MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-85

Total Repeats: 198

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020383	ACC	2	6	83	88	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_020383	TAA	2	6	132	137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020383	TGA	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020383	TTC	2	6	178	183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020383	GTA	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020383	TTA	2	6	208	213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020383	AGG	2	6	220	225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020383	ACA	2	6	226	231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020383	TAT	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020383	ATA	2	6	2644	2649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020383	TAT	2	6	2941	2946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020383	TTA	3	9	2948	2956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020383	TAT	2	6	3873	3878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020383	ATA	2	6	3907	3912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020383	ATA	2	6	3955	3960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020383	TCA	2	6	3994	3999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020383	ATA	2	6	4488	4493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020383	TTA	2	6	4746	4751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020383	TTA	2	6	4913	4918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020383	TAT	2	6	5002	5007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020383	GAG	2	6	5008	5013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020383	ATT	2	6	5081	5086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020383	TGA	2	6	5087	5092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020383	AAG	2	6	6443	6448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020383	TTC	2	6	8682	8687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020383	GTT	2	6	8715	8720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020383	TAG	2	6	9792	9797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020383	ACG	2	6	9851	9856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020383	TCA	2	6	10709	10714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020383	ATT	2	6	10775	10780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020383	GAA	2	6	11741	11746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020383	TAA	2	6	12547	12552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020383	TAA	2	6	12669	12674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020383	ATT	2	6	12686	12691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020383	AAT	2	6	12779	12784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020383	ATT	2	6	12865	12870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020383	TTA	2	6	13334	13339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020383	ATT	2	6	13417	13422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020383	CTA	2	6	13479	13484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020383	TTG	2	6	13938	13943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020383	TTA	2	6	14950	14955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020383	TCC	2	6	15169	15174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_020383	CCT	2	6	15765	15770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_020383	ATT	2	6	16025	16030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020383	TAT	2	6	16110	16115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020383	ATT	2	6	16116	16121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020383	ATT	2	6	16200	16205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020383	AGA	2	6	16244	16249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020383	GGT	2	6	16392	16397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020383	CTA	2	6	18526	18531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020383	GAA	2	6	18568	18573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020383	TAT	2	6	22159	22164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020383	TAA	2	6	22432	22437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020383	CAT	2	6	22481	22486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020383	CTT	2	6	22493	22498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020383	TGG	2	6	22550	22555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020383	ATT	2	6	22860	22865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020383	TAT	2	6	22890	22895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020383	ACA	2	6	22945	22950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020383	TTG	2	6	22967	22972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020383	GAA	2	6	23230	23235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020383	ATT	2	6	23311	23316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020383	GAT	2	6	23629	23634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020383	AAT	2	6	24045	24050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020383	GAA	2	6	24390	24395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020383	ACG	2	6	24760	24765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020383	TCC	2	6	25797	25802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_020383	GAA	2	6	26017	26022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020383	ATA	2	6	26428	26433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020383	TAC	2	6	26454	26459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020383	GCG	2	6	26515	26520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020383	CAT	2	6	26849	26854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020383	TTA	2	6	26912	26917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020383	TTA	2	6	26960	26965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020383	GGT	2	6	27054	27059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020383	ATT	2	6	27064	27069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020383	ATA	2	6	27899	27904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020383	TAA	2	6	27920	27925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020383	ATA	2	6	28087	28092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020383	CTA	2	6	28151	28156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020383	ATA	2	6	28857	28862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020383	TCC	2	6	29656	29661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_020383	ATT	2	6	30368	30373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020383	CCT	2	6	30376	30381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_020383	TCC	2	6	30792	30797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_020383	CAT	2	6	31365	31370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020383	TAT	2	6	32296	32301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020383	TAA	2	6	32320	32325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020383	TAT	2	6	32563	32568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020383	TCC	2	6	32600	32605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_020383	ATT	2	6	32621	32626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020383	TAA	2	6	32641	32646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020383	ATG	2	6	32826	32831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020383	TAT	2	6	33109	33114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020383	TAC	2	6	33207	33212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020383	AGG	2	6	33213	33218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020383	CAA	2	6	34572	34577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020383	AAT	2	6	34622	34627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020383	TAA	2	6	34660	34665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020383	ACT	2	6	34673	34678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020383	TCT	2	6	34908	34913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020383	GGA	2	6	34982	34987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020383	TGA	2	6	35411	35416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020383	ATA	2	6	35512	35517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020383	AAT	2	6	36955	36960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020383	ATT	2	6	37286	37291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020383	ATG	2	6	37379	37384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020383	ATA	2	6	37531	37536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020383	CCT	2	6	38097	38102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_020383	ATT	2	6	38220	38225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020383	CCT	2	6	38316	38321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_020383	TTG	2	6	38432	38437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020383	GAT	2	6	38501	38506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020383	CAA	2	6	39548	39553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020383	ATT	3	9	39610	39618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020383	CTT	2	6	39688	39693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020383	AGA	2	6	39933	39938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020383	GGT	2	6	40023	40028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020383	TTG	2	6	40307	40312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020383	TAT	2	6	42167	42172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020383	TAA	2	6	42333	42338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020383	TCC	2	6	44354	44359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_020383	CTT	3	9	45425	45433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020383	TCT	2	6	45452	45457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020383	CTT	2	6	45477	45482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020383	ATC	2	6	45499	45504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020383	ACA	2	6	45516	45521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020383	ATG	2	6	50243	50248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020383	CCT	2	6	52200	52205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_020383	CCA	2	6	52332	52337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_020383	CAT	2	6	52447	52452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020383	ACT	2	6	52634	52639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020383	TCC	2	6	61126	61131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_020383	GGA	2	6	61142	61147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020383	TCC	2	6	61165	61170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_020383	TCC	2	6	61368	61373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_020383	ATT	2	6	65886	65891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020383	ATT	2	6	65960	65965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020383	TAG	2	6	66000	66005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020383	GGA	2	6	66375	66380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020383	CAT	2	6	66787	66792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_020383	TTA	2	6	68484	68489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.