_020383	TGTT	2	8	3799	3806	0 %	75 %	25 %	0 %	452202282
9	NC_020383	CTTT	2	8	4245	4252	0 %	75 %	0 %	25 %	452202284
10	NC_020383	ATTA	2	8	4276	4283	50 %	50 %	0 %	0 %	452202284
11	NC_020383	TAAG	2	8	4563	4570	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020383	ATTT	2	8	4604	4611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020383	AGAT	2	8	5171	5178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020383	TTGA	2	8	5357	5364	25 %	50 %	25 %	0 %	452202285
15	NC_020383	AATG	2	8	5393	5400	50 %	25 %	25 %	0 %	452202285
16	NC_020383	TAAA	2	8	5511	5518	75 %	25 %	0 %	0 %	452202285
17	NC_020383	ATTT	2	8	5682	5689	25 %	75 %	0 %	0 %	452202285
18	NC_020383	ATTT	2	8	6258	6265	25 %	75 %	0 %	0 %	452202285
19	NC_020383	TTAC	2	8	6898	6905	25 %	50 %	0 %	25 %	452202286
20	NC_020383	AGAA	2	8	6923	6930	75 %	0 %	25 %	0 %	452202286
21	NC_020383	AGAA	2	8	7011	7018	75 %	0 %	25 %	0 %	452202286
22	NC_020383	GATT	2	8	7373	7380	25 %	50 %	25 %	0 %	452202287
23	NC_020383	TTTC	2	8	7660	7667	0 %	75 %	0 %	25 %	452202288
24	NC_020383	TTAA	2	8	7819	7826	50 %	50 %	0 %	0 %	452202288
25	NC_020383	TAAC	2	8	7978	7985	50 %	25 %	0 %	25 %	452202288
26	NC_020383	TAAA	2	8	8607	8614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020383	TACT	2	8	8768	8775	25 %	50 %	0 %	25 %	452202290
28	NC_020383	ACCA	2	8	9260	9267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020383	TCCA	2	8	9390	9397	25 %	25 %	0 %	50 %	452202291
30	NC_020383	AACC	2	8	9419	9426	50 %	0 %	0 %	50 %	452202291
31	NC_020383	TCCC	2	8	9546	9553	0 %	25 %	0 %	75 %	452202291
32	NC_020383	GGCT	2	8	9569	9576	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020383	ACTT	2	8	10075	10082	25 %	50 %	0 %	25 %	452202293
34	NC_020383	TAAA	2	8	10408	10415	75 %	25 %	0 %	0 %	452202293
35	NC_020383	CGTT	2	8	10625	10632	0 %	50 %	25 %	25 %	452202293
36	NC_020383	ATCT	2	8	10904	10911	25 %	50 %	0 %	25 %	452202294
37	NC_020383	ATAA	2	8	11037	11044	75 %	25 %	0 %	0 %	452202294
38	NC_020383	GCTG	2	8	11683	11690	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020383	AAAT	2	8	11829	11836	75 %	25 %	0 %	0 %	452202295
40	NC_020383	AATA	2	8	12847	12854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020383	ATAA	2	8	12905	12912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020383	AGTA	2	8	12965	12972	50 %	25 %	25 %	0 %	452202296
43	NC_020383	TTGT	2	8	13824	13831	0 %	75 %	25 %	0 %	452202297
44	NC_020383	TTTA	2	8	14147	14154	25 %	75 %	0 %	0 %	452202298
45	NC_020383	TTAC	2	8	14208	14215	25 %	50 %	0 %	25 %	452202298
46	NC_020383	AGAA	2	8	14511	14518	75 %	0 %	25 %	0 %	452202299
47	NC_020383	TAAA	2	8	14547	14554	75 %	25 %	0 %	0 %	452202299
48	NC_020383	AATC	2	8	14793	14800	50 %	25 %	0 %	25 %	452202300
49	NC_020383	CTCC	2	8	14937	14944	0 %	25 %	0 %	75 %	452202300
50	NC_020383	AAAT	2	8	15082	15089	75 %	25 %	0 %	0 %	452202301
51	NC_020383	ACTT	2	8	15801	15808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020383	ATCT	2	8	16130	16137	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020383	AATA	2	8	16347	16354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020383	GTAT	2	8	16400	16407	25 %	50 %	25 %	0 %	452202303
55	NC_020383	ATAA	2	8	16498	16505	75 %	25 %	0 %	0 %	452202303
56	NC_020383	GAAA	2	8	16857	16864	75 %	0 %	25 %	0 %	452202303
57	NC_020383	ATTC	2	8	17858	17865	25 %	50 %	0 %	25 %	452202304
58	NC_020383	TGAT	2	8	18433	18440	25 %	50 %	25 %	0 %	452202304
59	NC_020383	ATAA	2	8	18798	18805	75 %	25 %	0 %	0 %	452202305
60	NC_020383	TAAT	2	8	19303	19310	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
61	NC_020383	TAAG	2	8	19465	19472	50 %	25 %	25 %	0 %	452202305
62	NC_020383	ATTA	2	8	19616	19623	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
