MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-68

Total Repeats: 246

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020382	AAAC	2	8	136	143	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020382	ATTT	2	8	234	241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020382	ATAA	2	8	585	592	75 %	25 %	0 %	0 %	452202188
4	NC_020382	TCAT	2	8	770	777	25 %	50 %	0 %	25 %	452202188
5	NC_020382	TTAT	2	8	959	966	25 %	75 %	0 %	0 %	452202188
6	NC_020382	TATT	2	8	2084	2091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020382	AAAT	2	8	2125	2132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020382	TAAA	2	8	2267	2274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020382	GAAG	2	8	2778	2785	50 %	0 %	50 %	0 %	452202189
10	NC_020382	CAAA	2	8	2842	2849	75 %	0 %	0 %	25 %	452202189
11	NC_020382	TTTA	2	8	2899	2906	25 %	75 %	0 %	0 %	452202189
12	NC_020382	GGAT	2	8	3249	3256	25 %	25 %	50 %	0 %	452202189
13	NC_020382	ATTT	2	8	3362	3369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020382	AATT	2	8	3520	3527	50 %	50 %	0 %	0 %	452202190
15	NC_020382	CTAT	2	8	3629	3636	25 %	50 %	0 %	25 %	452202190
16	NC_020382	TATT	2	8	3722	3729	25 %	75 %	0 %	0 %	452202190
17	NC_020382	ATTT	2	8	3979	3986	25 %	75 %	0 %	0 %	452202190
18	NC_020382	ATCC	2	8	4049	4056	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020382	ATCA	2	8	4135	4142	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020382	GAAC	2	8	4279	4286	50 %	0 %	25 %	25 %	452202191
21	NC_020382	TTTG	2	8	4299	4306	0 %	75 %	25 %	0 %	452202191
22	NC_020382	GTAT	2	8	4674	4681	25 %	50 %	25 %	0 %	452202192
23	NC_020382	TTAT	3	12	5172	5183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020382	TATT	2	8	5227	5234	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020382	TACA	2	8	5401	5408	50 %	25 %	0 %	25 %	452202194
26	NC_020382	TAAA	2	8	5934	5941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020382	AATA	2	8	5943	5950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020382	GGGA	2	8	6378	6385	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020382	GCCT	2	8	6451	6458	0 %	25 %	25 %	50 %	452202195
30	NC_020382	ATTT	2	8	6857	6864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020382	TAAT	2	8	6888	6895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020382	AAAT	2	8	7121	7128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020382	ATTT	2	8	7136	7143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020382	AATA	2	8	7338	7345	75 %	25 %	0 %	0 %	452202196
35	NC_020382	GTAT	2	8	7391	7398	25 %	50 %	25 %	0 %	452202197
36	NC_020382	ATAA	2	8	7489	7496	75 %	25 %	0 %	0 %	452202197
37	NC_020382	GAAA	2	8	7848	7855	75 %	0 %	25 %	0 %	452202197
38	NC_020382	ATTC	2	8	8849	8856	25 %	50 %	0 %	25 %	452202198
39	NC_020382	TGAT	2	8	9424	9431	25 %	50 %	25 %	0 %	452202198
40	NC_020382	GATT	2	8	9660	9667	25 %	50 %	25 %	0 %	452202199
41	NC_020382	ATTT	2	8	9787	9794	25 %	75 %	0 %	0 %	452202199
42	NC_020382	ATTA	2	8	9911	9918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020382	TTCT	2	8	10269	10276	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020382	AGTA	2	8	10415	10422	50 %	25 %	25 %	0 %	452202201
45	NC_020382	GTAT	2	8	10977	10984	25 %	50 %	25 %	0 %	452202201
46	NC_020382	AGAT	2	8	11049	11056	50 %	25 %	25 %	0 %	452202201
