MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-85

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020383	TAGA	2	8	66	73	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020383	ATTT	2	8	1594	1601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020383	ATTT	2	8	2498	2505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020383	GATT	2	8	2855	2862	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020383	TAAG	2	8	4563	4570	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020383	ATTT	2	8	4604	4611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020383	AGAT	2	8	5171	5178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020383	TAAA	2	8	8607	8614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020383	ACCA	2	8	9260	9267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020383	GGCT	2	8	9569	9576	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020383	GCTG	2	8	11683	11690	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020383	AATA	2	8	12847	12854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020383	ATAA	2	8	12905	12912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020383	ACTT	2	8	15801	15808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020383	ATCT	2	8	16130	16137	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020383	AATA	2	8	16347	16354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020383	ATCC	2	8	22257	22264	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020383	TATT	2	8	22513	22520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020383	TTTA	2	8	22726	22733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020383	AATA	2	8	22805	22812	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020383	TATT	2	8	22872	22879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020383	TTCT	2	8	25987	25994	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020383	CTAA	2	8	26466	26473	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020383	CTAT	2	8	27019	27026	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020383	TTTC	2	8	27967	27974	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020383	TTAT	2	8	28021	28028	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020383	AAAT	2	8	28039	28046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020383	AAAT	2	8	28125	28132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020383	GTTT	2	8	30811	30818	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020383	ACAA	2	8	32992	32999	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020383	CTTT	2	8	34598	34605	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020383	CAAC	2	8	34771	34778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020383	AGGA	2	8	34899	34906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020383	TTCT	2	8	35552	35559	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020383	AACA	2	8	36845	36852	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020383	ATTT	2	8	38129	38136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020383	CACT	2	8	38353	38360	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020383	ATTT	2	8	38413	38420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020383	ATGT	2	8	38932	38939	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020383	TTAT	2	8	40434	40441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020383	TGAT	2	8	40486	40493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020383	ATAA	2	8	40515	40522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020383	AAAT	2	8	40547	40554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020383	GTTA	2	8	42133	42140	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020383	ATTA	2	8	43077	43084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020383	CTTT	2	8	44360	44367	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020383	AATA	2	8	45335	45342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020383	GTAA	2	8	52259	52266	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020383	CTAA	2	8	52368	52375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020383	TACA	2	8	52462	52469	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020383	TTTC	2	8	54193	54200	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020383	CCTT	2	8	55043	55050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020383	ACAA	2	8	55373	55380	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020383	CCCT	2	8	61632	61639	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_020383	TTCT	2	8	63376	63383	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020383	AGCT	2	8	63388	63395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020383	AAAT	2	8	66017	66024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020383	TTTA	2	8	66829	66836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020383	GAAA	2	8	68424	68431	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020383	TGAA	2	8	68471	68478	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020383	AAAT	2	8	70121	70128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020383	AAAC	2	8	70367	70374	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020383	AATT	2	8	70404	70411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020383	TTGT	2	8	70842	70849	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020383	AGAT	2	8	71886	71893	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020383	AAAT	2	8	72894	72901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020383	TATT	2	8	72985	72992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020383	AAAG	2	8	74641	74648	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020383	GAGG	2	8	75573	75580	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020383	TGTA	2	8	76258	76265	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020383	TCGT	2	8	76374	76381	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020383	TAAA	2	8	76475	76482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020383	CATA	2	8	82013	82020	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020383	AGTT	2	8	82040	82047	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020383	CAAC	2	8	84381	84388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020383	ATTG	2	8	84408	84415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.