MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-16

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020380	ATG	2	6	236	241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202119
2	NC_020380	TTA	2	6	324	329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202119
3	NC_020380	GAA	2	6	428	433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202119
4	NC_020380	AAC	2	6	438	443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202119
5	NC_020380	TTA	2	6	521	526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202119
6	NC_020380	CGA	2	6	546	551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202119
7	NC_020380	ATG	3	9	675	683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202119
8	NC_020380	TAT	2	6	704	709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202119
9	NC_020380	CAT	2	6	779	784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202119
10	NC_020380	TGA	2	6	793	798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202119
11	NC_020380	ATG	2	6	813	818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202119
12	NC_020380	AGA	2	6	1006	1011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202119
13	NC_020380	CTT	2	6	1031	1036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202119
14	NC_020380	ATG	3	9	1275	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202119
15	NC_020380	ATC	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202119
16	NC_020380	CTT	3	9	1362	1370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202119
17	NC_020380	TAC	2	6	1504	1509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202119
18	NC_020380	CTT	2	6	1544	1549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202119
19	NC_020380	CAT	2	6	1550	1555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202119
20	NC_020380	GAA	2	6	1574	1579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202119
21	NC_020380	TTG	2	6	1631	1636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202119
22	NC_020380	CTC	2	6	1650	1655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202119
23	NC_020380	TGG	2	6	1696	1701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202119
24	NC_020380	AGA	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202119
25	NC_020380	TAA	2	6	1755	1760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202119
26	NC_020380	TAA	2	6	1933	1938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202119
27	NC_020380	ATT	2	6	2084	2089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202119
28	NC_020380	AGA	2	6	2134	2139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202119
29	NC_020380	AGA	2	6	2164	2169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202119
30	NC_020380	GTA	2	6	2371	2376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020380	TGT	2	6	2404	2409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020380	TGT	2	6	2475	2480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020380	ATT	2	6	2512	2517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020380	ATT	2	6	2545	2550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020380	TAT	2	6	2562	2567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020380	ATA	2	6	2568	2573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020380	ATA	2	6	2582	2587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020380	TAT	2	6	2591	2596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020380	CAC	3	9	2736	2744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202120
40	NC_020380	ATT	2	6	2846	2851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202120
41	NC_020380	ATT	2	6	2925	2930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020380	CCA	2	6	2968	2973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202121
43	NC_020380	TAT	2	6	2994	2999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202121
44	NC_020380	CAG	2	6	3008	3013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202121
45	NC_020380	GTT	2	6	3091	3096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202121
46	NC_020380	CCT	2	6	3112	3117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202122
47	NC_020380	TAT	2	6	3271	3276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202122
48	NC_020380	TTC	2	6	3304	3309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202122
49	NC_020380	TTC	2	6	3346	3351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202122
50	NC_020380	TTA	2	6	3410	3415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202122
51	NC_020380	ATT	2	6	3460	3465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202122
52	NC_020380	TTC	2	6	3616	3621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202122
53	NC_020380	TTA	2	6	3668	3673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202122
54	NC_020380	TAA	2	6	3791	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202122
55	NC_020380	ATA	2	6	3916	3921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202122
56	NC_020380	TCT	3	9	4055	4063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202122
57	NC_020380	TAT	2	6	4221	4226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202122
58	NC_020380	TTA	2	6	4264	4269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020380	ACA	2	6	4467	4472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020380	ACA	2	6	4508	4513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020380	ATT	2	6	4549	4554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020380	AAT	2	6	4575	4580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020380	ATA	2	6	4590	4595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020380	GAA	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202123
65	NC_020380	TAT	2	6	4805	4810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202123
66	NC_020380	GTT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202123
67	NC_020380	TGA	2	6	5070	5075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202123
68	NC_020380	TGA	2	6	5125	5130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202123
69	NC_020380	GGA	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202123
70	NC_020380	ATT	2	6	5177	5182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202123
71	NC_020380	TTC	2	6	5185	5190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202123
72	NC_020380	GGA	2	6	5563	5568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020380	ATA	2	6	5769	5774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020380	CTT	2	6	6039	6044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020380	TAC	2	6	6082	6087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020380	AGT	2	6	6159	6164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020380	ATA	2	6	6165	6170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020380	TAA	2	6	6222	6227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020380	GGA	2	6	6244	6249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020380	ATA	2	6	6271	6276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020380	GGT	2	6	6277	6282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020380	AGA	2	6	6329	6334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020380	TAG	2	6	6378	6383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020380	AAT	2	6	6601	6606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202124
85	NC_020380	TTA	2	6	6646	6651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202124
86	NC_020380	AAG	2	6	6783	6788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202125
87	NC_020380	GTA	2	6	6897	6902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202125
88	NC_020380	GAA	2	6	6933	6938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202125
89	NC_020380	GAA	2	6	7067	7072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202126
90	NC_020380	GCA	2	6	7103	7108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202126
91	NC_020380	ATT	2	6	7142	7147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202126
92	NC_020380	ATT	2	6	7302	7307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202126
93	NC_020380	ATA	2	6	7362	7367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202126
94	NC_020380	ACA	2	6	7546	7551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202126
95	NC_020380	GGT	2	6	7625	7630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202126
96	NC_020380	TGG	2	6	7677	7682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202126
97	NC_020380	GAA	2	6	7793	7798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202126
98	NC_020380	GAA	2	6	7937	7942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202126
99	NC_020380	TCT	2	6	7955	7960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202126
100	NC_020380	GTT	2	6	8152	8157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202126
101	NC_020380	TGA	3	9	8158	8166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202126
102	NC_020380	TGA	2	6	8215	8220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202126
103	NC_020380	GAA	2	6	8330	8335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202126
104	NC_020380	AGA	2	6	8368	8373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202126
105	NC_020380	GTT	2	6	8384	8389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202126
106	NC_020380	GAT	2	6	8440	8445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202126
107	NC_020380	AGT	2	6	8471	8476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202126
108	NC_020380	TGA	2	6	8518	8523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202126
109	NC_020380	GCA	2	6	8542	8547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202126
110	NC_020380	TAA	2	6	8563	8568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202126
111	NC_020380	AGA	2	6	8710	8715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202126
112	NC_020380	ATT	2	6	8975	8980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202127
113	NC_020380	CGG	2	6	9036	9041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202127
114	NC_020380	TTA	2	6	9042	9047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202127
115	NC_020380	TGG	2	6	9049	9054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202127
116	NC_020380	CGA	2	6	9123	9128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202127
117	NC_020380	GAT	2	6	9161	9166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202127
118	NC_020380	GTA	2	6	9243	9248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020380	ATT	2	6	9271	9276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202128
120	NC_020380	AAG	2	6	9658	9663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020380	ATT	2	6	9823	9828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202129
122	NC_020380	ATC	2	6	9898	9903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202129
123	NC_020380	GCT	2	6	9932	9937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202129
124	NC_020380	GAA	2	6	10000	10005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202129
125	NC_020380	ATC	3	9	10015	10023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202129
126	NC_020380	TTC	2	6	10136	10141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202129
127	NC_020380	CAA	2	6	10171	10176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202129
128	NC_020380	TAA	2	6	10204	10209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202129
129	NC_020380	TTC	2	6	10439	10444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202129
130	NC_020380	TGA	2	6	10485	10490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202129
131	NC_020380	TTG	2	6	10539	10544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202129
132	NC_020380	CAG	2	6	10646	10651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202130
133	NC_020380	TTC	2	6	10707	10712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202130
134	NC_020380	CAG	2	6	10757	10762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202130
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.