47	NC_020382	GAAT	2	8	11121	11128	50 %	25 %	25 %	0 %	452202201
48	NC_020382	TTTA	2	8	11350	11357	25 %	75 %	0 %	0 %	452202201
49	NC_020382	ATTG	2	8	11437	11444	25 %	50 %	25 %	0 %	452202201
50	NC_020382	CCTT	2	8	12155	12162	0 %	50 %	0 %	50 %	452202202
51	NC_020382	TAAA	2	8	12559	12566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020382	GGTG	2	8	12684	12691	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020382	AAAT	2	8	12882	12889	75 %	25 %	0 %	0 %	452202204
54	NC_020382	ATAA	2	8	13059	13066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020382	AAAC	2	8	13354	13361	75 %	0 %	0 %	25 %	452202205
56	NC_020382	CAAC	2	8	13426	13433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020382	ATTG	2	8	13804	13811	25 %	50 %	25 %	0 %	452202206
58	NC_020382	TGTT	2	8	14608	14615	0 %	75 %	25 %	0 %	452202208
59	NC_020382	TGTT	2	8	15047	15054	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020382	CCTT	2	8	15289	15296	0 %	50 %	0 %	50 %	452202209
61	NC_020382	ATTA	2	8	15482	15489	50 %	50 %	0 %	0 %	452202210
62	NC_020382	ATTC	2	8	15712	15719	25 %	50 %	0 %	25 %	452202210
63	NC_020382	ATAA	2	8	15824	15831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020382	TTTA	2	8	15907	15914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020382	GTTT	2	8	16166	16173	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020382	TAAT	2	8	16929	16936	50 %	50 %	0 %	0 %	452202212
67	NC_020382	CTTT	2	8	16970	16977	0 %	75 %	0 %	25 %	452202213
68	NC_020382	TACT	2	8	17002	17009	25 %	50 %	0 %	25 %	452202213
69	NC_020382	ATTT	2	8	17529	17536	25 %	75 %	0 %	0 %	452202213
70	NC_020382	AATT	2	8	17801	17808	50 %	50 %	0 %	0 %	452202213
71	NC_020382	TAAG	2	8	18107	18114	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020382	GACT	2	8	18939	18946	25 %	25 %	25 %	25 %	452202214
73	NC_020382	TATC	2	8	19153	19160	25 %	50 %	0 %	25 %	452202215
74	NC_020382	CTTC	2	8	19977	19984	0 %	50 %	0 %	50 %	452202216
75	NC_020382	TTAA	2	8	20034	20041	50 %	50 %	0 %	0 %	452202216
76	NC_020382	CTAT	2	8	20250	20257	25 %	50 %	0 %	25 %	452202216
77	NC_020382	TTTG	2	8	20295	20302	0 %	75 %	25 %	0 %	452202216
78	NC_020382	TTTC	2	8	20564	20571	0 %	75 %	0 %	25 %	452202216
79	NC_020382	ATCA	2	8	21002	21009	50 %	25 %	0 %	25 %	452202216
80	NC_020382	AAAT	2	8	21115	21122	75 %	25 %	0 %	0 %	452202216
81	NC_020382	TAAG	2	8	21439	21446	50 %	25 %	25 %	0 %	452202216
82	NC_020382	TCCT	2	8	21707	21714	0 %	50 %	0 %	50 %	452202216
83	NC_020382	TACT	2	8	21861	21868	25 %	50 %	0 %	25 %	452202216
84	NC_020382	AATA	2	8	22037	22044	75 %	25 %	0 %	0 %	452202216
85	NC_020382	ATTA	3	12	22332	22343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020382	ATTT	2	8	22541	22548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020382	TTAA	2	8	23132	23139	50 %	50 %	0 %	0 %	452202217
88	NC_020382	ATTA	2	8	24052	24059	50 %	50 %	0 %	0 %	452202218
89	NC_020382	TTCT	2	8	24174	24181	0 %	75 %	0 %	25 %	452202218
90	NC_020382	CGTT	2	8	24336	24343	0 %	50 %	25 %	25 %	452202219
91	NC_020382	TTCT	2	8	24511	24518	0 %	75 %	0 %	25 %	452202219
92	NC_020382	AATA	2	8	24653	24660	75 %	25 %	0 %	0 %	452202219
93	NC_020382	ATTT	2	8	25327	25334	25 %	75 %	0 %	0 %	452202221
94	NC_020382	ATAC	2	8	25421	25428	50 %	25 %	0 %	25 %	452202221
95	NC_020382	AATT	2	8	25599	25606	50 %	50 %	0 %	0 %	452202221
96	NC_020382	TTCT	2	8	25628	25635	0 %	75 %	0 %	25 %	452202221
