MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-39

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020381	ATG	2	6	5	10	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020381	AAG	2	6	11	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020381	GTA	2	6	51	56	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020381	AGA	3	9	188	196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020381	GAT	2	6	219	224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020381	CAT	3	9	277	285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020381	GAA	2	6	523	528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020381	CTT	2	6	547	552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020381	TCA	2	6	741	746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020381	ATC	2	6	761	766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020381	ATG	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020381	ATA	2	6	851	856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020381	TCA	3	9	876	884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020381	TCG	2	6	1009	1014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020381	TAA	2	6	1034	1039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020381	GTT	2	6	1117	1122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020381	CTT	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020381	TAA	2	6	1231	1236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020381	TCT	2	6	1246	1251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020381	TCA	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020381	GTA	2	6	1675	1680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020381	TTG	2	6	1703	1708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020381	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020381	TAT	2	6	1807	1812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020381	TTG	2	6	1826	1831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020381	TAA	2	6	1844	1849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020381	AGA	2	6	1865	1870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020381	TTC	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020381	TCC	2	6	3101	3106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_020381	ACA	2	6	3201	3206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020381	ATT	2	6	5615	5620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020381	TTA	2	6	5625	5630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020381	AGT	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020381	TAT	2	6	5775	5780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020381	TCC	2	6	6774	6779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_020381	CTA	2	6	7124	7129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020381	ATT	2	6	7828	7833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020381	GAA	2	6	7857	7862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020381	ATT	2	6	7896	7901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020381	AGA	2	6	7952	7957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020381	GGT	2	6	7995	8000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020381	GCC	2	6	8521	8526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_020381	TAC	2	6	8527	8532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020381	GGA	2	6	8669	8674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020381	TAG	2	6	11266	11271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020381	GAG	2	6	11561	11566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020381	ACC	2	6	11598	11603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_020381	CTC	2	6	11701	11706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_020381	AGG	2	6	12180	12185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020381	ATA	2	6	12648	12653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020381	TAT	2	6	12670	12675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020381	GAA	2	6	12694	12699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020381	GAT	2	6	12744	12749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020381	TAT	2	6	12771	12776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020381	TTA	2	6	12936	12941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020381	GGA	2	6	12956	12961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020381	AGG	2	6	13000	13005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020381	GTA	2	6	13731	13736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020381	GAG	2	6	13775	13780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020381	GGC	2	6	15174	15179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020381	GAT	2	6	15217	15222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020381	CAA	2	6	16995	17000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020381	CTC	2	6	17032	17037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_020381	CAT	2	6	18387	18392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020381	TTG	2	6	18445	18450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020381	ATA	2	6	18520	18525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020381	CCT	2	6	18745	18750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_020381	TTA	2	6	18764	18769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020381	CCT	2	6	20528	20533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_020381	ACC	2	6	20633	20638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_020381	TAA	2	6	20682	20687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020381	TGA	2	6	20712	20717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020381	TTC	2	6	20728	20733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020381	GTA	2	6	20748	20753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020381	TTA	2	6	20758	20763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020381	AGG	2	6	20770	20775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020381	ACA	2	6	20776	20781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020381	CTG	2	6	22237	22242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020381	TCC	2	6	23488	23493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_020381	CCG	2	6	32665	32670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_020381	TTC	2	6	39730	39735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.