MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-85

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020383	TA	3	6	1678	1683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020383	CT	3	6	1851	1856	0 %	50 %	0 %	50 %	452202280
3	NC_020383	AT	3	6	1892	1897	50 %	50 %	0 %	0 %	452202280
4	NC_020383	AT	3	6	2060	2065	50 %	50 %	0 %	0 %	452202280
5	NC_020383	TA	3	6	2965	2970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020383	AT	3	6	3495	3500	50 %	50 %	0 %	0 %	452202282
7	NC_020383	TA	3	6	3519	3524	50 %	50 %	0 %	0 %	452202282
8	NC_020383	AT	3	6	4629	4634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020383	TA	3	6	5724	5729	50 %	50 %	0 %	0 %	452202285
10	NC_020383	CT	3	6	6145	6150	0 %	50 %	0 %	50 %	452202285
11	NC_020383	AT	3	6	6229	6234	50 %	50 %	0 %	0 %	452202285
12	NC_020383	CT	3	6	6395	6400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020383	TA	3	6	6521	6526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020383	TA	3	6	7195	7200	50 %	50 %	0 %	0 %	452202286
15	NC_020383	TA	4	8	7205	7212	50 %	50 %	0 %	0 %	452202286
16	NC_020383	AT	5	10	7408	7417	50 %	50 %	0 %	0 %	452202287
17	NC_020383	AC	3	6	8034	8039	50 %	0 %	0 %	50 %	452202288
18	NC_020383	TC	3	6	8477	8482	0 %	50 %	0 %	50 %	452202289
19	NC_020383	TA	3	6	8794	8799	50 %	50 %	0 %	0 %	452202290
20	NC_020383	AC	3	6	9372	9377	50 %	0 %	0 %	50 %	452202291
21	NC_020383	AG	4	8	9904	9911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020383	CT	3	6	12122	12127	0 %	50 %	0 %	50 %	452202295
23	NC_020383	AT	3	6	12418	12423	50 %	50 %	0 %	0 %	452202295
24	NC_020383	TA	3	6	13032	13037	50 %	50 %	0 %	0 %	452202296
25	NC_020383	CA	3	6	14071	14076	50 %	0 %	0 %	50 %	452202298
26	NC_020383	CT	3	6	14301	14306	0 %	50 %	0 %	50 %	452202298
27	NC_020383	AT	3	6	14415	14420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020383	AC	3	6	14747	14752	50 %	0 %	0 %	50 %	452202300
29	NC_020383	AC	3	6	14921	14926	50 %	0 %	0 %	50 %	452202300
30	NC_020383	TA	3	6	15234	15239	50 %	50 %	0 %	0 %	452202302
31	NC_020383	TA	3	6	16271	16276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020383	AT	3	6	17515	17520	50 %	50 %	0 %	0 %	452202303
33	NC_020383	TA	3	6	17678	17683	50 %	50 %	0 %	0 %	452202303
34	NC_020383	AT	3	6	18889	18894	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
35	NC_020383	AC	3	6	18974	18979	50 %	0 %	0 %	50 %	452202305
36	NC_020383	AT	3	6	18989	18994	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
37	NC_020383	AT	4	8	19054	19061	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
38	NC_020383	GA	3	6	19374	19379	50 %	0 %	50 %	0 %	452202305
39	NC_020383	TA	3	6	19851	19856	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
40	NC_020383	AT	3	6	20200	20205	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
41	NC_020383	AT	3	6	20947	20952	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
42	NC_020383	AT	3	6	21965	21970	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
43	NC_020383	AT	4	8	22048	22055	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
44	NC_020383	TA	4	8	22221	22228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020383	TA	3	6	22882	22887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020383	AT	3	6	23602	23607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020383	GA	3	6	23713	23718	50 %	0 %	50 %	0 %	452202308
48	NC_020383	AT	3	6	23726	23731	50 %	50 %	0 %	0 %	452202308