97	NC_020382	ACTT	2	8	25877	25884	25 %	50 %	0 %	25 %	452202221
98	NC_020382	TAGA	2	8	25917	25924	50 %	25 %	25 %	0 %	452202221
99	NC_020382	AGAA	2	8	25957	25964	75 %	0 %	25 %	0 %	452202221
100	NC_020382	TTTA	2	8	26001	26008	25 %	75 %	0 %	0 %	452202221
101	NC_020382	CATC	2	8	26165	26172	25 %	25 %	0 %	50 %	452202222
102	NC_020382	ATTT	2	8	26286	26293	25 %	75 %	0 %	0 %	452202222
103	NC_020382	ATTT	2	8	26660	26667	25 %	75 %	0 %	0 %	452202222
104	NC_020382	TAAT	2	8	26742	26749	50 %	50 %	0 %	0 %	452202223
105	NC_020382	TTTA	2	8	26996	27003	25 %	75 %	0 %	0 %	452202224
106	NC_020382	CAAA	2	8	27438	27445	75 %	0 %	0 %	25 %	452202225
107	NC_020382	TGTT	2	8	27710	27717	0 %	75 %	25 %	0 %	452202226
108	NC_020382	AAAT	2	8	28378	28385	75 %	25 %	0 %	0 %	452202228
109	NC_020382	TCCA	2	8	28456	28463	25 %	25 %	0 %	50 %	452202228
110	NC_020382	TATC	2	8	28921	28928	25 %	50 %	0 %	25 %	452202229
111	NC_020382	TAAA	2	8	29156	29163	75 %	25 %	0 %	0 %	452202230
112	NC_020382	TTAT	2	8	30586	30593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020382	TTAT	2	8	30620	30627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020382	ATAA	2	8	30658	30665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020382	AATA	2	8	30735	30742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020382	AAAT	2	8	31342	31349	75 %	25 %	0 %	0 %	452202235
117	NC_020382	GTAA	2	8	31508	31515	50 %	25 %	25 %	0 %	452202236
118	NC_020382	TAGT	2	8	31536	31543	25 %	50 %	25 %	0 %	452202236
119	NC_020382	ACTA	2	8	31754	31761	50 %	25 %	0 %	25 %	452202236
120	NC_020382	AGTA	2	8	31766	31773	50 %	25 %	25 %	0 %	452202236
121	NC_020382	AAAC	2	8	32110	32117	75 %	0 %	0 %	25 %	452202237
122	NC_020382	ATTC	2	8	32213	32220	25 %	50 %	0 %	25 %	452202237
123	NC_020382	TCAT	2	8	33163	33170	25 %	50 %	0 %	25 %	452202239
124	NC_020382	ATAA	2	8	33204	33211	75 %	25 %	0 %	0 %	452202239
125	NC_020382	ATCT	2	8	33305	33312	25 %	50 %	0 %	25 %	452202239
126	NC_020382	CTTT	2	8	33687	33694	0 %	75 %	0 %	25 %	452202240
127	NC_020382	GGTT	2	8	33764	33771	0 %	50 %	50 %	0 %	452202240
128	NC_020382	CTCA	2	8	34015	34022	25 %	25 %	0 %	50 %	452202240
129	NC_020382	AAAG	2	8	34048	34055	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020382	TAAT	2	8	34377	34384	50 %	50 %	0 %	0 %	452202241
131	NC_020382	TAAC	2	8	34570	34577	50 %	25 %	0 %	25 %	452202242
132	NC_020382	CATC	2	8	34651	34658	25 %	25 %	0 %	50 %	452202242
133	NC_020382	GAAT	2	8	35397	35404	50 %	25 %	25 %	0 %	452202243
134	NC_020382	TAGG	2	8	36328	36335	25 %	25 %	50 %	0 %	452202245
135	NC_020382	CATC	2	8	36444	36451	25 %	25 %	0 %	50 %	452202245
136	NC_020382	TCCA	2	8	36587	36594	25 %	25 %	0 %	50 %	452202245
137	NC_020382	ATAA	2	8	36920	36927	75 %	25 %	0 %	0 %	452202245
138	NC_020382	TGCT	2	8	37100	37107	0 %	50 %	25 %	25 %	452202245
139	NC_020382	TCCT	2	8	37343	37350	0 %	50 %	0 %	50 %	452202245
140	NC_020382	ACAA	2	8	37385	37392	75 %	0 %	0 %	25 %	452202245
141	NC_020382	CTTT	2	8	37543	37550	0 %	75 %	0 %	25 %	452202245
142	NC_020382	GATA	2	8	38057	38064	50 %	25 %	25 %	0 %	452202246
143	NC_020382	ATTA	2	8	39440	39447	50 %	50 %	0 %	0 %	452202248
144	NC_020382	AGCA	2	8	39567	39574	50 %	0 %	25 %	25 %	452202248
145	NC_020382	CAAA	2	8	39788	39795	75 %	0 %	0 %	25 %	452202248
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.