MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-68

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020382	TA	3	6	213	218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020382	AT	3	6	431	436	50 %	50 %	0 %	0 %	452202188
3	NC_020382	GT	3	6	1519	1524	0 %	50 %	50 %	0 %	452202188
4	NC_020382	CT	3	6	1627	1632	0 %	50 %	0 %	50 %	452202188
5	NC_020382	TC	3	6	1652	1657	0 %	50 %	0 %	50 %	452202188
6	NC_020382	AC	3	6	1932	1937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020382	TA	3	6	2076	2081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020382	TA	3	6	2246	2251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020382	AT	3	6	2749	2754	50 %	50 %	0 %	0 %	452202189
10	NC_020382	TG	3	6	2935	2940	0 %	50 %	50 %	0 %	452202189
11	NC_020382	TA	3	6	3352	3357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020382	TA	3	6	3380	3385	50 %	50 %	0 %	0 %	452202190
13	NC_020382	TG	3	6	3438	3443	0 %	50 %	50 %	0 %	452202190
14	NC_020382	AT	3	6	3635	3640	50 %	50 %	0 %	0 %	452202190
15	NC_020382	TC	3	6	3749	3754	0 %	50 %	0 %	50 %	452202190
16	NC_020382	TA	3	6	4448	4453	50 %	50 %	0 %	0 %	452202192
17	NC_020382	TA	3	6	4550	4555	50 %	50 %	0 %	0 %	452202192
18	NC_020382	TA	3	6	4815	4820	50 %	50 %	0 %	0 %	452202192
19	NC_020382	TA	3	6	5206	5211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020382	AT	3	6	5507	5512	50 %	50 %	0 %	0 %	452202194
21	NC_020382	AT	3	6	5909	5914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020382	AT	3	6	6113	6118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020382	TG	3	6	6292	6297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020382	TC	3	6	6833	6838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020382	AT	3	6	8506	8511	50 %	50 %	0 %	0 %	452202197
26	NC_020382	TA	3	6	8669	8674	50 %	50 %	0 %	0 %	452202197
27	NC_020382	AT	3	6	9579	9584	50 %	50 %	0 %	0 %	452202199
28	NC_020382	TG	3	6	10851	10856	0 %	50 %	50 %	0 %	452202201
29	NC_020382	AT	3	6	10924	10929	50 %	50 %	0 %	0 %	452202201
30	NC_020382	TC	3	6	10953	10958	0 %	50 %	0 %	50 %	452202201
31	NC_020382	AC	3	6	10971	10976	50 %	0 %	0 %	50 %	452202201
32	NC_020382	TA	3	6	11042	11047	50 %	50 %	0 %	0 %	452202201
33	NC_020382	TA	3	6	11268	11273	50 %	50 %	0 %	0 %	452202201
34	NC_020382	AT	4	8	11531	11538	50 %	50 %	0 %	0 %	452202201
35	NC_020382	AT	3	6	11679	11684	50 %	50 %	0 %	0 %	452202201
36	NC_020382	CA	3	6	11981	11986	50 %	0 %	0 %	50 %	452202202
37	NC_020382	AC	3	6	13021	13026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020382	TA	3	6	13040	13045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020382	AT	3	6	13192	13197	50 %	50 %	0 %	0 %	452202205
40	NC_020382	TA	3	6	13233	13238	50 %	50 %	0 %	0 %	452202205
41	NC_020382	TA	3	6	13534	13539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020382	CT	3	6	13580	13585	0 %	50 %	0 %	50 %	452202206
43	NC_020382	AT	3	6	14327	14332	50 %	50 %	0 %	0 %	452202207
44	NC_020382	AT	4	8	14368	14375	50 %	50 %	0 %	0 %	452202207
45	NC_020382	TA	3	6	14658	14663	50 %	50 %	0 %	0 %	452202208
46	NC_020382	AT	4	8	15008	15015	50 %	50 %	0 %	0 %	452202208
47	NC_020382	CT	3	6	15184	15189	0 %	50 %	0 %	50 %	452202209
48	NC_020382	AT	3	6	15336	15341	50 %	50 %	0 %	0 %	452202209