49	NC_020383	TA	4	8	24030	24037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020383	TA	3	6	24610	24615	50 %	50 %	0 %	0 %	452202310
51	NC_020383	CA	3	6	24664	24669	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020383	TA	3	6	24800	24805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020383	GA	3	6	24857	24862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020383	TA	3	6	25176	25181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020383	GA	3	6	25628	25633	50 %	0 %	50 %	0 %	452202312
56	NC_020383	AT	3	6	26542	26547	50 %	50 %	0 %	0 %	452202314
57	NC_020383	AT	3	6	26785	26790	50 %	50 %	0 %	0 %	452202314
58	NC_020383	AT	4	8	26863	26870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020383	AT	3	6	27169	27174	50 %	50 %	0 %	0 %	452202315
60	NC_020383	TA	3	6	27398	27403	50 %	50 %	0 %	0 %	452202315
61	NC_020383	GT	3	6	27874	27879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020383	AT	3	6	29249	29254	50 %	50 %	0 %	0 %	452202318
63	NC_020383	TC	3	6	30119	30124	0 %	50 %	0 %	50 %	452202319
64	NC_020383	TA	3	6	30828	30833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020383	TA	4	8	30882	30889	50 %	50 %	0 %	0 %	452202321
66	NC_020383	TA	3	6	31288	31293	50 %	50 %	0 %	0 %	452202321
67	NC_020383	TC	3	6	32256	32261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020383	AT	3	6	32280	32285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020383	TA	3	6	32843	32848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020383	AT	3	6	33067	33072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020383	TA	3	6	33337	33342	50 %	50 %	0 %	0 %	452202324
72	NC_020383	TA	3	6	33803	33808	50 %	50 %	0 %	0 %	452202324
73	NC_020383	TA	4	8	33981	33988	50 %	50 %	0 %	0 %	452202324
74	NC_020383	GT	3	6	34053	34058	0 %	50 %	50 %	0 %	452202324
75	NC_020383	CA	3	6	35108	35113	50 %	0 %	0 %	50 %	452202325
76	NC_020383	AC	3	6	36224	36229	50 %	0 %	0 %	50 %	452202326
77	NC_020383	AT	4	8	36989	36996	50 %	50 %	0 %	0 %	452202327
78	NC_020383	AT	3	6	37336	37341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020383	AC	3	6	39112	39117	50 %	0 %	0 %	50 %	452202330
80	NC_020383	AT	3	6	39603	39608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020383	GT	3	6	39883	39888	0 %	50 %	50 %	0 %	452202331
82	NC_020383	TA	3	6	40539	40544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020383	AT	3	6	41033	41038	50 %	50 %	0 %	0 %	452202333
84	NC_020383	AT	3	6	41093	41098	50 %	50 %	0 %	0 %	452202333
85	NC_020383	AT	3	6	41561	41566	50 %	50 %	0 %	0 %	452202333
86	NC_020383	AT	3	6	42945	42950	50 %	50 %	0 %	0 %	452202336
87	NC_020383	AT	3	6	43141	43146	50 %	50 %	0 %	0 %	452202337
88	NC_020383	GT	3	6	43851	43856	0 %	50 %	50 %	0 %	452202339
89	NC_020383	TA	3	6	44974	44979	50 %	50 %	0 %	0 %	452202340
90	NC_020383	AT	3	6	45562	45567	50 %	50 %	0 %	0 %	452202341
91	NC_020383	AT	3	6	47351	47356	50 %	50 %	0 %	0 %	452202342
92	NC_020383	AC	4	8	48197	48204	50 %	0 %	0 %	50 %	452202342
93	NC_020383	AT	3	6	49032	49037	50 %	50 %	0 %	0 %	452202343
94	NC_020383	TA	3	6	50036	50041	50 %	50 %	0 %	0 %	452202344
95	NC_020383	TA	3	6	50598	50603	50 %	50 %	0 %	0 %	452202345
96	NC_020383	AT	3	6	51145	51150	50 %	50 %	0 %	0 %	452202345
97	NC_020383	AT	3	6	52518	52523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020383	AT	3	6	54055	54060	50 %	50 %	0 %	0 %	452202346
