MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-68

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020382	ATAA	2	8	585	592	75 %	25 %	0 %	0 %	452202188
2	NC_020382	TCAT	2	8	770	777	25 %	50 %	0 %	25 %	452202188
3	NC_020382	TTAT	2	8	959	966	25 %	75 %	0 %	0 %	452202188
4	NC_020382	GAAG	2	8	2778	2785	50 %	0 %	50 %	0 %	452202189
5	NC_020382	CAAA	2	8	2842	2849	75 %	0 %	0 %	25 %	452202189
6	NC_020382	TTTA	2	8	2899	2906	25 %	75 %	0 %	0 %	452202189
7	NC_020382	GGAT	2	8	3249	3256	25 %	25 %	50 %	0 %	452202189
8	NC_020382	AATT	2	8	3520	3527	50 %	50 %	0 %	0 %	452202190
9	NC_020382	CTAT	2	8	3629	3636	25 %	50 %	0 %	25 %	452202190
10	NC_020382	TATT	2	8	3722	3729	25 %	75 %	0 %	0 %	452202190
11	NC_020382	ATTT	2	8	3979	3986	25 %	75 %	0 %	0 %	452202190
12	NC_020382	GAAC	2	8	4279	4286	50 %	0 %	25 %	25 %	452202191
13	NC_020382	TTTG	2	8	4299	4306	0 %	75 %	25 %	0 %	452202191
14	NC_020382	GTAT	2	8	4674	4681	25 %	50 %	25 %	0 %	452202192
15	NC_020382	TACA	2	8	5401	5408	50 %	25 %	0 %	25 %	452202194
16	NC_020382	GCCT	2	8	6451	6458	0 %	25 %	25 %	50 %	452202195
17	NC_020382	AATA	2	8	7338	7345	75 %	25 %	0 %	0 %	452202196
18	NC_020382	GTAT	2	8	7391	7398	25 %	50 %	25 %	0 %	452202197
19	NC_020382	ATAA	2	8	7489	7496	75 %	25 %	0 %	0 %	452202197
20	NC_020382	GAAA	2	8	7848	7855	75 %	0 %	25 %	0 %	452202197
21	NC_020382	ATTC	2	8	8849	8856	25 %	50 %	0 %	25 %	452202198
22	NC_020382	TGAT	2	8	9424	9431	25 %	50 %	25 %	0 %	452202198
23	NC_020382	GATT	2	8	9660	9667	25 %	50 %	25 %	0 %	452202199
24	NC_020382	ATTT	2	8	9787	9794	25 %	75 %	0 %	0 %	452202199
25	NC_020382	AGTA	2	8	10415	10422	50 %	25 %	25 %	0 %	452202201
26	NC_020382	GTAT	2	8	10977	10984	25 %	50 %	25 %	0 %	452202201
27	NC_020382	AGAT	2	8	11049	11056	50 %	25 %	25 %	0 %	452202201
28	NC_020382	GAAT	2	8	11121	11128	50 %	25 %	25 %	0 %	452202201
29	NC_020382	TTTA	2	8	11350	11357	25 %	75 %	0 %	0 %	452202201
30	NC_020382	ATTG	2	8	11437	11444	25 %	50 %	25 %	0 %	452202201
31	NC_020382	CCTT	2	8	12155	12162	0 %	50 %	0 %	50 %	452202202
32	NC_020382	AAAT	2	8	12882	12889	75 %	25 %	0 %	0 %	452202204
33	NC_020382	AAAC	2	8	13354	13361	75 %	0 %	0 %	25 %	452202205
34	NC_020382	ATTG	2	8	13804	13811	25 %	50 %	25 %	0 %	452202206
35	NC_020382	TGTT	2	8	14608	14615	0 %	75 %	25 %	0 %	452202208
36	NC_020382	CCTT	2	8	15289	15296	0 %	50 %	0 %	50 %	452202209
37	NC_020382	ATTA	2	8	15482	15489	50 %	50 %	0 %	0 %	452202210
38	NC_020382	ATTC	2	8	15712	15719	25 %	50 %	0 %	25 %	452202210
