MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-39

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020381	GATT	2	8	423	430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020381	TGCT	2	8	1271	1278	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020381	TTTG	2	8	1305	1312	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020381	CATA	2	8	1738	1745	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020381	CCAG	2	8	2030	2037	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020381	TCGA	2	8	2513	2520	25 %	25 %	25 %	25 %	452202138
7	NC_020381	TCAT	2	8	2628	2635	25 %	50 %	0 %	25 %	452202138
8	NC_020381	GATA	2	8	2639	2646	50 %	25 %	25 %	0 %	452202138
9	NC_020381	TATT	2	8	3136	3143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020381	TTAG	2	8	4247	4254	25 %	50 %	25 %	0 %	452202141
11	NC_020381	TTTC	2	8	4754	4761	0 %	75 %	0 %	25 %	452202142
12	NC_020381	CTAT	2	8	4924	4931	25 %	50 %	0 %	25 %	452202142
13	NC_020381	CTGT	2	8	5317	5324	0 %	50 %	25 %	25 %	452202142
14	NC_020381	ATAA	2	8	5481	5488	75 %	25 %	0 %	0 %	452202143
15	NC_020381	TAAC	2	8	5638	5645	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020381	AAAC	2	8	5672	5679	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020381	TTAG	2	8	5785	5792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020381	TAAC	2	8	5806	5813	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020381	ATAA	2	8	6247	6254	75 %	25 %	0 %	0 %	452202144
20	NC_020381	GGGA	2	8	6300	6307	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020381	CAAC	2	8	6367	6374	50 %	0 %	0 %	50 %	452202145
22	NC_020381	ATTT	2	8	6622	6629	25 %	75 %	0 %	0 %	452202145
23	NC_020381	GCAT	2	8	6662	6669	25 %	25 %	25 %	25 %	452202145
24	NC_020381	ACAT	2	8	6808	6815	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020381	AATT	2	8	7093	7100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020381	TTTC	2	8	7611	7618	0 %	75 %	0 %	25 %	452202147
27	NC_020381	GCTT	2	8	7705	7712	0 %	50 %	25 %	25 %	452202147
28	NC_020381	TAAG	2	8	7752	7759	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020381	GGAT	2	8	9026	9033	25 %	25 %	50 %	0 %	452202151
30	NC_020381	TACA	2	8	9120	9127	50 %	25 %	0 %	25 %	452202151
31	NC_020381	AATT	2	8	9962	9969	50 %	50 %	0 %	0 %	452202152
32	NC_020381	TTAC	2	8	10000	10007	25 %	50 %	0 %	25 %	452202152
33	NC_020381	TTAC	2	8	10436	10443	25 %	50 %	0 %	25 %	452202152
34	NC_020381	TTCA	2	8	10514	10521	25 %	50 %	0 %	25 %	452202152
35	NC_020381	AGAA	2	8	11046	11053	75 %	0 %	25 %	0 %	452202153
36	NC_020381	TAAA	2	8	11248	11255	75 %	25 %	0 %	0 %	452202153
37	NC_020381	AACT	2	8	11293	11300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020381	ATCA	2	8	11346	11353	50 %	25 %	0 %	25 %	452202154
39	NC_020381	TGTA	2	8	11432	11439	25 %	50 %	25 %	0 %	452202154
40	NC_020381	TTAA	2	8	11521	11528	50 %	50 %	0 %	0 %	452202154
41	NC_020381	AAAT	2	8	11607	11614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020381	CAAA	2	8	11789	11796	75 %	0 %	0 %	25 %	452202155
43	NC_020381	AGAA	2	8	11820	11827	75 %	0 %	25 %	0 %	452202155
44	NC_020381	ATTT	2	8	12407	12414	25 %	75 %	0 %	0 %	452202156
45	NC_020381	ATTT	2	8	12436	12443	25 %	75 %	0 %	0 %	452202156
46	NC_020381	CATG	2	8	12474	12481	25 %	25 %	25 %	25 %	452202157
47	NC_020381	ATAA	2	8	12564	12571	75 %	25 %	0 %	0 %	452202157
48	NC_020381	CATT	2	8	12706	12713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020381	GTTT	2	8	13689	13696	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020381	AGTG	2	8	14505	14512	25 %	25 %	50 %	0 %	452202159
51	NC_020381	GAAA	2	8	14771	14778	75 %	0 %	25 %	0 %	452202159
52	NC_020381	AAGT	2	8	14815	14822	50 %	25 %	25 %	0 %	452202160
53	NC_020381	GATG	2	8	14942	14949	25 %	25 %	50 %	0 %	452202160
54	NC_020381	ACTA	2	8	15249	15256	50 %	25 %	0 %	25 %	452202161
55	NC_020381	AATG	2	8	15346	15353	50 %	25 %	25 %	0 %	452202161
56	NC_020381	TACT	2	8	15822	15829	25 %	50 %	0 %	25 %	452202163