49	NC_020382	AT	3	6	15759	15764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020382	TA	3	6	15812	15817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020382	AT	3	6	17289	17294	50 %	50 %	0 %	0 %	452202213
52	NC_020382	TA	3	6	18000	18005	50 %	50 %	0 %	0 %	452202213
53	NC_020382	AG	3	6	18211	18216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020382	TC	3	6	18230	18235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020382	AT	4	8	18714	18721	50 %	50 %	0 %	0 %	452202214
56	NC_020382	TA	4	8	18760	18767	50 %	50 %	0 %	0 %	452202214
57	NC_020382	AT	3	6	20463	20468	50 %	50 %	0 %	0 %	452202216
58	NC_020382	AT	3	6	20825	20830	50 %	50 %	0 %	0 %	452202216
59	NC_020382	TA	3	6	21214	21219	50 %	50 %	0 %	0 %	452202216
60	NC_020382	TC	3	6	22200	22205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020382	TC	3	6	22218	22223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020382	GA	3	6	22872	22877	50 %	0 %	50 %	0 %	452202217
63	NC_020382	TC	3	6	23490	23495	0 %	50 %	0 %	50 %	452202217
64	NC_020382	TA	3	6	23521	23526	50 %	50 %	0 %	0 %	452202217
65	NC_020382	TA	3	6	24081	24086	50 %	50 %	0 %	0 %	452202218
66	NC_020382	TA	3	6	24659	24664	50 %	50 %	0 %	0 %	452202219
67	NC_020382	CT	3	6	24862	24867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020382	TA	3	6	25156	25161	50 %	50 %	0 %	0 %	452202220
69	NC_020382	CT	3	6	25338	25343	0 %	50 %	0 %	50 %	452202221
70	NC_020382	AT	3	6	25889	25894	50 %	50 %	0 %	0 %	452202221
71	NC_020382	TA	3	6	25904	25909	50 %	50 %	0 %	0 %	452202221
72	NC_020382	TA	3	6	26832	26837	50 %	50 %	0 %	0 %	452202223
73	NC_020382	AC	3	6	26944	26949	50 %	0 %	0 %	50 %	452202224
74	NC_020382	TA	4	8	27036	27043	50 %	50 %	0 %	0 %	452202224
75	NC_020382	AT	3	6	27410	27415	50 %	50 %	0 %	0 %	452202225
76	NC_020382	CA	3	6	27419	27424	50 %	0 %	0 %	50 %	452202225
77	NC_020382	CT	3	6	28557	28562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020382	GT	3	6	28685	28690	0 %	50 %	50 %	0 %	452202229
79	NC_020382	AT	3	6	28709	28714	50 %	50 %	0 %	0 %	452202229
80	NC_020382	TC	3	6	28859	28864	0 %	50 %	0 %	50 %	452202229
81	NC_020382	TA	3	6	29538	29543	50 %	50 %	0 %	0 %	452202231
82	NC_020382	TC	3	6	29774	29779	0 %	50 %	0 %	50 %	452202231
83	NC_020382	AT	3	6	30028	30033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020382	CT	3	6	30407	30412	0 %	50 %	0 %	50 %	452202233
85	NC_020382	TC	3	6	30442	30447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020382	TA	3	6	30470	30475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020382	AT	3	6	30494	30499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020382	TA	3	6	31114	31119	50 %	50 %	0 %	0 %	452202235
89	NC_020382	CA	3	6	31259	31264	50 %	0 %	0 %	50 %	452202235
90	NC_020382	AG	4	8	31474	31481	50 %	0 %	50 %	0 %	452202235
91	NC_020382	AT	3	6	31800	31805	50 %	50 %	0 %	0 %	452202236
92	NC_020382	TA	3	6	34727	34732	50 %	50 %	0 %	0 %	452202242
93	NC_020382	AT	3	6	35021	35026	50 %	50 %	0 %	0 %	452202242
94	NC_020382	TA	3	6	35231	35236	50 %	50 %	0 %	0 %	452202242
95	NC_020382	AT	3	6	35294	35299	50 %	50 %	0 %	0 %	452202242
96	NC_020382	TA	3	6	35603	35608	50 %	50 %	0 %	0 %	452202243
97	NC_020382	TA	3	6	36138	36143	50 %	50 %	0 %	0 %	452202244
98	NC_020382	TA	3	6	36643	36648	50 %	50 %	0 %	0 %	452202245
