MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-68

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020382	ATAAA	2	10	900	909	80 %	20 %	0 %	0 %	452202188
2	NC_020382	TAAAG	2	10	1113	1122	60 %	20 %	20 %	0 %	452202188
3	NC_020382	GGGCT	2	10	2635	2644	0 %	20 %	60 %	20 %	452202189
4	NC_020382	TGACT	2	10	4426	4435	20 %	40 %	20 %	20 %	452202192
5	NC_020382	TTACA	2	10	5023	5032	40 %	40 %	0 %	20 %	452202193
6	NC_020382	GAACA	2	10	8066	8075	60 %	0 %	20 %	20 %	452202197
7	NC_020382	TTATT	2	10	9073	9082	20 %	80 %	0 %	0 %	452202198
8	NC_020382	AAATA	2	10	10189	10198	80 %	20 %	0 %	0 %	452202200
9	NC_020382	AACAA	2	10	11164	11173	80 %	0 %	0 %	20 %	452202201
10	NC_020382	TTTTA	2	10	14011	14020	20 %	80 %	0 %	0 %	452202207
11	NC_020382	TGAAA	2	10	15950	15959	60 %	20 %	20 %	0 %	452202211
12	NC_020382	TATAA	2	10	17075	17084	60 %	40 %	0 %	0 %	452202213
13	NC_020382	AAATT	2	10	17168	17177	60 %	40 %	0 %	0 %	452202213
14	NC_020382	ATTTA	2	10	17259	17268	40 %	60 %	0 %	0 %	452202213
15	NC_020382	TTTAA	2	10	19830	19839	40 %	60 %	0 %	0 %	452202216
16	NC_020382	AGGAA	2	10	19841	19850	60 %	0 %	40 %	0 %	452202216
17	NC_020382	TAGTT	2	10	21491	21500	20 %	60 %	20 %	0 %	452202216
18	NC_020382	ACTGT	2	10	23699	23708	20 %	40 %	20 %	20 %	452202218
19	NC_020382	TTGTA	2	10	23785	23794	20 %	60 %	20 %	0 %	452202218
20	NC_020382	CCTTT	2	10	24234	24243	0 %	60 %	0 %	40 %	452202219
21	NC_020382	CTGTT	2	10	24934	24943	0 %	60 %	20 %	20 %	452202220
22	NC_020382	AAAAG	2	10	26415	26424	80 %	0 %	20 %	0 %	452202222
23	NC_020382	TTCGT	2	10	27339	27348	0 %	60 %	20 %	20 %	452202225
24	NC_020382	TTGTT	2	10	27695	27704	0 %	80 %	20 %	0 %	452202226
25	NC_020382	CAATT	2	10	30840	30849	40 %	40 %	0 %	20 %	452202234
26	NC_020382	CTTTG	2	10	33246	33255	0 %	60 %	20 %	20 %	452202239
27	NC_020382	TCTTT	2	10	33326	33335	0 %	80 %	0 %	20 %	452202239
28	NC_020382	CCATA	2	10	33509	33518	40 %	20 %	0 %	40 %	452202239
29	NC_020382	TTATT	2	10	35366	35375	20 %	80 %	0 %	0 %	452202243
30	NC_020382	TGTAC	2	10	36526	36535	20 %	40 %	20 %	20 %	452202245
31	NC_020382	TTGTA	2	10	38006	38015	20 %	60 %	20 %	0 %	452202246
32	NC_020382	CACTT	2	10	39063	39072	20 %	40 %	0 %	40 %	452202247
33	NC_020382	CCCTA	2	10	40933	40942	20 %	20 %	0 %	60 %	452202249
34	NC_020382	GATTT	2	10	41802	41811	20 %	60 %	20 %	0 %	452202249
35	NC_020382	TAAGT	2	10	42655	42664	40 %	40 %	20 %	0 %	452202250
36	NC_020382	ATTTT	2	10	47391	47400	20 %	80 %	0 %	0 %	452202254
37	NC_020382	AAAAG	2	10	48030	48039	80 %	0 %	20 %	0 %	452202254
38	NC_020382	CTTTT	2	10	48640	48649	0 %	80 %	0 %	20 %	452202255
39	NC_020382	CTTTT	2	10	49168	49177	0 %	80 %	0 %	20 %	452202255
40	NC_020382	CTTTT	2	10	50119	50128	0 %	80 %	0 %	20 %	452202255
41	NC_020382	TTTTC	2	10	53231	53240	0 %	80 %	0 %	20 %	452202260
42	NC_020382	ATTTT	2	10	54118	54127	20 %	80 %	0 %	0 %	452202260
43	NC_020382	TATTG	2	10	58417	58426	20 %	60 %	20 %	0 %	452202265
44	NC_020382	AATTA	2	10	58655	58664	60 %	40 %	0 %	0 %	452202266
45	NC_020382	CTAAT	2	10	58675	58684	40 %	40 %	0 %	20 %	452202266
46	NC_020382	TATCA	2	10	58916	58925	40 %	40 %	0 %	20 %	452202266
47	NC_020382	ATCCC	2	10	59131	59140	20 %	20 %	0 %	60 %	452202266
48	NC_020382	AAGAG	2	10	61261	61270	60 %	0 %	40 %	0 %	452202268
49	NC_020382	AAATG	2	10	62401	62410	60 %	20 %	20 %	0 %	452202268
50	NC_020382	TCTTT	2	10	64188	64197	0 %	80 %	0 %	20 %	452202271
51	NC_020382	ATTTC	2	10	65393	65402	20 %	60 %	0 %	20 %	452202272
52	NC_020382	CATCC	2	10	65784	65793	20 %	20 %	0 %	60 %	452202273

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.