MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-85

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020383	GTAA	2	8	692	699	50 %	25 %	25 %	0 %	452202279
2	NC_020383	GAAG	2	8	3224	3231	50 %	0 %	50 %	0 %	452202281
3	NC_020383	GAAG	2	8	3284	3291	50 %	0 %	50 %	0 %	452202281
4	NC_020383	TGTT	2	8	3799	3806	0 %	75 %	25 %	0 %	452202282
5	NC_020383	CTTT	2	8	4245	4252	0 %	75 %	0 %	25 %	452202284
6	NC_020383	ATTA	2	8	4276	4283	50 %	50 %	0 %	0 %	452202284
7	NC_020383	TTGA	2	8	5357	5364	25 %	50 %	25 %	0 %	452202285
8	NC_020383	AATG	2	8	5393	5400	50 %	25 %	25 %	0 %	452202285
9	NC_020383	TAAA	2	8	5511	5518	75 %	25 %	0 %	0 %	452202285
10	NC_020383	ATTT	2	8	5682	5689	25 %	75 %	0 %	0 %	452202285
11	NC_020383	ATTT	2	8	6258	6265	25 %	75 %	0 %	0 %	452202285
12	NC_020383	TTAC	2	8	6898	6905	25 %	50 %	0 %	25 %	452202286
13	NC_020383	AGAA	2	8	6923	6930	75 %	0 %	25 %	0 %	452202286
14	NC_020383	AGAA	2	8	7011	7018	75 %	0 %	25 %	0 %	452202286
15	NC_020383	GATT	2	8	7373	7380	25 %	50 %	25 %	0 %	452202287
16	NC_020383	TTTC	2	8	7660	7667	0 %	75 %	0 %	25 %	452202288
17	NC_020383	TTAA	2	8	7819	7826	50 %	50 %	0 %	0 %	452202288
18	NC_020383	TAAC	2	8	7978	7985	50 %	25 %	0 %	25 %	452202288
19	NC_020383	TACT	2	8	8768	8775	25 %	50 %	0 %	25 %	452202290
20	NC_020383	TCCA	2	8	9390	9397	25 %	25 %	0 %	50 %	452202291
21	NC_020383	AACC	2	8	9419	9426	50 %	0 %	0 %	50 %	452202291
22	NC_020383	TCCC	2	8	9546	9553	0 %	25 %	0 %	75 %	452202291
23	NC_020383	ACTT	2	8	10075	10082	25 %	50 %	0 %	25 %	452202293
24	NC_020383	TAAA	2	8	10408	10415	75 %	25 %	0 %	0 %	452202293
25	NC_020383	CGTT	2	8	10625	10632	0 %	50 %	25 %	25 %	452202293
26	NC_020383	ATCT	2	8	10904	10911	25 %	50 %	0 %	25 %	452202294
27	NC_020383	ATAA	2	8	11037	11044	75 %	25 %	0 %	0 %	452202294
28	NC_020383	AAAT	2	8	11829	11836	75 %	25 %	0 %	0 %	452202295
29	NC_020383	AGTA	2	8	12965	12972	50 %	25 %	25 %	0 %	452202296
30	NC_020383	TTGT	2	8	13824	13831	0 %	75 %	25 %	0 %	452202297
31	NC_020383	TTTA	2	8	14147	14154	25 %	75 %	0 %	0 %	452202298
32	NC_020383	TTAC	2	8	14208	14215	25 %	50 %	0 %	25 %	452202298
33	NC_020383	AGAA	2	8	14511	14518	75 %	0 %	25 %	0 %	452202299
34	NC_020383	TAAA	2	8	14547	14554	75 %	25 %	0 %	0 %	452202299
35	NC_020383	AATC	2	8	14793	14800	50 %	25 %	0 %	25 %	452202300
36	NC_020383	CTCC	2	8	14937	14944	0 %	25 %	0 %	75 %	452202300
37	NC_020383	AAAT	2	8	15082	15089	75 %	25 %	0 %	0 %	452202301
38	NC_020383	GTAT	2	8	16400	16407	25 %	50 %	25 %	0 %	452202303
39	NC_020383	ATAA	2	8	16498	16505	75 %	25 %	0 %	0 %	452202303
40	NC_020383	GAAA	2	8	16857	16864	75 %	0 %	25 %	0 %	452202303
41	NC_020383	ATTC	2	8	17858	17865	25 %	50 %	0 %	25 %	452202304
42	NC_020383	TGAT	2	8	18433	18440	25 %	50 %	25 %	0 %	452202304
43	NC_020383	ATAA	2	8	18798	18805	75 %	25 %	0 %	0 %	452202305
44	NC_020383	TAAT	2	8	19303	19310	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
45	NC_020383	TAAG	2	8	19465	19472	50 %	25 %	25 %	0 %	452202305
46	NC_020383	ATTA	2	8	19616	19623	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