39	NC_020382	TAAT	2	8	16929	16936	50 %	50 %	0 %	0 %	452202212
40	NC_020382	CTTT	2	8	16970	16977	0 %	75 %	0 %	25 %	452202213
41	NC_020382	TACT	2	8	17002	17009	25 %	50 %	0 %	25 %	452202213
42	NC_020382	ATTT	2	8	17529	17536	25 %	75 %	0 %	0 %	452202213
43	NC_020382	AATT	2	8	17801	17808	50 %	50 %	0 %	0 %	452202213
44	NC_020382	GACT	2	8	18939	18946	25 %	25 %	25 %	25 %	452202214
45	NC_020382	TATC	2	8	19153	19160	25 %	50 %	0 %	25 %	452202215
46	NC_020382	CTTC	2	8	19977	19984	0 %	50 %	0 %	50 %	452202216
47	NC_020382	TTAA	2	8	20034	20041	50 %	50 %	0 %	0 %	452202216
48	NC_020382	CTAT	2	8	20250	20257	25 %	50 %	0 %	25 %	452202216
49	NC_020382	TTTG	2	8	20295	20302	0 %	75 %	25 %	0 %	452202216
50	NC_020382	TTTC	2	8	20564	20571	0 %	75 %	0 %	25 %	452202216
51	NC_020382	ATCA	2	8	21002	21009	50 %	25 %	0 %	25 %	452202216
52	NC_020382	AAAT	2	8	21115	21122	75 %	25 %	0 %	0 %	452202216
53	NC_020382	TAAG	2	8	21439	21446	50 %	25 %	25 %	0 %	452202216
54	NC_020382	TCCT	2	8	21707	21714	0 %	50 %	0 %	50 %	452202216
55	NC_020382	TACT	2	8	21861	21868	25 %	50 %	0 %	25 %	452202216
56	NC_020382	AATA	2	8	22037	22044	75 %	25 %	0 %	0 %	452202216
57	NC_020382	TTAA	2	8	23132	23139	50 %	50 %	0 %	0 %	452202217
58	NC_020382	ATTA	2	8	24052	24059	50 %	50 %	0 %	0 %	452202218
59	NC_020382	TTCT	2	8	24174	24181	0 %	75 %	0 %	25 %	452202218
60	NC_020382	CGTT	2	8	24336	24343	0 %	50 %	25 %	25 %	452202219
61	NC_020382	TTCT	2	8	24511	24518	0 %	75 %	0 %	25 %	452202219
62	NC_020382	AATA	2	8	24653	24660	75 %	25 %	0 %	0 %	452202219
63	NC_020382	ATTT	2	8	25327	25334	25 %	75 %	0 %	0 %	452202221
64	NC_020382	ATAC	2	8	25421	25428	50 %	25 %	0 %	25 %	452202221
65	NC_020382	AATT	2	8	25599	25606	50 %	50 %	0 %	0 %	452202221
66	NC_020382	TTCT	2	8	25628	25635	0 %	75 %	0 %	25 %	452202221
67	NC_020382	ACTT	2	8	25877	25884	25 %	50 %	0 %	25 %	452202221
68	NC_020382	TAGA	2	8	25917	25924	50 %	25 %	25 %	0 %	452202221
69	NC_020382	AGAA	2	8	25957	25964	75 %	0 %	25 %	0 %	452202221
70	NC_020382	TTTA	2	8	26001	26008	25 %	75 %	0 %	0 %	452202221
71	NC_020382	CATC	2	8	26165	26172	25 %	25 %	0 %	50 %	452202222
72	NC_020382	ATTT	2	8	26286	26293	25 %	75 %	0 %	0 %	452202222
73	NC_020382	ATTT	2	8	26660	26667	25 %	75 %	0 %	0 %	452202222
74	NC_020382	TAAT	2	8	26742	26749	50 %	50 %	0 %	0 %	452202223
75	NC_020382	TTTA	2	8	26996	27003	25 %	75 %	0 %	0 %	452202224
76	NC_020382	CAAA	2	8	27438	27445	75 %	0 %	0 %	25 %	452202225
77	NC_020382	TGTT	2	8	27710	27717	0 %	75 %	25 %	0 %	452202226
