MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-39

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020381	AC	3	6	2722	2727	50 %	0 %	0 %	50 %	452202138
2	NC_020381	AT	3	6	3272	3277	50 %	50 %	0 %	0 %	452202139
3	NC_020381	AT	3	6	3376	3381	50 %	50 %	0 %	0 %	452202139
4	NC_020381	CT	3	6	3394	3399	0 %	50 %	0 %	50 %	452202139
5	NC_020381	TA	3	6	3502	3507	50 %	50 %	0 %	0 %	452202140
6	NC_020381	TA	3	6	4699	4704	50 %	50 %	0 %	0 %	452202142
7	NC_020381	TA	3	6	5058	5063	50 %	50 %	0 %	0 %	452202142
8	NC_020381	TC	3	6	5337	5342	0 %	50 %	0 %	50 %	452202142
9	NC_020381	TC	3	6	6700	6705	0 %	50 %	0 %	50 %	452202145
10	NC_020381	AC	3	6	7211	7216	50 %	0 %	0 %	50 %	452202147
11	NC_020381	AG	3	6	7338	7343	50 %	0 %	50 %	0 %	452202147
12	NC_020381	GA	3	6	9420	9425	50 %	0 %	50 %	0 %	452202151
13	NC_020381	AT	3	6	9935	9940	50 %	50 %	0 %	0 %	452202152
14	NC_020381	AC	3	6	10535	10540	50 %	0 %	0 %	50 %	452202152
15	NC_020381	TA	3	6	11066	11071	50 %	50 %	0 %	0 %	452202153
16	NC_020381	GA	3	6	11151	11156	50 %	0 %	50 %	0 %	452202153
17	NC_020381	AT	3	6	15541	15546	50 %	50 %	0 %	0 %	452202162
18	NC_020381	TA	3	6	16004	16009	50 %	50 %	0 %	0 %	452202163
19	NC_020381	TA	3	6	16397	16402	50 %	50 %	0 %	0 %	452202163
20	NC_020381	AG	3	6	16692	16697	50 %	0 %	50 %	0 %	452202163
21	NC_020381	TA	3	6	17071	17076	50 %	50 %	0 %	0 %	452202164
22	NC_020381	TA	3	6	18918	18923	50 %	50 %	0 %	0 %	452202168
23	NC_020381	AT	3	6	22822	22827	50 %	50 %	0 %	0 %	452202172
24	NC_020381	TA	3	6	23244	23249	50 %	50 %	0 %	0 %	452202172
25	NC_020381	TA	3	6	23557	23562	50 %	50 %	0 %	0 %	452202173
26	NC_020381	TA	3	6	23850	23855	50 %	50 %	0 %	0 %	452202173
27	NC_020381	AT	3	6	25383	25388	50 %	50 %	0 %	0 %	452202174
28	NC_020381	TC	3	6	25685	25690	0 %	50 %	0 %	50 %	452202174
29	NC_020381	CT	3	6	26028	26033	0 %	50 %	0 %	50 %	452202175
30	NC_020381	TC	3	6	26142	26147	0 %	50 %	0 %	50 %	452202175
31	NC_020381	TG	3	6	27142	27147	0 %	50 %	50 %	0 %	452202175
32	NC_020381	AT	3	6	27219	27224	50 %	50 %	0 %	0 %	452202175
33	NC_020381	AT	3	6	27624	27629	50 %	50 %	0 %	0 %	452202175
34	NC_020381	CT	3	6	27953	27958	0 %	50 %	0 %	50 %	452202175
35	NC_020381	TA	3	6	29139	29144	50 %	50 %	0 %	0 %	452202176
36	NC_020381	AT	3	6	30173	30178	50 %	50 %	0 %	0 %	452202176
37	NC_020381	TG	3	6	30719	30724	0 %	50 %	50 %	0 %	452202177
38	NC_020381	GA	3	6	32495	32500	50 %	0 %	50 %	0 %	452202180
39	NC_020381	TA	3	6	33949	33954	50 %	50 %	0 %	0 %	452202181
40	NC_020381	TC	3	6	34295	34300	0 %	50 %	0 %	50 %	452202181
41	NC_020381	TA	3	6	34662	34667	50 %	50 %	0 %	0 %	452202182
42	NC_020381	TC	3	6	34776	34781	0 %	50 %	0 %	50 %	452202182
43	NC_020381	TA	3	6	35665	35670	50 %	50 %	0 %	0 %	452202183
44	NC_020381	AT	3	6	39188	39193	50 %	50 %	0 %	0 %	452202186
45	NC_020381	CA	3	6	39203	39208	50 %	0 %	0 %	50 %	452202186

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.