57	NC_020381	TTTA	2	8	16268	16275	25 %	75 %	0 %	0 %	452202163
58	NC_020381	CCTT	2	8	16362	16369	0 %	50 %	0 %	50 %	452202163
59	NC_020381	GGAA	2	8	16933	16940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020381	GGTA	2	8	17214	17221	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020381	GATT	2	8	17345	17352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020381	TGAG	2	8	17409	17416	25 %	25 %	50 %	0 %	452202165
63	NC_020381	TGAA	2	8	17649	17656	50 %	25 %	25 %	0 %	452202165
64	NC_020381	AAAT	2	8	17947	17954	75 %	25 %	0 %	0 %	452202165
65	NC_020381	AAAT	2	8	18793	18800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020381	TTTA	2	8	19227	19234	25 %	75 %	0 %	0 %	452202168
67	NC_020381	AATC	2	8	19436	19443	50 %	25 %	0 %	25 %	452202168
68	NC_020381	GTAA	2	8	19473	19480	50 %	25 %	25 %	0 %	452202168
69	NC_020381	ATAA	2	8	19906	19913	75 %	25 %	0 %	0 %	452202168
70	NC_020381	CAAA	2	8	19965	19972	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020381	AAAT	2	8	20230	20237	75 %	25 %	0 %	0 %	452202169
72	NC_020381	ATTA	2	8	20410	20417	50 %	50 %	0 %	0 %	452202169
73	NC_020381	TAGA	2	8	20616	20623	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020381	GTAA	2	8	21242	21249	50 %	25 %	25 %	0 %	452202170
75	NC_020381	ATTT	2	8	22144	22151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020381	TTGT	2	8	23573	23580	0 %	75 %	25 %	0 %	452202173
77	NC_020381	ATAA	2	8	23678	23685	75 %	25 %	0 %	0 %	452202173
78	NC_020381	AAAT	2	8	23912	23919	75 %	25 %	0 %	0 %	452202174
79	NC_020381	AATC	2	8	23994	24001	50 %	25 %	0 %	25 %	452202174
80	NC_020381	GAAG	2	8	24326	24333	50 %	0 %	50 %	0 %	452202174
81	NC_020381	CTTT	2	8	24920	24927	0 %	75 %	0 %	25 %	452202174
82	NC_020381	ACCT	2	8	25054	25061	25 %	25 %	0 %	50 %	452202174
83	NC_020381	AAAC	2	8	25529	25536	75 %	0 %	0 %	25 %	452202174
84	NC_020381	ATTG	2	8	25875	25882	25 %	50 %	25 %	0 %	452202174
85	NC_020381	TTGT	2	8	26374	26381	0 %	75 %	25 %	0 %	452202175
86	NC_020381	TAAG	2	8	26544	26551	50 %	25 %	25 %	0 %	452202175
87	NC_020381	CAAA	2	8	26586	26593	75 %	0 %	0 %	25 %	452202175
88	NC_020381	AAAT	2	8	26632	26639	75 %	25 %	0 %	0 %	452202175
89	NC_020381	ATTT	2	8	26911	26918	25 %	75 %	0 %	0 %	452202175
90	NC_020381	TTTC	2	8	27203	27210	0 %	75 %	0 %	25 %	452202175
91	NC_020381	ATTC	2	8	27885	27892	25 %	50 %	0 %	25 %	452202175
92	NC_020381	AAAT	2	8	29441	29448	75 %	25 %	0 %	0 %	452202176
93	NC_020381	TCTT	2	8	29891	29898	0 %	75 %	0 %	25 %	452202176
94	NC_020381	CGTT	2	8	30091	30098	0 %	50 %	25 %	25 %	452202176
95	NC_020381	TTCT	2	8	30313	30320	0 %	75 %	0 %	25 %	452202177
96	NC_020381	TTTG	2	8	30940	30947	0 %	75 %	25 %	0 %	452202177
97	NC_020381	ACTT	2	8	31065	31072	25 %	50 %	0 %	25 %	452202177
98	NC_020381	CTTT	2	8	31256	31263	0 %	75 %	0 %	25 %	452202177
99	NC_020381	CTTT	2	8	32620	32627	0 %	75 %	0 %	25 %	452202180
100	NC_020381	TCAA	2	8	32686	32693	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020381	TCCG	2	8	32901	32908	0 %	25 %	25 %	50 %	452202181
102	NC_020381	AATA	2	8	33036	33043	75 %	25 %	0 %	0 %	452202181
103	NC_020381	CATG	2	8	34553	34560	25 %	25 %	25 %	25 %	452202182
104	NC_020381	TGTT	2	8	34602	34609	0 %	75 %	25 %	0 %	452202182
105	NC_020381	TTGT	2	8	34709	34716	0 %	75 %	25 %	0 %	452202182
106	NC_020381	TTTA	2	8	35261	35268	25 %	75 %	0 %	0 %	452202183
107	NC_020381	CTTT	2	8	35596	35603	0 %	75 %	0 %	25 %	452202183
108	NC_020381	CTTT	2	8	35881	35888	0 %	75 %	0 %	25 %	452202183
109	NC_020381	TCCA	2	8	36007	36014	25 %	25 %	0 %	50 %	452202183
110	NC_020381	ATGA	2	8	36231	36238	50 %	25 %	25 %	0 %	452202183
111	NC_020381	TTGT	2	8	37364	37371	0 %	75 %	25 %	0 %	452202183
112	NC_020381	TCCA	2	8	38348	38355	25 %	25 %	0 %	50 %	452202184
113	NC_020381	TTGC	2	8	38773	38780	0 %	50 %	25 %	25 %	452202185
114	NC_020381	ATTG	2	8	39319	39326	25 %	50 %	25 %	0 %	452202186
115	NC_020381	TTTA	2	8	39334	39341	25 %	75 %	0 %	0 %	452202186

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.