78	NC_020382	AAAT	2	8	28378	28385	75 %	25 %	0 %	0 %	452202228
79	NC_020382	TCCA	2	8	28456	28463	25 %	25 %	0 %	50 %	452202228
80	NC_020382	TATC	2	8	28921	28928	25 %	50 %	0 %	25 %	452202229
81	NC_020382	TAAA	2	8	29156	29163	75 %	25 %	0 %	0 %	452202230
82	NC_020382	AAAT	2	8	31342	31349	75 %	25 %	0 %	0 %	452202235
83	NC_020382	GTAA	2	8	31508	31515	50 %	25 %	25 %	0 %	452202236
84	NC_020382	TAGT	2	8	31536	31543	25 %	50 %	25 %	0 %	452202236
85	NC_020382	ACTA	2	8	31754	31761	50 %	25 %	0 %	25 %	452202236
86	NC_020382	AGTA	2	8	31766	31773	50 %	25 %	25 %	0 %	452202236
87	NC_020382	AAAC	2	8	32110	32117	75 %	0 %	0 %	25 %	452202237
88	NC_020382	ATTC	2	8	32213	32220	25 %	50 %	0 %	25 %	452202237
89	NC_020382	TCAT	2	8	33163	33170	25 %	50 %	0 %	25 %	452202239
90	NC_020382	ATAA	2	8	33204	33211	75 %	25 %	0 %	0 %	452202239
91	NC_020382	ATCT	2	8	33305	33312	25 %	50 %	0 %	25 %	452202239
92	NC_020382	CTTT	2	8	33687	33694	0 %	75 %	0 %	25 %	452202240
93	NC_020382	GGTT	2	8	33764	33771	0 %	50 %	50 %	0 %	452202240
94	NC_020382	CTCA	2	8	34015	34022	25 %	25 %	0 %	50 %	452202240
95	NC_020382	TAAT	2	8	34377	34384	50 %	50 %	0 %	0 %	452202241
96	NC_020382	TAAC	2	8	34570	34577	50 %	25 %	0 %	25 %	452202242
97	NC_020382	CATC	2	8	34651	34658	25 %	25 %	0 %	50 %	452202242
98	NC_020382	GAAT	2	8	35397	35404	50 %	25 %	25 %	0 %	452202243
99	NC_020382	TAGG	2	8	36328	36335	25 %	25 %	50 %	0 %	452202245
100	NC_020382	CATC	2	8	36444	36451	25 %	25 %	0 %	50 %	452202245
101	NC_020382	TCCA	2	8	36587	36594	25 %	25 %	0 %	50 %	452202245
102	NC_020382	ATAA	2	8	36920	36927	75 %	25 %	0 %	0 %	452202245
103	NC_020382	TGCT	2	8	37100	37107	0 %	50 %	25 %	25 %	452202245
104	NC_020382	TCCT	2	8	37343	37350	0 %	50 %	0 %	50 %	452202245
105	NC_020382	ACAA	2	8	37385	37392	75 %	0 %	0 %	25 %	452202245
106	NC_020382	CTTT	2	8	37543	37550	0 %	75 %	0 %	25 %	452202245
107	NC_020382	GATA	2	8	38057	38064	50 %	25 %	25 %	0 %	452202246
108	NC_020382	ATTA	2	8	39440	39447	50 %	50 %	0 %	0 %	452202248
109	NC_020382	AGCA	2	8	39567	39574	50 %	0 %	25 %	25 %	452202248
110	NC_020382	CAAA	2	8	39788	39795	75 %	0 %	0 %	25 %	452202248
111	NC_020382	ATTT	2	8	40227	40234	25 %	75 %	0 %	0 %	452202249
112	NC_020382	ATTA	2	8	40627	40634	50 %	50 %	0 %	0 %	452202249
113	NC_020382	CCTT	2	8	40907	40914	0 %	50 %	0 %	50 %	452202249
114	NC_020382	ATTT	2	8	41016	41023	25 %	75 %	0 %	0 %	452202249
115	NC_020382	TTCT	2	8	41575	41582	0 %	75 %	0 %	25 %	452202249
116	NC_020382	TTTC	2	8	41687	41694	0 %	75 %	0 %	25 %	452202249
