MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-68

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020382	AT	3	6	431	436	50 %	50 %	0 %	0 %	452202188
2	NC_020382	GT	3	6	1519	1524	0 %	50 %	50 %	0 %	452202188
3	NC_020382	CT	3	6	1627	1632	0 %	50 %	0 %	50 %	452202188
4	NC_020382	TC	3	6	1652	1657	0 %	50 %	0 %	50 %	452202188
5	NC_020382	AT	3	6	2749	2754	50 %	50 %	0 %	0 %	452202189
6	NC_020382	TG	3	6	2935	2940	0 %	50 %	50 %	0 %	452202189
7	NC_020382	TA	3	6	3380	3385	50 %	50 %	0 %	0 %	452202190
8	NC_020382	TG	3	6	3438	3443	0 %	50 %	50 %	0 %	452202190
9	NC_020382	AT	3	6	3635	3640	50 %	50 %	0 %	0 %	452202190
10	NC_020382	TC	3	6	3749	3754	0 %	50 %	0 %	50 %	452202190
11	NC_020382	TA	3	6	4448	4453	50 %	50 %	0 %	0 %	452202192
12	NC_020382	TA	3	6	4550	4555	50 %	50 %	0 %	0 %	452202192
13	NC_020382	TA	3	6	4815	4820	50 %	50 %	0 %	0 %	452202192
14	NC_020382	AT	3	6	5507	5512	50 %	50 %	0 %	0 %	452202194
15	NC_020382	AT	3	6	8506	8511	50 %	50 %	0 %	0 %	452202197
16	NC_020382	TA	3	6	8669	8674	50 %	50 %	0 %	0 %	452202197
17	NC_020382	AT	3	6	9579	9584	50 %	50 %	0 %	0 %	452202199
18	NC_020382	TG	3	6	10851	10856	0 %	50 %	50 %	0 %	452202201
19	NC_020382	AT	3	6	10924	10929	50 %	50 %	0 %	0 %	452202201
20	NC_020382	TC	3	6	10953	10958	0 %	50 %	0 %	50 %	452202201
21	NC_020382	AC	3	6	10971	10976	50 %	0 %	0 %	50 %	452202201
22	NC_020382	TA	3	6	11042	11047	50 %	50 %	0 %	0 %	452202201
23	NC_020382	TA	3	6	11268	11273	50 %	50 %	0 %	0 %	452202201
24	NC_020382	AT	4	8	11531	11538	50 %	50 %	0 %	0 %	452202201
25	NC_020382	AT	3	6	11679	11684	50 %	50 %	0 %	0 %	452202201
26	NC_020382	CA	3	6	11981	11986	50 %	0 %	0 %	50 %	452202202
27	NC_020382	AT	3	6	13192	13197	50 %	50 %	0 %	0 %	452202205
28	NC_020382	TA	3	6	13233	13238	50 %	50 %	0 %	0 %	452202205
29	NC_020382	CT	3	6	13580	13585	0 %	50 %	0 %	50 %	452202206
30	NC_020382	AT	3	6	14327	14332	50 %	50 %	0 %	0 %	452202207
31	NC_020382	AT	4	8	14368	14375	50 %	50 %	0 %	0 %	452202207
32	NC_020382	TA	3	6	14658	14663	50 %	50 %	0 %	0 %	452202208
33	NC_020382	AT	4	8	15008	15015	50 %	50 %	0 %	0 %	452202208
34	NC_020382	CT	3	6	15184	15189	0 %	50 %	0 %	50 %	452202209
35	NC_020382	AT	3	6	15336	15341	50 %	50 %	0 %	0 %	452202209
36	NC_020382	AT	3	6	17289	17294	50 %	50 %	0 %	0 %	452202213
37	NC_020382	TA	3	6	18000	18005	50 %	50 %	0 %	0 %	452202213
38	NC_020382	AT	4	8	18714	18721	50 %	50 %	0 %	0 %	452202214
39	NC_020382	TA	4	8	18760	18767	50 %	50 %	0 %	0 %	452202214
40	NC_020382	AT	3	6	20463	20468	50 %	50 %	0 %	0 %	452202216
41	NC_020382	AT	3	6	20825	20830	50 %	50 %	0 %	0 %	452202216
42	NC_020382	TA	3	6	21214	21219	50 %	50 %	0 %	0 %	452202216
43	NC_020382	GA	3	6	22872	22877	50 %	0 %	50 %	0 %	452202217
44	NC_020382	TC	3	6	23490	23495	0 %	50 %	0 %	50 %	452202217
