MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-68

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020382	ATAAA	2	10	900	909	80 %	20 %	0 %	0 %	452202188
2	NC_020382	TAAAG	2	10	1113	1122	60 %	20 %	20 %	0 %	452202188
3	NC_020382	GAATA	2	10	2419	2428	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020382	TTATT	2	10	2526	2535	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020382	GGGCT	2	10	2635	2644	0 %	20 %	60 %	20 %	452202189
6	NC_020382	TGACT	2	10	4426	4435	20 %	40 %	20 %	20 %	452202192
7	NC_020382	TTACA	2	10	5023	5032	40 %	40 %	0 %	20 %	452202193
8	NC_020382	GAACA	2	10	8066	8075	60 %	0 %	20 %	20 %	452202197
9	NC_020382	TTATT	2	10	9073	9082	20 %	80 %	0 %	0 %	452202198
10	NC_020382	ATATT	2	10	9949	9958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020382	AAATA	2	10	10189	10198	80 %	20 %	0 %	0 %	452202200
12	NC_020382	AACAA	2	10	11164	11173	80 %	0 %	0 %	20 %	452202201
13	NC_020382	GTTGA	2	10	12362	12371	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020382	ATAGC	2	10	12578	12587	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020382	TTTTA	2	10	14011	14020	20 %	80 %	0 %	0 %	452202207
16	NC_020382	TGAAA	2	10	15950	15959	60 %	20 %	20 %	0 %	452202211
17	NC_020382	AGTTG	2	10	16347	16356	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020382	GTTTT	2	10	16577	16586	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020382	TATAA	2	10	17075	17084	60 %	40 %	0 %	0 %	452202213
20	NC_020382	AAATT	2	10	17168	17177	60 %	40 %	0 %	0 %	452202213
21	NC_020382	ATTTA	2	10	17259	17268	40 %	60 %	0 %	0 %	452202213
22	NC_020382	TAAAT	2	10	18161	18170	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020382	TTTAA	2	10	19830	19839	40 %	60 %	0 %	0 %	452202216
24	NC_020382	AGGAA	2	10	19841	19850	60 %	0 %	40 %	0 %	452202216
25	NC_020382	TAGTT	2	10	21491	21500	20 %	60 %	20 %	0 %	452202216
26	NC_020382	AATTA	2	10	22224	22233	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020382	ACTGT	2	10	23699	23708	20 %	40 %	20 %	20 %	452202218
28	NC_020382	TTGTA	2	10	23785	23794	20 %	60 %	20 %	0 %	452202218
29	NC_020382	CCTTT	2	10	24234	24243	0 %	60 %	0 %	40 %	452202219
30	NC_020382	TTTTA	2	10	24849	24858	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020382	CTGTT	2	10	24934	24943	0 %	60 %	20 %	20 %	452202220
32	NC_020382	AAAAG	2	10	26415	26424	80 %	0 %	20 %	0 %	452202222
33	NC_020382	TTCGT	2	10	27339	27348	0 %	60 %	20 %	20 %	452202225
34	NC_020382	TTGTT	2	10	27695	27704	0 %	80 %	20 %	0 %	452202226
35	NC_020382	TCATT	3	15	30034	30048	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020382	CAATT	2	10	30840	30849	40 %	40 %	0 %	20 %	452202234
37	NC_020382	CTTTG	2	10	33246	33255	0 %	60 %	20 %	20 %	452202239
38	NC_020382	TCTTT	2	10	33326	33335	0 %	80 %	0 %	20 %	452202239
39	NC_020382	CCATA	2	10	33509	33518	40 %	20 %	0 %	40 %	452202239
40	NC_020382	TTATT	2	10	35366	35375	20 %	80 %	0 %	0 %	452202243
41	NC_020382	TGTAC	2	10	36526	36535	20 %	40 %	20 %	20 %	452202245
42	NC_020382	TTGTA	2	10	38006	38015	20 %	60 %	20 %	0 %	452202246
43	NC_020382	CACTT	2	10	39063	39072	20 %	40 %	0 %	40 %	452202247
44	NC_020382	CCCTA	2	10	40933	40942	20 %	20 %	0 %	60 %	452202249
45	NC_020382	GATTT	2	10	41802	41811	20 %	60 %	20 %	0 %	452202249
46	NC_020382	TAAGT	2	10	42655	42664	40 %	40 %	20 %	0 %	452202250
47	NC_020382	ATTAA	2	10	44799	44808	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020382	ATTTT	2	10	47391	47400	20 %	80 %	0 %	0 %	452202254
49	NC_020382	AAAAG	2	10	48030	48039	80 %	0 %	20 %	0 %	452202254
50	NC_020382	CTTTT	2	10	48640	48649	0 %	80 %	0 %	20 %	452202255
51	NC_020382	CTTTT	2	10	49168	49177	0 %	80 %	0 %	20 %	452202255
52	NC_020382	CTTTT	2	10	50119	50128	0 %	80 %	0 %	20 %	452202255
53	NC_020382	TTTTC	2	10	53231	53240	0 %	80 %	0 %	20 %	452202260
54	NC_020382	ATTTT	2	10	54118	54127	20 %	80 %	0 %	0 %	452202260
55	NC_020382	AAATC	2	10	56943	56952	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_020382	TATTG	2	10	58417	58426	20 %	60 %	20 %	0 %	452202265
57	NC_020382	AATTA	2	10	58655	58664	60 %	40 %	0 %	0 %	452202266
58	NC_020382	CTAAT	2	10	58675	58684	40 %	40 %	0 %	20 %	452202266
59	NC_020382	TATCA	2	10	58916	58925	40 %	40 %	0 %	20 %	452202266
60	NC_020382	ATCCC	2	10	59131	59140	20 %	20 %	0 %	60 %	452202266
61	NC_020382	AAGAG	2	10	61261	61270	60 %	0 %	40 %	0 %	452202268
62	NC_020382	AAATG	2	10	62401	62410	60 %	20 %	20 %	0 %	452202268
63	NC_020382	TCTTT	2	10	63382	63391	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_020382	TCTTT	2	10	64188	64197	0 %	80 %	0 %	20 %	452202271
65	NC_020382	AAACT	2	10	64836	64845	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_020382	ATTTC	2	10	65393	65402	20 %	60 %	0 %	20 %	452202272
67	NC_020382	CATCC	2	10	65784	65793	20 %	20 %	0 %	60 %	452202273
68	NC_020382	TAGTT	2	10	66842	66851	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020382	TTCAA	2	10	68447	68456	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.