47	NC_020383	AATT	2	8	19687	19694	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
48	NC_020383	AAAT	2	8	19874	19881	75 %	25 %	0 %	0 %	452202305
49	NC_020383	AAAT	2	8	20162	20169	75 %	25 %	0 %	0 %	452202305
50	NC_020383	AATT	2	8	20803	20810	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
51	NC_020383	GCAT	2	8	21001	21008	25 %	25 %	25 %	25 %	452202305
52	NC_020383	ATTT	2	8	21210	21217	25 %	75 %	0 %	0 %	452202305
53	NC_020383	GGTT	2	8	21684	21691	0 %	50 %	50 %	0 %	452202305
54	NC_020383	CAAA	2	8	21858	21865	75 %	0 %	0 %	25 %	452202305
55	NC_020383	TCTA	2	8	23129	23136	25 %	50 %	0 %	25 %	452202306
56	NC_020383	TATG	2	8	23317	23324	25 %	50 %	25 %	0 %	452202307
57	NC_020383	AATT	2	8	23774	23781	50 %	50 %	0 %	0 %	452202308
58	NC_020383	AGTG	2	8	23919	23926	25 %	25 %	50 %	0 %	452202308
59	NC_020383	TCTT	2	8	25199	25206	0 %	75 %	0 %	25 %	452202312
60	NC_020383	AACT	2	8	27787	27794	50 %	25 %	0 %	25 %	452202315
61	NC_020383	GATT	2	8	28273	28280	25 %	50 %	25 %	0 %	452202316
62	NC_020383	TAAG	2	8	28573	28580	50 %	25 %	25 %	0 %	452202316
63	NC_020383	ATTT	2	8	28744	28751	25 %	75 %	0 %	0 %	452202316
64	NC_020383	AGCT	2	8	28915	28922	25 %	25 %	25 %	25 %	452202317
65	NC_020383	AAAC	2	8	29068	29075	75 %	0 %	0 %	25 %	452202317
66	NC_020383	CTAA	2	8	29557	29564	50 %	25 %	0 %	25 %	452202318
67	NC_020383	TAAA	2	8	29706	29713	75 %	25 %	0 %	0 %	452202319
68	NC_020383	ATTT	2	8	29993	30000	25 %	75 %	0 %	0 %	452202319
69	NC_020383	TCAC	2	8	30088	30095	25 %	25 %	0 %	50 %	452202319
70	NC_020383	GTTG	2	8	30161	30168	0 %	50 %	50 %	0 %	452202319
71	NC_020383	TCTA	2	8	30480	30487	25 %	50 %	0 %	25 %	452202320
72	NC_020383	ATAA	2	8	31100	31107	75 %	25 %	0 %	0 %	452202321
73	NC_020383	GTTT	2	8	31457	31464	0 %	75 %	25 %	0 %	452202322
74	NC_020383	GTTA	2	8	31881	31888	25 %	50 %	25 %	0 %	452202322
75	NC_020383	TGAA	2	8	32356	32363	50 %	25 %	25 %	0 %	452202323
76	NC_020383	TTTA	2	8	32391	32398	25 %	75 %	0 %	0 %	452202323
77	NC_020383	ATTG	2	8	32454	32461	25 %	50 %	25 %	0 %	452202323
78	NC_020383	TTAA	2	8	32500	32507	50 %	50 %	0 %	0 %	452202323
79	NC_020383	ATTT	2	8	34004	34011	25 %	75 %	0 %	0 %	452202324
80	NC_020383	GTTA	2	8	35039	35046	25 %	50 %	25 %	0 %	452202325
81	NC_020383	AAAT	2	8	35885	35892	75 %	25 %	0 %	0 %	452202326
82	NC_020383	TCTT	2	8	36103	36110	0 %	75 %	0 %	25 %	452202326
83	NC_020383	CCTA	2	8	36150	36157	25 %	25 %	0 %	50 %	452202326
84	NC_020383	AATT	2	8	36510	36517	50 %	50 %	0 %	0 %	452202326
85	NC_020383	CAAA	2	8	36681	36688	75 %	0 %	0 %	25 %	452202326
86	NC_020383	TCAA	2	8	36730	36737	50 %	25 %	0 %	25 %	452202326
87	NC_020383	TCAT	2	8	37878	37885	25 %	50 %	0 %	25 %	452202328
88	NC_020383	ATTG	2	8	38070	38077	25 %	50 %	25 %	0 %	452202328
89	NC_020383	AGTT	2	8	38575	38582	25 %	50 %	25 %	0 %	452202329
90	NC_020383	TAAA	2	8	38914	38921	75 %	25 %	0 %	0 %	452202329
91	NC_020383	ATTG	2	8	38976	38983	25 %	50 %	25 %	0 %	452202330
92	NC_020383	TAAT	2	8	38992	38999	50 %	50 %	0 %	0 %	452202330
93	NC_020383	ATTC	2	8	39349	39356	25 %	50 %	0 %	25 %	452202330
94	NC_020383	TTTC	2	8	40062	40069	0 %	75 %	0 %	25 %	452202332
