MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-8

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020377	ATT	2	6	294	299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202002
2	NC_020377	ATC	2	6	310	315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202002
3	NC_020377	GAC	2	6	392	397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202002
4	NC_020377	TAC	2	6	511	516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202002
5	NC_020377	ATT	2	6	875	880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202003
6	NC_020377	AAC	2	6	1046	1051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202003
7	NC_020377	ACT	2	6	1066	1071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202003
8	NC_020377	ACT	2	6	1137	1142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202003
9	NC_020377	TAA	2	6	1363	1368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202004
10	NC_020377	TAA	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202005
11	NC_020377	ATC	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202007
12	NC_020377	CAC	2	6	2322	2327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202007
13	NC_020377	TTC	2	6	2416	2421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202007
14	NC_020377	TCA	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202008
15	NC_020377	TAA	2	6	2596	2601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202008
16	NC_020377	CCA	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202008
17	NC_020377	TTC	2	6	2880	2885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202008
18	NC_020377	AAT	2	6	2915	2920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202008
19	NC_020377	ATA	2	6	3009	3014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202008
20	NC_020377	TAT	2	6	3029	3034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202008
21	NC_020377	TTC	2	6	3045	3050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202008
22	NC_020377	AAT	2	6	3133	3138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202008
23	NC_020377	TTA	2	6	3139	3144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202008
24	NC_020377	GTC	2	6	3202	3207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202008
25	NC_020377	CAT	2	6	3255	3260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202008
26	NC_020377	TAC	2	6	3392	3397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202008
27	NC_020377	AAC	2	6	3895	3900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202009
28	NC_020377	TCA	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202009
29	NC_020377	TCT	2	6	4137	4142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202009
30	NC_020377	CTT	2	6	4266	4271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202009
31	NC_020377	CTT	2	6	4347	4352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202009
32	NC_020377	CTT	2	6	4362	4367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202009
33	NC_020377	CAA	2	6	4377	4382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202009
34	NC_020377	AGG	2	6	4889	4894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202010
35	NC_020377	ACT	2	6	5002	5007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202010
36	NC_020377	GAA	2	6	5050	5055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202010
37	NC_020377	GGA	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202011
38	NC_020377	TTA	2	6	5324	5329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202011
39	NC_020377	CAA	2	6	5351	5356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202011
40	NC_020377	ATT	2	6	5407	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202011
41	NC_020377	AAG	2	6	5523	5528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202011
42	NC_020377	GTA	2	6	5549	5554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202011
43	NC_020377	GAA	2	6	5573	5578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202011
44	NC_020377	TCA	2	6	5603	5608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202011
45	NC_020377	ATT	2	6	5788	5793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202012
46	NC_020377	ATC	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202012
47	NC_020377	ATC	2	6	5948	5953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202012
48	NC_020377	ATT	2	6	6002	6007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202012
49	NC_020377	AAT	2	6	6061	6066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202012
50	NC_020377	CTT	2	6	6139	6144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202013
51	NC_020377	TGT	2	6	6166	6171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202013
52	NC_020377	TCA	3	9	6220	6228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202013
53	NC_020377	ATC	2	6	6295	6300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202013
54	NC_020377	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202013
55	NC_020377	AGA	2	6	6516	6521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202013
56	NC_020377	TCT	2	6	6550	6555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202013
57	NC_020377	GAC	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202013
58	NC_020377	TTG	2	6	6705	6710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202013
59	NC_020377	ACA	2	6	7102	7107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202013
60	NC_020377	ATT	2	6	7129	7134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202013
61	NC_020377	AAT	2	6	7197	7202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202013
62	NC_020377	ACA	2	6	7716	7721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202014
63	NC_020377	ACT	2	6	7816	7821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202014
64	NC_020377	ATT	2	6	7837	7842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202014

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.