MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-68

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020382	CTTCAC	2	12	3867	3878	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	452202190
2	NC_020382	CTTTCT	2	12	4204	4215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202191
3	NC_020382	ATGAAT	2	12	4619	4630	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452202192
4	NC_020382	ATACAT	2	12	5951	5962	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_020382	TTAAAA	2	12	8720	8731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202198
6	NC_020382	CGTATT	2	12	10664	10675	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452202201
7	NC_020382	TTCATA	2	12	10800	10811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452202201
8	NC_020382	ACTTTT	2	12	13914	13925	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452202206
9	NC_020382	AGCTGC	2	12	16653	16664	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020382	CTTTAG	2	12	17564	17575	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452202213
11	NC_020382	AACAAA	2	12	18093	18104	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020382	CAAATA	2	12	18432	18443	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452202214
13	NC_020382	ATTTAG	2	12	22252	22263	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020382	CATTAA	2	12	23878	23889	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452202218
15	NC_020382	ACTAAA	2	12	23971	23982	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452202218
16	NC_020382	TTTCAT	2	12	28098	28109	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452202227
17	NC_020382	ATTAAA	2	12	32362	32373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202237
18	NC_020382	ACAAAA	2	12	32415	32426	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	452202237
19	NC_020382	AAACCA	2	12	32898	32909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202238
20	NC_020382	TCCTGT	2	12	34177	34188	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	452202241
21	NC_020382	CATCTT	2	12	35651	35662	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	452202244
22	NC_020382	CAAATT	2	12	37881	37892	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452202246
23	NC_020382	AACTTG	2	12	39797	39808	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202248
24	NC_020382	ACCAAA	2	12	43741	43752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202250
25	NC_020382	TGCTGT	2	12	43918	43929	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	452202250
26	NC_020382	CATTGC	2	12	45508	45519	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	452202252
27	NC_020382	TCCTGT	2	12	47510	47521	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	452202254
28	NC_020382	CTGATC	2	12	50359	50370	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	452202256
29	NC_020382	TCTTTT	2	12	52374	52385	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020382	TTTGTT	2	12	54403	54414	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	452202261
31	NC_020382	TTTTTA	2	12	57358	57369	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452202262
32	NC_020382	TAATCA	2	12	58444	58455	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452202265
33	NC_020382	AGCTGC	2	12	63916	63927	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.