MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056

Total Repeats: 2188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020376	TCTTTG	2	12	3537	3548	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	452196385
2	NC_020376	AACAAA	2	12	4471	4482	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	452196386
3	NC_020376	TGGCGG	2	12	4793	4804	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	452196386
4	NC_020376	AAGTTG	2	12	5236	5247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196386
5	NC_020376	CAAGCG	2	12	7738	7749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452196387
6	NC_020376	TGAAGA	2	12	7965	7976	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452196387
7	NC_020376	TGGTGT	2	12	16069	16080	0 %	50 %	50 %	0 %	452196389
8	NC_020376	GGCAAT	2	12	17073	17084	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452196390
9	NC_020376	ACTGGA	2	12	17405	17416	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452196390
10	NC_020376	AAAGAT	2	12	17683	17694	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452196390
11	NC_020376	CAGGAA	2	12	18631	18642	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	452196391
12	NC_020376	ACAGGA	2	12	20613	20624	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	452196393
13	NC_020376	CAAGAT	2	12	24201	24212	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452196398
14	NC_020376	CGTATA	2	12	35342	35353	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452196405
15	NC_020376	AGCTTT	2	12	36846	36857	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452196407
16	NC_020376	AAATGA	2	12	37433	37444	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452196408
17	NC_020376	TGTAGA	2	12	37538	37549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196408
18	NC_020376	TTGAAA	2	12	39663	39674	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452196412
19	NC_020376	GCACGT	2	12	51995	52006	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452196425
20	NC_020376	AAGCAA	2	12	54471	54482	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	452196429
21	NC_020376	ATTAAC	2	12	56387	56398	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452196429
22	NC_020376	TGCATA	2	12	56861	56872	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452196429
23	NC_020376	TTTAGG	2	12	60134	60145	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	452196432
24	NC_020376	TATTGA	2	12	65989	66000	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452196438
25	NC_020376	CAGGTA	2	12	69755	69766	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452196441
26	NC_020376	TGTCGG	2	12	69849	69860	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	452196441
27	NC_020376	AGCGTT	2	12	72106	72117	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452196443
28	NC_020376	AAAGTA	2	12	72755	72766	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452196443
29	NC_020376	CTGGTG	2	12	73613	73624	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	452196444
30	NC_020376	GCAGAA	2	12	74683	74694	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	452196445
31	NC_020376	AAGGTG	2	12	77227	77238	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	452196448
32	NC_020376	CGGTTA	2	12	79366	79377	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452196452
33	NC_020376	ATATCA	2	12	80106	80117	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452196453
34	NC_020376	TAGAAA	2	12	89364	89375	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452196455
35	NC_020376	GTGAAG	2	12	98609	98620	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	452196459
36	NC_020376	TTTAAT	2	12	103701	103712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196462
37	NC_020376	GCAGAA	2	12	103888	103899	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	452196462
38	NC_020376	CAGATG	2	12	105437	105448	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452196464
39	NC_020376	CAAGAT	2	12	106968	106979	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452196465
40	NC_020376	GTAGAA	2	12	112978	112989	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452196473
41	NC_020376	TCTGGT	2	12	113808	113819	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	452196474
42	NC_020376	GAAGCT	2	12	114407	114418	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452196475
43	NC_020376	CTGTAG	2	12	115751	115762	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452196477
44	NC_020376	ATGCGA	2	12	123841	123852	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452196480
45	NC_020376	GCAAGA	2	12	125920	125931	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	452196484
46	NC_020376	AGTAGA	2	12	126025	126036	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452196484
47	NC_020376	AGCGTG	2	12	126798	126809	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	452196484
48	NC_020376	AAGTTG	2	12	127572	127583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196484
49	NC_020376	GCTAAA	2	12	127958	127969	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452196485
50	NC_020376	GAAACT	2	12	128165	128176	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452196485
51	NC_020376	CAAGCT	2	12	128759	128770	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	452196485
52	NC_020376	AACTGA	2	12	130005	130016	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452196488
53	NC_020376	TAAAGG	2	12	130227	130238	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452196488
54	NC_020376	GAAATC	2	12	131431	131442	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452196490
55	NC_020376	ACAAGC	2	12	133780	133791	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	452196495
56	NC_020376	TTGAAG	2	12	136959	136970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196503
57	NC_020376	AAAGGT	2	12	137069	137080	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452196503
58	NC_020376	TAGTTG	2	12	137658	137669	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	452196505
59	NC_020376	CTGAAA	2	12	140199	140210	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452196509
60	NC_020376	TAAACA	2	12	141886	141897	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452196512
61	NC_020376	TTAGGT	2	12	143807	143818	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	452196515
62	NC_020376	ATTTTT	2	12	146159	146170	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452196519
63	NC_020376	ATATCC	2	12	147226	147237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452196520
64	NC_020376	TGCAGT	2	12	150263	150274	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452196525
65	NC_020376	TTAGAT	2	12	161970	161981	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452196531
66	NC_020376	AGCAAA	2	12	163514	163525	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	452196533
67	NC_020376	AAGAAA	2	12	164617	164628	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452196533
68	NC_020376	AAGATA	2	12	164659	164670	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452196533
69	NC_020376	GATGGC	2	12	165457	165468	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	452196534
70	NC_020376	CGCATC	2	12	166824	166835	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	452196535
71	NC_020376	ATCGTA	2	12	167204	167215	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452196535
72	NC_020376	AGATAA	2	12	170140	170151	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452196536
73	NC_020376	TGAAAC	2	12	172987	172998	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452196539
74	NC_020376	CAAAAT	2	12	180062	180073	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452196547
75	NC_020376	ATTTTG	2	12	186517	186528	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	452196554