117	NC_020382	TTTA	2	8	41995	42002	25 %	75 %	0 %	0 %	452202249
118	NC_020382	AAAT	2	8	42032	42039	75 %	25 %	0 %	0 %	452202249
119	NC_020382	CATT	2	8	42057	42064	25 %	50 %	0 %	25 %	452202249
120	NC_020382	ATGT	2	8	42223	42230	25 %	50 %	25 %	0 %	452202249
121	NC_020382	AGTT	2	8	42319	42326	25 %	50 %	25 %	0 %	452202249
122	NC_020382	TTTA	2	8	42748	42755	25 %	75 %	0 %	0 %	452202250
123	NC_020382	TTTC	2	8	43620	43627	0 %	75 %	0 %	25 %	452202250
124	NC_020382	GTAT	2	8	43696	43703	25 %	50 %	25 %	0 %	452202250
125	NC_020382	CAGA	2	8	44451	44458	50 %	0 %	25 %	25 %	452202251
126	NC_020382	AATA	2	8	45175	45182	75 %	25 %	0 %	0 %	452202252
127	NC_020382	AATA	2	8	45330	45337	75 %	25 %	0 %	0 %	452202252
128	NC_020382	TATC	2	8	45879	45886	25 %	50 %	0 %	25 %	452202252
129	NC_020382	GCTT	2	8	46019	46026	0 %	50 %	25 %	25 %	452202252
130	NC_020382	CCAT	2	8	46124	46131	25 %	25 %	0 %	50 %	452202252
131	NC_020382	CTTT	3	12	46371	46382	0 %	75 %	0 %	25 %	452202253
132	NC_020382	CATT	2	8	46469	46476	25 %	50 %	0 %	25 %	452202253
133	NC_020382	AATA	2	8	46555	46562	75 %	25 %	0 %	0 %	452202253
134	NC_020382	ATAA	2	8	46573	46580	75 %	25 %	0 %	0 %	452202253
135	NC_020382	TACT	2	8	46831	46838	25 %	50 %	0 %	25 %	452202254
136	NC_020382	ATTC	2	8	47135	47142	25 %	50 %	0 %	25 %	452202254
137	NC_020382	AATT	2	8	47468	47475	50 %	50 %	0 %	0 %	452202254
138	NC_020382	TTTA	2	8	47477	47484	25 %	75 %	0 %	0 %	452202254
139	NC_020382	TTCT	2	8	47579	47586	0 %	75 %	0 %	25 %	452202254
140	NC_020382	GTTT	2	8	47781	47788	0 %	75 %	25 %	0 %	452202254
141	NC_020382	TTTG	2	8	47810	47817	0 %	75 %	25 %	0 %	452202254
142	NC_020382	TAAT	2	8	48273	48280	50 %	50 %	0 %	0 %	452202255
143	NC_020382	AATA	2	8	48328	48335	75 %	25 %	0 %	0 %	452202255
144	NC_020382	ATGT	2	8	48363	48370	25 %	50 %	25 %	0 %	452202255
145	NC_020382	ATAG	2	8	48833	48840	50 %	25 %	25 %	0 %	452202255
146	NC_020382	CAAT	2	8	49247	49254	50 %	25 %	0 %	25 %	452202255
147	NC_020382	CCAT	2	8	49262	49269	25 %	25 %	0 %	50 %	452202255
148	NC_020382	TGTT	2	8	50569	50576	0 %	75 %	25 %	0 %	452202256
149	NC_020382	CTGC	2	8	51211	51218	0 %	25 %	25 %	50 %	452202258
150	NC_020382	CATT	2	8	51808	51815	25 %	50 %	0 %	25 %	452202258
151	NC_020382	TTAA	2	8	52067	52074	50 %	50 %	0 %	0 %	452202259
152	NC_020382	CTTT	2	8	52453	52460	0 %	75 %	0 %	25 %	452202260
153	NC_020382	TCTT	2	8	52624	52631	0 %	75 %	0 %	25 %	452202260
154	NC_020382	TCAA	2	8	53413	53420	50 %	25 %	0 %	25 %	452202260
