MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-85

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020383	CT	3	6	1851	1856	0 %	50 %	0 %	50 %	452202280
2	NC_020383	AT	3	6	1892	1897	50 %	50 %	0 %	0 %	452202280
3	NC_020383	AT	3	6	2060	2065	50 %	50 %	0 %	0 %	452202280
4	NC_020383	AT	3	6	3495	3500	50 %	50 %	0 %	0 %	452202282
5	NC_020383	TA	3	6	3519	3524	50 %	50 %	0 %	0 %	452202282
6	NC_020383	TA	3	6	5724	5729	50 %	50 %	0 %	0 %	452202285
7	NC_020383	CT	3	6	6145	6150	0 %	50 %	0 %	50 %	452202285
8	NC_020383	AT	3	6	6229	6234	50 %	50 %	0 %	0 %	452202285
9	NC_020383	TA	3	6	7195	7200	50 %	50 %	0 %	0 %	452202286
10	NC_020383	TA	4	8	7205	7212	50 %	50 %	0 %	0 %	452202286
11	NC_020383	AT	5	10	7408	7417	50 %	50 %	0 %	0 %	452202287
12	NC_020383	AC	3	6	8034	8039	50 %	0 %	0 %	50 %	452202288
13	NC_020383	TC	3	6	8477	8482	0 %	50 %	0 %	50 %	452202289
14	NC_020383	TA	3	6	8794	8799	50 %	50 %	0 %	0 %	452202290
15	NC_020383	AC	3	6	9372	9377	50 %	0 %	0 %	50 %	452202291
16	NC_020383	CT	3	6	12122	12127	0 %	50 %	0 %	50 %	452202295
17	NC_020383	AT	3	6	12418	12423	50 %	50 %	0 %	0 %	452202295
18	NC_020383	TA	3	6	13032	13037	50 %	50 %	0 %	0 %	452202296
19	NC_020383	CA	3	6	14071	14076	50 %	0 %	0 %	50 %	452202298
20	NC_020383	CT	3	6	14301	14306	0 %	50 %	0 %	50 %	452202298
21	NC_020383	AC	3	6	14747	14752	50 %	0 %	0 %	50 %	452202300
22	NC_020383	AC	3	6	14921	14926	50 %	0 %	0 %	50 %	452202300
23	NC_020383	TA	3	6	15234	15239	50 %	50 %	0 %	0 %	452202302
24	NC_020383	AT	3	6	17515	17520	50 %	50 %	0 %	0 %	452202303
25	NC_020383	TA	3	6	17678	17683	50 %	50 %	0 %	0 %	452202303
26	NC_020383	AT	3	6	18889	18894	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
27	NC_020383	AC	3	6	18974	18979	50 %	0 %	0 %	50 %	452202305
28	NC_020383	AT	3	6	18989	18994	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
29	NC_020383	AT	4	8	19054	19061	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
30	NC_020383	GA	3	6	19374	19379	50 %	0 %	50 %	0 %	452202305
31	NC_020383	TA	3	6	19851	19856	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
32	NC_020383	AT	3	6	20200	20205	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
33	NC_020383	AT	3	6	20947	20952	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
34	NC_020383	AT	3	6	21965	21970	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
35	NC_020383	AT	4	8	22048	22055	50 %	50 %	0 %	0 %	452202305
36	NC_020383	GA	3	6	23713	23718	50 %	0 %	50 %	0 %	452202308
37	NC_020383	AT	3	6	23726	23731	50 %	50 %	0 %	0 %	452202308
38	NC_020383	TA	3	6	24610	24615	50 %	50 %	0 %	0 %	452202310
39	NC_020383	GA	3	6	25628	25633	50 %	0 %	50 %	0 %	452202312
40	NC_020383	AT	3	6	26542	26547	50 %	50 %	0 %	0 %	452202314
41	NC_020383	AT	3	6	26785	26790	50 %	50 %	0 %	0 %	452202314
42	NC_020383	AT	3	6	27169	27174	50 %	50 %	0 %	0 %	452202315
43	NC_020383	TA	3	6	27398	27403	50 %	50 %	0 %	0 %	452202315
44	NC_020383	AT	3	6	29249	29254	50 %	50 %	0 %	0 %	452202318
45	NC_020383	TC	3	6	30119	30124	0 %	50 %	0 %	50 %	452202319
46	NC_020383	TA	4	8	30882	30889	50 %	50 %	0 %	0 %	452202321
47	NC_020383	TA	3	6	31288	31293	50 %	50 %	0 %	0 %	452202321
48	NC_020383	TA	3	6	33337	33342	50 %	50 %	0 %	0 %	452202324
49	NC_020383	TA	3	6	33803	33808	50 %	50 %	0 %	0 %	452202324
50	NC_020383	TA	4	8	33981	33988	50 %	50 %	0 %	0 %	452202324
51	NC_020383	GT	3	6	34053	34058	0 %	50 %	50 %	0 %	452202324
52	NC_020383	CA	3	6	35108	35113	50 %	0 %	0 %	50 %	452202325
53	NC_020383	AC	3	6	36224	36229	50 %	0 %	0 %	50 %	452202326