63	NC_020383	AATT	2	8	19687	19694	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
64	NC_020383	AAAT	2	8	19874	19881	75 %	25 %	0 %	0 %	452202305
65	NC_020383	AAAT	2	8	20162	20169	75 %	25 %	0 %	0 %	452202305
66	NC_020383	AATT	2	8	20803	20810	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
67	NC_020383	GCAT	2	8	21001	21008	25 %	25 %	25 %	25 %	452202305
68	NC_020383	ATTT	2	8	21210	21217	25 %	75 %	0 %	0 %	452202305
69	NC_020383	GGTT	2	8	21684	21691	0 %	50 %	50 %	0 %	452202305
70	NC_020383	CAAA	2	8	21858	21865	75 %	0 %	0 %	25 %	452202305
71	NC_020383	ATCC	2	8	22257	22264	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020383	TATT	2	8	22513	22520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020383	TTTA	2	8	22726	22733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020383	AATA	2	8	22805	22812	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020383	TATT	2	8	22872	22879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020383	TCTA	2	8	23129	23136	25 %	50 %	0 %	25 %	452202306
77	NC_020383	TATG	2	8	23317	23324	25 %	50 %	25 %	0 %	452202307
78	NC_020383	AATT	2	8	23774	23781	50 %	50 %	0 %	0 %	452202308
79	NC_020383	AGTG	2	8	23919	23926	25 %	25 %	50 %	0 %	452202308
80	NC_020383	TCTT	2	8	25199	25206	0 %	75 %	0 %	25 %	452202312
81	NC_020383	TTCT	2	8	25987	25994	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_020383	CTAA	2	8	26466	26473	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_020383	CTAT	2	8	27019	27026	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020383	AACT	2	8	27787	27794	50 %	25 %	0 %	25 %	452202315
85	NC_020383	TTTC	2	8	27967	27974	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_020383	TTAT	2	8	28021	28028	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020383	AAAT	2	8	28039	28046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020383	AAAT	2	8	28125	28132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020383	GATT	2	8	28273	28280	25 %	50 %	25 %	0 %	452202316
90	NC_020383	TAAG	2	8	28573	28580	50 %	25 %	25 %	0 %	452202316
91	NC_020383	ATTT	2	8	28744	28751	25 %	75 %	0 %	0 %	452202316
92	NC_020383	AGCT	2	8	28915	28922	25 %	25 %	25 %	25 %	452202317
93	NC_020383	AAAC	2	8	29068	29075	75 %	0 %	0 %	25 %	452202317
94	NC_020383	CTAA	2	8	29557	29564	50 %	25 %	0 %	25 %	452202318
95	NC_020383	TAAA	2	8	29706	29713	75 %	25 %	0 %	0 %	452202319
96	NC_020383	ATTT	2	8	29993	30000	25 %	75 %	0 %	0 %	452202319
97	NC_020383	TCAC	2	8	30088	30095	25 %	25 %	0 %	50 %	452202319
98	NC_020383	GTTG	2	8	30161	30168	0 %	50 %	50 %	0 %	452202319
99	NC_020383	TCTA	2	8	30480	30487	25 %	50 %	0 %	25 %	452202320
100	NC_020383	GTTT	2	8	30811	30818	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020383	ATAA	2	8	31100	31107	75 %	25 %	0 %	0 %	452202321
102	NC_020383	GTTT	2	8	31457	31464	0 %	75 %	25 %	0 %	452202322
103	NC_020383	GTTA	2	8	31881	31888	25 %	50 %	25 %	0 %	452202322
104	NC_020383	TGAA	2	8	32356	32363	50 %	25 %	25 %	0 %	452202323
105	NC_020383	TTTA	2	8	32391	32398	25 %	75 %	0 %	0 %	452202323
106	NC_020383	ATTG	2	8	32454	32461	25 %	50 %	25 %	0 %	452202323
107	NC_020383	TTAA	2	8	32500	32507	50 %	50 %	0 %	0 %	452202323
108	NC_020383	ACAA	2	8	32992	32999	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_020383	ATTT	2	8	34004	34011	25 %	75 %	0 %	0 %	452202324
110	NC_020383	CTTT	2	8	34598	34605	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_020383	CAAC	2	8	34771	34778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020383	AGGA	2	8	34899	34906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020383	GTTA	2	8	35039	35046	25 %	50 %	25 %	0 %	452202325
114	NC_020383	TTCT	2	8	35552	35559	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_020383	AAAT	2	8	35885	35892	75 %	25 %	0 %	0 %	452202326
