MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-15

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020379	TAA	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202827
2	NC_020379	TAT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202827
3	NC_020379	CGA	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202827
4	NC_020379	GGT	2	6	241	246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202827
5	NC_020379	AAT	2	6	334	339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202827
6	NC_020379	AGA	2	6	420	425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202827
7	NC_020379	CTA	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202827
8	NC_020379	AAG	2	6	614	619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202827
9	NC_020379	TCA	2	6	891	896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202827
10	NC_020379	TTC	2	6	966	971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202827
11	NC_020379	GAT	2	6	1044	1049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202827
12	NC_020379	CCT	2	6	1131	1136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202827
13	NC_020379	AGA	2	6	1139	1144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202827
14	NC_020379	GAA	2	6	1170	1175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202827
15	NC_020379	TCT	2	6	1572	1577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202828
16	NC_020379	TTC	2	6	1601	1606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202828
17	NC_020379	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202828
18	NC_020379	TTA	2	6	1803	1808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202828
19	NC_020379	TTA	2	6	1981	1986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202828
20	NC_020379	TTC	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202828
21	NC_020379	CCA	2	6	2040	2045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202828
22	NC_020379	GAG	2	6	2086	2091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202828
23	NC_020379	CAA	2	6	2105	2110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202828
24	NC_020379	TTC	2	6	2162	2167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202828
25	NC_020379	ATG	2	6	2186	2191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202828
26	NC_020379	AAG	2	6	2192	2197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202828
27	NC_020379	GTA	2	6	2232	2237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202828
28	NC_020379	AGA	3	9	2369	2377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202828
29	NC_020379	GAT	2	6	2400	2405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202828
30	NC_020379	CAT	3	9	2458	2466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202828
31	NC_020379	GAA	2	6	2704	2709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202828
32	NC_020379	CTT	2	6	2728	2733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202828
33	NC_020379	TCA	2	6	2922	2927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202828
34	NC_020379	ATC	2	6	2942	2947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202828
35	NC_020379	ATG	2	6	2957	2962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202828
36	NC_020379	ATA	2	6	3032	3037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202828
37	NC_020379	TCA	3	9	3057	3065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202828
38	NC_020379	TCG	2	6	3190	3195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202828
39	NC_020379	TAA	2	6	3215	3220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202828
40	NC_020379	GTT	2	6	3298	3303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202828
41	NC_020379	CTT	2	6	3307	3312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202828
42	NC_020379	TAA	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202828
43	NC_020379	TCT	2	6	3427	3432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202828
44	NC_020379	TCA	2	6	3499	3504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202828
45	NC_020379	GTA	2	6	3856	3861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202828
46	NC_020379	TTG	2	6	3884	3889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202828
47	NC_020379	GAA	2	6	3931	3936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202828
48	NC_020379	TAT	2	6	3988	3993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202828
49	NC_020379	TTG	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202828
50	NC_020379	TAA	2	6	4025	4030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202828
51	NC_020379	AGA	2	6	4046	4051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202828
52	NC_020379	TTC	2	6	4133	4138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202828
53	NC_020379	AGT	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202829
54	NC_020379	AGA	2	6	4555	4560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202829
55	NC_020379	TAA	2	6	4582	4587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202829
56	NC_020379	GAC	2	6	4616	4621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202829
57	NC_020379	TAA	2	6	4651	4656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202829
58	NC_020379	GTT	2	6	4753	4758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202829
59	NC_020379	CCT	2	6	4761	4766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202829
60	NC_020379	AAT	2	6	4778	4783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202829
61	NC_020379	TTA	2	6	4890	4895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202829
62	NC_020379	CAA	2	6	4936	4941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202829
63	NC_020379	TTG	2	6	5006	5011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202829
64	NC_020379	CTA	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202829
65	NC_020379	AAT	2	6	5838	5843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202830
