MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-68

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020382	AAAC	2	8	136	143	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020382	ATTT	2	8	234	241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020382	TATT	2	8	2084	2091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020382	AAAT	2	8	2125	2132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020382	TAAA	2	8	2267	2274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020382	ATTT	2	8	3362	3369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020382	ATCC	2	8	4049	4056	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020382	ATCA	2	8	4135	4142	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020382	TTAT	3	12	5172	5183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020382	TATT	2	8	5227	5234	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020382	TAAA	2	8	5934	5941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020382	AATA	2	8	5943	5950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020382	GGGA	2	8	6378	6385	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020382	ATTT	2	8	6857	6864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020382	TAAT	2	8	6888	6895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020382	AAAT	2	8	7121	7128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020382	ATTT	2	8	7136	7143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020382	ATTA	2	8	9911	9918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020382	TTCT	2	8	10269	10276	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020382	TAAA	2	8	12559	12566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020382	GGTG	2	8	12684	12691	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020382	ATAA	2	8	13059	13066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020382	CAAC	2	8	13426	13433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020382	TGTT	2	8	15047	15054	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020382	ATAA	2	8	15824	15831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020382	TTTA	2	8	15907	15914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020382	GTTT	2	8	16166	16173	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020382	TAAG	2	8	18107	18114	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020382	ATTA	3	12	22332	22343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020382	ATTT	2	8	22541	22548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020382	TTAT	2	8	30586	30593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020382	TTAT	2	8	30620	30627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020382	ATAA	2	8	30658	30665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020382	AATA	2	8	30735	30742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020382	AAAG	2	8	34048	34055	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020382	ATTT	2	8	42488	42495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020382	ATTT	2	8	43952	43959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020382	ATTA	2	8	44597	44604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020382	AAAC	2	8	58072	58079	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020382	TAAG	2	8	58343	58350	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020382	TTAT	2	8	59147	59154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020382	TTTA	2	8	59316	59323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020382	TAAA	2	8	59607	59614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020382	GAAG	2	8	63361	63368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020382	AAGA	2	8	63738	63745	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020382	TCAA	2	8	64066	64073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020382	AATT	2	8	64632	64639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020382	TTTA	2	8	64882	64889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020382	TAAT	2	8	66874	66881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020382	CTTA	2	8	67926	67933	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020382	AAAT	2	8	67952	67959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020382	TTCT	2	8	68400	68407	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020382	AGCT	2	8	68412	68419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020382	GTCA	2	8	68595	68602	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.