MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-15

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020379	TCC	2	6	5282	5287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_020379	ACA	2	6	5382	5387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020379	TGT	2	6	5400	5405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020379	ATT	2	6	5406	5411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020379	AAT	2	6	5446	5451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020379	TAG	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020379	TAA	2	6	5686	5691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020379	ATG	2	6	5699	5704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020379	AGG	2	6	5714	5719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020379	CCT	2	6	6451	6456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_020379	TAT	2	6	7373	7378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020379	ATT	2	6	7381	7386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020379	AGG	2	6	7421	7426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020379	ATT	2	6	7558	7563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020379	TAA	2	6	7669	7674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020379	TGT	2	6	7698	7703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020379	TAC	2	6	8097	8102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020379	ATA	2	6	8117	8122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020379	CCG	2	6	8172	8177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_020379	CGC	2	6	8225	8230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_020379	GAT	2	6	8340	8345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020379	AAT	2	6	8427	8432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020379	TTC	2	6	8730	8735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020379	GAC	2	6	8981	8986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020379	ACT	2	6	9007	9012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020379	TAA	2	6	9122	9127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020379	CGC	2	6	9165	9170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_020379	ATC	2	6	9253	9258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020379	ATT	2	6	9259	9264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020379	TAT	2	6	9509	9514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020379	TAA	2	6	9580	9585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020379	ATT	2	6	11036	11041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020379	TAT	2	6	11230	11235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020379	CTA	2	6	11245	11250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020379	TTG	2	6	11281	11286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020379	TGT	2	6	11447	11452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020379	AGT	2	6	11491	11496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020379	ATT	2	6	11681	11686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020379	CCT	2	6	11698	11703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_020379	TAA	2	6	11726	11731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020379	TGT	2	6	12056	12061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020379	AAT	2	6	12299	12304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020379	CTA	2	6	12399	12404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020379	ATA	2	6	12416	12421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020379	TTA	2	6	12423	12428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020379	TAA	2	6	12450	12455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020379	TAT	2	6	12486	12491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020379	TCT	2	6	12573	12578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020379	TCC	2	6	14046	14051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_020379	TAA	2	6	14059	14064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020379	CTT	2	6	14784	14789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020379	TTG	2	6	14797	14802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020379	AAC	2	6	14816	14821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020379	CTT	2	6	15058	15063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020379	AGA	2	6	15068	15073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.