66	NC_020379	CAA	2	6	5847	5852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202830
67	NC_020379	AAG	2	6	5929	5934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202830
68	NC_020379	ATC	2	6	5954	5959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202830
69	NC_020379	CAA	2	6	6114	6119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202830
70	NC_020379	CAA	3	9	6210	6218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202830
71	NC_020379	ATC	2	6	6219	6224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202830
72	NC_020379	CAA	2	6	6231	6236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202830
73	NC_020379	CAA	2	6	6384	6389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202830
74	NC_020379	TTC	2	6	6411	6416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202830
75	NC_020379	TTC	2	6	6423	6428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202830
76	NC_020379	CTC	2	6	6582	6587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202831
77	NC_020379	TCA	2	6	6598	6603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202831
78	NC_020379	ATC	2	6	6627	6632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202831
79	NC_020379	TCA	2	6	6649	6654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202831
80	NC_020379	AAG	2	6	6738	6743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202831
81	NC_020379	GTT	2	6	7016	7021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202831
82	NC_020379	CTT	2	6	7088	7093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202831
83	NC_020379	CTA	2	6	7102	7107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202831
84	NC_020379	TTA	2	6	7135	7140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202831
85	NC_020379	GCT	2	6	7162	7167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202831
86	NC_020379	CCG	2	6	7175	7180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202831
87	NC_020379	CTG	2	6	7205	7210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202831
88	NC_020379	GTG	2	6	7228	7233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202831
89	NC_020379	ACA	2	6	7800	7805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202832
90	NC_020379	AAC	2	6	8536	8541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202833
91	NC_020379	ATT	2	6	8542	8547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202833
92	NC_020379	GGA	2	6	9844	9849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202834
93	NC_020379	TAA	2	6	9995	10000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202835
94	NC_020379	CGC	2	6	10088	10093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202835
95	NC_020379	CTT	2	6	10176	10181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202835
96	NC_020379	AAG	2	6	10390	10395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202835
97	NC_020379	CTT	2	6	10457	10462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202835
98	NC_020379	TTA	2	6	10513	10518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202835
99	NC_020379	TTA	2	6	10531	10536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202835
100	NC_020379	TTC	2	6	10617	10622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202835
101	NC_020379	TTC	2	6	10662	10667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202835
102	NC_020379	CTC	2	6	10947	10952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202835
103	NC_020379	CAT	2	6	10965	10970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202835
104	NC_020379	TAG	2	6	10993	10998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202835
105	NC_020379	CTT	2	6	11612	11617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202836
106	NC_020379	TGT	2	6	11909	11914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202837
107	NC_020379	CTT	2	6	11964	11969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202837
108	NC_020379	CTT	3	9	12677	12685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202838
109	NC_020379	TCT	2	6	12724	12729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202838
110	NC_020379	CTT	2	6	12791	12796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202838
111	NC_020379	ATT	2	6	12889	12894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202838
112	NC_020379	TGT	2	6	12960	12965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202838
113	NC_020379	ATA	2	6	13008	13013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202839
114	NC_020379	TCG	2	6	13024	13029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202839
115	NC_020379	CTT	2	6	13126	13131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202839
116	NC_020379	TCA	2	6	13347	13352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202840
117	NC_020379	TGG	2	6	13553	13558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202840
118	NC_020379	GTC	2	6	13571	13576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202840
119	NC_020379	TTA	2	6	13662	13667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202840
120	NC_020379	CTG	2	6	13711	13716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202840
121	NC_020379	TTC	2	6	13741	13746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202840
122	NC_020379	TAA	2	6	13757	13762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202840
123	NC_020379	TTA	2	6	13828	13833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202841
124	NC_020379	CCT	2	6	13901	13906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202841
125	NC_020379	TCT	2	6	13927	13932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202841
126	NC_020379	CTT	2	6	14210	14215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202842
127	NC_020379	TGG	2	6	14334	14339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202842
128	NC_020379	CCG	2	6	14587	14592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202842

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.