MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-16

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020380	TA	3	6	878	883	50 %	50 %	0 %	0 %	452202119
2	NC_020380	AC	3	6	1625	1630	50 %	0 %	0 %	50 %	452202119
3	NC_020380	GT	3	6	2100	2105	0 %	50 %	50 %	0 %	452202119
4	NC_020380	TA	3	6	2115	2120	50 %	50 %	0 %	0 %	452202119
5	NC_020380	AT	4	8	3235	3242	50 %	50 %	0 %	0 %	452202122
6	NC_020380	TG	3	6	3644	3649	0 %	50 %	50 %	0 %	452202122
7	NC_020380	GA	3	6	3926	3931	50 %	0 %	50 %	0 %	452202122
8	NC_020380	GT	3	6	3945	3950	0 %	50 %	50 %	0 %	452202122
9	NC_020380	AT	3	6	4253	4258	50 %	50 %	0 %	0 %	452202122
10	NC_020380	AT	4	8	4276	4283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020380	GA	3	6	4994	4999	50 %	0 %	50 %	0 %	452202123
12	NC_020380	TA	5	10	5474	5483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020380	AT	3	6	5950	5955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020380	TA	4	8	6011	6018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020380	GA	3	6	6137	6142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020380	AG	3	6	6171	6176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020380	AG	3	6	6363	6368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020380	AG	5	10	6497	6506	50 %	0 %	50 %	0 %	452202124
19	NC_020380	TG	3	6	6560	6565	0 %	50 %	50 %	0 %	452202124
20	NC_020380	AG	3	6	7033	7038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020380	AT	3	6	7428	7433	50 %	50 %	0 %	0 %	452202126
22	NC_020380	GA	3	6	7491	7496	50 %	0 %	50 %	0 %	452202126
23	NC_020380	AT	4	8	8981	8988	50 %	50 %	0 %	0 %	452202127
24	NC_020380	TA	4	8	9000	9007	50 %	50 %	0 %	0 %	452202127
25	NC_020380	TG	3	6	9257	9262	0 %	50 %	50 %	0 %	452202128
26	NC_020380	GT	3	6	9741	9746	0 %	50 %	50 %	0 %	452202129
27	NC_020380	CG	3	6	10210	10215	0 %	0 %	50 %	50 %	452202129
28	NC_020380	TG	3	6	10265	10270	0 %	50 %	50 %	0 %	452202129
29	NC_020380	AC	3	6	10365	10370	50 %	0 %	0 %	50 %	452202129
30	NC_020380	TA	3	6	10495	10500	50 %	50 %	0 %	0 %	452202129
31	NC_020380	TC	3	6	10711	10716	0 %	50 %	0 %	50 %	452202130
32	NC_020380	TA	3	6	11683	11688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020380	AT	3	6	11946	11951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020380	TA	3	6	12135	12140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020380	TG	3	6	12290	12295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020380	TG	3	6	12803	12808	0 %	50 %	50 %	0 %	452202132
37	NC_020380	AT	3	6	12982	12987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020380	AT	3	6	13006	13011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020380	AT	4	8	13060	13067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020380	TA	3	6	13130	13135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020380	TA	3	6	14133	14138	50 %	50 %	0 %	0 %	452202135
42	NC_020380	TA	3	6	14409	14414	50 %	50 %	0 %	0 %	452202135
43	NC_020380	TG	3	6	14418	14423	0 %	50 %	50 %	0 %	452202135
44	NC_020380	AT	3	6	14489	14494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020380	GT	3	6	15039	15044	0 %	50 %	50 %	0 %	452202136

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.