99	NC_020383	TA	3	6	55953	55958	50 %	50 %	0 %	0 %	452202351
100	NC_020383	CG	3	6	56033	56038	0 %	0 %	50 %	50 %	452202351
101	NC_020383	AT	3	6	56809	56814	50 %	50 %	0 %	0 %	452202353
102	NC_020383	AT	3	6	57239	57244	50 %	50 %	0 %	0 %	452202355
103	NC_020383	CT	3	6	57632	57637	0 %	50 %	0 %	50 %	452202355
104	NC_020383	TA	3	6	57782	57787	50 %	50 %	0 %	0 %	452202355
105	NC_020383	TA	3	6	57933	57938	50 %	50 %	0 %	0 %	452202355
106	NC_020383	TG	3	6	58239	58244	0 %	50 %	50 %	0 %	452202356
107	NC_020383	CA	3	6	58572	58577	50 %	0 %	0 %	50 %	452202356
108	NC_020383	CT	3	6	58757	58762	0 %	50 %	0 %	50 %	452202356
109	NC_020383	TG	3	6	59112	59117	0 %	50 %	50 %	0 %	452202356
110	NC_020383	AC	3	6	60694	60699	50 %	0 %	0 %	50 %	452202356
111	NC_020383	AG	3	6	61220	61225	50 %	0 %	50 %	0 %	452202358
112	NC_020383	GT	3	6	62255	62260	0 %	50 %	50 %	0 %	452202360
113	NC_020383	TC	3	6	63595	63600	0 %	50 %	0 %	50 %	452202361
114	NC_020383	AT	3	6	63699	63704	50 %	50 %	0 %	0 %	452202361
115	NC_020383	TA	3	6	64063	64068	50 %	50 %	0 %	0 %	452202361
116	NC_020383	AT	3	6	64381	64386	50 %	50 %	0 %	0 %	452202361
117	NC_020383	TA	3	6	65095	65100	50 %	50 %	0 %	0 %	452202362
118	NC_020383	AT	3	6	66400	66405	50 %	50 %	0 %	0 %	452202364
119	NC_020383	AT	3	6	67139	67144	50 %	50 %	0 %	0 %	452202366
120	NC_020383	CT	3	6	67663	67668	0 %	50 %	0 %	50 %	452202367
121	NC_020383	AC	3	6	68264	68269	50 %	0 %	0 %	50 %	452202367
122	NC_020383	AT	3	6	68447	68452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020383	AT	3	6	68641	68646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020383	TA	3	6	68765	68770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020383	TG	3	6	68832	68837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020383	AT	3	6	69412	69417	50 %	50 %	0 %	0 %	452202368
127	NC_020383	AT	3	6	70133	70138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020383	AT	3	6	70346	70351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020383	TA	3	6	70708	70713	50 %	50 %	0 %	0 %	452202369
130	NC_020383	TA	3	6	70860	70865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020383	TA	3	6	70897	70902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020383	AT	3	6	71072	71077	50 %	50 %	0 %	0 %	452202370
133	NC_020383	TC	3	6	71204	71209	0 %	50 %	0 %	50 %	452202370
134	NC_020383	AT	4	8	72299	72306	50 %	50 %	0 %	0 %	452202372
135	NC_020383	GA	3	6	72521	72526	50 %	0 %	50 %	0 %	452202372
136	NC_020383	TA	3	6	73089	73094	50 %	50 %	0 %	0 %	452202374
137	NC_020383	AC	3	6	74527	74532	50 %	0 %	0 %	50 %	452202375
138	NC_020383	GA	3	6	74713	74718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020383	CT	3	6	74910	74915	0 %	50 %	0 %	50 %	452202376
140	NC_020383	CA	3	6	76185	76190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020383	AT	3	6	76458	76463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020383	TC	3	6	77110	77115	0 %	50 %	0 %	50 %	452202379
143	NC_020383	AT	3	6	79186	79191	50 %	50 %	0 %	0 %	452202379
144	NC_020383	AG	3	6	80881	80886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020383	AT	3	6	80966	80971	50 %	50 %	0 %	0 %	452202383
146	NC_020383	CT	3	6	82558	82563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020383	TA	3	6	83400	83405	50 %	50 %	0 %	0 %	452202386
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149	NC_020383	CT	3	6	84480	84485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.