45	NC_020382	TA	3	6	23521	23526	50 %	50 %	0 %	0 %	452202217
46	NC_020382	TA	3	6	24081	24086	50 %	50 %	0 %	0 %	452202218
47	NC_020382	TA	3	6	24659	24664	50 %	50 %	0 %	0 %	452202219
48	NC_020382	TA	3	6	25156	25161	50 %	50 %	0 %	0 %	452202220
49	NC_020382	CT	3	6	25338	25343	0 %	50 %	0 %	50 %	452202221
50	NC_020382	AT	3	6	25889	25894	50 %	50 %	0 %	0 %	452202221
51	NC_020382	TA	3	6	25904	25909	50 %	50 %	0 %	0 %	452202221
52	NC_020382	TA	3	6	26832	26837	50 %	50 %	0 %	0 %	452202223
53	NC_020382	AC	3	6	26944	26949	50 %	0 %	0 %	50 %	452202224
54	NC_020382	TA	4	8	27036	27043	50 %	50 %	0 %	0 %	452202224
55	NC_020382	AT	3	6	27410	27415	50 %	50 %	0 %	0 %	452202225
56	NC_020382	CA	3	6	27419	27424	50 %	0 %	0 %	50 %	452202225
57	NC_020382	GT	3	6	28685	28690	0 %	50 %	50 %	0 %	452202229
58	NC_020382	AT	3	6	28709	28714	50 %	50 %	0 %	0 %	452202229
59	NC_020382	TC	3	6	28859	28864	0 %	50 %	0 %	50 %	452202229
60	NC_020382	TA	3	6	29538	29543	50 %	50 %	0 %	0 %	452202231
61	NC_020382	TC	3	6	29774	29779	0 %	50 %	0 %	50 %	452202231
62	NC_020382	CT	3	6	30407	30412	0 %	50 %	0 %	50 %	452202233
63	NC_020382	TA	3	6	31114	31119	50 %	50 %	0 %	0 %	452202235
64	NC_020382	CA	3	6	31259	31264	50 %	0 %	0 %	50 %	452202235
65	NC_020382	AG	4	8	31474	31481	50 %	0 %	50 %	0 %	452202235
66	NC_020382	AT	3	6	31800	31805	50 %	50 %	0 %	0 %	452202236
67	NC_020382	TA	3	6	34727	34732	50 %	50 %	0 %	0 %	452202242
68	NC_020382	AT	3	6	35021	35026	50 %	50 %	0 %	0 %	452202242
69	NC_020382	TA	3	6	35231	35236	50 %	50 %	0 %	0 %	452202242
70	NC_020382	AT	3	6	35294	35299	50 %	50 %	0 %	0 %	452202242
71	NC_020382	TA	3	6	35603	35608	50 %	50 %	0 %	0 %	452202243
72	NC_020382	TA	3	6	36138	36143	50 %	50 %	0 %	0 %	452202244
73	NC_020382	TA	3	6	36643	36648	50 %	50 %	0 %	0 %	452202245
74	NC_020382	AT	3	6	38048	38053	50 %	50 %	0 %	0 %	452202246
75	NC_020382	CT	3	6	38611	38616	0 %	50 %	0 %	50 %	452202247
76	NC_020382	AT	4	8	39597	39604	50 %	50 %	0 %	0 %	452202248
77	NC_020382	TA	3	6	40760	40765	50 %	50 %	0 %	0 %	452202249
78	NC_020382	CT	3	6	40901	40906	0 %	50 %	0 %	50 %	452202249
79	NC_020382	AG	3	6	41225	41230	50 %	0 %	50 %	0 %	452202249
80	NC_020382	CA	3	6	41517	41522	50 %	0 %	0 %	50 %	452202249
81	NC_020382	AT	3	6	41621	41626	50 %	50 %	0 %	0 %	452202249
82	NC_020382	AT	4	8	42241	42248	50 %	50 %	0 %	0 %	452202249
83	NC_020382	TA	3	6	44273	44278	50 %	50 %	0 %	0 %	452202251
84	NC_020382	TC	3	6	44372	44377	0 %	50 %	0 %	50 %	452202251
85	NC_020382	AC	3	6	44410	44415	50 %	0 %	0 %	50 %	452202251
86	NC_020382	AT	3	6	44536	44541	50 %	50 %	0 %	0 %	452202251
87	NC_020382	AT	3	6	45085	45090	50 %	50 %	0 %	0 %	452202252
88	NC_020382	TA	3	6	45181	45186	50 %	50 %	0 %	0 %	452202252
89	NC_020382	TC	3	6	45219	45224	0 %	50 %	0 %	50 %	452202252