76	NC_020376	AAGTAA	2	12	189256	189267	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452196557
77	NC_020376	CAAATT	2	12	189758	189769	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452196557
78	NC_020376	GAAAAA	2	12	190815	190826	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452196558
79	NC_020376	GTGGTT	2	12	192902	192913	0 %	50 %	50 %	0 %	452196561
80	NC_020376	AAGTTA	2	12	196613	196624	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452196563
81	NC_020376	TCTGGA	2	12	196625	196636	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452196563
82	NC_020376	TTCTTT	2	12	201592	201603	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452196569
83	NC_020376	ATTTAT	2	12	204775	204786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196572
84	NC_020376	TATGAA	2	12	209714	209725	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452196578
85	NC_020376	CTAATA	2	12	212854	212865	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	452196581
86	NC_020376	TATATT	2	12	213452	213463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196582
87	NC_020376	TTCATA	2	12	215005	215016	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452196584
88	NC_020376	GGAACA	2	12	216024	216035	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	452196585
89	NC_020376	GAAAGA	2	12	222461	222472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196590
90	NC_020376	TAAATG	2	12	223138	223149	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452196590
91	NC_020376	GAGAAT	2	12	223522	223533	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452196591
92	NC_020376	TTATTT	2	12	230442	230453	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452196598
93	NC_020376	CCATAT	2	12	232148	232159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452196600
94	NC_020376	AAGGTC	2	12	237248	237259	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452196603
95	NC_020376	TAAAGA	2	12	237891	237902	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452196604
96	NC_020376	AAAACA	2	12	239924	239935	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	452196607
97	NC_020376	GTAAGT	2	12	240329	240340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196607
98	NC_020376	AGCTGA	2	12	253404	253415	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452196615
99	NC_020376	AGCGGT	2	12	253954	253965	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	452196617
100	NC_020376	GTAATC	2	12	255747	255758	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452196618
101	NC_020376	GGATAT	2	12	257709	257720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196619
102	NC_020376	GGCATG	2	12	261436	261447	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	452196623
103	NC_020376	TTGCGA	2	12	269888	269899	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452196630
104	NC_020376	TTAAAA	2	12	284629	284640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452196635
105	NC_020376	TTATAT	2	12	289728	289739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196640
106	NC_020376	AAACAA	2	12	289894	289905	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	452196640
107	NC_020376	CATTTT	2	12	290966	290977	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452196642
108	NC_020376	TTTGCA	2	12	291016	291027	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452196642
109	NC_020376	GTAATC	2	12	291850	291861	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452196642
110	NC_020376	TTTATT	2	12	305649	305660	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452196645
111	NC_020376	TGTACG	2	12	312412	312423	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452196652
112	NC_020376	TTATGA	2	12	314649	314660	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452196653
113	NC_020376	ATCTTT	2	12	321781	321792	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452196660
114	NC_020376	GCAGGT	2	12	324481	324492	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	452196664
115	NC_020376	CAGAAG	2	12	324635	324646	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	452196664
116	NC_020376	GACAAC	2	12	326406	326417	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	452196664
117	NC_020376	AGGTGA	2	12	326547	326558	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	452196664
118	NC_020376	CAAATC	2	12	327406	327417	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	452196665
119	NC_020376	TTTATT	2	12	330681	330692	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452196667
120	NC_020376	TTAAAA	2	12	331346	331357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452196668
121	NC_020376	TTGCAA	2	12	332202	332213	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452196668
122	NC_020376	AAAGAT	2	12	336144	336155	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452196672
123	NC_020376	ACTTTT	2	12	337131	337142	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452196673
124	NC_020376	TTGCTG	2	12	338282	338293	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	452196674
125	NC_020376	TGAGCA	2	12	341970	341981	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452196679
126	NC_020376	AATGAC	2	12	345702	345713	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452196682
127	NC_020376	CAGCTT	2	12	350907	350918	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	452196687
128	NC_020376	ACCAGC	2	12	351097	351108	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	452196687
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134	NC_020376	CAGCTG	2	12	373914	373925	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452196708
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137	NC_020376	GTTAAT	2	12	374213	374224	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452196708
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139	NC_020376	GAATGT	2	12	379519	379530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196714
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144	NC_020376	TAGAAC	2	12	384440	384451	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452196719
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227	NC_020376	CTTTTG	2	12	586689	586700	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	452196895
228	NC_020376	TAATAG	2	12	586959	586970	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452196895
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231	NC_020376	GCAAAT	2	12	592191	592202	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452196898
232	NC_020376	AAAGTA	2	12	594469	594480	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452196900
233	NC_020376	TGAAGT	2	12	597587	597598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196902
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339	NC_020376	GGAAGA	2	12	837702	837713	50 %	0 %	50 %	0 %	452197147
340	NC_020376	TTATGT	2	12	846547	846558	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	452197154
341	NC_020376	GTACTT	2	12	846828	846839	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452197154
342	NC_020376	TAACTG	2	12	848569	848580	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452197157
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344	NC_020376	AGGCAT	2	12	851001	851012	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452197158
345	NC_020376	ACCAGA	2	12	852125	852136	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	452197159
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449	NC_020376	ATTTTG	2	12	1135000	1135011	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	452197448
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454	NC_020376	AAAATG	2	12	1158921	1158932	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452197469
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