116	NC_020383	TCTT	2	8	36103	36110	0 %	75 %	0 %	25 %	452202326
117	NC_020383	CCTA	2	8	36150	36157	25 %	25 %	0 %	50 %	452202326
118	NC_020383	AATT	2	8	36510	36517	50 %	50 %	0 %	0 %	452202326
119	NC_020383	CAAA	2	8	36681	36688	75 %	0 %	0 %	25 %	452202326
120	NC_020383	TCAA	2	8	36730	36737	50 %	25 %	0 %	25 %	452202326
121	NC_020383	AACA	2	8	36845	36852	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_020383	TCAT	2	8	37878	37885	25 %	50 %	0 %	25 %	452202328
123	NC_020383	ATTG	2	8	38070	38077	25 %	50 %	25 %	0 %	452202328
124	NC_020383	ATTT	2	8	38129	38136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020383	CACT	2	8	38353	38360	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020383	ATTT	2	8	38413	38420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020383	AGTT	2	8	38575	38582	25 %	50 %	25 %	0 %	452202329
128	NC_020383	TAAA	2	8	38914	38921	75 %	25 %	0 %	0 %	452202329
129	NC_020383	ATGT	2	8	38932	38939	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020383	ATTG	2	8	38976	38983	25 %	50 %	25 %	0 %	452202330
131	NC_020383	TAAT	2	8	38992	38999	50 %	50 %	0 %	0 %	452202330
132	NC_020383	ATTC	2	8	39349	39356	25 %	50 %	0 %	25 %	452202330
133	NC_020383	TTTC	2	8	40062	40069	0 %	75 %	0 %	25 %	452202332
134	NC_020383	TTAT	2	8	40434	40441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020383	TGAT	2	8	40486	40493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020383	ATAA	2	8	40515	40522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020383	AAAT	2	8	40547	40554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020383	CCTC	2	8	41144	41151	0 %	25 %	0 %	75 %	452202333
139	NC_020383	GTTC	2	8	41744	41751	0 %	50 %	25 %	25 %	452202334
140	NC_020383	TCAT	2	8	41756	41763	25 %	50 %	0 %	25 %	452202334
141	NC_020383	TTTA	2	8	41764	41771	25 %	75 %	0 %	0 %	452202334
142	NC_020383	TAAA	2	8	42072	42079	75 %	25 %	0 %	0 %	452202334
143	NC_020383	GTTA	2	8	42133	42140	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020383	ATTA	2	8	43077	43084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020383	ATAA	2	8	43346	43353	75 %	25 %	0 %	0 %	452202337
146	NC_020383	CTTT	2	8	44360	44367	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_020383	TCCT	2	8	44507	44514	0 %	50 %	0 %	50 %	452202340
148	NC_020383	AATA	2	8	45335	45342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020383	GATT	2	8	45530	45537	25 %	50 %	25 %	0 %	452202341
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161	NC_020383	GTAA	2	8	52259	52266	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_020383	CTAA	2	8	52368	52375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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173	NC_020383	ACAA	2	8	55373	55380	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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260	NC_020383	ATTT	2	8	78526	78533	25 %	75 %	0 %	0 %	452202379
261	NC_020383	TTTC	2	8	79031	79038	0 %	75 %	0 %	25 %	452202379
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264	NC_020383	TTCC	2	8	79550	79557	0 %	50 %	0 %	50 %	452202380
265	NC_020383	CTTT	2	8	79995	80002	0 %	75 %	0 %	25 %	452202381
266	NC_020383	TTTG	2	8	80237	80244	0 %	75 %	25 %	0 %	452202382
267	NC_020383	AGAA	2	8	80972	80979	75 %	0 %	25 %	0 %	452202383
268	NC_020383	GAAC	2	8	81434	81441	50 %	0 %	25 %	25 %	452202383
269	NC_020383	CTTT	2	8	81627	81634	0 %	75 %	0 %	25 %	452202383
270	NC_020383	CATA	2	8	82013	82020	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
271	NC_020383	AGTT	2	8	82040	82047	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
272	NC_020383	CAAC	2	8	84381	84388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
273	NC_020383	ATTG	2	8	84408	84415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.