MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-16

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020380	GTA	2	6	2371	2376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020380	TGT	2	6	2404	2409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020380	TGT	2	6	2475	2480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020380	ATT	2	6	2512	2517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020380	ATT	2	6	2545	2550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020380	TAT	2	6	2562	2567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020380	ATA	2	6	2568	2573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020380	ATA	2	6	2582	2587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020380	TAT	2	6	2591	2596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020380	ATT	2	6	2925	2930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020380	TTA	2	6	4264	4269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020380	ACA	2	6	4467	4472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020380	ACA	2	6	4508	4513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020380	ATT	2	6	4549	4554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020380	AAT	2	6	4575	4580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020380	ATA	2	6	4590	4595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020380	GGA	2	6	5563	5568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020380	ATA	2	6	5769	5774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020380	CTT	2	6	6039	6044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020380	TAC	2	6	6082	6087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020380	AGT	2	6	6159	6164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020380	ATA	2	6	6165	6170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020380	TAA	2	6	6222	6227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020380	GGA	2	6	6244	6249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020380	ATA	2	6	6271	6276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020380	GGT	2	6	6277	6282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020380	AGA	2	6	6329	6334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020380	TAG	2	6	6378	6383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020380	GTA	2	6	9243	9248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020380	AAG	2	6	9658	9663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020380	TTA	2	6	11615	11620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020380	ATG	2	6	11698	11703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020380	GAA	2	6	11778	11783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020380	GTT	2	6	11933	11938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020380	TAA	2	6	12031	12036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020380	CTT	2	6	12058	12063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020380	AGA	2	6	12078	12083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020380	ATG	2	6	12191	12196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020380	TCA	2	6	12241	12246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020380	GAA	2	6	12592	12597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020380	ATA	2	6	12844	12849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020380	TAA	2	6	12906	12911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020380	TTG	2	6	12936	12941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020380	ATT	2	6	12962	12967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020380	ATT	3	9	13073	13081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020380	ATC	2	6	13085	13090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020380	GTA	2	6	13229	13234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020380	AGA	2	6	13555	13560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020380	TAG	2	6	13870	13875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020380	ATT	2	6	14496	14501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020380	ACA	2	6	14542	14547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020380	TGT	2	6	14560	14565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020380	TAA	2	6	14577	14582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020380	GGA	2	6	14660	14665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020380	GAA	2	6	15809	15814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020380	TCT	2	6	15896	15901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020380	TTA	2	6	15917	15922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020380	CAA	2	6	15935	15940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020380	AAT	2	6	15953	15958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020380	TTC	2	6	16011	16016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.