95	NC_020383	CCTC	2	8	41144	41151	0 %	25 %	0 %	75 %	452202333
96	NC_020383	GTTC	2	8	41744	41751	0 %	50 %	25 %	25 %	452202334
97	NC_020383	TCAT	2	8	41756	41763	25 %	50 %	0 %	25 %	452202334
98	NC_020383	TTTA	2	8	41764	41771	25 %	75 %	0 %	0 %	452202334
99	NC_020383	TAAA	2	8	42072	42079	75 %	25 %	0 %	0 %	452202334
100	NC_020383	ATAA	2	8	43346	43353	75 %	25 %	0 %	0 %	452202337
101	NC_020383	TCCT	2	8	44507	44514	0 %	50 %	0 %	50 %	452202340
102	NC_020383	GATT	2	8	45530	45537	25 %	50 %	25 %	0 %	452202341
103	NC_020383	ATCC	2	8	45791	45798	25 %	25 %	0 %	50 %	452202341
104	NC_020383	CATC	2	8	45847	45854	25 %	25 %	0 %	50 %	452202341
105	NC_020383	CTTT	2	8	47105	47112	0 %	75 %	0 %	25 %	452202342
106	NC_020383	AAAT	2	8	48453	48460	75 %	25 %	0 %	0 %	452202342
107	NC_020383	TGGT	2	8	48501	48508	0 %	50 %	50 %	0 %	452202342
108	NC_020383	TTCT	2	8	49085	49092	0 %	75 %	0 %	25 %	452202343
109	NC_020383	TTCT	2	8	49956	49963	0 %	75 %	0 %	25 %	452202344
110	NC_020383	AATT	2	8	50351	50358	50 %	50 %	0 %	0 %	452202345
111	NC_020383	CTTT	2	8	50870	50877	0 %	75 %	0 %	25 %	452202345
112	NC_020383	GATT	2	8	51245	51252	25 %	50 %	25 %	0 %	452202345
113	NC_020383	TACT	2	8	52135	52142	25 %	50 %	0 %	25 %	452202345
114	NC_020383	TCTT	2	8	54137	54144	0 %	75 %	0 %	25 %	452202346
115	NC_020383	AAAG	2	8	54240	54247	75 %	0 %	25 %	0 %	452202347
116	NC_020383	CAAG	2	8	54330	54337	50 %	0 %	25 %	25 %	452202347
117	NC_020383	ACAT	2	8	54638	54645	50 %	25 %	0 %	25 %	452202348
118	NC_020383	GATC	2	8	54828	54835	25 %	25 %	25 %	25 %	452202349
119	NC_020383	AGGA	2	8	54862	54869	50 %	0 %	50 %	0 %	452202349
120	NC_020383	CTTA	2	8	55058	55065	25 %	50 %	0 %	25 %	452202350
121	NC_020383	ATCA	2	8	55417	55424	50 %	25 %	0 %	25 %	452202351
122	NC_020383	TAGC	2	8	55535	55542	25 %	25 %	25 %	25 %	452202351
123	NC_020383	AAAG	2	8	55584	55591	75 %	0 %	25 %	0 %	452202351
124	NC_020383	TCGT	2	8	56338	56345	0 %	50 %	25 %	25 %	452202352
125	NC_020383	TCCC	2	8	56492	56499	0 %	25 %	0 %	75 %	452202352
126	NC_020383	CTTG	2	8	56644	56651	0 %	50 %	25 %	25 %	452202353
127	NC_020383	TCTT	2	8	57624	57631	0 %	75 %	0 %	25 %	452202355
128	NC_020383	TTTG	2	8	58143	58150	0 %	75 %	25 %	0 %	452202356
129	NC_020383	GAAT	2	8	58455	58462	50 %	25 %	25 %	0 %	452202356
130	NC_020383	CATT	2	8	58476	58483	25 %	50 %	0 %	25 %	452202356
131	NC_020383	TACA	2	8	58711	58718	50 %	25 %	0 %	25 %	452202356
132	NC_020383	CCGC	2	8	58728	58735	0 %	0 %	25 %	75 %	452202356
133	NC_020383	GTAA	2	8	58953	58960	50 %	25 %	25 %	0 %	452202356
134	NC_020383	CATC	2	8	59011	59018	25 %	25 %	0 %	50 %	452202356
135	NC_020383	TGTT	2	8	59309	59316	0 %	75 %	25 %	0 %	452202356
136	NC_020383	AAAT	2	8	59399	59406	75 %	25 %	0 %	0 %	452202356
137	NC_020383	TTCA	2	8	59933	59940	25 %	50 %	0 %	25 %	452202356
138	NC_020383	TTCT	2	8	60739	60746	0 %	75 %	0 %	25 %	452202356
139	NC_020383	GTTC	2	8	60917	60924	0 %	50 %	25 %	25 %	452202357
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141	NC_020383	GTTT	2	8	62119	62126	0 %	75 %	25 %	0 %	452202360
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.