90	NC_020382	CT	3	6	46069	46074	0 %	50 %	0 %	50 %	452202252
91	NC_020382	TA	4	8	46547	46554	50 %	50 %	0 %	0 %	452202253
92	NC_020382	GT	3	6	46763	46768	0 %	50 %	50 %	0 %	452202254
93	NC_020382	TA	3	6	46996	47001	50 %	50 %	0 %	0 %	452202254
94	NC_020382	AT	3	6	47217	47222	50 %	50 %	0 %	0 %	452202254
95	NC_020382	TA	3	6	47227	47232	50 %	50 %	0 %	0 %	452202254
96	NC_020382	AC	3	6	47501	47506	50 %	0 %	0 %	50 %	452202254
97	NC_020382	TA	3	6	47978	47983	50 %	50 %	0 %	0 %	452202254
98	NC_020382	TA	3	6	48444	48449	50 %	50 %	0 %	0 %	452202255
99	NC_020382	TA	3	6	49026	49031	50 %	50 %	0 %	0 %	452202255
100	NC_020382	TC	3	6	50836	50841	0 %	50 %	0 %	50 %	452202257
101	NC_020382	CA	3	6	50966	50971	50 %	0 %	0 %	50 %	452202257
102	NC_020382	CT	3	6	51147	51152	0 %	50 %	0 %	50 %	452202257
103	NC_020382	TA	3	6	51712	51717	50 %	50 %	0 %	0 %	452202258
104	NC_020382	TA	3	6	51821	51826	50 %	50 %	0 %	0 %	452202258
105	NC_020382	TA	3	6	51831	51836	50 %	50 %	0 %	0 %	452202258
106	NC_020382	TA	4	8	53166	53173	50 %	50 %	0 %	0 %	452202260
107	NC_020382	AT	3	6	53278	53283	50 %	50 %	0 %	0 %	452202260
108	NC_020382	AC	3	6	53504	53509	50 %	0 %	0 %	50 %	452202260
109	NC_020382	TA	4	8	53550	53557	50 %	50 %	0 %	0 %	452202260
110	NC_020382	TC	4	8	54037	54044	0 %	50 %	0 %	50 %	452202260
111	NC_020382	TA	3	6	54235	54240	50 %	50 %	0 %	0 %	452202260
112	NC_020382	TA	3	6	54308	54313	50 %	50 %	0 %	0 %	452202260
113	NC_020382	CT	4	8	54382	54389	0 %	50 %	0 %	50 %	452202261
114	NC_020382	AT	3	6	54561	54566	50 %	50 %	0 %	0 %	452202261
115	NC_020382	CT	3	6	54606	54611	0 %	50 %	0 %	50 %	452202261
116	NC_020382	GT	3	6	56208	56213	0 %	50 %	50 %	0 %	452202261
117	NC_020382	AT	3	6	56363	56368	50 %	50 %	0 %	0 %	452202261
118	NC_020382	CT	3	6	56657	56662	0 %	50 %	0 %	50 %	452202261
119	NC_020382	AT	3	6	57039	57044	50 %	50 %	0 %	0 %	452202262
120	NC_020382	GC	3	6	60653	60658	0 %	0 %	50 %	50 %	452202267
121	NC_020382	TG	3	6	60868	60873	0 %	50 %	50 %	0 %	452202268
122	NC_020382	AT	3	6	61281	61286	50 %	50 %	0 %	0 %	452202268
123	NC_020382	AT	3	6	61729	61734	50 %	50 %	0 %	0 %	452202268
124	NC_020382	AT	3	6	61822	61827	50 %	50 %	0 %	0 %	452202268
125	NC_020382	AT	3	6	62118	62123	50 %	50 %	0 %	0 %	452202268
126	NC_020382	AT	3	6	62440	62445	50 %	50 %	0 %	0 %	452202268
127	NC_020382	TG	3	6	62571	62576	0 %	50 %	50 %	0 %	452202268
128	NC_020382	CT	3	6	64428	64433	0 %	50 %	0 %	50 %	452202271
129	NC_020382	AT	3	6	65482	65487	50 %	50 %	0 %	0 %	452202272
130	NC_020382	CT	3	6	67367	67372	0 %	50 %	0 %	50 %	452202274
131	NC_020382	TA	3	6	67659	67664	50 %	50 %	0 %	0 %	452202275
132	NC_020382	TA	3	6	68193	68198	50 %	50 %	0 %	0 %	452202276

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.