MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-39

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020381	CAAAAT	2	12	3922	3933	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452202140
2	NC_020381	ATTAAA	2	12	9738	9749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202151
3	NC_020381	TGATTT	2	12	11889	11900	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	452202155
4	NC_020381	AGAAAA	2	12	15053	15064	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452202160
5	NC_020381	TGAATT	2	12	15113	15124	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452202160
6	NC_020381	CACATA	2	12	17044	17055	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	452202164
7	NC_020381	CACATA	2	12	18891	18902	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	452202168
8	NC_020381	TGGTTT	2	12	19344	19355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202168
9	NC_020381	AACTGT	2	12	19356	19367	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202168
10	NC_020381	TAAACA	2	12	20842	20853	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452202170
11	NC_020381	AGCTAC	2	12	24355	24366	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	452202174
12	NC_020381	CTTTTT	2	12	24942	24953	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452202174
13	NC_020381	TCTGGT	2	12	25364	25375	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	452202174
14	NC_020381	CTGTAA	2	12	25482	25493	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452202174
15	NC_020381	AATCAG	2	12	28095	28106	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452202175
16	NC_020381	TTTCCT	2	12	29615	29626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202176
17	NC_020381	CAAATT	2	12	31382	31393	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452202177
18	NC_020381	ACTCCT	2	12	34312	34323	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	452202182
19	NC_020381	CCTTTA	2	12	37164	37175	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	452202183
20	NC_020381	TCGTCT	2	12	38053	38064	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	452202184
21	NC_020381	CTTTTA	2	12	38593	38604	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452202185

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.