99	NC_020382	AT	3	6	38048	38053	50 %	50 %	0 %	0 %	452202246
100	NC_020382	CT	3	6	38611	38616	0 %	50 %	0 %	50 %	452202247
101	NC_020382	AT	4	8	39597	39604	50 %	50 %	0 %	0 %	452202248
102	NC_020382	TA	3	6	40760	40765	50 %	50 %	0 %	0 %	452202249
103	NC_020382	CT	3	6	40901	40906	0 %	50 %	0 %	50 %	452202249
104	NC_020382	AG	3	6	41225	41230	50 %	0 %	50 %	0 %	452202249
105	NC_020382	CA	3	6	41517	41522	50 %	0 %	0 %	50 %	452202249
106	NC_020382	AT	3	6	41621	41626	50 %	50 %	0 %	0 %	452202249
107	NC_020382	AT	4	8	42241	42248	50 %	50 %	0 %	0 %	452202249
108	NC_020382	TA	3	6	44273	44278	50 %	50 %	0 %	0 %	452202251
109	NC_020382	TC	3	6	44372	44377	0 %	50 %	0 %	50 %	452202251
110	NC_020382	AC	3	6	44410	44415	50 %	0 %	0 %	50 %	452202251
111	NC_020382	AT	3	6	44536	44541	50 %	50 %	0 %	0 %	452202251
112	NC_020382	TA	3	6	44620	44625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020382	TA	3	6	44643	44648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020382	AT	3	6	45085	45090	50 %	50 %	0 %	0 %	452202252
115	NC_020382	TA	3	6	45181	45186	50 %	50 %	0 %	0 %	452202252
116	NC_020382	TC	3	6	45219	45224	0 %	50 %	0 %	50 %	452202252
117	NC_020382	CT	3	6	46069	46074	0 %	50 %	0 %	50 %	452202252
118	NC_020382	AC	3	6	46136	46141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020382	TA	4	8	46547	46554	50 %	50 %	0 %	0 %	452202253
120	NC_020382	GT	3	6	46763	46768	0 %	50 %	50 %	0 %	452202254
121	NC_020382	TA	3	6	46996	47001	50 %	50 %	0 %	0 %	452202254
122	NC_020382	AT	3	6	47217	47222	50 %	50 %	0 %	0 %	452202254
123	NC_020382	TA	3	6	47227	47232	50 %	50 %	0 %	0 %	452202254
124	NC_020382	AC	3	6	47501	47506	50 %	0 %	0 %	50 %	452202254
125	NC_020382	TA	3	6	47978	47983	50 %	50 %	0 %	0 %	452202254
126	NC_020382	AT	3	6	48220	48225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020382	TA	3	6	48444	48449	50 %	50 %	0 %	0 %	452202255
128	NC_020382	TA	3	6	49026	49031	50 %	50 %	0 %	0 %	452202255
129	NC_020382	TC	3	6	50836	50841	0 %	50 %	0 %	50 %	452202257
130	NC_020382	CA	3	6	50966	50971	50 %	0 %	0 %	50 %	452202257
131	NC_020382	CT	3	6	51147	51152	0 %	50 %	0 %	50 %	452202257
132	NC_020382	TA	3	6	51712	51717	50 %	50 %	0 %	0 %	452202258
133	NC_020382	TA	3	6	51821	51826	50 %	50 %	0 %	0 %	452202258
134	NC_020382	TA	3	6	51831	51836	50 %	50 %	0 %	0 %	452202258
135	NC_020382	TA	4	8	53166	53173	50 %	50 %	0 %	0 %	452202260
136	NC_020382	AT	3	6	53278	53283	50 %	50 %	0 %	0 %	452202260
137	NC_020382	AC	3	6	53504	53509	50 %	0 %	0 %	50 %	452202260
138	NC_020382	TA	4	8	53550	53557	50 %	50 %	0 %	0 %	452202260
139	NC_020382	TC	4	8	54037	54044	0 %	50 %	0 %	50 %	452202260
140	NC_020382	TA	3	6	54235	54240	50 %	50 %	0 %	0 %	452202260
141	NC_020382	TA	3	6	54308	54313	50 %	50 %	0 %	0 %	452202260
142	NC_020382	CT	4	8	54382	54389	0 %	50 %	0 %	50 %	452202261
143	NC_020382	AT	3	6	54561	54566	50 %	50 %	0 %	0 %	452202261
144	NC_020382	CT	3	6	54606	54611	0 %	50 %	0 %	50 %	452202261
145	NC_020382	GT	3	6	56208	56213	0 %	50 %	50 %	0 %	452202261
146	NC_020382	AT	3	6	56363	56368	50 %	50 %	0 %	0 %	452202261
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148	NC_020382	AT	3	6	57039	57044	50 %	50 %	0 %	0 %	452202262
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.