MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056

Total Repeats: 352

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020376	CTATTA	2	12	1730	1741	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020376	ATTTTT	2	12	9160	9171	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020376	ATTTTT	2	12	28678	28689	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020376	TTTCGT	2	12	30308	30319	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_020376	TTTTCC	2	12	53998	54009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020376	CTTTTT	2	12	74027	74038	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020376	TTATAT	2	12	81695	81706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020376	ATTTTT	2	12	81958	81969	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020376	ATTTTT	2	12	90770	90781	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020376	TTTCGT	2	12	92398	92409	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020376	AGTCAA	2	12	95969	95980	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020376	ATTTTT	2	12	154154	154165	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020376	GTGATT	2	12	161129	161140	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020376	GTATGT	2	12	177287	177298	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020376	AAAATA	2	12	209935	209946	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020376	AAGGGG	2	12	210018	210029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020376	AAAAGT	2	12	211436	211447	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020376	AGAGGT	2	12	213399	213410	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020376	AAAAGA	2	12	225637	225648	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020376	ATTTTT	2	12	247140	247151	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020376	ATTTTT	2	12	270258	270269	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020376	ATTTTT	2	12	277667	277678	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020376	AGTATT	2	12	292937	292948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020376	ATTTTT	2	12	293259	293270	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020376	TTTCGT	2	12	294886	294897	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020376	ATTTTT	2	12	300601	300612	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020376	TTTCGT	2	12	302230	302241	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020376	TATAAA	2	12	339054	339065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020376	AAAAAT	2	12	355592	355603	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020376	ATTTGA	2	12	357430	357441	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020376	GTGTAA	2	12	370321	370332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020376	AATGAT	2	12	376871	376882	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020376	ATACTT	2	12	382687	382698	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020376	TAAAAA	2	12	435784	435795	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020376	AAAAAT	2	12	437151	437162	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020376	TATTTT	5	30	457939	457968	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020376	ATTTTT	2	12	461588	461599	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020376	CCAATT	2	12	467538	467549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020376	TTTTCT	2	12	483431	483442	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020376	GCATAA	2	12	496135	496146	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020376	AATGAA	2	12	496188	496199	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020376	ATTTTT	2	12	520668	520679	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020376	ATCATT	2	12	540310	540321	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_020376	TGTATA	2	12	592880	592891	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020376	ATTTAT	2	12	600711	600722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020376	ATGAAA	2	12	633147	633158	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020376	TATTAA	2	12	690613	690624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020376	AATTTG	2	12	691096	691107	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020376	GCTTCA	2	12	691131	691142	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020376	TTTAAT	2	12	691384	691395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020376	CTTTTT	2	12	706035	706046	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020376	TCTAAA	2	12	726905	726916	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020376	AGATTT	2	12	727944	727955	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020376	GAAATA	2	12	735456	735467	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020376	ATTTTT	2	12	737287	737298	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020376	ACTTAA	2	12	750690	750701	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_020376	CTTTTT	2	12	762397	762408	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020376	TTAAAA	2	12	772168	772179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020376	ATTTTT	2	12	779379	779390	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020376	ATCAAT	2	12	824156	824167	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_020376	GTATAT	2	12	830889	830900	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020376	TGTAGA	2	12	836974	836985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020376	ATGTAA	2	12	853466	853477	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020376	TTAAAG	2	12	868498	868509	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020376	AAATTC	2	12	879226	879237	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020376	AAATGT	2	12	898414	898425	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020376	ACGAGA	2	12	898463	898474	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_020376	GTTTTT	2	12	904040	904051	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020376	GTATAT	2	12	917241	917252	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020376	ATTACC	2	12	927491	927502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020376	TATGAA	2	12	940492	940503	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020376	AAAAAT	2	12	952073	952084	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020376	TGGGAG	2	12	955994	956005	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020376	TGATGG	2	12	959150	959161	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020376	GCATGT	2	12	970686	970697	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_020376	ATATAG	2	12	986164	986175	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020376	AAATGT	2	12	1002221	1002232	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020376	CATTAA	2	12	1010462	1010473	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_020376	TGTTTA	2	12	1010482	1010493	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020376	GCAATA	2	12	1014655	1014666	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_020376	AGCCAC	2	12	1014929	1014940	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020376	ATTAAA	2	12	1016374	1016385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020376	TACTTT	2	12	1025835	1025846	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_020376	TCTTTT	2	12	1054736	1054747	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020376	ATACAT	2	12	1067859	1067870	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_020376	AAAATA	2	12	1075777	1075788	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020376	AAAAAG	2	12	1115446	1115457	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020376	TAATAT	2	12	1116073	1116084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020376	TCCATT	2	12	1117367	1117378	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020376	AAATTC	2	12	1121911	1121922	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_020376	TACTTT	3	18	1134358	1134375	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_020376	GAAGTA	2	12	1152719	1152730	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020376	CTTTTT	2	12	1182071	1182082	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_020376	GAAATA	2	12	1200941	1200952	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020376	AAGTAT	2	12	1230068	1230079	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020376	GAAGGG	2	12	1239338	1239349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020376	ATTTGA	2	12	1275695	1275706	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020376	AGAAAT	2	12	1276591	1276602	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020376	TTACGT	2	12	1276816	1276827	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_020376	GGAGAG	2	12	1278927	1278938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020376	AAATAA	2	12	1281274	1281285	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020376	AAAGAA	2	12	1282079	1282090	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020376	GAAAAA	2	12	1310917	1310928	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020376	ATTTTT	2	12	1335516	1335527	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020376	AGGATA	2	12	1337240	1337251	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020376	AAAAGT	2	12	1349331	1349342	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020376	AATAAA	2	12	1358263	1358274	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020376	CTTTTT	2	12	1380417	1380428	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_020376	TCTTTT	2	12	1380847	1380858	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_020376	ATACAA	2	12	1406487	1406498	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_020376	GTATAT	2	12	1433326	1433337	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020376	TTATCA	2	12	1442501	1442512	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_020376	TTTTAT	2	12	1485645	1485656	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020376	AGGTAG	2	12	1537087	1537098	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020376	ATAAGT	2	12	1590444	1590455	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020376	AATGAT	2	12	1649397	1649408	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020376	TTAAAA	2	12	1650852	1650863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020376	TATAAC	2	12	1650914	1650925	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_020376	TAAAGG	2	12	1673002	1673013	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020376	TTTATT	2	12	1675834	1675845	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020376	AATAGA	2	12	1686547	1686558	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020376	AGAGAT	2	12	1695902	1695913	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020376	TCCTTT	2	12	1718033	1718044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020376	TTTTAT	2	12	1743766	1743777	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020376	TTTTTA	2	12	1759249	1759260	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020376	TTCTTT	2	12	1775830	1775841	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_020376	TATGGA	2	12	1810147	1810158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020376	GAAAAA	2	12	1822328	1822339	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020376	AAAATC	2	12	1827191	1827202	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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254	NC_020376	AGGGAT	2	12	3645529	3645540	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
255	NC_020376	TTTTAA	2	12	3696027	3696038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_020376	TTTATG	2	12	3696419	3696430	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_020376	TAAAAA	2	12	3710930	3710941	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_020376	TACTTT	2	12	3751992	3752003	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.