54	NC_020383	AT	4	8	36989	36996	50 %	50 %	0 %	0 %	452202327
55	NC_020383	AC	3	6	39112	39117	50 %	0 %	0 %	50 %	452202330
56	NC_020383	GT	3	6	39883	39888	0 %	50 %	50 %	0 %	452202331
57	NC_020383	AT	3	6	41033	41038	50 %	50 %	0 %	0 %	452202333
58	NC_020383	AT	3	6	41093	41098	50 %	50 %	0 %	0 %	452202333
59	NC_020383	AT	3	6	41561	41566	50 %	50 %	0 %	0 %	452202333
60	NC_020383	AT	3	6	42945	42950	50 %	50 %	0 %	0 %	452202336
61	NC_020383	AT	3	6	43141	43146	50 %	50 %	0 %	0 %	452202337
62	NC_020383	GT	3	6	43851	43856	0 %	50 %	50 %	0 %	452202339
63	NC_020383	TA	3	6	44974	44979	50 %	50 %	0 %	0 %	452202340
64	NC_020383	AT	3	6	45562	45567	50 %	50 %	0 %	0 %	452202341
65	NC_020383	AT	3	6	47351	47356	50 %	50 %	0 %	0 %	452202342
66	NC_020383	AC	4	8	48197	48204	50 %	0 %	0 %	50 %	452202342
67	NC_020383	AT	3	6	49032	49037	50 %	50 %	0 %	0 %	452202343
68	NC_020383	TA	3	6	50036	50041	50 %	50 %	0 %	0 %	452202344
69	NC_020383	TA	3	6	50598	50603	50 %	50 %	0 %	0 %	452202345
70	NC_020383	AT	3	6	51145	51150	50 %	50 %	0 %	0 %	452202345
71	NC_020383	AT	3	6	54055	54060	50 %	50 %	0 %	0 %	452202346
72	NC_020383	TA	3	6	55953	55958	50 %	50 %	0 %	0 %	452202351
73	NC_020383	CG	3	6	56033	56038	0 %	0 %	50 %	50 %	452202351
74	NC_020383	AT	3	6	56809	56814	50 %	50 %	0 %	0 %	452202353
75	NC_020383	AT	3	6	57239	57244	50 %	50 %	0 %	0 %	452202355
76	NC_020383	CT	3	6	57632	57637	0 %	50 %	0 %	50 %	452202355
77	NC_020383	TA	3	6	57782	57787	50 %	50 %	0 %	0 %	452202355
78	NC_020383	TA	3	6	57933	57938	50 %	50 %	0 %	0 %	452202355
79	NC_020383	TG	3	6	58239	58244	0 %	50 %	50 %	0 %	452202356
80	NC_020383	CA	3	6	58572	58577	50 %	0 %	0 %	50 %	452202356
81	NC_020383	CT	3	6	58757	58762	0 %	50 %	0 %	50 %	452202356
82	NC_020383	TG	3	6	59112	59117	0 %	50 %	50 %	0 %	452202356
83	NC_020383	AC	3	6	60694	60699	50 %	0 %	0 %	50 %	452202356
84	NC_020383	AG	3	6	61220	61225	50 %	0 %	50 %	0 %	452202358
85	NC_020383	GT	3	6	62255	62260	0 %	50 %	50 %	0 %	452202360
86	NC_020383	TC	3	6	63595	63600	0 %	50 %	0 %	50 %	452202361
87	NC_020383	AT	3	6	63699	63704	50 %	50 %	0 %	0 %	452202361
88	NC_020383	TA	3	6	64063	64068	50 %	50 %	0 %	0 %	452202361
89	NC_020383	AT	3	6	64381	64386	50 %	50 %	0 %	0 %	452202361
90	NC_020383	TA	3	6	65095	65100	50 %	50 %	0 %	0 %	452202362
91	NC_020383	AT	3	6	66400	66405	50 %	50 %	0 %	0 %	452202364
92	NC_020383	AT	3	6	67139	67144	50 %	50 %	0 %	0 %	452202366
93	NC_020383	CT	3	6	67663	67668	0 %	50 %	0 %	50 %	452202367
94	NC_020383	AC	3	6	68264	68269	50 %	0 %	0 %	50 %	452202367
95	NC_020383	AT	3	6	69412	69417	50 %	50 %	0 %	0 %	452202368
96	NC_020383	TA	3	6	70708	70713	50 %	50 %	0 %	0 %	452202369
97	NC_020383	AT	3	6	71072	71077	50 %	50 %	0 %	0 %	452202370
98	NC_020383	TC	3	6	71204	71209	0 %	50 %	0 %	50 %	452202370
99	NC_020383	AT	4	8	72299	72306	50 %	50 %	0 %	0 %	452202372
100	NC_020383	GA	3	6	72521	72526	50 %	0 %	50 %	0 %	452202372
101	NC_020383	TA	3	6	73089	73094	50 %	50 %	0 %	0 %	452202374
102	NC_020383	AC	3	6	74527	74532	50 %	0 %	0 %	50 %	452202375
103	NC_020383	CT	3	6	74910	74915	0 %	50 %	0 %	50 %	452202376
104	NC_020383	TC	3	6	77110	77115	0 %	50 %	0 %	50 %	452202379
105	NC_020383	AT	3	6	79186	79191	50 %	50 %	0 %	0 %	452202379
106	NC_020383	AT	3	6	80966	80971	50 %	50 %	0 %	0 %	452202383
107	NC_020383	TA	3	6	83400	83405	50 %	50 %	0 %	0 %	452202386
108	NC_020383	TC	3	6	84277	84282	0 %	50 %	0 %	50 %	452202388
109	NC_020383	TA	3	6	84892	84897	50 %	50 %	0 %	0 %	452202389

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.