155	NC_020382	TCTT	2	8	53530	53537	0 %	75 %	0 %	25 %	452202260
156	NC_020382	ATAA	2	8	53874	53881	75 %	25 %	0 %	0 %	452202260
157	NC_020382	TAAT	2	8	53915	53922	50 %	50 %	0 %	0 %	452202260
158	NC_020382	TTTC	2	8	54140	54147	0 %	75 %	0 %	25 %	452202260
159	NC_020382	TAAA	2	8	54192	54199	75 %	25 %	0 %	0 %	452202260
160	NC_020382	TAAA	2	8	54290	54297	75 %	25 %	0 %	0 %	452202260
161	NC_020382	TCGT	2	8	54852	54859	0 %	50 %	25 %	25 %	452202261
162	NC_020382	CTTT	2	8	54908	54915	0 %	75 %	0 %	25 %	452202261
163	NC_020382	ATTT	2	8	54929	54936	25 %	75 %	0 %	0 %	452202261
164	NC_020382	TCCA	2	8	55327	55334	25 %	25 %	0 %	50 %	452202261
165	NC_020382	TTTC	2	8	55969	55976	0 %	75 %	0 %	25 %	452202261
166	NC_020382	TTCA	2	8	56369	56376	25 %	50 %	0 %	25 %	452202261
167	NC_020382	CGAA	2	8	56555	56562	50 %	0 %	25 %	25 %	452202261
168	NC_020382	TAAA	2	8	56882	56889	75 %	25 %	0 %	0 %	452202261
169	NC_020382	ATCC	2	8	57804	57811	25 %	25 %	0 %	50 %	452202263
170	NC_020382	AAAT	2	8	57954	57961	75 %	25 %	0 %	0 %	452202263
171	NC_020382	CAAG	2	8	58632	58639	50 %	0 %	25 %	25 %	452202266
172	NC_020382	TTTC	2	8	58785	58792	0 %	75 %	0 %	25 %	452202266
173	NC_020382	CAAA	2	8	59071	59078	75 %	0 %	0 %	25 %	452202266
174	NC_020382	ATAC	2	8	60444	60451	50 %	25 %	0 %	25 %	452202267
175	NC_020382	ATGT	2	8	60690	60697	25 %	50 %	25 %	0 %	452202267
176	NC_020382	AGTA	2	8	60781	60788	50 %	25 %	25 %	0 %	452202268
177	NC_020382	TTTC	2	8	60957	60964	0 %	75 %	0 %	25 %	452202268
178	NC_020382	AAAC	2	8	61078	61085	75 %	0 %	0 %	25 %	452202268
179	NC_020382	TAAT	2	8	61155	61162	50 %	50 %	0 %	0 %	452202268
180	NC_020382	CATC	2	8	61361	61368	25 %	25 %	0 %	50 %	452202268
181	NC_020382	TTAC	2	8	61621	61628	25 %	50 %	0 %	25 %	452202268
182	NC_020382	TATC	2	8	62179	62186	25 %	50 %	0 %	25 %	452202268
183	NC_020382	GAAT	2	8	62241	62248	50 %	25 %	25 %	0 %	452202268
184	NC_020382	AATT	2	8	63419	63426	50 %	50 %	0 %	0 %	452202270
185	NC_020382	TTTC	2	8	63438	63445	0 %	75 %	0 %	25 %	452202270
186	NC_020382	CATT	2	8	64288	64295	25 %	50 %	0 %	25 %	452202271
187	NC_020382	AATT	2	8	64317	64324	50 %	50 %	0 %	0 %	452202271
188	NC_020382	AATA	2	8	64411	64418	75 %	25 %	0 %	0 %	452202271
189	NC_020382	AATT	2	8	65349	65356	50 %	50 %	0 %	0 %	452202272
190	NC_020382	AAAG	2	8	66075	66082	75 %	0 %	25 %	0 %	452202273
191	NC_020382	CATT	2	8	66218	66225	25 %	50 %	0 %	25 %	452202273
192	NC_020382	TTCA	2	8	66729	66736	25 %	50 %	0 %	25 %	452202273

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.