MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-8

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020377	AACA	2	8	137	144	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020377	ATAC	2	8	550	557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020377	TTCA	2	8	689	696	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020377	TTAT	2	8	726	733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020377	TAAA	2	8	765	772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020377	AGAA	2	8	1018	1025	75 %	0 %	25 %	0 %	452202003
7	NC_020377	TAAC	2	8	1146	1153	50 %	25 %	0 %	25 %	452202003
8	NC_020377	CAAA	2	8	1265	1272	75 %	0 %	0 %	25 %	452202004
9	NC_020377	TATT	2	8	1280	1287	25 %	75 %	0 %	0 %	452202004
10	NC_020377	TCTT	2	8	2173	2180	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020377	TACT	2	8	2220	2227	25 %	50 %	0 %	25 %	452202006
12	NC_020377	TTTC	2	8	2241	2248	0 %	75 %	0 %	25 %	452202006
13	NC_020377	AATT	2	8	2688	2695	50 %	50 %	0 %	0 %	452202008
14	NC_020377	TAAA	2	8	2712	2719	75 %	25 %	0 %	0 %	452202008
15	NC_020377	CTTT	2	8	3227	3234	0 %	75 %	0 %	25 %	452202008
16	NC_020377	CTCA	2	8	3423	3430	25 %	25 %	0 %	50 %	452202008
17	NC_020377	AAAG	2	8	3746	3753	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020377	CAAA	2	8	4080	4087	75 %	0 %	0 %	25 %	452202009
19	NC_020377	AATT	2	8	4180	4187	50 %	50 %	0 %	0 %	452202009
20	NC_020377	TCAT	2	8	4430	4437	25 %	50 %	0 %	25 %	452202009
21	NC_020377	CTTT	2	8	4560	4567	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020377	TAAA	2	8	4571	4578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020377	CAAG	2	8	4586	4593	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020377	CTAA	2	8	4703	4710	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020377	CAAA	3	12	4784	4795	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020377	CAAA	2	8	5448	5455	75 %	0 %	0 %	25 %	452202011
27	NC_020377	AAAC	2	8	5662	5669	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020377	TTCA	2	8	5888	5895	25 %	50 %	0 %	25 %	452202012
29	NC_020377	TTGT	2	8	6183	6190	0 %	75 %	25 %	0 %	452202013
30	NC_020377	CTTC	2	8	6374	6381	0 %	50 %	0 %	50 %	452202013
31	NC_020377	AATC	2	8	6557	6564	50 %	25 %	0 %	25 %	452202013
32	NC_020377	TTTC	2	8	6671	6678	0 %	75 %	0 %	25 %	452202013
33	NC_020377	TTTC	2	8	6788	6795	0 %	75 %	0 %	25 %	452202013
34	NC_020377	GAAC	2	8	7056	7063	50 %	0 %	25 %	25 %	452202013
35	NC_020377	AACA	2	8	7064	7071	75 %	0 %	0 %	25 %	452202013
36	NC_020377	CGTT	2	8	7185	7192	0 %	50 %	25 %	25 %	452202013
37	NC_020377	CTTT	2	8	7219	7226	0 %	75 %	0 %	25 %	452202013
38	NC_020377	TCCG	2	8	7620	7627	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020377	TGTA	2	8	7646	7653	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020377	ATTC	2	8	7973	7980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.